MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_012125	CAG	2	6	4354779	4354784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585969
78002	NC_012125	ACC	2	6	4354807	4354812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585969
78003	NC_012125	ATA	2	6	4354834	4354839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585969
78004	NC_012125	GAT	2	6	4354846	4354851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585969
78005	NC_012125	T	6	6	4354890	4354895	0 %	100 %	0 %	0 %	224585969
78006	NC_012125	T	7	7	4354920	4354926	0 %	100 %	0 %	0 %	224585969
78007	NC_012125	CGA	2	6	4354998	4355003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585969
78008	NC_012125	CGC	2	6	4355016	4355021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585969
78009	NC_012125	CGCAG	2	10	4355155	4355164	20 %	0 %	40 %	40 %	224585969
78010	NC_012125	AACAA	2	10	4355231	4355240	80 %	0 %	0 %	20 %	224585969
78011	NC_012125	TGAA	2	8	4355291	4355298	50 %	25 %	25 %	0 %	224585969
78012	NC_012125	CAGAA	2	10	4355464	4355473	60 %	0 %	20 %	20 %	224585969
78013	NC_012125	T	6	6	4355561	4355566	0 %	100 %	0 %	0 %	224585969
78014	NC_012125	AGA	2	6	4355583	4355588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585969
78015	NC_012125	CAA	2	6	4355598	4355603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585969
78016	NC_012125	GCA	2	6	4355630	4355635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585969
78017	NC_012125	GAA	2	6	4355689	4355694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585969
78018	NC_012125	AAT	2	6	4355705	4355710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585969
78019	NC_012125	AGT	2	6	4355712	4355717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585969
78020	NC_012125	ATG	2	6	4355881	4355886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585969
78021	NC_012125	ATC	2	6	4355929	4355934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585969
78022	NC_012125	A	6	6	4355975	4355980	100 %	0 %	0 %	0 %	224585969
78023	NC_012125	AGT	2	6	4355984	4355989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585969
78024	NC_012125	ATC	2	6	4355990	4355995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585969
78025	NC_012125	ATT	2	6	4356029	4356034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585969
78026	NC_012125	CAT	2	6	4356036	4356041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585970
78027	NC_012125	T	7	7	4356044	4356050	0 %	100 %	0 %	0 %	224585970
78028	NC_012125	AT	3	6	4356103	4356108	50 %	50 %	0 %	0 %	224585970
78029	NC_012125	ATG	2	6	4356115	4356120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585970
78030	NC_012125	GCC	2	6	4356141	4356146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585970
78031	NC_012125	AAG	2	6	4356148	4356153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585970
78032	NC_012125	ATC	2	6	4356217	4356222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585970
78033	NC_012125	AT	3	6	4356231	4356236	50 %	50 %	0 %	0 %	224585970
78034	NC_012125	TA	3	6	4356264	4356269	50 %	50 %	0 %	0 %	224585970
78035	NC_012125	ACA	2	6	4356388	4356393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585970
78036	NC_012125	CG	3	6	4356476	4356481	0 %	0 %	50 %	50 %	224585970
78037	NC_012125	CGAT	2	8	4356592	4356599	25 %	25 %	25 %	25 %	224585970
78038	NC_012125	CAC	2	6	4356696	4356701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585970
78039	NC_012125	AATCC	2	10	4356716	4356725	40 %	20 %	0 %	40 %	224585970
78040	NC_012125	AAC	2	6	4356774	4356779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585970
78041	NC_012125	TGA	2	6	4356806	4356811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585970
78042	NC_012125	CAT	2	6	4356836	4356841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585970
78043	NC_012125	ACG	2	6	4357077	4357082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585971
78044	NC_012125	A	6	6	4357167	4357172	100 %	0 %	0 %	0 %	224585971
78045	NC_012125	GACAGC	2	12	4357181	4357192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585971
78046	NC_012125	AAT	2	6	4357305	4357310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585971
78047	NC_012125	GTG	2	6	4357654	4357659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585972
78048	NC_012125	GCC	2	6	4357669	4357674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585972
78049	NC_012125	CGC	3	9	4357752	4357760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585972
78050	NC_012125	TGCC	2	8	4357761	4357768	0 %	25 %	25 %	50 %	224585972
78051	NC_012125	T	6	6	4357789	4357794	0 %	100 %	0 %	0 %	224585972
78052	NC_012125	GCG	2	6	4357827	4357832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585972
78053	NC_012125	CGA	2	6	4357836	4357841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585972
78054	NC_012125	GCC	2	6	4357916	4357921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585972
78055	NC_012125	TGC	2	6	4357952	4357957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585972
78056	NC_012125	CTTCA	2	10	4357999	4358008	20 %	40 %	0 %	40 %	224585972
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78058	NC_012125	GCC	2	6	4358026	4358031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585972
78059	NC_012125	CG	3	6	4358106	4358111	0 %	0 %	50 %	50 %	224585972
78060	NC_012125	GCG	2	6	4358118	4358123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585972
78061	NC_012125	CAC	2	6	4358155	4358160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585972
78062	NC_012125	GTC	2	6	4358176	4358181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585972
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78070	NC_012125	TTG	2	6	4358507	4358512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585973
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78077	NC_012125	TCCG	2	8	4358798	4358805	0 %	25 %	25 %	50 %	224585973
78078	NC_012125	CAGCG	2	10	4358831	4358840	20 %	0 %	40 %	40 %	224585973
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78088	NC_012125	CTC	2	6	4359624	4359629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585975
78089	NC_012125	CGG	3	9	4359637	4359645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585975
78090	NC_012125	CG	3	6	4359685	4359690	0 %	0 %	50 %	50 %	224585975
78091	NC_012125	GCT	2	6	4359737	4359742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585975
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78097	NC_012125	CTTC	2	8	4359976	4359983	0 %	50 %	0 %	50 %	224585975
78098	NC_012125	T	7	7	4360009	4360015	0 %	100 %	0 %	0 %	224585975
78099	NC_012125	TCA	2	6	4360020	4360025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585975
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78101	NC_012125	TCA	2	6	4360087	4360092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585975
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