MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 36935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_011900	ACG	2	6	1096767	1096772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231922
18003	NC_011900	AGA	2	6	1096774	1096779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231922
18004	NC_011900	AAT	3	9	1096971	1096979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231922
18005	NC_011900	CCTT	2	8	1097047	1097054	0 %	50 %	0 %	50 %	221231922
18006	NC_011900	ATA	2	6	1097071	1097076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231922
18007	NC_011900	TCA	2	6	1097092	1097097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231922
18008	NC_011900	T	7	7	1097111	1097117	0 %	100 %	0 %	0 %	221231922
18009	NC_011900	T	6	6	1097222	1097227	0 %	100 %	0 %	0 %	221231923
18010	NC_011900	TTC	2	6	1097259	1097264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231923
18011	NC_011900	TCAC	2	8	1097308	1097315	25 %	25 %	0 %	50 %	221231923
18012	NC_011900	AAAC	2	8	1097377	1097384	75 %	0 %	0 %	25 %	221231923
18013	NC_011900	CTG	2	6	1097415	1097420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231923
18014	NC_011900	CT	3	6	1097425	1097430	0 %	50 %	0 %	50 %	221231923
18015	NC_011900	TTC	2	6	1097457	1097462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231923
18016	NC_011900	TGA	2	6	1097470	1097475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231923
18017	NC_011900	CTT	2	6	1097492	1097497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231923
18018	NC_011900	T	7	7	1097563	1097569	0 %	100 %	0 %	0 %	221231923
18019	NC_011900	TTC	2	6	1097709	1097714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231923
18020	NC_011900	CAT	2	6	1097808	1097813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231923
18021	NC_011900	CTG	2	6	1097945	1097950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231923
18022	NC_011900	CCA	2	6	1098007	1098012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231923
18023	NC_011900	AGTC	2	8	1098014	1098021	25 %	25 %	25 %	25 %	221231923
18024	NC_011900	CTG	2	6	1098027	1098032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231923
18025	NC_011900	AAT	2	6	1098062	1098067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231923
18026	NC_011900	CTC	2	6	1098099	1098104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231923
18027	NC_011900	GTA	2	6	1098156	1098161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231923
18028	NC_011900	CTG	2	6	1098186	1098191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231923
18029	NC_011900	TCC	2	6	1098236	1098241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231923
18030	NC_011900	TCA	2	6	1098262	1098267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231923
18031	NC_011900	GAAA	2	8	1098291	1098298	75 %	0 %	25 %	0 %	221231923
18032	NC_011900	TCC	2	6	1098307	1098312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231923
18033	NC_011900	GCT	2	6	1098727	1098732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231924
18034	NC_011900	TCT	2	6	1098953	1098958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231924
18035	NC_011900	T	6	6	1098998	1099003	0 %	100 %	0 %	0 %	221231924
18036	NC_011900	AAC	2	6	1099077	1099082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231924
18037	NC_011900	CTG	2	6	1099226	1099231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231924
18038	NC_011900	TCAG	2	8	1099309	1099316	25 %	25 %	25 %	25 %	221231924
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18040	NC_011900	AAC	2	6	1099371	1099376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231924
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18042	NC_011900	ACC	2	6	1099539	1099544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231924
18043	NC_011900	ACG	2	6	1099695	1099700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231924
18044	NC_011900	ACC	2	6	1099800	1099805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231924
18045	NC_011900	ACG	2	6	1099869	1099874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231924
18046	NC_011900	TCAA	2	8	1099915	1099922	50 %	25 %	0 %	25 %	221231924
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18048	NC_011900	GCAT	2	8	1099954	1099961	25 %	25 %	25 %	25 %	221231924
18049	NC_011900	CAC	2	6	1100015	1100020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231924
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18051	NC_011900	CAC	2	6	1100027	1100032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231924
18052	NC_011900	TCG	2	6	1100263	1100268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231924
18053	NC_011900	ACA	2	6	1100290	1100295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231924
18054	NC_011900	CAA	2	6	1100297	1100302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231924
18055	NC_011900	TTCA	2	8	1100344	1100351	25 %	50 %	0 %	25 %	221231924
18056	NC_011900	GTTT	2	8	1100704	1100711	0 %	75 %	25 %	0 %	221231925
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18058	NC_011900	TACCAA	2	12	1100772	1100783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	221231925
18059	NC_011900	AAGC	2	8	1100922	1100929	50 %	0 %	25 %	25 %	221231925
18060	NC_011900	ATC	2	6	1100933	1100938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231925
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18062	NC_011900	TGA	2	6	1100958	1100963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231925
18063	NC_011900	GGAAT	2	10	1101015	1101024	40 %	20 %	40 %	0 %	221231925
18064	NC_011900	CTA	2	6	1101026	1101031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231925
18065	NC_011900	CTG	2	6	1101052	1101057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231925
18066	NC_011900	ATC	2	6	1101074	1101079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231925
18067	NC_011900	ATC	2	6	1101127	1101132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231925
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18088	NC_011900	ACGATT	2	12	1102027	1102038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221231927
18089	NC_011900	TC	3	6	1102058	1102063	0 %	50 %	0 %	50 %	221231927
18090	NC_011900	CTTA	2	8	1102136	1102143	25 %	50 %	0 %	25 %	221231927
18091	NC_011900	TGA	2	6	1102154	1102159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231927
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18099	NC_011900	AT	3	6	1102909	1102914	50 %	50 %	0 %	0 %	221231928
18100	NC_011900	TTTTG	2	10	1102994	1103003	0 %	80 %	20 %	0 %	221231928
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18117	NC_011900	TCA	2	6	1104032	1104037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231930
18118	NC_011900	ACCAG	2	10	1104067	1104076	40 %	0 %	20 %	40 %	221231930
18119	NC_011900	CAC	2	6	1104106	1104111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231930
18120	NC_011900	ATT	2	6	1104250	1104255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231931
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18122	NC_011900	T	6	6	1104307	1104312	0 %	100 %	0 %	0 %	221231931
18123	NC_011900	T	6	6	1104337	1104342	0 %	100 %	0 %	0 %	221231931
18124	NC_011900	GC	3	6	1104357	1104362	0 %	0 %	50 %	50 %	221231931
18125	NC_011900	GCT	2	6	1104420	1104425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231931
18126	NC_011900	ATA	2	6	1104455	1104460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231931
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18128	NC_011900	TCA	2	6	1104507	1104512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231931
18129	NC_011900	ACCA	2	8	1104536	1104543	50 %	0 %	0 %	50 %	221231931
18130	NC_011900	CCAT	2	8	1104552	1104559	25 %	25 %	0 %	50 %	221231931
18131	NC_011900	CAAT	2	8	1104562	1104569	50 %	25 %	0 %	25 %	221231931
18132	NC_011900	TCA	2	6	1104648	1104653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231931
18133	NC_011900	CT	3	6	1104659	1104664	0 %	50 %	0 %	50 %	221231931
18134	NC_011900	TTGAT	2	10	1104718	1104727	20 %	60 %	20 %	0 %	221231931
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18136	NC_011900	TCT	2	6	1104754	1104759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231932
18137	NC_011900	ATA	2	6	1104801	1104806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231932
18138	NC_011900	CTT	2	6	1104827	1104832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231932
18139	NC_011900	T	6	6	1104831	1104836	0 %	100 %	0 %	0 %	221231932
18140	NC_011900	TCA	2	6	1104860	1104865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231932
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18142	NC_011900	CTAT	2	8	1104931	1104938	25 %	50 %	0 %	25 %	221231932
18143	NC_011900	T	6	6	1104981	1104986	0 %	100 %	0 %	0 %	221231932
18144	NC_011900	TCCA	2	8	1105009	1105016	25 %	25 %	0 %	50 %	221231932
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18148	NC_011900	ATA	2	6	1105164	1105169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231932
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18152	NC_011900	TAAA	2	8	1105257	1105264	75 %	25 %	0 %	0 %	221231932
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18184	NC_011900	TAG	2	6	1106974	1106979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231933
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18220	NC_011900	AT	3	6	1109272	1109277	50 %	50 %	0 %	0 %	221231935
18221	NC_011900	TTC	2	6	1109290	1109295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231935
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18223	NC_011900	TGC	2	6	1109416	1109421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231935
18224	NC_011900	TGTC	2	8	1109469	1109476	0 %	50 %	25 %	25 %	221231935
18225	NC_011900	TAC	2	6	1109516	1109521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231935
18226	NC_011900	CTT	2	6	1109565	1109570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231935
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18229	NC_011900	A	6	6	1109828	1109833	100 %	0 %	0 %	0 %	221231935
18230	NC_011900	CAA	2	6	1109863	1109868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231935
18231	NC_011900	CTAG	2	8	1109924	1109931	25 %	25 %	25 %	25 %	221231935
18232	NC_011900	CAA	2	6	1109949	1109954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231935
18233	NC_011900	AAC	2	6	1109968	1109973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231935
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18235	NC_011900	ACAA	2	8	1110000	1110007	75 %	0 %	0 %	25 %	221231935
18236	NC_011900	TGA	2	6	1110165	1110170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231935
18237	NC_011900	TCT	2	6	1110186	1110191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231935
18238	NC_011900	CAA	2	6	1110227	1110232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231935
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18240	NC_011900	GCT	2	6	1110284	1110289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231935
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18347	NC_011900	AAT	2	6	1115798	1115803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231940
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18349	NC_011900	AG	3	6	1115874	1115879	50 %	0 %	50 %	0 %	221231940
18350	NC_011900	CTA	2	6	1115943	1115948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231940
18351	NC_011900	TAACT	2	10	1115985	1115994	40 %	40 %	0 %	20 %	221231941
18352	NC_011900	ATAG	2	8	1116036	1116043	50 %	25 %	25 %	0 %	221231941
18353	NC_011900	ACG	2	6	1116079	1116084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231941
18354	NC_011900	AAT	2	6	1116201	1116206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221231941
18355	NC_011900	GCAAG	2	10	1116215	1116224	40 %	0 %	40 %	20 %	221231941
18356	NC_011900	CAC	3	9	1116242	1116250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231941
18357	NC_011900	TCA	2	6	1116433	1116438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231941
18358	NC_011900	ATC	2	6	1116486	1116491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231941
18359	NC_011900	CTT	2	6	1116527	1116532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18360	NC_011900	CTT	2	6	1116599	1116604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18361	NC_011900	TCTT	2	8	1116721	1116728	0 %	75 %	0 %	25 %	221231941
18362	NC_011900	TTGC	2	8	1116744	1116751	0 %	50 %	25 %	25 %	221231941
18363	NC_011900	CTC	2	6	1116759	1116764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231941
18364	NC_011900	CTG	2	6	1116768	1116773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231941
18365	NC_011900	ATC	2	6	1116801	1116806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231941
18366	NC_011900	ATC	2	6	1116822	1116827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231941
18367	NC_011900	TTG	2	6	1116855	1116860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231941
18368	NC_011900	CTT	2	6	1116884	1116889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18369	NC_011900	CTG	2	6	1116894	1116899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231941
18370	NC_011900	TCT	2	6	1116964	1116969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18371	NC_011900	GCA	2	6	1117174	1117179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221231941
18372	NC_011900	CTT	2	6	1117244	1117249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18373	NC_011900	CATCT	2	10	1117383	1117392	20 %	40 %	0 %	40 %	221231941
18374	NC_011900	CTT	2	6	1117412	1117417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18375	NC_011900	GCTT	2	8	1117428	1117435	0 %	50 %	25 %	25 %	221231941
18376	NC_011900	CTT	3	9	1117433	1117441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
18377	NC_011900	TGA	2	6	1117478	1117483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231941
18378	NC_011900	TGT	2	6	1117490	1117495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231941
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18381	NC_011900	CGT	2	6	1117626	1117631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221231941
18382	NC_011900	TAAC	2	8	1117676	1117683	50 %	25 %	0 %	25 %	221231941
18383	NC_011900	GAA	2	6	1117772	1117777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231941
18384	NC_011900	TCT	2	6	1117840	1117845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231941
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18387	NC_011900	ACTG	2	8	1117923	1117930	25 %	25 %	25 %	25 %	221231941
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18389	NC_011900	TTG	2	6	1118079	1118084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231941
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18403	NC_011900	TAAA	2	8	1118817	1118824	75 %	25 %	0 %	0 %	221231941
18404	NC_011900	GCTT	2	8	1118872	1118879	0 %	50 %	25 %	25 %	221231941
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18407	NC_011900	TTTCT	2	10	1118969	1118978	0 %	80 %	0 %	20 %	221231941
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18413	NC_011900	CAT	2	6	1119233	1119238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231941
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18417	NC_011900	CAA	2	6	1119589	1119594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221231942
18418	NC_011900	ATC	2	6	1119714	1119719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231942
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18420	NC_011900	AAG	2	6	1119797	1119802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231942
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18424	NC_011900	CTC	2	6	1119932	1119937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231942
18425	NC_011900	T	6	6	1119992	1119997	0 %	100 %	0 %	0 %	221231942
18426	NC_011900	TG	3	6	1120060	1120065	0 %	50 %	50 %	0 %	221231942
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18428	NC_011900	ATCATG	2	12	1120802	1120813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	221231943
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18432	NC_011900	TAG	2	6	1120992	1120997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231943
18433	NC_011900	TTCT	2	8	1121077	1121084	0 %	75 %	0 %	25 %	221231943
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18435	NC_011900	TCA	2	6	1121270	1121275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231943
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18442	NC_011900	ATTC	2	8	1122231	1122238	25 %	50 %	0 %	25 %	221231944
18443	NC_011900	GA	3	6	1122316	1122321	50 %	0 %	50 %	0 %	221231944
18444	NC_011900	CT	3	6	1122414	1122419	0 %	50 %	0 %	50 %	221231944
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18447	NC_011900	CT	3	6	1122598	1122603	0 %	50 %	0 %	50 %	221231944
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18450	NC_011900	TCA	2	6	1122688	1122693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231944
18451	NC_011900	CT	3	6	1122852	1122857	0 %	50 %	0 %	50 %	221231944
18452	NC_011900	AAG	2	6	1122882	1122887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221231944
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18458	NC_011900	TCA	2	6	1123046	1123051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231945
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18465	NC_011900	GAT	2	6	1123363	1123368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18466	NC_011900	TCA	2	6	1123397	1123402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231945
18467	NC_011900	CAC	2	6	1123446	1123451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231945
18468	NC_011900	GATT	2	8	1123509	1123516	25 %	50 %	25 %	0 %	221231945
18469	NC_011900	GAT	2	6	1123522	1123527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18470	NC_011900	CCA	2	6	1123619	1123624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231945
18471	NC_011900	GTA	2	6	1123630	1123635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18472	NC_011900	TTA	2	6	1123643	1123648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231945
18473	NC_011900	CTA	2	6	1123739	1123744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231945
18474	NC_011900	TAAG	2	8	1123753	1123760	50 %	25 %	25 %	0 %	221231945
18475	NC_011900	TA	3	6	1123771	1123776	50 %	50 %	0 %	0 %	221231945
18476	NC_011900	TTC	2	6	1123783	1123788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231945
18477	NC_011900	TA	3	6	1123798	1123803	50 %	50 %	0 %	0 %	221231945
18478	NC_011900	TAAG	2	8	1123807	1123814	50 %	25 %	25 %	0 %	221231945
18479	NC_011900	TCA	2	6	1123826	1123831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221231945
18480	NC_011900	TCC	2	6	1123843	1123848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221231945
18481	NC_011900	ATG	2	6	1123974	1123979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18482	NC_011900	CAC	2	6	1124073	1124078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221231945
18483	NC_011900	TGA	2	6	1124120	1124125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18484	NC_011900	TGA	2	6	1124137	1124142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221231945
18485	NC_011900	ATT	2	6	1124255	1124260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231945
18486	NC_011900	TTCT	2	8	1124320	1124327	0 %	75 %	0 %	25 %	221231945
18487	NC_011900	AAAG	2	8	1124347	1124354	75 %	0 %	25 %	0 %	221231945
18488	NC_011900	TTG	2	6	1124418	1124423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221231945
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18490	NC_011900	ATT	2	6	1124536	1124541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221231945
18491	NC_011900	TTTG	2	8	1124557	1124564	0 %	75 %	25 %	0 %	221231945
18492	NC_011900	T	7	7	1124565	1124571	0 %	100 %	0 %	0 %	221231945
18493	NC_011900	AATA	2	8	1124577	1124584	75 %	25 %	0 %	0 %	221231945
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18495	NC_011900	ATTT	2	8	1124664	1124671	25 %	75 %	0 %	0 %	221231945
18496	NC_011900	CTT	2	6	1124748	1124753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231945
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18498	NC_011900	CTT	2	6	1124802	1124807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231945
18499	NC_011900	TCT	2	6	1124834	1124839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221231945
18500	NC_011900	CTTTT	2	10	1124847	1124856	0 %	80 %	0 %	20 %	221231945

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