MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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81002	NC_012125	CGTC	2	8	4533009	4533016	0 %	25 %	25 %	50 %	224586122
81003	NC_012125	ATT	2	6	4533018	4533023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586122
81004	NC_012125	T	6	6	4533026	4533031	0 %	100 %	0 %	0 %	224586122
81005	NC_012125	CTG	2	6	4533066	4533071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586122
81006	NC_012125	GAA	2	6	4533150	4533155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586122
81007	NC_012125	GTA	2	6	4533219	4533224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586122
81008	NC_012125	T	7	7	4533228	4533234	0 %	100 %	0 %	0 %	224586122
81009	NC_012125	CTGG	2	8	4533323	4533330	0 %	25 %	50 %	25 %	224586122
81010	NC_012125	AACAG	2	10	4533335	4533344	60 %	0 %	20 %	20 %	224586122
81011	NC_012125	CCGG	2	8	4533362	4533369	0 %	0 %	50 %	50 %	224586122
81012	NC_012125	TGG	2	6	4533436	4533441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586122
81013	NC_012125	GAT	2	6	4533471	4533476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586122
81014	NC_012125	GTT	2	6	4533581	4533586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586122
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81016	NC_012125	TGA	2	6	4533653	4533658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586122
81017	NC_012125	GT	3	6	4533739	4533744	0 %	50 %	50 %	0 %	224586122
81018	NC_012125	GGT	2	6	4533745	4533750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586122
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81022	NC_012125	CTGG	2	8	4534260	4534267	0 %	25 %	50 %	25 %	224586122
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81033	NC_012125	TGC	2	6	4534967	4534972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586122
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81119	NC_012125	TAA	2	6	4539682	4539687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586128
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81232	NC_012125	GA	3	6	4549565	4549570	50 %	0 %	50 %	0 %	224586139
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81235	NC_012125	TGC	2	6	4549617	4549622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586139
81236	NC_012125	CGG	2	6	4549643	4549648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586139
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81334	NC_012125	CCT	2	6	4555995	4556000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586147
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81346	NC_012125	GCCG	2	8	4556352	4556359	0 %	0 %	50 %	50 %	224586147
81347	NC_012125	TCG	2	6	4556411	4556416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586147
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81351	NC_012125	CG	3	6	4556597	4556602	0 %	0 %	50 %	50 %	224586147
81352	NC_012125	CATC	2	8	4556609	4556616	25 %	25 %	0 %	50 %	224586147
81353	NC_012125	GTT	2	6	4556617	4556622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586147
81354	NC_012125	CAC	2	6	4556629	4556634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586147
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81373	NC_012125	TGA	2	6	4558567	4558572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586151
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81381	NC_012125	AGA	2	6	4559178	4559183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586152
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81455	NC_012125	T	6	6	4563258	4563263	0 %	100 %	0 %	0 %	224586154
81456	NC_012125	TA	3	6	4563308	4563313	50 %	50 %	0 %	0 %	224586155
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81459	NC_012125	CA	3	6	4563396	4563401	50 %	0 %	0 %	50 %	224586155
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81464	NC_012125	GGC	2	6	4563576	4563581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586155
81465	NC_012125	TCAC	2	8	4563638	4563645	25 %	25 %	0 %	50 %	224586155
81466	NC_012125	CAT	2	6	4563730	4563735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586155
81467	NC_012125	TCA	2	6	4563827	4563832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586155
81468	NC_012125	CA	3	6	4563846	4563851	50 %	0 %	0 %	50 %	224586155
81469	NC_012125	CGT	2	6	4563865	4563870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586155
81470	NC_012125	GCC	2	6	4563887	4563892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586155
81471	NC_012125	ACC	2	6	4563944	4563949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224586155
81472	NC_012125	GTA	2	6	4564171	4564176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586156
81473	NC_012125	TAA	2	6	4564199	4564204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586156
81474	NC_012125	ATTC	2	8	4564216	4564223	25 %	50 %	0 %	25 %	224586156
81475	NC_012125	TTAA	2	8	4564416	4564423	50 %	50 %	0 %	0 %	224586156
81476	NC_012125	ATA	3	9	4564428	4564436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586156
81477	NC_012125	A	6	6	4564477	4564482	100 %	0 %	0 %	0 %	224586156
81478	NC_012125	GAAT	2	8	4564529	4564536	50 %	25 %	25 %	0 %	224586156
81479	NC_012125	CAT	2	6	4564697	4564702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586156
81480	NC_012125	AATAA	2	10	4564752	4564761	80 %	20 %	0 %	0 %	224586156
81481	NC_012125	ATA	2	6	4564793	4564798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586156
81482	NC_012125	ATT	2	6	4564802	4564807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224586156
81483	NC_012125	AGAA	2	8	4564834	4564841	75 %	0 %	25 %	0 %	224586157
81484	NC_012125	GATA	2	8	4564990	4564997	50 %	25 %	25 %	0 %	224586157
81485	NC_012125	CTG	2	6	4565012	4565017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586157
81486	NC_012125	ACG	2	6	4565112	4565117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586157
81487	NC_012125	CTG	2	6	4565158	4565163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586157
81488	NC_012125	TGC	2	6	4565280	4565285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586157
81489	NC_012125	CAT	2	6	4565306	4565311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586157
81490	NC_012125	ACTGCC	2	12	4565331	4565342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224586157
81491	NC_012125	GCGG	2	8	4565435	4565442	0 %	0 %	75 %	25 %	224586157
81492	NC_012125	CG	3	6	4565476	4565481	0 %	0 %	50 %	50 %	224586157
81493	NC_012125	TCA	2	6	4565499	4565504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586157
81494	NC_012125	ATCCA	2	10	4565519	4565528	40 %	20 %	0 %	40 %	224586157
81495	NC_012125	GTCA	2	8	4565573	4565580	25 %	25 %	25 %	25 %	224586157
81496	NC_012125	CGC	2	6	4565608	4565613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224586157
81497	NC_012125	CCCG	2	8	4565639	4565646	0 %	0 %	25 %	75 %	224586157
81498	NC_012125	GCA	2	6	4565665	4565670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586157
81499	NC_012125	TAA	2	6	4565812	4565817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224586157
81500	NC_012125	ATG	2	6	4565883	4565888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586157

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