MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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69003	NC_012125	CGG	2	6	3857486	3857491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585524
69004	NC_012125	CTTTAA	2	12	3857549	3857560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224585524
69005	NC_012125	AAG	2	6	3857629	3857634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585524
69006	NC_012125	GC	3	6	3857713	3857718	0 %	0 %	50 %	50 %	224585524
69007	NC_012125	CTG	2	6	3857727	3857732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585524
69008	NC_012125	CTG	2	6	3857736	3857741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585524
69009	NC_012125	CG	3	6	3857847	3857852	0 %	0 %	50 %	50 %	224585525
69010	NC_012125	CGC	2	6	3857887	3857892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585525
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69012	NC_012125	GGT	2	6	3857977	3857982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585525
69013	NC_012125	GACA	2	8	3858017	3858024	50 %	0 %	25 %	25 %	224585525
69014	NC_012125	GC	3	6	3858049	3858054	0 %	0 %	50 %	50 %	224585525
69015	NC_012125	TCG	2	6	3858164	3858169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585525
69016	NC_012125	GC	3	6	3858185	3858190	0 %	0 %	50 %	50 %	224585525
69017	NC_012125	CAG	2	6	3858502	3858507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585526
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69019	NC_012125	GAC	2	6	3858530	3858535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585526
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69043	NC_012125	CGC	2	6	3860299	3860304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585529
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69051	NC_012125	A	7	7	3861878	3861884	100 %	0 %	0 %	0 %	224585530
69052	NC_012125	CAG	2	6	3861917	3861922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585530
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69054	NC_012125	CGA	2	6	3861982	3861987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585530
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69232	NC_012125	ATC	2	6	3872969	3872974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585540
69233	NC_012125	CCA	2	6	3873007	3873012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585540
69234	NC_012125	GC	3	6	3873138	3873143	0 %	0 %	50 %	50 %	224585540
69235	NC_012125	CGG	2	6	3873156	3873161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585540
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69237	NC_012125	TTA	2	6	3873306	3873311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585540
69238	NC_012125	CGG	3	9	3873526	3873534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585541
69239	NC_012125	GCA	2	6	3873535	3873540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585541
69240	NC_012125	GATT	2	8	3873659	3873666	25 %	50 %	25 %	0 %	224585541
69241	NC_012125	ATC	2	6	3873747	3873752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585541
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69243	NC_012125	CCAGCG	2	12	3873821	3873832	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	224585541
69244	NC_012125	CAG	2	6	3873885	3873890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585541
69245	NC_012125	CTG	2	6	3873894	3873899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585541
69246	NC_012125	GGT	2	6	3873906	3873911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585541
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69248	NC_012125	TGG	2	6	3873999	3874004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585541
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69250	NC_012125	GGC	2	6	3874016	3874021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585541
69251	NC_012125	GCGCA	2	10	3874086	3874095	20 %	0 %	40 %	40 %	224585542
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69253	NC_012125	CCTC	2	8	3874150	3874157	0 %	25 %	0 %	75 %	224585542
69254	NC_012125	CTG	2	6	3874199	3874204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585542
69255	NC_012125	CGG	2	6	3874258	3874263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585542
69256	NC_012125	TCG	2	6	3874264	3874269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585542
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69259	NC_012125	GAAGC	2	10	3874385	3874394	40 %	0 %	40 %	20 %	224585542
69260	NC_012125	GAT	2	6	3874414	3874419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585542
69261	NC_012125	ACC	2	6	3874493	3874498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585542
69262	NC_012125	AAGC	2	8	3874508	3874515	50 %	0 %	25 %	25 %	224585542
69263	NC_012125	ACT	2	6	3874576	3874581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585542
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69266	NC_012125	CGCC	2	8	3874640	3874647	0 %	0 %	25 %	75 %	224585542
69267	NC_012125	GCG	2	6	3874696	3874701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585542
69268	NC_012125	GC	3	6	3874758	3874763	0 %	0 %	50 %	50 %	224585542
69269	NC_012125	CAA	2	6	3874792	3874797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585542
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69271	NC_012125	CGT	2	6	3874821	3874826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585542
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69300	NC_012125	GCA	2	6	3876234	3876239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585543
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69312	NC_012125	CTG	2	6	3876598	3876603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585543
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69316	NC_012125	CTC	2	6	3876667	3876672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585543
69317	NC_012125	AGGCA	2	10	3876717	3876726	40 %	0 %	40 %	20 %	224585543
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69323	NC_012125	GCA	2	6	3876989	3876994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585544
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69332	NC_012125	CA	3	6	3877425	3877430	50 %	0 %	0 %	50 %	224585544
69333	NC_012125	CAGA	2	8	3877494	3877501	50 %	0 %	25 %	25 %	224585544
69334	NC_012125	AG	3	6	3877534	3877539	50 %	0 %	50 %	0 %	224585544
69335	NC_012125	GTG	2	6	3877612	3877617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585544
69336	NC_012125	GCC	2	6	3877647	3877652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585544
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69340	NC_012125	ACG	2	6	3877876	3877881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585544
69341	NC_012125	CAA	2	6	3877895	3877900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585544
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69344	NC_012125	T	7	7	3878015	3878021	0 %	100 %	0 %	0 %	224585544
69345	NC_012125	CAG	2	6	3878028	3878033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585544
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69464	NC_012125	CGA	2	6	3888704	3888709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585550
69465	NC_012125	GTC	2	6	3888795	3888800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585550
69466	NC_012125	TAC	2	6	3888821	3888826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585550
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