MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 chromosome

Total Repeats: 75011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011663	CTTTAG	2	12	1340273	1340284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217972326
19002	NC_011663	CTG	2	6	1340291	1340296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972326
19003	NC_011663	CGG	2	6	1340451	1340456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972326
19004	NC_011663	TCCAA	2	10	1340625	1340634	40 %	20 %	0 %	40 %	217972326
19005	NC_011663	CTT	2	6	1340832	1340837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217972326
19006	NC_011663	CGG	2	6	1340931	1340936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972326
19007	NC_011663	TCT	2	6	1340942	1340947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217972326
19008	NC_011663	TTG	2	6	1341038	1341043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972326
19009	NC_011663	TAT	2	6	1341514	1341519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972327
19010	NC_011663	A	7	7	1341529	1341535	100 %	0 %	0 %	0 %	217972327
19011	NC_011663	GCA	2	6	1341536	1341541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972327
19012	NC_011663	ATG	2	6	1341579	1341584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972327
19013	NC_011663	CATTGC	2	12	1341763	1341774	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217972327
19014	NC_011663	CGA	2	6	1341811	1341816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972327
19015	NC_011663	AAG	2	6	1341894	1341899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972327
19016	NC_011663	TCA	2	6	1341924	1341929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972327
19017	NC_011663	CCG	2	6	1341964	1341969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217972327
19018	NC_011663	GGT	2	6	1342115	1342120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217972327
19019	NC_011663	TGC	2	6	1342129	1342134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972327
19020	NC_011663	TTA	2	6	1342223	1342228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972327
19021	NC_011663	TGC	2	6	1342236	1342241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972327
19022	NC_011663	AC	3	6	1342242	1342247	50 %	0 %	0 %	50 %	217972327
19023	NC_011663	ATT	2	6	1342491	1342496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972328
19024	NC_011663	A	6	6	1342500	1342505	100 %	0 %	0 %	0 %	217972328
19025	NC_011663	GAA	2	6	1342530	1342535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972328
19026	NC_011663	ACC	2	6	1342560	1342565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217972328
19027	NC_011663	CGC	2	6	1342589	1342594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217972328
19028	NC_011663	TGG	2	6	1342733	1342738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217972328
19029	NC_011663	ATT	2	6	1342929	1342934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972328
19030	NC_011663	TTCTA	2	10	1342971	1342980	20 %	60 %	0 %	20 %	217972328
19031	NC_011663	ATA	2	6	1342987	1342992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217972328
19032	NC_011663	TCA	2	6	1343017	1343022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972328
19033	NC_011663	GCG	2	6	1343092	1343097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972328
19034	NC_011663	GAA	2	6	1343124	1343129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972328
19035	NC_011663	ACG	2	6	1343175	1343180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972328
19036	NC_011663	TTAC	2	8	1343184	1343191	25 %	50 %	0 %	25 %	217972328
19037	NC_011663	AAG	2	6	1343242	1343247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972328
19038	NC_011663	TGC	2	6	1343320	1343325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972328
19039	NC_011663	GCAA	2	8	1343340	1343347	50 %	0 %	25 %	25 %	217972328
19040	NC_011663	TGG	2	6	1343432	1343437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217972328
19041	NC_011663	TTG	2	6	1343449	1343454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972328
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19043	NC_011663	GGC	2	6	1343574	1343579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972328
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19046	NC_011663	A	6	6	1343758	1343763	100 %	0 %	0 %	0 %	217972328
19047	NC_011663	ATT	2	6	1343826	1343831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972329
19048	NC_011663	ATG	2	6	1343832	1343837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972329
19049	NC_011663	CTG	2	6	1343863	1343868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972329
19050	NC_011663	GCA	2	6	1343871	1343876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972329
19051	NC_011663	ACCTA	2	10	1343972	1343981	40 %	20 %	0 %	40 %	217972329
19052	NC_011663	GC	3	6	1343982	1343987	0 %	0 %	50 %	50 %	217972329
19053	NC_011663	TTAGGC	2	12	1343988	1343999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	217972329
19054	NC_011663	GCG	2	6	1344003	1344008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972329
19055	NC_011663	GGCG	2	8	1344128	1344135	0 %	0 %	75 %	25 %	217972329
19056	NC_011663	TGGA	2	8	1344226	1344233	25 %	25 %	50 %	0 %	217972329
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19058	NC_011663	CTG	2	6	1344325	1344330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972329
19059	NC_011663	GAA	2	6	1344357	1344362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972329
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19063	NC_011663	GCGG	2	8	1344552	1344559	0 %	0 %	75 %	25 %	217972329
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19067	NC_011663	CTG	2	6	1344825	1344830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972329
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19071	NC_011663	AT	3	6	1345200	1345205	50 %	50 %	0 %	0 %	217972330
19072	NC_011663	CTAT	2	8	1345331	1345338	25 %	50 %	0 %	25 %	217972330
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19074	NC_011663	ACGTG	2	10	1345422	1345431	20 %	20 %	40 %	20 %	217972330
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19083	NC_011663	TAA	2	6	1346216	1346221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217972331
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19085	NC_011663	TGAG	2	8	1346262	1346269	25 %	25 %	50 %	0 %	217972331
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19089	NC_011663	TGT	3	9	1346553	1346561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972331
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19100	NC_011663	AAGGCG	2	12	1346982	1346993	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	217972331
19101	NC_011663	T	7	7	1347160	1347166	0 %	100 %	0 %	0 %	217972332
19102	NC_011663	TATC	2	8	1347269	1347276	25 %	50 %	0 %	25 %	217972332
19103	NC_011663	GCAG	2	8	1347290	1347297	25 %	0 %	50 %	25 %	217972332
19104	NC_011663	TCA	2	6	1347457	1347462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972332
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19106	NC_011663	TTA	2	6	1347495	1347500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972332
19107	NC_011663	TGA	2	6	1347542	1347547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972332
19108	NC_011663	GGCG	2	8	1347560	1347567	0 %	0 %	75 %	25 %	217972332
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19113	NC_011663	CGG	2	6	1347773	1347778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972332
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19116	NC_011663	GCG	2	6	1348053	1348058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972332
19117	NC_011663	TTA	2	6	1348334	1348339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972333
19118	NC_011663	GTGGCC	2	12	1348422	1348433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	217972333
19119	NC_011663	GTT	2	6	1348437	1348442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972333
19120	NC_011663	ATCG	2	8	1348511	1348518	25 %	25 %	25 %	25 %	217972333
19121	NC_011663	GCA	2	6	1348570	1348575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972333
19122	NC_011663	GAT	2	6	1348625	1348630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972333
19123	NC_011663	ACA	2	6	1348723	1348728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217972333
19124	NC_011663	CGTT	2	8	1348732	1348739	0 %	50 %	25 %	25 %	217972333
19125	NC_011663	GCT	2	6	1348741	1348746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972333
19126	NC_011663	TGC	2	6	1348858	1348863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972333
19127	NC_011663	GATC	2	8	1348942	1348949	25 %	25 %	25 %	25 %	217972333
19128	NC_011663	ACG	2	6	1348950	1348955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972333
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19136	NC_011663	AGC	2	6	1349648	1349653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972334
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19141	NC_011663	GTT	2	6	1349859	1349864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972334
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19143	NC_011663	TTTA	2	8	1349893	1349900	25 %	75 %	0 %	0 %	217972334
19144	NC_011663	G	6	6	1349919	1349924	0 %	0 %	100 %	0 %	217972334
19145	NC_011663	TAG	2	6	1350046	1350051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972334
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19151	NC_011663	CTG	2	6	1350367	1350372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972334
19152	NC_011663	CAT	2	6	1350511	1350516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972334
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19216	NC_011663	TATT	2	8	1354484	1354491	25 %	75 %	0 %	0 %	217972337
19217	NC_011663	GAT	2	6	1354595	1354600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972338
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19220	NC_011663	ATC	2	6	1354702	1354707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972338
19221	NC_011663	GCT	2	6	1354860	1354865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972338
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19223	NC_011663	TTA	2	6	1354910	1354915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972338
19224	NC_011663	ACC	2	6	1354993	1354998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217972338
19225	NC_011663	TGT	2	6	1355048	1355053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972338
19226	NC_011663	GCA	2	6	1355057	1355062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972338
19227	NC_011663	TGA	2	6	1355070	1355075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972338
19228	NC_011663	TTG	2	6	1355147	1355152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972338
19229	NC_011663	CTGA	2	8	1355210	1355217	25 %	25 %	25 %	25 %	217972338
19230	NC_011663	CAT	2	6	1355232	1355237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972338
19231	NC_011663	GTT	2	6	1355271	1355276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217972338
19232	NC_011663	TAA	2	6	1355288	1355293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217972338
19233	NC_011663	CTGC	2	8	1355294	1355301	0 %	25 %	25 %	50 %	217972338
19234	NC_011663	AGT	2	6	1355439	1355444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972338
19235	NC_011663	GCT	2	6	1355487	1355492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972338
19236	NC_011663	CAT	2	6	1355584	1355589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972338
19237	NC_011663	TG	3	6	1355645	1355650	0 %	50 %	50 %	0 %	217972339
19238	NC_011663	CTTTAT	2	12	1355655	1355666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217972339
19239	NC_011663	GT	3	6	1355706	1355711	0 %	50 %	50 %	0 %	217972339
19240	NC_011663	TGC	2	6	1355727	1355732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972339
19241	NC_011663	GCG	2	6	1355816	1355821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217972339
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19244	NC_011663	ATC	2	6	1356014	1356019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217972339
19245	NC_011663	CGC	2	6	1356106	1356111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217972339
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19247	NC_011663	CGA	2	6	1356229	1356234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972339
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19251	NC_011663	AAGT	2	8	1356351	1356358	50 %	25 %	25 %	0 %	217972339
19252	NC_011663	CA	3	6	1356587	1356592	50 %	0 %	0 %	50 %	217972339
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19255	NC_011663	TGG	2	6	1356693	1356698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217972339
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19261	NC_011663	GCA	3	9	1357276	1357284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972339
19262	NC_011663	TTA	2	6	1357316	1357321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217972339
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19342	NC_011663	AAG	2	6	1364047	1364052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217972344
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19345	NC_011663	ATTG	2	8	1364453	1364460	25 %	50 %	25 %	0 %	217972344
19346	NC_011663	CGC	2	6	1364559	1364564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217972344
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19348	NC_011663	TGA	2	6	1364752	1364757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217972344
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19461	NC_011663	TG	3	6	1371768	1371773	0 %	50 %	50 %	0 %	217972350
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19465	NC_011663	GGT	2	6	1372098	1372103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217972350
19466	NC_011663	TGC	2	6	1372136	1372141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217972350
19467	NC_011663	CAG	2	6	1372210	1372215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217972350
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19470	NC_011663	GCC	2	6	1372325	1372330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217972350
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19499	NC_011663	TCTT	2	8	1376970	1376977	0 %	75 %	0 %	25 %	217972353
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