MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302

Total Repeats: 1066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011668	AC	3	6	439	444	50 %	0 %	0 %	50 %	217980265
2	NC_011668	CAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980265
3	NC_011668	CAAAA	2	10	540	549	80 %	0 %	0 %	20 %	217980265
4	NC_011668	A	6	6	571	576	100 %	0 %	0 %	0 %	217980265
5	NC_011668	TAA	2	6	600	605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217980265
6	NC_011668	ATT	2	6	607	612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217980265
7	NC_011668	GT	3	6	643	648	0 %	50 %	50 %	0 %	217980265
8	NC_011668	ATC	2	6	660	665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980265
9	NC_011668	A	6	6	700	705	100 %	0 %	0 %	0 %	217980265
10	NC_011668	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217980265
11	NC_011668	GGAAAA	2	12	861	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980265
12	NC_011668	GAA	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980265
13	NC_011668	T	7	7	1013	1019	0 %	100 %	0 %	0 %	217980265
14	NC_011668	AC	3	6	1156	1161	50 %	0 %	0 %	50 %	217980265
15	NC_011668	TAGA	2	8	1184	1191	50 %	25 %	25 %	0 %	217980265
16	NC_011668	GAT	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980265
17	NC_011668	T	6	6	1260	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	217980265
18	NC_011668	TA	3	6	1309	1314	50 %	50 %	0 %	0 %	217980265
19	NC_011668	GCA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980265
20	NC_011668	GCC	2	6	1593	1598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980266
21	NC_011668	ACC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980266
22	NC_011668	CTG	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980266
23	NC_011668	CGA	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980266
24	NC_011668	A	6	6	1942	1947	100 %	0 %	0 %	0 %	217980266
25	NC_011668	T	7	7	1949	1955	0 %	100 %	0 %	0 %	217980266
26	NC_011668	CAGC	2	8	1981	1988	25 %	0 %	25 %	50 %	217980266
27	NC_011668	TCA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980266
28	NC_011668	CCT	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980266
29	NC_011668	ACG	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980266
30	NC_011668	CCA	2	6	2175	2180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980266
31	NC_011668	TGAC	2	8	2220	2227	25 %	25 %	25 %	25 %	217980266
32	NC_011668	CAAT	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	217980266
33	NC_011668	TCCACT	2	12	2272	2283	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	217980266
34	NC_011668	CAA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980266
35	NC_011668	TGC	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980266
36	NC_011668	GCT	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980266
37	NC_011668	TGC	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980266
38	NC_011668	TGT	2	6	2393	2398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980266
39	NC_011668	GCT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980266
40	NC_011668	AAT	2	6	3406	3411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217980267
41	NC_011668	TCC	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217980267
42	NC_011668	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980267
43	NC_011668	TTC	2	6	3600	3605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980267
44	NC_011668	CAT	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980267
45	NC_011668	ACT	2	6	3645	3650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980267
46	NC_011668	GAA	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980267
47	NC_011668	CAATA	2	10	3671	3680	60 %	20 %	0 %	20 %	217980267
48	NC_011668	ATA	3	9	3678	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217980267
49	NC_011668	TGT	2	6	3700	3705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980267
50	NC_011668	CAT	2	6	3708	3713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980267
51	NC_011668	ACA	2	6	3748	3753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217980267
52	NC_011668	TTTA	2	8	3824	3831	25 %	75 %	0 %	0 %	217980268
53	NC_011668	T	6	6	3837	3842	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
54	NC_011668	TTTAT	2	10	3941	3950	20 %	80 %	0 %	0 %	217980268
55	NC_011668	TCG	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
56	NC_011668	T	6	6	3989	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
57	NC_011668	AAT	2	6	4135	4140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217980268
58	NC_011668	ATT	3	9	4276	4284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217980268
59	NC_011668	ATT	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217980268
60	NC_011668	TCG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
61	NC_011668	TTAT	2	8	4430	4437	25 %	75 %	0 %	0 %	217980268
62	NC_011668	GTAA	2	8	4474	4481	50 %	25 %	25 %	0 %	217980268
63	NC_011668	TGC	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
64	NC_011668	CTTG	2	8	4611	4618	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
65	NC_011668	GAGT	2	8	4636	4643	25 %	25 %	50 %	0 %	217980268
66	NC_011668	CG	4	8	4678	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
67	NC_011668	TCA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980268
68	NC_011668	T	6	6	4742	4747	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
69	NC_011668	GTTC	2	8	4767	4774	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
70	NC_011668	CAT	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980268
71	NC_011668	T	6	6	5196	5201	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
72	NC_011668	TGA	2	6	5214	5219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
73	NC_011668	CG	3	6	5257	5262	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
74	NC_011668	GTTA	2	8	5269	5276	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
75	NC_011668	CGG	2	6	5337	5342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
76	NC_011668	TG	3	6	5401	5406	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
77	NC_011668	TTG	2	6	5465	5470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
78	NC_011668	GAA	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217980268
79	NC_011668	GTC	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
80	NC_011668	CTG	2	6	5698	5703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
81	NC_011668	T	6	6	5787	5792	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
82	NC_011668	GTC	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
83	NC_011668	TTG	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
84	NC_011668	TGAT	2	8	5999	6006	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
85	NC_011668	CGT	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
86	NC_011668	TTG	2	6	6079	6084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
87	NC_011668	AGT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
88	NC_011668	CTGTT	2	10	6152	6161	0 %	60 %	20 %	20 %	217980268
89	NC_011668	ATTG	2	8	6190	6197	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
90	NC_011668	CTT	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980268
91	NC_011668	GC	5	10	6275	6284	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
92	NC_011668	TGT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
93	NC_011668	TCAA	2	8	6293	6300	50 %	25 %	0 %	25 %	217980268
94	NC_011668	CGG	2	6	6462	6467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
95	NC_011668	GT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
96	NC_011668	TG	3	6	6515	6520	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
97	NC_011668	TACCCG	2	12	6579	6590	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	217980268
98	NC_011668	TGG	3	9	6621	6629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980268
99	NC_011668	TTTTGA	2	12	6668	6679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217980268
100	NC_011668	GCG	2	6	6692	6697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
101	NC_011668	GTCT	2	8	6744	6751	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
102	NC_011668	CGT	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
103	NC_011668	GC	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
104	NC_011668	TGA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
105	NC_011668	CTT	2	6	6966	6971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980268
106	NC_011668	TGC	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
107	NC_011668	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
108	NC_011668	T	6	6	7164	7169	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
109	NC_011668	TCA	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980268
110	NC_011668	TTG	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
111	NC_011668	AT	3	6	7206	7211	50 %	50 %	0 %	0 %	217980268
112	NC_011668	GTG	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980268
113	NC_011668	GCG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
114	NC_011668	GCTGT	2	10	7375	7384	0 %	40 %	40 %	20 %	217980268
115	NC_011668	TTTG	2	8	7443	7450	0 %	75 %	25 %	0 %	217980268
116	NC_011668	ATG	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
117	NC_011668	TGC	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
118	NC_011668	GTT	2	6	7612	7617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
119	NC_011668	TGC	2	6	7646	7651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
120	NC_011668	CGA	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217980268
121	NC_011668	TGC	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
122	NC_011668	GCT	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
123	NC_011668	GT	3	6	7865	7870	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
124	NC_011668	TTTG	2	8	7959	7966	0 %	75 %	25 %	0 %	217980268
125	NC_011668	T	6	6	7999	8004	0 %	100 %	0 %	0 %	217980268
126	NC_011668	CTTG	2	8	8037	8044	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
127	NC_011668	GTT	2	6	8167	8172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980268
128	NC_011668	GCT	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
129	NC_011668	CAC	2	6	8239	8244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980268
130	NC_011668	ATG	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
131	NC_011668	CTTT	2	8	8427	8434	0 %	75 %	0 %	25 %	217980268
132	NC_011668	CT	3	6	8516	8521	0 %	50 %	0 %	50 %	217980268
133	NC_011668	GCG	2	6	8549	8554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
134	NC_011668	CG	3	6	8655	8660	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
135	NC_011668	GCG	2	6	8756	8761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217980268
136	NC_011668	CGC	2	6	8929	8934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980268
137	NC_011668	CAAA	2	8	9030	9037	75 %	0 %	0 %	25 %	217980268
138	NC_011668	TTA	2	6	9038	9043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217980268
139	NC_011668	GC	3	6	9082	9087	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
140	NC_011668	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
141	NC_011668	TGA	2	6	9153	9158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
142	NC_011668	GCC	2	6	9160	9165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217980268
143	NC_011668	GCT	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
144	NC_011668	GC	4	8	9189	9196	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
145	NC_011668	GTGA	2	8	9230	9237	25 %	25 %	50 %	0 %	217980268
146	NC_011668	TCT	2	6	9257	9262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980268
147	NC_011668	GGTT	2	8	9339	9346	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
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151	NC_011668	CTT	2	6	9669	9674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217980268
152	NC_011668	GCT	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980268
153	NC_011668	TTCTT	2	10	9719	9728	0 %	80 %	0 %	20 %	217980268
154	NC_011668	GTA	2	6	9736	9741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980268
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158	NC_011668	CA	3	6	9984	9989	50 %	0 %	0 %	50 %	217980269
159	NC_011668	CCAGTG	2	12	10002	10013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	217980269
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171	NC_011668	T	6	6	10832	10837	0 %	100 %	0 %	0 %	217980272
172	NC_011668	T	6	6	10915	10920	0 %	100 %	0 %	0 %	217980272
173	NC_011668	TGCGC	2	10	10936	10945	0 %	20 %	40 %	40 %	217980272
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178	NC_011668	T	6	6	11447	11452	0 %	100 %	0 %	0 %	217980272
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256	NC_011668	ATC	2	6	15863	15868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980274
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259	NC_011668	GGT	2	6	16016	16021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217980274
260	NC_011668	GCAA	2	8	16029	16036	50 %	0 %	25 %	25 %	217980274
261	NC_011668	TGA	2	6	16090	16095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217980274
262	NC_011668	CCA	2	6	16114	16119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217980274
263	NC_011668	TCA	2	6	16189	16194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217980274
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265	NC_011668	TGC	2	6	16340	16345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217980275
266	NC_011668	TTG	2	6	16442	16447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980275
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393	NC_011668	TGT	2	6	22434	22439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217980281
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400	NC_011668	G	6	6	23148	23153	0 %	0 %	100 %	0 %	217980282
401	NC_011668	CG	3	6	23202	23207	0 %	0 %	50 %	50 %	217980282
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