MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_011274	CTG	3	9	1228418	1228426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352385
21502	NC_011274	CCAG	2	8	1228432	1228439	25 %	0 %	25 %	50 %	205352385
21503	NC_011274	ATG	2	6	1228496	1228501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352385
21504	NC_011274	AGT	2	6	1228594	1228599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352385
21505	NC_011274	CGA	2	6	1228600	1228605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352385
21506	NC_011274	AG	3	6	1228673	1228678	50 %	0 %	50 %	0 %	205352385
21507	NC_011274	G	6	6	1228786	1228791	0 %	0 %	100 %	0 %	205352385
21508	NC_011274	T	6	6	1228802	1228807	0 %	100 %	0 %	0 %	205352385
21509	NC_011274	CAT	2	6	1228817	1228822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352385
21510	NC_011274	GAACT	2	10	1228844	1228853	40 %	20 %	20 %	20 %	205352385
21511	NC_011274	CTGA	2	8	1228858	1228865	25 %	25 %	25 %	25 %	205352385
21512	NC_011274	GC	3	6	1228891	1228896	0 %	0 %	50 %	50 %	205352385
21513	NC_011274	GCA	2	6	1228899	1228904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352385
21514	NC_011274	GA	3	6	1228929	1228934	50 %	0 %	50 %	0 %	205352385
21515	NC_011274	TGA	2	6	1229208	1229213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352386
21516	NC_011274	ACG	2	6	1229338	1229343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352386
21517	NC_011274	ATC	2	6	1229398	1229403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352386
21518	NC_011274	TG	3	6	1229446	1229451	0 %	50 %	50 %	0 %	205352386
21519	NC_011274	TGC	2	6	1229537	1229542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352386
21520	NC_011274	GTT	2	6	1229580	1229585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352386
21521	NC_011274	GGC	2	6	1229745	1229750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352386
21522	NC_011274	TGT	2	6	1229795	1229800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352387
21523	NC_011274	GC	3	6	1229814	1229819	0 %	0 %	50 %	50 %	205352387
21524	NC_011274	GCGCC	2	10	1229859	1229868	0 %	0 %	40 %	60 %	205352387
21525	NC_011274	AAG	2	6	1229871	1229876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205352387
21526	NC_011274	ATT	2	6	1229945	1229950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352387
21527	NC_011274	CGG	2	6	1229959	1229964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352387
21528	NC_011274	TAC	2	6	1229972	1229977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352387
21529	NC_011274	GCC	2	6	1229993	1229998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352387
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21531	NC_011274	A	6	6	1230096	1230101	100 %	0 %	0 %	0 %	205352387
21532	NC_011274	GGC	3	9	1230106	1230114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352387
21533	NC_011274	TG	3	6	1230153	1230158	0 %	50 %	50 %	0 %	205352387
21534	NC_011274	GCG	2	6	1230236	1230241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352387
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21536	NC_011274	CCG	2	6	1230369	1230374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352387
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21538	NC_011274	TGAAA	2	10	1230484	1230493	60 %	20 %	20 %	0 %	205352387
21539	NC_011274	CG	3	6	1230783	1230788	0 %	0 %	50 %	50 %	205352388
21540	NC_011274	GCGGG	2	10	1230791	1230800	0 %	0 %	80 %	20 %	205352388
21541	NC_011274	TGC	2	6	1230818	1230823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21542	NC_011274	CCAT	2	8	1230863	1230870	25 %	25 %	0 %	50 %	205352388
21543	NC_011274	GCT	2	6	1230881	1230886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21544	NC_011274	GGT	3	9	1230891	1230899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352388
21545	NC_011274	T	7	7	1230951	1230957	0 %	100 %	0 %	0 %	205352388
21546	NC_011274	GGAA	2	8	1230969	1230976	50 %	0 %	50 %	0 %	205352388
21547	NC_011274	TCG	2	6	1231033	1231038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21548	NC_011274	CGA	2	6	1231043	1231048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21549	NC_011274	GCG	2	6	1231115	1231120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352388
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21551	NC_011274	GCA	2	6	1231199	1231204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21552	NC_011274	GC	4	8	1231208	1231215	0 %	0 %	50 %	50 %	205352388
21553	NC_011274	CAC	2	6	1231239	1231244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352388
21554	NC_011274	ATC	2	6	1231309	1231314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352388
21555	NC_011274	CCGG	2	8	1231359	1231366	0 %	0 %	50 %	50 %	205352388
21556	NC_011274	GCA	2	6	1231481	1231486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352388
21557	NC_011274	GCG	2	6	1231520	1231525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352388
21558	NC_011274	GCC	2	6	1231562	1231567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352388
21559	NC_011274	TGC	3	9	1231624	1231632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352388
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21562	NC_011274	GA	3	6	1231681	1231686	50 %	0 %	50 %	0 %	205352388
21563	NC_011274	GC	3	6	1231820	1231825	0 %	0 %	50 %	50 %	205352389
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21567	NC_011274	CAC	2	6	1232081	1232086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352389
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21589	NC_011274	GGC	2	6	1233274	1233279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352391
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21593	NC_011274	A	7	7	1233367	1233373	100 %	0 %	0 %	0 %	205352391
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21602	NC_011274	GCG	2	6	1233865	1233870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352392
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21734	NC_011274	GAC	2	6	1241005	1241010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352400
21735	NC_011274	GGC	2	6	1241092	1241097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352400
21736	NC_011274	ATG	2	6	1241121	1241126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352400
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21740	NC_011274	GCC	2	6	1241257	1241262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352400
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21760	NC_011274	CG	3	6	1242066	1242071	0 %	0 %	50 %	50 %	205352401
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21830	NC_011274	CGT	2	6	1246281	1246286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352405
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21832	NC_011274	A	6	6	1246366	1246371	100 %	0 %	0 %	0 %	205352405
21833	NC_011274	GGC	2	6	1246373	1246378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352405
21834	NC_011274	GC	3	6	1246458	1246463	0 %	0 %	50 %	50 %	205352405
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21842	NC_011274	GCGT	2	8	1247150	1247157	0 %	25 %	50 %	25 %	205352406
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21844	NC_011274	CTT	2	6	1247300	1247305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352406
21845	NC_011274	T	6	6	1247360	1247365	0 %	100 %	0 %	0 %	205352406
21846	NC_011274	CG	3	6	1247381	1247386	0 %	0 %	50 %	50 %	205352406
21847	NC_011274	CG	3	6	1247493	1247498	0 %	0 %	50 %	50 %	205352406
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21849	NC_011274	CAT	2	6	1247529	1247534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352406
21850	NC_011274	TGA	2	6	1247546	1247551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352406
21851	NC_011274	ACCA	2	8	1247598	1247605	50 %	0 %	0 %	50 %	205352406
21852	NC_011274	GGC	2	6	1247762	1247767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352406
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21880	NC_011274	T	8	8	1248992	1248999	0 %	100 %	0 %	0 %	205352407
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21966	NC_011274	CG	3	6	1253157	1253162	0 %	0 %	50 %	50 %	205352409
21967	NC_011274	GTT	2	6	1253179	1253184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352409
21968	NC_011274	GC	3	6	1253187	1253192	0 %	0 %	50 %	50 %	205352409
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21998	NC_011274	TTC	2	6	1254831	1254836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352411
21999	NC_011274	TCC	2	6	1254916	1254921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205352411
22000	NC_011274	CATG	2	8	1255049	1255056	25 %	25 %	25 %	25 %	205352411

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