MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_012125	CAT	2	6	4134912	4134917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585771
74002	NC_012125	GTT	2	6	4134924	4134929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585771
74003	NC_012125	TCCAGC	2	12	4134964	4134975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224585771
74004	NC_012125	GTT	2	6	4135246	4135251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585772
74005	NC_012125	GCCA	2	8	4135252	4135259	25 %	0 %	25 %	50 %	224585772
74006	NC_012125	AAG	2	6	4135287	4135292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585772
74007	NC_012125	ATG	2	6	4135311	4135316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585772
74008	NC_012125	ATC	2	6	4135337	4135342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585772
74009	NC_012125	ACT	2	6	4135398	4135403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585772
74010	NC_012125	TGG	2	6	4135574	4135579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585772
74011	NC_012125	CTGG	2	8	4135789	4135796	0 %	25 %	50 %	25 %	224585772
74012	NC_012125	GAT	2	6	4135832	4135837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585772
74013	NC_012125	AT	3	6	4135855	4135860	50 %	50 %	0 %	0 %	224585772
74014	NC_012125	TTA	2	6	4135864	4135869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585772
74015	NC_012125	CGG	2	6	4135945	4135950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585772
74016	NC_012125	GTCGGC	2	12	4136060	4136071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224585772
74017	NC_012125	TCT	2	6	4136088	4136093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585772
74018	NC_012125	GATTG	2	10	4136094	4136103	20 %	40 %	40 %	0 %	224585772
74019	NC_012125	ATT	2	6	4136275	4136280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585773
74020	NC_012125	GTC	2	6	4136311	4136316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74021	NC_012125	CGG	3	9	4136325	4136333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585773
74022	NC_012125	GTT	2	6	4136361	4136366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585773
74023	NC_012125	TGGA	2	8	4136369	4136376	25 %	25 %	50 %	0 %	224585773
74024	NC_012125	CGT	3	9	4136382	4136390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74025	NC_012125	TGA	2	6	4136408	4136413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585773
74026	NC_012125	GGC	3	9	4136448	4136456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585773
74027	NC_012125	AGC	3	9	4136483	4136491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74028	NC_012125	CTG	2	6	4136530	4136535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74029	NC_012125	ATC	2	6	4136576	4136581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585773
74030	NC_012125	TCCG	2	8	4136651	4136658	0 %	25 %	25 %	50 %	224585773
74031	NC_012125	ACCGCC	2	12	4136719	4136730	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224585773
74032	NC_012125	GAC	2	6	4136731	4136736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74033	NC_012125	ATT	2	6	4136752	4136757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585773
74034	NC_012125	GACC	2	8	4136803	4136810	25 %	0 %	25 %	50 %	224585773
74035	NC_012125	ATC	2	6	4136896	4136901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585773
74036	NC_012125	CCG	2	6	4136933	4136938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585773
74037	NC_012125	CG	3	6	4136937	4136942	0 %	0 %	50 %	50 %	224585773
74038	NC_012125	GCG	2	6	4136965	4136970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585773
74039	NC_012125	CGA	2	6	4137030	4137035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74040	NC_012125	GTG	2	6	4137046	4137051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585773
74041	NC_012125	AAAC	2	8	4137078	4137085	75 %	0 %	0 %	25 %	224585773
74042	NC_012125	ACGT	2	8	4137089	4137096	25 %	25 %	25 %	25 %	224585773
74043	NC_012125	TCG	2	6	4137098	4137103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74044	NC_012125	CTA	2	6	4137135	4137140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585773
74045	NC_012125	CTGC	2	8	4137172	4137179	0 %	25 %	25 %	50 %	224585773
74046	NC_012125	GCC	3	9	4137317	4137325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585773
74047	NC_012125	ATG	2	6	4137407	4137412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585773
74048	NC_012125	TCAT	2	8	4137605	4137612	25 %	50 %	0 %	25 %	224585773
74049	NC_012125	GCA	2	6	4137639	4137644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74050	NC_012125	CG	3	6	4137669	4137674	0 %	0 %	50 %	50 %	224585773
74051	NC_012125	TCG	2	6	4137722	4137727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74052	NC_012125	CGG	2	6	4137759	4137764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585773
74053	NC_012125	TGA	2	6	4137819	4137824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585773
74054	NC_012125	CCG	2	6	4137835	4137840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585773
74055	NC_012125	ACG	2	6	4137854	4137859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585773
74056	NC_012125	CG	3	6	4137976	4137981	0 %	0 %	50 %	50 %	224585773
74057	NC_012125	TGA	2	6	4137993	4137998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585773
74058	NC_012125	AGT	2	6	4138004	4138009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585773
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74060	NC_012125	TTC	2	6	4138141	4138146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585774
74061	NC_012125	CTG	2	6	4138157	4138162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585774
74062	NC_012125	GAT	2	6	4138185	4138190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585774
74063	NC_012125	GCG	2	6	4138211	4138216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585774
74064	NC_012125	GGGC	2	8	4138226	4138233	0 %	0 %	75 %	25 %	224585774
74065	NC_012125	GCT	2	6	4138239	4138244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585774
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74068	NC_012125	GGC	3	9	4138300	4138308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585774
74069	NC_012125	TGC	2	6	4138337	4138342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585774
74070	NC_012125	GCG	2	6	4138343	4138348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585774
74071	NC_012125	A	6	6	4138354	4138359	100 %	0 %	0 %	0 %	224585774
74072	NC_012125	GCG	3	9	4138366	4138374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585774
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74075	NC_012125	GCG	2	6	4138510	4138515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585774
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74084	NC_012125	TGC	2	6	4138931	4138936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585775
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74086	NC_012125	AAGA	2	8	4138966	4138973	75 %	0 %	25 %	0 %	224585775
74087	NC_012125	CG	3	6	4139008	4139013	0 %	0 %	50 %	50 %	224585775
74088	NC_012125	GCG	2	6	4139072	4139077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585775
74089	NC_012125	CTG	2	6	4139083	4139088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585775
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74099	NC_012125	GCA	2	6	4139825	4139830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585776
74100	NC_012125	G	6	6	4139882	4139887	0 %	0 %	100 %	0 %	224585776
74101	NC_012125	GTGCG	2	10	4139922	4139931	0 %	20 %	60 %	20 %	224585776
74102	NC_012125	CCTT	2	8	4139979	4139986	0 %	50 %	0 %	50 %	224585776
74103	NC_012125	GGCG	2	8	4140064	4140071	0 %	0 %	75 %	25 %	224585776
74104	NC_012125	GCC	2	6	4140103	4140108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585776
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74108	NC_012125	GCGA	2	8	4140225	4140232	25 %	0 %	50 %	25 %	224585776
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74114	NC_012125	TAT	2	6	4140491	4140496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585777
74115	NC_012125	GTT	2	6	4140504	4140509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585777
74116	NC_012125	GCT	2	6	4140530	4140535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585777
74117	NC_012125	GTC	2	6	4140622	4140627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585777
74118	NC_012125	GC	3	6	4140694	4140699	0 %	0 %	50 %	50 %	224585777
74119	NC_012125	GTG	2	6	4140774	4140779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585777
74120	NC_012125	CGA	3	9	4140815	4140823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585777
74121	NC_012125	T	6	6	4140860	4140865	0 %	100 %	0 %	0 %	224585777
74122	NC_012125	GCT	2	6	4140905	4140910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585777
74123	NC_012125	GTT	2	6	4140962	4140967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585777
74124	NC_012125	CG	3	6	4140989	4140994	0 %	0 %	50 %	50 %	224585777
74125	NC_012125	GGCG	2	8	4141049	4141056	0 %	0 %	75 %	25 %	224585777
74126	NC_012125	ACG	2	6	4141144	4141149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585777
74127	NC_012125	CAT	2	6	4141181	4141186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585777
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74129	NC_012125	GGC	2	6	4141489	4141494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585778
74130	NC_012125	TGG	2	6	4141560	4141565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585778
74131	NC_012125	CAT	2	6	4141582	4141587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585778
74132	NC_012125	CTG	3	9	4141634	4141642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585778
74133	NC_012125	CGC	2	6	4141656	4141661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585778
74134	NC_012125	TGA	2	6	4141686	4141691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585778
74135	NC_012125	CGT	2	6	4141697	4141702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585778
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74138	NC_012125	TGG	2	6	4141839	4141844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585778
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74142	NC_012125	GTG	2	6	4142009	4142014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585778
74143	NC_012125	CATG	2	8	4142092	4142099	25 %	25 %	25 %	25 %	224585778
74144	NC_012125	CTG	2	6	4142111	4142116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585778
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74149	NC_012125	GGC	2	6	4142327	4142332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585779
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74152	NC_012125	GGC	2	6	4142409	4142414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585779
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74220	NC_012125	CGGGC	2	10	4145422	4145431	0 %	0 %	60 %	40 %	224585780
74221	NC_012125	CTG	2	6	4145483	4145488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585780
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74224	NC_012125	GCG	2	6	4145600	4145605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585780
74225	NC_012125	TCT	2	6	4145721	4145726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224585781
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74227	NC_012125	ATGA	2	8	4145809	4145816	50 %	25 %	25 %	0 %	224585781
74228	NC_012125	T	6	6	4147391	4147396	0 %	100 %	0 %	0 %	224585782
74229	NC_012125	GCG	2	6	4147533	4147538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585782
74230	NC_012125	CCG	2	6	4147593	4147598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585782
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74339	NC_012125	TGT	2	6	4153397	4153402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585787
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74344	NC_012125	GC	3	6	4153705	4153710	0 %	0 %	50 %	50 %	224585787
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