MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011274	CGC	2	6	858449	858454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352074
15002	NC_011274	CGC	2	6	858505	858510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352074
15003	NC_011274	CCGC	2	8	858517	858524	0 %	0 %	25 %	75 %	205352074
15004	NC_011274	GC	3	6	858616	858621	0 %	0 %	50 %	50 %	205352074
15005	NC_011274	CG	3	6	858631	858636	0 %	0 %	50 %	50 %	205352074
15006	NC_011274	TGC	2	6	858642	858647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352074
15007	NC_011274	CAC	2	6	858665	858670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352074
15008	NC_011274	T	6	6	858697	858702	0 %	100 %	0 %	0 %	205352074
15009	NC_011274	AATT	2	8	858704	858711	50 %	50 %	0 %	0 %	205352074
15010	NC_011274	CCT	2	6	858781	858786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205352074
15011	NC_011274	TGT	2	6	858792	858797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352074
15012	NC_011274	ACAGCA	2	12	858859	858870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	205352074
15013	NC_011274	CAC	2	6	858878	858883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352074
15014	NC_011274	CAGC	2	8	858890	858897	25 %	0 %	25 %	50 %	205352074
15015	NC_011274	ACGC	3	12	858940	858951	25 %	0 %	25 %	50 %	205352074
15016	NC_011274	GA	4	8	858960	858967	50 %	0 %	50 %	0 %	205352074
15017	NC_011274	TGA	2	6	859001	859006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352075
15018	NC_011274	TCG	2	6	859028	859033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15019	NC_011274	CGG	2	6	859052	859057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352075
15020	NC_011274	GTC	2	6	859156	859161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15021	NC_011274	CCA	2	6	859184	859189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352075
15022	NC_011274	CGG	2	6	859216	859221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352075
15023	NC_011274	TCA	2	6	859249	859254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352075
15024	NC_011274	T	6	6	859385	859390	0 %	100 %	0 %	0 %	205352075
15025	NC_011274	GC	3	6	859397	859402	0 %	0 %	50 %	50 %	205352075
15026	NC_011274	A	6	6	859429	859434	100 %	0 %	0 %	0 %	205352075
15027	NC_011274	CAG	2	6	859569	859574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15028	NC_011274	CAT	2	6	859581	859586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352075
15029	NC_011274	GGT	2	6	859593	859598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352075
15030	NC_011274	CGC	2	6	859640	859645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352075
15031	NC_011274	ACG	2	6	859651	859656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15032	NC_011274	T	6	6	859692	859697	0 %	100 %	0 %	0 %	205352075
15033	NC_011274	GCGCG	2	10	859821	859830	0 %	0 %	60 %	40 %	205352075
15034	NC_011274	CTG	2	6	859877	859882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15035	NC_011274	T	6	6	859893	859898	0 %	100 %	0 %	0 %	205352075
15036	NC_011274	CT	3	6	859961	859966	0 %	50 %	0 %	50 %	205352075
15037	NC_011274	GTA	2	6	859967	859972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352075
15038	NC_011274	GTT	2	6	859980	859985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352075
15039	NC_011274	TCA	2	6	860000	860005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352075
15040	NC_011274	AGC	2	6	860059	860064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15041	NC_011274	TTCA	2	8	860070	860077	25 %	50 %	0 %	25 %	205352075
15042	NC_011274	CAG	2	6	860079	860084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15043	NC_011274	AGG	2	6	860117	860122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205352075
15044	NC_011274	CGCC	2	8	860147	860154	0 %	0 %	25 %	75 %	205352075
15045	NC_011274	CAACGC	2	12	860198	860209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	205352075
15046	NC_011274	CAG	2	6	860223	860228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352075
15047	NC_011274	CCG	2	6	860281	860286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352075
15048	NC_011274	CAA	2	6	860337	860342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205352075
15049	NC_011274	GCC	2	6	860520	860525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352075
15050	NC_011274	GCG	2	6	860630	860635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352075
15051	NC_011274	CGG	2	6	860639	860644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352075
15052	NC_011274	TAA	2	6	860687	860692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352075
15053	NC_011274	CTCA	2	8	860697	860704	25 %	25 %	0 %	50 %	205352075
15054	NC_011274	CGAAA	2	10	860854	860863	60 %	0 %	20 %	20 %	205352076
15055	NC_011274	GAC	2	6	860892	860897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352076
15056	NC_011274	ACA	2	6	860907	860912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205352076
15057	NC_011274	CTGA	2	8	860935	860942	25 %	25 %	25 %	25 %	205352076
15058	NC_011274	GC	3	6	860963	860968	0 %	0 %	50 %	50 %	205352076
15059	NC_011274	TGC	2	6	861006	861011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352076
15060	NC_011274	CG	3	6	861040	861045	0 %	0 %	50 %	50 %	205352076
15061	NC_011274	GTG	2	6	861080	861085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352076
15062	NC_011274	CTGCGC	2	12	861100	861111	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	205352076
15063	NC_011274	GGCT	2	8	861135	861142	0 %	25 %	50 %	25 %	205352076
15064	NC_011274	CGGTA	2	10	861174	861183	20 %	20 %	40 %	20 %	205352076
15065	NC_011274	CGCCTG	2	12	861217	861228	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	205352076
15066	NC_011274	CG	3	6	861231	861236	0 %	0 %	50 %	50 %	205352076
15067	NC_011274	GGC	2	6	861328	861333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352076
15068	NC_011274	CGG	4	12	861348	861359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352076
15069	NC_011274	CGAC	2	8	861417	861424	25 %	0 %	25 %	50 %	205352076
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15077	NC_011274	GCT	2	6	861989	861994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352077
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15080	NC_011274	GGCT	2	8	862105	862112	0 %	25 %	50 %	25 %	205352077
15081	NC_011274	AGTA	2	8	862217	862224	50 %	25 %	25 %	0 %	205352077
15082	NC_011274	GGC	2	6	862227	862232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352077
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15085	NC_011274	GCG	2	6	862306	862311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352077
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15088	NC_011274	GC	3	6	862635	862640	0 %	0 %	50 %	50 %	205352078
15089	NC_011274	CCG	2	6	862694	862699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352078
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15091	NC_011274	ATT	2	6	862770	862775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352078
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15093	NC_011274	GTC	2	6	862811	862816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352078
15094	NC_011274	GC	3	6	862824	862829	0 %	0 %	50 %	50 %	205352078
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15101	NC_011274	TGG	2	6	862982	862987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352078
15102	NC_011274	TTCA	2	8	863092	863099	25 %	50 %	0 %	25 %	205352078
15103	NC_011274	TCG	2	6	863106	863111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352078
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15105	NC_011274	GAC	2	6	863170	863175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352078
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15107	NC_011274	GCA	2	6	863259	863264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352078
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15121	NC_011274	A	6	6	863689	863694	100 %	0 %	0 %	0 %	205352078
15122	NC_011274	ACG	2	6	863710	863715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352078
15123	NC_011274	GTC	2	6	863765	863770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352078
15124	NC_011274	AGC	2	6	863771	863776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352078
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15127	NC_011274	CAG	2	6	863830	863835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352078
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15133	NC_011274	AGGCGA	2	12	866495	866506	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	205352079
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15142	NC_011274	GC	3	6	866878	866883	0 %	0 %	50 %	50 %	205352079
15143	NC_011274	TGC	2	6	866926	866931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352079
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15145	NC_011274	GGCG	2	8	866994	867001	0 %	0 %	75 %	25 %	205352079
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15153	NC_011274	GGC	2	6	867260	867265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352079
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15182	NC_011274	AGCG	2	8	869080	869087	25 %	0 %	50 %	25 %	205352082
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15226	NC_011274	ATAA	2	8	871027	871034	75 %	25 %	0 %	0 %	205352083
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15229	NC_011274	CGA	2	6	871073	871078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352083
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15234	NC_011274	GCGCTG	2	12	871388	871399	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	205352083
15235	NC_011274	TCGG	2	8	871402	871409	0 %	25 %	50 %	25 %	205352083
15236	NC_011274	T	8	8	871500	871507	0 %	100 %	0 %	0 %	205352083
15237	NC_011274	GCT	2	6	871528	871533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352083
15238	NC_011274	GCTG	2	8	871535	871542	0 %	25 %	50 %	25 %	205352083
15239	NC_011274	A	6	6	871604	871609	100 %	0 %	0 %	0 %	205352083
15240	NC_011274	GTGA	2	8	871891	871898	25 %	25 %	50 %	0 %	205352084
15241	NC_011274	CTT	2	6	871917	871922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352084
15242	NC_011274	CAT	2	6	871999	872004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352084
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15244	NC_011274	CCG	2	6	872054	872059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352084
15245	NC_011274	CTT	3	9	872136	872144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352084
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15354	NC_011274	TGGAC	2	10	880478	880487	20 %	20 %	40 %	20 %	205352091
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