MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
80501	NC_012125	GCA	2	6	4499866	4499871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586088
80502	NC_012125	TGA	2	6	4499880	4499885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586088
80503	NC_012125	CATCT	2	10	4500102	4500111	20 %	40 %	0 %	40 %	224586088
80504	NC_012125	CAT	2	6	4500147	4500152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586088
80505	NC_012125	CAA	2	6	4500179	4500184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586088
80506	NC_012125	CCAGAT	2	12	4500239	4500250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	224586088
80507	NC_012125	GAT	2	6	4500269	4500274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586088
80508	NC_012125	GGTTC	2	10	4500288	4500297	0 %	40 %	40 %	20 %	224586088
80509	NC_012125	G	6	6	4500347	4500352	0 %	0 %	100 %	0 %	224586088
80510	NC_012125	TGA	2	6	4500382	4500387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586088
80511	NC_012125	TC	3	6	4500511	4500516	0 %	50 %	0 %	50 %	224586088
80512	NC_012125	GAT	2	6	4500611	4500616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586088
80513	NC_012125	GCTT	2	8	4500646	4500653	0 %	50 %	25 %	25 %	224586088
80514	NC_012125	CGG	2	6	4500739	4500744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586088
80515	NC_012125	CTT	2	6	4500823	4500828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586088
80516	NC_012125	GGC	2	6	4500937	4500942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586088
80517	NC_012125	GAG	2	6	4500958	4500963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586088
80518	NC_012125	TTGATG	2	12	4500973	4500984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224586088
80519	NC_012125	GCA	2	6	4501310	4501315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586089
80520	NC_012125	TGCC	2	8	4501342	4501349	0 %	25 %	25 %	50 %	224586089
80521	NC_012125	GAG	2	6	4501424	4501429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586089
80522	NC_012125	A	6	6	4501492	4501497	100 %	0 %	0 %	0 %	224586090
80523	NC_012125	TGA	3	9	4501546	4501554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586090
80524	NC_012125	AAG	2	6	4501728	4501733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586090
80525	NC_012125	CGG	2	6	4501771	4501776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586090
80526	NC_012125	CAG	3	9	4501992	4502000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586090
80527	NC_012125	A	6	6	4502052	4502057	100 %	0 %	0 %	0 %	224586090
80528	NC_012125	AGGC	2	8	4502061	4502068	25 %	0 %	50 %	25 %	224586090
80529	NC_012125	AGGC	2	8	4502085	4502092	25 %	0 %	50 %	25 %	224586090
80530	NC_012125	GAG	2	6	4502124	4502129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586090
80531	NC_012125	AGG	2	6	4502140	4502145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224586090
80532	NC_012125	GAA	2	6	4502382	4502387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586091
80533	NC_012125	CTGTTT	2	12	4502410	4502421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224586091
80534	NC_012125	CAT	2	6	4502436	4502441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586091
80535	NC_012125	CGAA	2	8	4502492	4502499	50 %	0 %	25 %	25 %	224586091
80536	NC_012125	GAT	2	6	4502534	4502539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586091
80537	NC_012125	TCT	2	6	4502545	4502550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586091
80538	NC_012125	TGA	2	6	4502630	4502635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586091
80539	NC_012125	CT	3	6	4502702	4502707	0 %	50 %	0 %	50 %	224586091
80540	NC_012125	ATG	2	6	4502715	4502720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586091
80541	NC_012125	CCT	2	6	4502817	4502822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586092
80542	NC_012125	CAG	2	6	4502900	4502905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586092
80543	NC_012125	GACA	2	8	4502931	4502938	50 %	0 %	25 %	25 %	224586092
80544	NC_012125	CTG	2	6	4502975	4502980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586092
80545	NC_012125	TTAT	2	8	4503005	4503012	25 %	75 %	0 %	0 %	224586092
80546	NC_012125	GA	3	6	4503048	4503053	50 %	0 %	50 %	0 %	224586092
80547	NC_012125	AAC	2	6	4503063	4503068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224586093
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80549	NC_012125	GAA	2	6	4503103	4503108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586093
80550	NC_012125	GAT	2	6	4503139	4503144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586093
80551	NC_012125	TCG	2	6	4503199	4503204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586093
80552	NC_012125	GCT	2	6	4503222	4503227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586093
80553	NC_012125	ACG	2	6	4503245	4503250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586093
80554	NC_012125	ACG	2	6	4503338	4503343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224586093
80555	NC_012125	ATG	2	6	4503362	4503367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586093
80556	NC_012125	TTC	2	6	4503384	4503389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586093
80557	NC_012125	ATG	2	6	4503524	4503529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586093
80558	NC_012125	CAGT	2	8	4503533	4503540	25 %	25 %	25 %	25 %	224586093
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80569	NC_012125	ACGT	2	8	4503920	4503927	25 %	25 %	25 %	25 %	224586093
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80571	NC_012125	A	7	7	4503949	4503955	100 %	0 %	0 %	0 %	224586093
80572	NC_012125	CGTA	2	8	4503956	4503963	25 %	25 %	25 %	25 %	224586093
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80583	NC_012125	A	6	6	4504481	4504486	100 %	0 %	0 %	0 %	224586094
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80966	NC_012125	TGC	2	6	4530556	4530561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224586120
80967	NC_012125	GTT	2	6	4530671	4530676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586120
80968	NC_012125	TGT	2	6	4530712	4530717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224586120
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80970	NC_012125	GGC	2	6	4530820	4530825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224586120
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80974	NC_012125	GTG	2	6	4530987	4530992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224586121
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80976	NC_012125	TAC	2	6	4531031	4531036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224586121
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80983	NC_012125	CTC	2	6	4531489	4531494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224586121
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80988	NC_012125	GT	3	6	4531874	4531879	0 %	50 %	50 %	0 %	224586121
80989	NC_012125	GTTT	2	8	4531904	4531911	0 %	75 %	25 %	0 %	224586121
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80996	NC_012125	AAG	2	6	4532230	4532235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224586121
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80999	NC_012125	TCT	2	6	4532892	4532897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224586122
81000	NC_012125	ATG	2	6	4532970	4532975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224586122

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