MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_012466	GTT	2	6	1237651	1237656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854836
21004	NC_012466	CAA	2	6	1237724	1237729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854836
21005	NC_012466	GTTG	2	8	1237741	1237748	0 %	50 %	50 %	0 %	225854836
21006	NC_012466	TCC	2	6	1237784	1237789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225854836
21007	NC_012466	GCT	2	6	1237858	1237863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854836
21008	NC_012466	TTTC	2	8	1237867	1237874	0 %	75 %	0 %	25 %	225854836
21009	NC_012466	TTG	2	6	1237974	1237979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854836
21010	NC_012466	GTC	2	6	1238025	1238030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854836
21011	NC_012466	AAT	2	6	1238048	1238053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854836
21012	NC_012466	CTT	2	6	1238110	1238115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854836
21013	NC_012466	T	6	6	1238198	1238203	0 %	100 %	0 %	0 %	225854836
21014	NC_012466	CGATA	2	10	1238530	1238539	40 %	20 %	20 %	20 %	225854837
21015	NC_012466	GACAA	2	10	1238715	1238724	60 %	0 %	20 %	20 %	225854837
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21017	NC_012466	GTT	2	6	1238949	1238954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854837
21018	NC_012466	TCAA	2	8	1238955	1238962	50 %	25 %	0 %	25 %	225854837
21019	NC_012466	CA	3	6	1239022	1239027	50 %	0 %	0 %	50 %	225854837
21020	NC_012466	ACGA	2	8	1239056	1239063	50 %	0 %	25 %	25 %	225854837
21021	NC_012466	TTGC	2	8	1239069	1239076	0 %	50 %	25 %	25 %	225854837
21022	NC_012466	TTGG	2	8	1239107	1239114	0 %	50 %	50 %	0 %	225854837
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21035	NC_012466	TGC	2	6	1239884	1239889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854838
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21037	NC_012466	GAT	2	6	1239922	1239927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854838
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21053	NC_012466	GTATT	2	10	1240830	1240839	20 %	60 %	20 %	0 %	225854839
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21059	NC_012466	CGA	2	6	1241266	1241271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854840
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21067	NC_012466	AGCCA	2	10	1241498	1241507	40 %	0 %	20 %	40 %	225854840
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21109	NC_012466	GA	3	6	1244563	1244568	50 %	0 %	50 %	0 %	225854843
21110	NC_012466	GAG	2	6	1244572	1244577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225854843
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21115	NC_012466	AAG	2	6	1244828	1244833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854844
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21117	NC_012466	CTG	2	6	1244860	1244865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854844
21118	NC_012466	ATG	3	9	1244882	1244890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854844
21119	NC_012466	TCT	2	6	1244921	1244926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854844
21120	NC_012466	AGGCTG	2	12	1244952	1244963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225854844
21121	NC_012466	GTT	2	6	1245021	1245026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225854844
21122	NC_012466	ACC	2	6	1245031	1245036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854844
21123	NC_012466	TCAT	2	8	1245320	1245327	25 %	50 %	0 %	25 %	225854844
21124	NC_012466	GTAG	2	8	1245346	1245353	25 %	25 %	50 %	0 %	225854844
21125	NC_012466	TTTC	2	8	1245395	1245402	0 %	75 %	0 %	25 %	225854844
21126	NC_012466	TAG	2	6	1245462	1245467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854844
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21128	NC_012466	CTG	2	6	1245637	1245642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854845
21129	NC_012466	CTG	2	6	1245790	1245795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854845
21130	NC_012466	GAC	2	6	1245842	1245847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854845
21131	NC_012466	AAC	2	6	1245881	1245886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854845
21132	NC_012466	CAAGGC	2	12	1246007	1246018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225854845
21133	NC_012466	CAC	3	9	1246082	1246090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854845
21134	NC_012466	T	6	6	1246148	1246153	0 %	100 %	0 %	0 %	225854845
21135	NC_012466	AAT	2	6	1246202	1246207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854845
21136	NC_012466	CAC	2	6	1246258	1246263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854845
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21141	NC_012466	CTTT	2	8	1246441	1246448	0 %	75 %	0 %	25 %	225854846
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21144	NC_012466	GCC	2	6	1246708	1246713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225854846
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21149	NC_012466	ACT	2	6	1246939	1246944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854846
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21154	NC_012466	AAG	2	6	1247173	1247178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854846
21155	NC_012466	AAAG	2	8	1247236	1247243	75 %	0 %	25 %	0 %	225854846
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21221	NC_012466	ATG	2	6	1251363	1251368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854852
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21225	NC_012466	ATA	2	6	1251435	1251440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854852
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21228	NC_012466	TTTCA	2	10	1251735	1251744	20 %	60 %	0 %	20 %	225854853
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21230	NC_012466	A	6	6	1251796	1251801	100 %	0 %	0 %	0 %	225854853
21231	NC_012466	GAG	2	6	1251802	1251807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225854853
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21234	NC_012466	ATC	2	6	1251880	1251885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854853
21235	NC_012466	ATC	2	6	1251956	1251961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854853
21236	NC_012466	ACT	2	6	1251971	1251976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854853
21237	NC_012466	CTA	2	6	1252068	1252073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854853
21238	NC_012466	GCT	2	6	1252124	1252129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854853
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21240	NC_012466	TCA	2	6	1252185	1252190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854853
21241	NC_012466	TAGA	2	8	1252225	1252232	50 %	25 %	25 %	0 %	225854853
21242	NC_012466	GAGAGG	2	12	1252307	1252318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225854853
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21245	NC_012466	GTC	2	6	1252443	1252448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854854
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21252	NC_012466	CT	3	6	1252971	1252976	0 %	50 %	0 %	50 %	225854854
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21337	NC_012466	TTTACG	2	12	1257757	1257768	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225854861
21338	NC_012466	CGT	2	6	1257858	1257863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854861
21339	NC_012466	ATTC	2	8	1257870	1257877	25 %	50 %	0 %	25 %	225854861
21340	NC_012466	TAC	2	6	1257883	1257888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854861
21341	NC_012466	T	7	7	1257900	1257906	0 %	100 %	0 %	0 %	225854861
21342	NC_012466	TAAGC	2	10	1258052	1258061	40 %	20 %	20 %	20 %	225854862
21343	NC_012466	GAT	2	6	1258076	1258081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854862
21344	NC_012466	AGGT	2	8	1258115	1258122	25 %	25 %	50 %	0 %	225854862
21345	NC_012466	AAT	2	6	1258190	1258195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854862
21346	NC_012466	TTGGG	2	10	1258238	1258247	0 %	40 %	60 %	0 %	225854862
21347	NC_012466	AAG	2	6	1258266	1258271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854862
21348	NC_012466	TAG	2	6	1258288	1258293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854862
21349	NC_012466	CTA	2	6	1258306	1258311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854862
21350	NC_012466	CTTCAG	2	12	1258432	1258443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225854862
21351	NC_012466	CTTT	2	8	1258473	1258480	0 %	75 %	0 %	25 %	225854862
21352	NC_012466	TCA	2	6	1258560	1258565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854862
21353	NC_012466	CAA	2	6	1258606	1258611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225854862
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21466	NC_012466	CCA	2	6	1269234	1269239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854871
21467	NC_012466	CTTT	2	8	1269592	1269599	0 %	75 %	0 %	25 %	225854872
21468	NC_012466	ATA	2	6	1269723	1269728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854872
21469	NC_012466	AAT	2	6	1269756	1269761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854872
21470	NC_012466	AATG	2	8	1269779	1269786	50 %	25 %	25 %	0 %	225854872
21471	NC_012466	TTTCCT	2	12	1269830	1269841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854872
21472	NC_012466	TGA	2	6	1269889	1269894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225854873
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21474	NC_012466	CAT	2	6	1270003	1270008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854873
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21481	NC_012466	CCA	2	6	1270548	1270553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225854873
21482	NC_012466	TTC	2	6	1270676	1270681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854873
21483	NC_012466	TAGT	2	8	1270749	1270756	25 %	50 %	25 %	0 %	225854873
21484	NC_012466	CTG	2	6	1270843	1270848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225854873
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21486	NC_012466	CTT	2	6	1270969	1270974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854873
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21490	NC_012466	TAA	2	6	1272422	1272427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854874
21491	NC_012466	ATTC	2	8	1272442	1272449	25 %	50 %	0 %	25 %	225854874
21492	NC_012466	AGA	2	6	1272503	1272508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225854874
21493	NC_012466	A	6	6	1272524	1272529	100 %	0 %	0 %	0 %	225854874
21494	NC_012466	ATC	2	6	1272568	1272573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854874
21495	NC_012466	ATA	2	6	1272592	1272597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225854874
21496	NC_012466	GGT	2	6	1272646	1272651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225854874
21497	NC_012466	A	6	6	1272659	1272664	100 %	0 %	0 %	0 %	225854874
21498	NC_012466	ATT	2	6	1272668	1272673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225854874
21499	NC_012466	ATC	2	6	1272679	1272684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225854874
21500	NC_012466	TTC	2	6	1272746	1272751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225854874

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