MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011274	ATGA	2	8	167677	167684	50 %	25 %	25 %	0 %	205351483
3002	NC_011274	TGA	2	6	167696	167701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
3003	NC_011274	CTT	2	6	167721	167726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351483
3004	NC_011274	GCG	2	6	167735	167740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
3005	NC_011274	TGA	2	6	167793	167798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
3006	NC_011274	TGCC	2	8	168122	168129	0 %	25 %	25 %	50 %	205351484
3007	NC_011274	GC	3	6	168139	168144	0 %	0 %	50 %	50 %	205351484
3008	NC_011274	ACC	2	6	168231	168236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351484
3009	NC_011274	ATC	2	6	168255	168260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351484
3010	NC_011274	TGC	2	6	168279	168284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3011	NC_011274	TGG	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351484
3012	NC_011274	GCC	2	6	168351	168356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351484
3013	NC_011274	ATG	3	9	168402	168410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3014	NC_011274	GCA	2	6	168436	168441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3015	NC_011274	GGAT	2	8	168468	168475	25 %	25 %	50 %	0 %	205351484
3016	NC_011274	GC	3	6	168562	168567	0 %	0 %	50 %	50 %	205351484
3017	NC_011274	CAA	2	6	168713	168718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351484
3018	NC_011274	GAC	2	6	168725	168730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351484
3019	NC_011274	CTT	2	6	168739	168744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351484
3020	NC_011274	CGCC	2	8	168781	168788	0 %	0 %	25 %	75 %	205351484
3021	NC_011274	GAA	2	6	168910	168915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351484
3022	NC_011274	GAT	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3023	NC_011274	CA	3	6	169110	169115	50 %	0 %	0 %	50 %	205351484
3024	NC_011274	ACC	2	6	169179	169184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351484
3025	NC_011274	TGA	2	6	169227	169232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351484
3026	NC_011274	TGAGC	2	10	169249	169258	20 %	20 %	40 %	20 %	205351484
3027	NC_011274	TGT	2	6	169314	169319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351485
3028	NC_011274	CCAG	2	8	169355	169362	25 %	0 %	25 %	50 %	205351485
3029	NC_011274	GGCG	2	8	169385	169392	0 %	0 %	75 %	25 %	205351485
3030	NC_011274	ATG	2	6	169395	169400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351485
3031	NC_011274	TGA	2	6	169438	169443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351485
3032	NC_011274	TGA	2	6	169480	169485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351485
3033	NC_011274	CGCAT	2	10	169511	169520	20 %	20 %	20 %	40 %	205351485
3034	NC_011274	CCA	2	6	169530	169535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351485
3035	NC_011274	GAT	2	6	169658	169663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351485
3036	NC_011274	GTT	2	6	169702	169707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351485
3037	NC_011274	GA	3	6	169952	169957	50 %	0 %	50 %	0 %	205351486
3038	NC_011274	GC	3	6	169964	169969	0 %	0 %	50 %	50 %	205351486
3039	NC_011274	GC	3	6	169983	169988	0 %	0 %	50 %	50 %	205351486
3040	NC_011274	ATG	2	6	170129	170134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351486
3041	NC_011274	CGAAC	2	10	170240	170249	40 %	0 %	20 %	40 %	205351486
3042	NC_011274	GAT	2	6	170257	170262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351486
3043	NC_011274	GAT	2	6	170304	170309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351486
3044	NC_011274	GCC	3	9	170314	170322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351486
3045	NC_011274	GCCA	2	8	170398	170405	25 %	0 %	25 %	50 %	205351486
3046	NC_011274	GCG	2	6	170419	170424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351486
3047	NC_011274	CAA	2	6	170485	170490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351486
3048	NC_011274	GTTCA	2	10	170506	170515	20 %	40 %	20 %	20 %	205351486
3049	NC_011274	TTGG	2	8	170524	170531	0 %	50 %	50 %	0 %	205351486
3050	NC_011274	CAT	2	6	170574	170579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351486
3051	NC_011274	CGCC	2	8	170580	170587	0 %	0 %	25 %	75 %	205351486
3052	NC_011274	TAG	2	6	170939	170944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351487
3053	NC_011274	TGG	2	6	171008	171013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351487
3054	NC_011274	ATA	2	6	171017	171022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351487
3055	NC_011274	C	6	6	171031	171036	0 %	0 %	0 %	100 %	205351487
3056	NC_011274	ATT	2	6	171066	171071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351487
3057	NC_011274	T	7	7	171102	171108	0 %	100 %	0 %	0 %	205351487
3058	NC_011274	TCG	2	6	171150	171155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351487
3059	NC_011274	GCGT	2	8	171192	171199	0 %	25 %	50 %	25 %	205351487
3060	NC_011274	CAG	2	6	171307	171312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351487
3061	NC_011274	GCC	2	6	171316	171321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351487
3062	NC_011274	TCG	2	6	171457	171462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351487
3063	NC_011274	ATGAC	2	10	171472	171481	40 %	20 %	20 %	20 %	205351487
3064	NC_011274	TGG	2	6	171628	171633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351488
3065	NC_011274	GCT	2	6	171665	171670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351488
3066	NC_011274	TGG	2	6	171688	171693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351488
3067	NC_011274	GCG	2	6	171765	171770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351488
3068	NC_011274	GCC	2	6	171833	171838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351488
3069	NC_011274	GTT	2	6	171881	171886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351488
3070	NC_011274	TGG	2	6	171961	171966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351488
3071	NC_011274	TGGC	2	8	171996	172003	0 %	25 %	50 %	25 %	205351488
3072	NC_011274	GC	3	6	172002	172007	0 %	0 %	50 %	50 %	205351488
3073	NC_011274	CGC	2	6	172015	172020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351488
3074	NC_011274	TTC	2	6	172051	172056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351488
3075	NC_011274	CTGGA	2	10	172062	172071	20 %	20 %	40 %	20 %	205351488
3076	NC_011274	GGCG	2	8	172085	172092	0 %	0 %	75 %	25 %	205351488
3077	NC_011274	GC	3	6	172209	172214	0 %	0 %	50 %	50 %	205351488
3078	NC_011274	GCG	2	6	172248	172253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351488
3079	NC_011274	GAA	2	6	172265	172270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351488
3080	NC_011274	TGG	3	9	172282	172290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351488
3081	NC_011274	ATT	2	6	172293	172298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351488
3082	NC_011274	GGC	2	6	172439	172444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351489
3083	NC_011274	TGG	2	6	172632	172637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351489
3084	NC_011274	CG	3	6	172677	172682	0 %	0 %	50 %	50 %	205351489
3085	NC_011274	TCG	2	6	172685	172690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351489
3086	NC_011274	AGT	2	6	172719	172724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351489
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3088	NC_011274	TGA	2	6	172955	172960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351489
3089	NC_011274	GTG	2	6	172967	172972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351489
3090	NC_011274	GAC	2	6	173209	173214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351489
3091	NC_011274	CGG	2	6	173223	173228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351489
3092	NC_011274	CGG	2	6	173255	173260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351489
3093	NC_011274	AGT	2	6	173298	173303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351489
3094	NC_011274	GTT	2	6	173340	173345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351489
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3097	NC_011274	CAG	2	6	173493	173498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351490
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3099	NC_011274	ATA	2	6	173557	173562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351490
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3101	NC_011274	ATC	2	6	173730	173735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351490
3102	NC_011274	ATC	2	6	173812	173817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351490
3103	NC_011274	ATC	2	6	173941	173946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351490
3104	NC_011274	TAA	2	6	173966	173971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351490
3105	NC_011274	CGC	2	6	174027	174032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351490
3106	NC_011274	TTC	2	6	174121	174126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351490
3107	NC_011274	ATC	2	6	174129	174134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351490
3108	NC_011274	CAGAA	2	10	174181	174190	60 %	0 %	20 %	20 %	205351490
3109	NC_011274	CGC	3	9	174251	174259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351490
3110	NC_011274	CCA	2	6	174269	174274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351490
3111	NC_011274	CGC	2	6	174374	174379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351490
3112	NC_011274	CGT	2	6	174480	174485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351490
3113	NC_011274	GC	3	6	174578	174583	0 %	0 %	50 %	50 %	205351490
3114	NC_011274	AACA	2	8	174684	174691	75 %	0 %	0 %	25 %	205351490
3115	NC_011274	AAT	2	6	174708	174713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351490
3116	NC_011274	TC	3	6	174749	174754	0 %	50 %	0 %	50 %	205351490
3117	NC_011274	T	6	6	174969	174974	0 %	100 %	0 %	0 %	205351491
3118	NC_011274	AGC	2	6	175004	175009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351491
3119	NC_011274	TCA	2	6	175050	175055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351491
3120	NC_011274	CCG	2	6	175071	175076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351491
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3122	NC_011274	CTG	3	9	175144	175152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351491
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3243	NC_011274	CTG	2	6	180779	180784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351494
3244	NC_011274	GCG	2	6	180790	180795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351494
3245	NC_011274	ACGTTC	2	12	180800	180811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	205351494
3246	NC_011274	GGCG	2	8	181017	181024	0 %	0 %	75 %	25 %	205351494
3247	NC_011274	GCA	2	6	181036	181041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3251	NC_011274	CGA	2	6	181122	181127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3253	NC_011274	CT	3	6	181290	181295	0 %	50 %	0 %	50 %	205351494
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3256	NC_011274	CTG	2	6	181391	181396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3260	NC_011274	CG	3	6	181582	181587	0 %	0 %	50 %	50 %	205351494
3261	NC_011274	GCT	2	6	181600	181605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3263	NC_011274	TGC	2	6	181628	181633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351494
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3346	NC_011274	TC	3	6	185628	185633	0 %	50 %	0 %	50 %	205351498
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3357	NC_011274	CTGT	2	8	185816	185823	0 %	50 %	25 %	25 %	205351498
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3362	NC_011274	TAT	2	6	185983	185988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351498
3363	NC_011274	TGC	2	6	186024	186029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351498
3364	NC_011274	ATT	2	6	186077	186082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351498
3365	NC_011274	ACC	2	6	186125	186130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351498
3366	NC_011274	ATG	2	6	186131	186136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351498
3367	NC_011274	ATC	3	9	186140	186148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351498
3368	NC_011274	ATG	2	6	186149	186154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351498
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3383	NC_011274	CATC	2	8	186550	186557	25 %	25 %	0 %	50 %	205351498
3384	NC_011274	TGGC	2	8	186678	186685	0 %	25 %	50 %	25 %	205351498
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3387	NC_011274	TCG	2	6	187411	187416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351499
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3393	NC_011274	GCT	2	6	187620	187625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351499
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3400	NC_011274	CCG	2	6	187893	187898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351499
3401	NC_011274	A	6	6	187906	187911	100 %	0 %	0 %	0 %	205351499
3402	NC_011274	TCACCG	2	12	187912	187923	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	205351499
3403	NC_011274	CGA	2	6	187952	187957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351499
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3405	NC_011274	CAAA	2	8	188075	188082	75 %	0 %	0 %	25 %	205351499
3406	NC_011274	A	6	6	188097	188102	100 %	0 %	0 %	0 %	205351499
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3453	NC_011274	CGT	2	6	190215	190220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351500
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3463	NC_011274	ATT	2	6	190495	190500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351500
3464	NC_011274	TCG	2	6	191004	191009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351501
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3471	NC_011274	GGT	2	6	191593	191598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351502
3472	NC_011274	CG	3	6	191662	191667	0 %	0 %	50 %	50 %	205351502
3473	NC_011274	TGGA	2	8	191723	191730	25 %	25 %	50 %	0 %	205351502
3474	NC_011274	TGA	2	6	191742	191747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351502
3475	NC_011274	TTA	2	6	191800	191805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351502
3476	NC_011274	AG	3	6	191812	191817	50 %	0 %	50 %	0 %	205351502
3477	NC_011274	GGA	2	6	191836	191841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351502
3478	NC_011274	GTC	2	6	191852	191857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351502
3479	NC_011274	A	6	6	192134	192139	100 %	0 %	0 %	0 %	205351503
3480	NC_011274	CGG	2	6	192157	192162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351503
3481	NC_011274	ATG	2	6	192164	192169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351503
3482	NC_011274	CGG	2	6	192229	192234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351503
3483	NC_011274	ACC	2	6	192239	192244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351503
3484	NC_011274	CGGCG	2	10	192259	192268	0 %	0 %	60 %	40 %	205351503
3485	NC_011274	CTG	2	6	192287	192292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351503
3486	NC_011274	GCG	2	6	192438	192443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351503
3487	NC_011274	TGC	2	6	192487	192492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351503
3488	NC_011274	ATG	2	6	192552	192557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351503
3489	NC_011274	CTTT	2	8	192561	192568	0 %	75 %	0 %	25 %	205351503
3490	NC_011274	GAT	2	6	192571	192576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351503
3491	NC_011274	TGG	2	6	192621	192626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351503
3492	NC_011274	T	6	6	192688	192693	0 %	100 %	0 %	0 %	205351503
3493	NC_011274	GGC	2	6	192701	192706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351503
3494	NC_011274	GCT	2	6	192709	192714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351503
3495	NC_011274	CTTT	2	8	192720	192727	0 %	75 %	0 %	25 %	205351503
3496	NC_011274	GGGC	2	8	192741	192748	0 %	0 %	75 %	25 %	205351503
3497	NC_011274	CGTT	2	8	192810	192817	0 %	50 %	25 %	25 %	205351503
3498	NC_011274	T	7	7	192823	192829	0 %	100 %	0 %	0 %	205351503
3499	NC_011274	GCG	2	6	192875	192880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351503
3500	NC_011274	CGC	2	6	192912	192917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351503

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