MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_011274	CCT	2	6	1331090	1331095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205352487
23003	NC_011274	TCA	2	6	1331152	1331157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352487
23004	NC_011274	GCG	2	6	1331277	1331282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352487
23005	NC_011274	AAAT	2	8	1331303	1331310	75 %	25 %	0 %	0 %	205352487
23006	NC_011274	TCA	2	6	1331311	1331316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352487
23007	NC_011274	AG	3	6	1331319	1331324	50 %	0 %	50 %	0 %	205352487
23008	NC_011274	CT	3	6	1331517	1331522	0 %	50 %	0 %	50 %	205352488
23009	NC_011274	GCG	2	6	1331563	1331568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352488
23010	NC_011274	TGG	2	6	1331573	1331578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352488
23011	NC_011274	CAC	2	6	1331630	1331635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352488
23012	NC_011274	GCC	2	6	1331636	1331641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352488
23013	NC_011274	TTA	2	6	1331691	1331696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352488
23014	NC_011274	ATC	2	6	1331736	1331741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352488
23015	NC_011274	ACG	2	6	1331850	1331855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352488
23016	NC_011274	GCCGC	2	10	1331922	1331931	0 %	0 %	40 %	60 %	205352488
23017	NC_011274	CGCC	2	8	1331983	1331990	0 %	0 %	25 %	75 %	205352488
23018	NC_011274	CG	3	6	1332209	1332214	0 %	0 %	50 %	50 %	205352488
23019	NC_011274	CTGGCG	2	12	1332264	1332275	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	205352488
23020	NC_011274	GC	3	6	1332310	1332315	0 %	0 %	50 %	50 %	205352488
23021	NC_011274	CGC	2	6	1332370	1332375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352488
23022	NC_011274	TGA	2	6	1332472	1332477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352488
23023	NC_011274	ACG	2	6	1332507	1332512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352488
23024	NC_011274	CCTG	2	8	1332516	1332523	0 %	25 %	25 %	50 %	205352488
23025	NC_011274	GGT	2	6	1332557	1332562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352488
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23028	NC_011274	TGC	2	6	1332783	1332788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352488
23029	NC_011274	CGTCAG	2	12	1332911	1332922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205352488
23030	NC_011274	GCA	2	6	1332943	1332948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352488
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23055	NC_011274	GCA	2	6	1334507	1334512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352489
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23232	NC_011274	TGG	2	6	1346837	1346842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352501
23233	NC_011274	CGCCA	2	10	1346855	1346864	20 %	0 %	20 %	60 %	205352501
23234	NC_011274	CAT	2	6	1346871	1346876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352501
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23335	NC_011274	GC	4	8	1352516	1352523	0 %	0 %	50 %	50 %	205352506
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23339	NC_011274	CT	3	6	1352763	1352768	0 %	50 %	0 %	50 %	205352506
23340	NC_011274	TGG	2	6	1352845	1352850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352506
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23342	NC_011274	GTG	2	6	1352904	1352909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352506
23343	NC_011274	CG	5	10	1352952	1352961	0 %	0 %	50 %	50 %	205352506
23344	NC_011274	GTG	2	6	1352994	1352999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352506
23345	NC_011274	CGC	2	6	1353013	1353018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352506
23346	NC_011274	TGCCGA	2	12	1353080	1353091	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205352506
23347	NC_011274	GGC	2	6	1353108	1353113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352506
23348	NC_011274	CAG	2	6	1353132	1353137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352506
23349	NC_011274	ATC	2	6	1353151	1353156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352506
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23378	NC_011274	TGAT	2	8	1354939	1354946	25 %	50 %	25 %	0 %	205352507
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23383	NC_011274	GCACCT	2	12	1355299	1355310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	205352508
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23462	NC_011274	GGCG	2	8	1359770	1359777	0 %	0 %	75 %	25 %	205352513
23463	NC_011274	TGC	2	6	1359814	1359819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23464	NC_011274	GGA	2	6	1359875	1359880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205352513
23465	NC_011274	ACC	3	9	1360009	1360017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352513
23466	NC_011274	TGG	2	6	1360033	1360038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352513
23467	NC_011274	AG	3	6	1360043	1360048	50 %	0 %	50 %	0 %	205352513
23468	NC_011274	CCA	2	6	1360100	1360105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352513
23469	NC_011274	GCCA	2	8	1360119	1360126	25 %	0 %	25 %	50 %	205352513
23470	NC_011274	CGGA	2	8	1360194	1360201	25 %	0 %	50 %	25 %	205352513
23471	NC_011274	CTG	2	6	1360347	1360352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23472	NC_011274	GAT	2	6	1360353	1360358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352513
23473	NC_011274	ACG	2	6	1360375	1360380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23474	NC_011274	GCT	2	6	1360409	1360414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23475	NC_011274	ATCA	2	8	1360473	1360480	50 %	25 %	0 %	25 %	205352513
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23479	NC_011274	TGC	3	9	1360678	1360686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23480	NC_011274	ACCA	2	8	1360746	1360753	50 %	0 %	0 %	50 %	205352513
23481	NC_011274	CGGCG	2	10	1360757	1360766	0 %	0 %	60 %	40 %	205352513
23482	NC_011274	GGC	2	6	1360775	1360780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352513
23483	NC_011274	ATT	2	6	1360794	1360799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352513
23484	NC_011274	ATG	2	6	1360845	1360850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352513
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23486	NC_011274	TTG	2	6	1360896	1360901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352513
23487	NC_011274	GCT	2	6	1360958	1360963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23488	NC_011274	CCA	2	6	1360969	1360974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352513
23489	NC_011274	GCG	2	6	1361002	1361007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352513
23490	NC_011274	GAC	2	6	1361055	1361060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352513
23491	NC_011274	GTT	2	6	1361063	1361068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352513
23492	NC_011274	TGA	2	6	1361114	1361119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352513
23493	NC_011274	GGC	2	6	1361164	1361169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352513
23494	NC_011274	GCCT	2	8	1361257	1361264	0 %	25 %	25 %	50 %	205352513
23495	NC_011274	CCG	2	6	1361320	1361325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352513
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23499	NC_011274	GCG	2	6	1361533	1361538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352514
23500	NC_011274	GCGT	2	8	1361596	1361603	0 %	25 %	50 %	25 %	205352514

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