MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22303

Total Repeats: 957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011665	TCA	2	6	1140	1145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975698
2	NC_011665	TGC	2	6	1152	1157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975698
3	NC_011665	TTA	2	6	1207	1212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975698
4	NC_011665	GCA	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975698
5	NC_011665	GAT	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975698
6	NC_011665	T	6	6	1370	1375	0 %	100 %	0 %	0 %	217975698
7	NC_011665	TCG	2	6	1396	1401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975698
8	NC_011665	A	6	6	1439	1444	100 %	0 %	0 %	0 %	217975698
9	NC_011665	TAT	2	6	1559	1564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975699
10	NC_011665	TCAG	2	8	1598	1605	25 %	25 %	25 %	25 %	217975699
11	NC_011665	AAG	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975699
12	NC_011665	TAA	2	6	1797	1802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975699
13	NC_011665	A	7	7	1852	1858	100 %	0 %	0 %	0 %	217975699
14	NC_011665	A	8	8	1915	1922	100 %	0 %	0 %	0 %	217975699
15	NC_011665	A	7	7	1981	1987	100 %	0 %	0 %	0 %	217975699
16	NC_011665	CAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975700
17	NC_011665	ATC	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975700
18	NC_011665	CTG	2	6	2811	2816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975700
19	NC_011665	GTC	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975700
20	NC_011665	GAA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975700
21	NC_011665	AGG	2	6	3096	3101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217975700
22	NC_011665	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975700
23	NC_011665	TGG	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975700
24	NC_011665	AG	3	6	3262	3267	50 %	0 %	50 %	0 %	217975700
25	NC_011665	CA	3	6	3304	3309	50 %	0 %	0 %	50 %	217975700
26	NC_011665	AAG	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975700
27	NC_011665	A	6	6	3436	3441	100 %	0 %	0 %	0 %	217975700
28	NC_011665	CAA	2	6	3484	3489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975700
29	NC_011665	TGA	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975700
30	NC_011665	GTC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975700
31	NC_011665	CCG	2	6	3598	3603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975700
32	NC_011665	TAT	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975700
33	NC_011665	GAG	2	6	3623	3628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217975700
34	NC_011665	TTG	2	6	3750	3755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975700
35	NC_011665	CA	3	6	3815	3820	50 %	0 %	0 %	50 %	217975700
36	NC_011665	ATC	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975700
37	NC_011665	TCA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975700
38	NC_011665	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975700
39	NC_011665	A	6	6	3902	3907	100 %	0 %	0 %	0 %	217975700
40	NC_011665	GGTTA	2	10	4024	4033	20 %	40 %	40 %	0 %	217975700
41	NC_011665	T	6	6	4138	4143	0 %	100 %	0 %	0 %	217975700
42	NC_011665	CAG	2	6	4202	4207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975700
43	NC_011665	CTT	2	6	4251	4256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975701
44	NC_011665	AG	3	6	4380	4385	50 %	0 %	50 %	0 %	217975701
45	NC_011665	ATA	2	6	4531	4536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975701
46	NC_011665	GCA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975701
47	NC_011665	AGA	2	6	4670	4675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975701
48	NC_011665	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975701
49	NC_011665	A	6	6	4750	4755	100 %	0 %	0 %	0 %	217975701
50	NC_011665	AGA	2	6	4760	4765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975701
51	NC_011665	ATC	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975701
52	NC_011665	TGA	2	6	4873	4878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975701
53	NC_011665	CCA	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975701
54	NC_011665	TGCAA	2	10	4921	4930	40 %	20 %	20 %	20 %	217975701
55	NC_011665	AAG	2	6	4951	4956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975701
56	NC_011665	AAGTA	2	10	5483	5492	60 %	20 %	20 %	0 %	217975702
57	NC_011665	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975702
58	NC_011665	AAG	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975702
59	NC_011665	ATC	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975702
60	NC_011665	A	8	8	5683	5690	100 %	0 %	0 %	0 %	217975702
61	NC_011665	TGG	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975702
62	NC_011665	GGATG	2	10	5731	5740	20 %	20 %	60 %	0 %	217975702
63	NC_011665	TTG	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975702
64	NC_011665	GGTA	2	8	6395	6402	25 %	25 %	50 %	0 %	217975703
65	NC_011665	TTG	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975703
66	NC_011665	CAC	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975703
67	NC_011665	AC	3	6	6601	6606	50 %	0 %	0 %	50 %	217975703
68	NC_011665	GTG	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975703
69	NC_011665	ACCA	2	8	6631	6638	50 %	0 %	0 %	50 %	217975703
70	NC_011665	CTAAA	2	10	6676	6685	60 %	20 %	0 %	20 %	217975703
71	NC_011665	GTG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975703
72	NC_011665	AG	3	6	6747	6752	50 %	0 %	50 %	0 %	217975703
73	NC_011665	CTAAAA	2	12	6757	6768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217975703
74	NC_011665	CAATT	2	10	6784	6793	40 %	40 %	0 %	20 %	217975703
75	NC_011665	ATT	2	6	6905	6910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975703
76	NC_011665	ACA	2	6	6963	6968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975704
77	NC_011665	CGC	2	6	7014	7019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975704
78	NC_011665	A	6	6	7037	7042	100 %	0 %	0 %	0 %	217975704
79	NC_011665	AAG	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975704
80	NC_011665	CAAT	2	8	7176	7183	50 %	25 %	0 %	25 %	217975704
81	NC_011665	TTAT	2	8	7190	7197	25 %	75 %	0 %	0 %	217975704
82	NC_011665	TAGTGA	2	12	7213	7224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975704
83	NC_011665	CTA	2	6	7241	7246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975704
84	NC_011665	TAG	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975704
85	NC_011665	GAA	2	6	7265	7270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975704
86	NC_011665	ACA	2	6	7273	7278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975704
87	NC_011665	ATTA	2	8	8518	8525	50 %	50 %	0 %	0 %	217975705
88	NC_011665	ATCG	2	8	8538	8545	25 %	25 %	25 %	25 %	217975705
89	NC_011665	T	6	6	8588	8593	0 %	100 %	0 %	0 %	217975705
90	NC_011665	AAT	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975705
91	NC_011665	GATAC	2	10	8784	8793	40 %	20 %	20 %	20 %	217975705
92	NC_011665	TGA	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975705
93	NC_011665	T	6	6	8869	8874	0 %	100 %	0 %	0 %	217975705
94	NC_011665	TAT	2	6	8887	8892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975705
95	NC_011665	CTG	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975705
96	NC_011665	TCA	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975705
97	NC_011665	CCA	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
98	NC_011665	GGT	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975705
99	NC_011665	GC	3	6	9179	9184	0 %	0 %	50 %	50 %	217975705
100	NC_011665	CTT	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975705
101	NC_011665	CAC	2	6	9260	9265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
102	NC_011665	TGT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975705
103	NC_011665	CAG	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975705
104	NC_011665	TCT	2	6	9472	9477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975705
105	NC_011665	TG	3	6	9491	9496	0 %	50 %	50 %	0 %	217975705
106	NC_011665	GAA	2	6	9581	9586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975705
107	NC_011665	ATG	2	6	9594	9599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975705
108	NC_011665	GCC	2	6	9653	9658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975705
109	NC_011665	CATCG	2	10	9662	9671	20 %	20 %	20 %	40 %	217975705
110	NC_011665	CCCAGC	2	12	9781	9792	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	217975705
111	NC_011665	GCT	2	6	9802	9807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975705
112	NC_011665	ACCT	2	8	9869	9876	25 %	25 %	0 %	50 %	217975705
113	NC_011665	CCA	2	6	9936	9941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
114	NC_011665	TGCACC	2	12	9942	9953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	217975705
115	NC_011665	TGT	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975705
116	NC_011665	AGCT	2	8	9986	9993	25 %	25 %	25 %	25 %	217975705
117	NC_011665	CCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
118	NC_011665	CTCCC	2	10	10014	10023	0 %	20 %	0 %	80 %	217975705
119	NC_011665	CTG	2	6	10035	10040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975705
120	NC_011665	GA	3	6	10072	10077	50 %	0 %	50 %	0 %	217975705
121	NC_011665	CAG	2	6	10148	10153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975705
122	NC_011665	ATC	2	6	10209	10214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975705
123	NC_011665	CCT	2	6	10252	10257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217975705
124	NC_011665	TGA	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975705
125	NC_011665	GCA	3	9	10318	10326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975705
126	NC_011665	CAC	2	6	10363	10368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
127	NC_011665	GGCA	2	8	10418	10425	25 %	0 %	50 %	25 %	217975705
128	NC_011665	CGC	2	6	10429	10434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975705
129	NC_011665	GTT	2	6	10463	10468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975705
130	NC_011665	AGA	2	6	10558	10563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975705
131	NC_011665	TCG	2	6	10564	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975705
132	NC_011665	AGCGCA	2	12	10588	10599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975705
133	NC_011665	CCA	2	6	10675	10680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975705
134	NC_011665	CTG	3	9	10749	10757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975705
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136	NC_011665	GGT	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975705
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257	NC_011665	CAA	2	6	18745	18750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975713
258	NC_011665	GAA	2	6	18763	18768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975713
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262	NC_011665	TGC	2	6	18882	18887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975713
263	NC_011665	TTG	2	6	18917	18922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975713
264	NC_011665	TCG	2	6	18962	18967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975713
265	NC_011665	T	6	6	19108	19113	0 %	100 %	0 %	0 %	217975714
266	NC_011665	TTA	2	6	19147	19152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975714
267	NC_011665	GATG	2	8	19161	19168	25 %	25 %	50 %	0 %	217975714
268	NC_011665	T	6	6	19189	19194	0 %	100 %	0 %	0 %	217975714
269	NC_011665	ATG	2	6	19207	19212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975714
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271	NC_011665	AC	3	6	19482	19487	50 %	0 %	0 %	50 %	217975715
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276	NC_011665	CG	3	6	19895	19900	0 %	0 %	50 %	50 %	217975715
277	NC_011665	CAT	2	6	19924	19929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975715
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280	NC_011665	GATT	2	8	20172	20179	25 %	50 %	25 %	0 %	217975716
281	NC_011665	GC	3	6	20233	20238	0 %	0 %	50 %	50 %	217975716
282	NC_011665	TCAATC	2	12	20240	20251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975716
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284	NC_011665	TCA	2	6	20309	20314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975716
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288	NC_011665	ATG	2	6	20495	20500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975716
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293	NC_011665	GCA	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975716
294	NC_011665	CAC	2	6	20697	20702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975716
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296	NC_011665	CAC	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975716
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301	NC_011665	A	6	6	20889	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	217975717
302	NC_011665	TGAT	2	8	21025	21032	25 %	50 %	25 %	0 %	217975717
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