MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 chromosome

Total Repeats: 86107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_012125	CGC	2	6	3804580	3804585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585478
68002	NC_012125	GC	3	6	3804649	3804654	0 %	0 %	50 %	50 %	224585478
68003	NC_012125	AGG	2	6	3804847	3804852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585478
68004	NC_012125	CGATA	2	10	3804854	3804863	40 %	20 %	20 %	20 %	224585478
68005	NC_012125	CGC	2	6	3804888	3804893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585478
68006	NC_012125	GAA	2	6	3804987	3804992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585478
68007	NC_012125	AG	3	6	3805016	3805021	50 %	0 %	50 %	0 %	224585478
68008	NC_012125	GCA	2	6	3805109	3805114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585478
68009	NC_012125	CAG	2	6	3805451	3805456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585479
68010	NC_012125	CAT	2	6	3805484	3805489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585479
68011	NC_012125	GCC	2	6	3805526	3805531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585479
68012	NC_012125	GCA	2	6	3805536	3805541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585479
68013	NC_012125	CCT	2	6	3805681	3805686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585479
68014	NC_012125	GGT	2	6	3805700	3805705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585479
68015	NC_012125	TCC	2	6	3805731	3805736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585479
68016	NC_012125	ATT	2	6	3805751	3805756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585479
68017	NC_012125	T	6	6	3805853	3805858	0 %	100 %	0 %	0 %	224585479
68018	NC_012125	CGATAT	2	12	3805861	3805872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224585479
68019	NC_012125	GA	3	6	3805900	3805905	50 %	0 %	50 %	0 %	224585479
68020	NC_012125	CT	3	6	3805956	3805961	0 %	50 %	0 %	50 %	224585479
68021	NC_012125	GC	3	6	3805974	3805979	0 %	0 %	50 %	50 %	224585479
68022	NC_012125	ATAG	2	8	3805994	3806001	50 %	25 %	25 %	0 %	224585479
68023	NC_012125	AC	3	6	3806033	3806038	50 %	0 %	0 %	50 %	224585479
68024	NC_012125	CATC	2	8	3806104	3806111	25 %	25 %	0 %	50 %	224585479
68025	NC_012125	AGA	2	6	3806122	3806127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585479
68026	NC_012125	GCC	2	6	3806141	3806146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585479
68027	NC_012125	AAT	2	6	3806165	3806170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585479
68028	NC_012125	CGC	2	6	3806272	3806277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585479
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68030	NC_012125	GAC	2	6	3806297	3806302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585479
68031	NC_012125	CGG	2	6	3806306	3806311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585479
68032	NC_012125	CAG	2	6	3806339	3806344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585479
68033	NC_012125	GCG	2	6	3806353	3806358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585479
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68035	NC_012125	CGC	2	6	3806393	3806398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585479
68036	NC_012125	CAA	2	6	3806429	3806434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224585479
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68038	NC_012125	CCT	2	6	3806527	3806532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585479
68039	NC_012125	GATC	2	8	3806563	3806570	25 %	25 %	25 %	25 %	224585479
68040	NC_012125	CGG	2	6	3806584	3806589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585479
68041	NC_012125	GCG	2	6	3806739	3806744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585479
68042	NC_012125	T	6	6	3806765	3806770	0 %	100 %	0 %	0 %	224585479
68043	NC_012125	GGA	2	6	3806774	3806779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585479
68044	NC_012125	ATA	2	6	3806825	3806830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585479
68045	NC_012125	CGG	2	6	3806839	3806844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585479
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68047	NC_012125	GCA	2	6	3807121	3807126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585480
68048	NC_012125	AT	3	6	3807127	3807132	50 %	50 %	0 %	0 %	224585480
68049	NC_012125	GGA	2	6	3807146	3807151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224585480
68050	NC_012125	GAA	2	6	3807188	3807193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585480
68051	NC_012125	CAT	2	6	3807200	3807205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585480
68052	NC_012125	TGG	2	6	3807258	3807263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585480
68053	NC_012125	GC	3	6	3807354	3807359	0 %	0 %	50 %	50 %	224585480
68054	NC_012125	GTT	2	6	3807391	3807396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224585480
68055	NC_012125	ACG	2	6	3807432	3807437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585480
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68057	NC_012125	GCA	2	6	3807478	3807483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585480
68058	NC_012125	GGC	2	6	3807524	3807529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585480
68059	NC_012125	TAT	2	6	3807532	3807537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224585480
68060	NC_012125	GC	3	6	3807561	3807566	0 %	0 %	50 %	50 %	224585480
68061	NC_012125	CGT	2	6	3807654	3807659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585480
68062	NC_012125	GCC	2	6	3807660	3807665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585480
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68064	NC_012125	GCC	2	6	3807694	3807699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585480
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68066	NC_012125	GTG	2	6	3807818	3807823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224585480
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68069	NC_012125	GCA	2	6	3807976	3807981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224585480
68070	NC_012125	TCGA	2	8	3807987	3807994	25 %	25 %	25 %	25 %	224585480
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68072	NC_012125	TAA	2	6	3808281	3808286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585481
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68077	NC_012125	ATG	2	6	3808489	3808494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224585481
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68082	NC_012125	CTG	2	6	3808620	3808625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585481
68083	NC_012125	CAAC	2	8	3808662	3808669	50 %	0 %	0 %	50 %	224585481
68084	NC_012125	TCG	2	6	3808693	3808698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585481
68085	NC_012125	TCC	2	6	3808735	3808740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224585481
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68087	NC_012125	GCGG	2	8	3808842	3808849	0 %	0 %	75 %	25 %	224585481
68088	NC_012125	GC	3	6	3808856	3808861	0 %	0 %	50 %	50 %	224585481
68089	NC_012125	CGC	2	6	3808992	3808997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224585481
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68112	NC_012125	CGCC	2	8	3809885	3809892	0 %	0 %	25 %	75 %	224585481
68113	NC_012125	AG	3	6	3809901	3809906	50 %	0 %	50 %	0 %	224585481
68114	NC_012125	T	6	6	3810000	3810005	0 %	100 %	0 %	0 %	224585481
68115	NC_012125	CGT	2	6	3810054	3810059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585481
68116	NC_012125	AAT	2	6	3810090	3810095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224585481
68117	NC_012125	CAT	2	6	3810104	3810109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585482
68118	NC_012125	CAT	2	6	3810163	3810168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224585482
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68121	NC_012125	GGC	2	6	3810263	3810268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585482
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68128	NC_012125	GCCC	2	8	3810589	3810596	0 %	0 %	25 %	75 %	224585482
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68145	NC_012125	ACC	2	6	3811377	3811382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224585482
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68220	NC_012125	TCG	2	6	3815353	3815358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585486
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68224	NC_012125	GAA	2	6	3815562	3815567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224585486
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68228	NC_012125	CGG	2	6	3815791	3815796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585486
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68351	NC_012125	CGG	2	6	3822093	3822098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224585492
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68353	NC_012125	TGC	2	6	3822349	3822354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224585492
68354	NC_012125	TGTC	2	8	3822411	3822418	0 %	50 %	25 %	25 %	224585492
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68495	NC_012125	CT	3	6	3831049	3831054	0 %	50 %	0 %	50 %	224585498
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