MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75501	NC_012125	TGC	2	6	4221961	4221966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585848
75502	NC_012125	AT	3	6	4221991	4221996	50 %	50 %	0 %	0 %	224585848
75503	NC_012125	T	6	6	4221996	4222001	0 %	100 %	0 %	0 %	224585848
75504	NC_012125	CAT	2	6	4222070	4222075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585848
75505	NC_012125	TATT	2	8	4222099	4222106	25 %	75 %	0 %	0 %	224585848
75506	NC_012125	ATTG	2	8	4222113	4222120	25 %	50 %	25 %	0 %	224585848
75507	NC_012125	TAA	2	6	4222145	4222150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585848
75508	NC_012125	AGC	2	6	4222158	4222163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585848
75509	NC_012125	AG	3	6	4222171	4222176	50 %	0 %	50 %	0 %	224585848
75510	NC_012125	GCC	3	9	4222198	4222206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585848
75511	NC_012125	TCG	2	6	4222300	4222305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585848
75512	NC_012125	ATT	2	6	4222353	4222358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585848
75513	NC_012125	CAAT	2	8	4222363	4222370	50 %	25 %	0 %	25 %	224585848
75514	NC_012125	TGA	2	6	4222446	4222451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585848
75515	NC_012125	GTT	2	6	4222472	4222477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585848
75516	NC_012125	T	8	8	4222485	4222492	0 %	100 %	0 %	0 %	224585848
75517	NC_012125	TCA	2	6	4222517	4222522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585848
75518	NC_012125	ATA	2	6	4222531	4222536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585848
75519	NC_012125	TGA	2	6	4222539	4222544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585848
75520	NC_012125	TAT	2	6	4222758	4222763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585849
75521	NC_012125	TGA	2	6	4222810	4222815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585849
75522	NC_012125	AAT	2	6	4222817	4222822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585849
75523	NC_012125	GCC	2	6	4222844	4222849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585849
75524	NC_012125	CAG	2	6	4222923	4222928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585849
75525	NC_012125	CGG	2	6	4222956	4222961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585849
75526	NC_012125	GAA	2	6	4223000	4223005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585849
75527	NC_012125	A	6	6	4223016	4223021	100 %	0 %	0 %	0 %	224585849
75528	NC_012125	TAA	2	6	4223044	4223049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585849
75529	NC_012125	A	6	6	4223108	4223113	100 %	0 %	0 %	0 %	224585849
75530	NC_012125	AG	3	6	4223128	4223133	50 %	0 %	50 %	0 %	224585849
75531	NC_012125	GCC	2	6	4223204	4223209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585849
75532	NC_012125	GAT	2	6	4223327	4223332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585849
75533	NC_012125	GAA	2	6	4223371	4223376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585849
75534	NC_012125	AAAT	2	8	4223427	4223434	75 %	25 %	0 %	0 %	224585849
75535	NC_012125	GGC	2	6	4223439	4223444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585849
75536	NC_012125	AGA	2	6	4223467	4223472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585849
75537	NC_012125	TAT	2	6	4223495	4223500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585849
75538	NC_012125	CAA	2	6	4223533	4223538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585849
75539	NC_012125	GAT	2	6	4223572	4223577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585849
75540	NC_012125	A	6	6	4223579	4223584	100 %	0 %	0 %	0 %	224585849
75541	NC_012125	AAG	2	6	4223619	4223624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585849
75542	NC_012125	TTC	2	6	4223644	4223649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585849
75543	NC_012125	TCA	2	6	4223652	4223657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585849
75544	NC_012125	A	6	6	4223687	4223692	100 %	0 %	0 %	0 %	224585849
75545	NC_012125	TCG	2	6	4223698	4223703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585849
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75547	NC_012125	CGT	2	6	4223793	4223798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585849
75548	NC_012125	TGG	2	6	4223817	4223822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585849
75549	NC_012125	TTAA	2	8	4224200	4224207	50 %	50 %	0 %	0 %	224585850
75550	NC_012125	TAA	2	6	4224221	4224226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585850
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75553	NC_012125	CAC	2	6	4224254	4224259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585850
75554	NC_012125	CG	3	6	4224313	4224318	0 %	0 %	50 %	50 %	224585850
75555	NC_012125	GGT	2	6	4224350	4224355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585850
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75558	NC_012125	CGC	2	6	4224448	4224453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585850
75559	NC_012125	ATA	2	6	4224498	4224503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585850
75560	NC_012125	ATT	2	6	4224522	4224527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585850
75561	NC_012125	T	6	6	4224526	4224531	0 %	100 %	0 %	0 %	224585851
75562	NC_012125	AGC	2	6	4224548	4224553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585851
75563	NC_012125	CGG	2	6	4224591	4224596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585851
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75568	NC_012125	TCA	2	6	4224851	4224856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585851
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75572	NC_012125	GC	3	6	4224934	4224939	0 %	0 %	50 %	50 %	224585851
75573	NC_012125	CAG	2	6	4224946	4224951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585851
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75577	NC_012125	CGCC	2	8	4225020	4225027	0 %	0 %	25 %	75 %	224585851
75578	NC_012125	AG	3	6	4225039	4225044	50 %	0 %	50 %	0 %	224585851
75579	NC_012125	CGA	2	6	4225104	4225109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585851
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75581	NC_012125	GCGCG	2	10	4225361	4225370	0 %	0 %	60 %	40 %	224585852
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75583	NC_012125	A	6	6	4225497	4225502	100 %	0 %	0 %	0 %	224585852
75584	NC_012125	CGC	2	6	4225514	4225519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585852
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75586	NC_012125	GC	3	6	4225590	4225595	0 %	0 %	50 %	50 %	224585852
75587	NC_012125	ATCT	2	8	4225604	4225611	25 %	50 %	0 %	25 %	224585852
75588	NC_012125	TC	3	6	4225641	4225646	0 %	50 %	0 %	50 %	224585852
75589	NC_012125	CCG	2	6	4225655	4225660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585852
75590	NC_012125	ATT	2	6	4225676	4225681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585852
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75593	NC_012125	A	6	6	4225871	4225876	100 %	0 %	0 %	0 %	224585853
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75597	NC_012125	GC	3	6	4226069	4226074	0 %	0 %	50 %	50 %	224585853
75598	NC_012125	GAC	2	6	4226120	4226125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585853
75599	NC_012125	CTC	2	6	4226133	4226138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585853
75600	NC_012125	GC	3	6	4226228	4226233	0 %	0 %	50 %	50 %	224585854
75601	NC_012125	GC	3	6	4226242	4226247	0 %	0 %	50 %	50 %	224585854
75602	NC_012125	CCAG	2	8	4226269	4226276	25 %	0 %	25 %	50 %	224585854
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75604	NC_012125	CG	3	6	4226395	4226400	0 %	0 %	50 %	50 %	224585854
75605	NC_012125	GCA	2	6	4226476	4226481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585854
75606	NC_012125	CA	3	6	4226655	4226660	50 %	0 %	0 %	50 %	224585854
75607	NC_012125	GC	3	6	4226707	4226712	0 %	0 %	50 %	50 %	224585854
75608	NC_012125	GCG	2	6	4226763	4226768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585854
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75613	NC_012125	GGT	2	6	4227142	4227147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585854
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75615	NC_012125	TCA	2	6	4227325	4227330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585854
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75617	NC_012125	TATC	2	8	4227595	4227602	25 %	50 %	0 %	25 %	224585855
75618	NC_012125	TGGCC	2	10	4227694	4227703	0 %	20 %	40 %	40 %	224585855
75619	NC_012125	CCAT	2	8	4227724	4227731	25 %	25 %	0 %	50 %	224585855
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