MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011274	TTTC	2	8	804209	804216	0 %	75 %	0 %	25 %	205352022
14002	NC_011274	TAA	2	6	804251	804256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352022
14003	NC_011274	GAA	2	6	804303	804308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205352022
14004	NC_011274	TTAA	2	8	804340	804347	50 %	50 %	0 %	0 %	205352022
14005	NC_011274	AAT	2	6	804386	804391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352022
14006	NC_011274	TTC	2	6	804400	804405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352023
14007	NC_011274	CTTT	2	8	804494	804501	0 %	75 %	0 %	25 %	205352023
14008	NC_011274	TGC	2	6	804604	804609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352023
14009	NC_011274	TAT	2	6	804636	804641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352023
14010	NC_011274	TAT	2	6	804673	804678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352023
14011	NC_011274	TGA	2	6	804697	804702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352023
14012	NC_011274	AAAG	2	8	804704	804711	75 %	0 %	25 %	0 %	205352023
14013	NC_011274	TTA	2	6	804728	804733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352023
14014	NC_011274	TTATTT	2	12	804821	804832	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	205352023
14015	NC_011274	CAT	2	6	804892	804897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352023
14016	NC_011274	T	6	6	804897	804902	0 %	100 %	0 %	0 %	205352023
14017	NC_011274	CGCA	2	8	804903	804910	25 %	0 %	25 %	50 %	205352023
14018	NC_011274	A	6	6	805014	805019	100 %	0 %	0 %	0 %	205352023
14019	NC_011274	GTT	2	6	805029	805034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352023
14020	NC_011274	CTT	2	6	805148	805153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352023
14021	NC_011274	ACCC	2	8	805168	805175	25 %	0 %	0 %	75 %	205352023
14022	NC_011274	TTC	2	6	805177	805182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352023
14023	NC_011274	GA	3	6	805183	805188	50 %	0 %	50 %	0 %	205352023
14024	NC_011274	CGA	2	6	805196	805201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352023
14025	NC_011274	TTA	2	6	805329	805334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352023
14026	NC_011274	TA	3	6	805354	805359	50 %	50 %	0 %	0 %	205352023
14027	NC_011274	ACAG	2	8	805373	805380	50 %	0 %	25 %	25 %	205352023
14028	NC_011274	ATT	2	6	805609	805614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352024
14029	NC_011274	TTG	2	6	805618	805623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352024
14030	NC_011274	AAT	2	6	805638	805643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205352024
14031	NC_011274	TCG	2	6	805772	805777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352024
14032	NC_011274	TG	3	6	805781	805786	0 %	50 %	50 %	0 %	205352024
14033	NC_011274	T	6	6	805801	805806	0 %	100 %	0 %	0 %	205352024
14034	NC_011274	TGGCA	2	10	805817	805826	20 %	20 %	40 %	20 %	205352024
14035	NC_011274	AGAA	2	8	805860	805867	75 %	0 %	25 %	0 %	205352024
14036	NC_011274	TGG	2	6	805893	805898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352024
14037	NC_011274	GCC	2	6	805966	805971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352024
14038	NC_011274	AGT	2	6	805972	805977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352024
14039	NC_011274	CTT	2	6	805996	806001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352024
14040	NC_011274	CAA	2	6	806021	806026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205352024
14041	NC_011274	TAT	2	6	806043	806048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352024
14042	NC_011274	TTC	2	6	806179	806184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352024
14043	NC_011274	TGG	2	6	806309	806314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352024
14044	NC_011274	ATT	2	6	806350	806355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352024
14045	NC_011274	ATG	2	6	806455	806460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352024
14046	NC_011274	ATT	2	6	806548	806553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352024
14047	NC_011274	GCA	2	6	806608	806613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352024
14048	NC_011274	GTT	2	6	806619	806624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352024
14049	NC_011274	GTT	2	6	806677	806682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352024
14050	NC_011274	AGT	2	6	806701	806706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352024
14051	NC_011274	ATT	2	6	806749	806754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352024
14052	NC_011274	T	6	6	806781	806786	0 %	100 %	0 %	0 %	205352024
14053	NC_011274	GTTTG	2	10	806807	806816	0 %	60 %	40 %	0 %	205352024
14054	NC_011274	TAC	2	6	806837	806842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352024
14055	NC_011274	TAT	2	6	806911	806916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205352025
14056	NC_011274	CTG	2	6	806993	806998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352025
14057	NC_011274	CTT	2	6	807037	807042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205352025
14058	NC_011274	CGC	2	6	807055	807060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352025
14059	NC_011274	CGT	2	6	807082	807087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352025
14060	NC_011274	GAC	2	6	807089	807094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352025
14061	NC_011274	GCC	3	9	807119	807127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352025
14062	NC_011274	CCA	2	6	807142	807147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352025
14063	NC_011274	CGT	2	6	807191	807196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14064	NC_011274	CCA	2	6	807209	807214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352026
14065	NC_011274	TGA	2	6	807242	807247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352026
14066	NC_011274	TGC	2	6	807250	807255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14067	NC_011274	GCC	2	6	807261	807266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352026
14068	NC_011274	CGA	2	6	807272	807277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14069	NC_011274	GCG	2	6	807307	807312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352026
14070	NC_011274	CTGCGC	2	12	807357	807368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	205352026
14071	NC_011274	A	6	6	807375	807380	100 %	0 %	0 %	0 %	205352026
14072	NC_011274	TGC	3	9	807406	807414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14073	NC_011274	GTG	2	6	807456	807461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352026
14074	NC_011274	TCG	2	6	807469	807474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14075	NC_011274	GCC	2	6	807546	807551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352026
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14078	NC_011274	CTG	2	6	807654	807659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14079	NC_011274	A	6	6	807744	807749	100 %	0 %	0 %	0 %	205352026
14080	NC_011274	ACG	2	6	807754	807759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352026
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14084	NC_011274	TCC	2	6	807858	807863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205352026
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14087	NC_011274	TGG	2	6	808042	808047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352026
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14090	NC_011274	CGG	2	6	808261	808266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352026
14091	NC_011274	CGC	2	6	808310	808315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352026
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14098	NC_011274	GTGGAA	2	12	808611	808622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	205352026
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14100	NC_011274	CAGC	2	8	808664	808671	25 %	0 %	25 %	50 %	205352026
14101	NC_011274	CGG	2	6	808675	808680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352026
14102	NC_011274	GGC	2	6	808700	808705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352026
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14104	NC_011274	TGC	2	6	808813	808818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352026
14105	NC_011274	CCGCG	2	10	808853	808862	0 %	0 %	40 %	60 %	205352026
14106	NC_011274	TGA	2	6	808927	808932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352026
14107	NC_011274	CAGGC	2	10	809008	809017	20 %	0 %	40 %	40 %	205352027
14108	NC_011274	CAT	2	6	809018	809023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352027
14109	NC_011274	GCT	2	6	809024	809029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
14110	NC_011274	CTG	4	12	809037	809048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
14111	NC_011274	TGGC	2	8	809049	809056	0 %	25 %	50 %	25 %	205352027
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14114	NC_011274	CGG	2	6	809102	809107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352027
14115	NC_011274	CTG	2	6	809160	809165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
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14117	NC_011274	GC	3	6	809215	809220	0 %	0 %	50 %	50 %	205352027
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14119	NC_011274	CGC	2	6	809362	809367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352027
14120	NC_011274	TGGGCG	2	12	809380	809391	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	205352027
14121	NC_011274	GCT	2	6	809411	809416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
14122	NC_011274	CTG	3	9	809433	809441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
14123	NC_011274	GCG	3	9	809445	809453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205352027
14124	NC_011274	ACT	2	6	809497	809502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205352027
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14127	NC_011274	GCT	2	6	809606	809611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352027
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14226	NC_011274	GCT	2	6	815814	815819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352033
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14229	NC_011274	CCA	2	6	815874	815879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205352033
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14232	NC_011274	CAAT	2	8	815960	815967	50 %	25 %	0 %	25 %	205352033
14233	NC_011274	T	6	6	815983	815988	0 %	100 %	0 %	0 %	205352033
14234	NC_011274	GC	3	6	816075	816080	0 %	0 %	50 %	50 %	205352033
14235	NC_011274	GCT	2	6	816102	816107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352033
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14237	NC_011274	TGA	2	6	816180	816185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205352033
14238	NC_011274	CGC	2	6	816195	816200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352033
14239	NC_011274	GTT	2	6	816208	816213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205352033
14240	NC_011274	CGC	2	6	816237	816242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352033
14241	NC_011274	CTG	2	6	816259	816264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205352033
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14353	NC_011274	CAG	2	6	821787	821792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352038
14354	NC_011274	GATCGC	2	12	821816	821827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	205352038
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14359	NC_011274	CAG	2	6	822165	822170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352038
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14478	NC_011274	TGG	2	6	828968	828973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205352046
14479	NC_011274	GAC	2	6	829070	829075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352046
14480	NC_011274	CGC	2	6	829131	829136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205352046
14481	NC_011274	AGC	2	6	829145	829150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205352046
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