MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011274	GAT	2	6	621455	621460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351863
10502	NC_011274	TCG	2	6	621475	621480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351863
10503	NC_011274	GGC	2	6	621558	621563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351863
10504	NC_011274	GGC	2	6	621612	621617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351863
10505	NC_011274	CGA	2	6	621643	621648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351863
10506	NC_011274	GCT	2	6	621713	621718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351863
10507	NC_011274	TGA	2	6	621758	621763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351863
10508	NC_011274	TGA	2	6	621776	621781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351863
10509	NC_011274	GAA	2	6	622167	622172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351864
10510	NC_011274	GCG	2	6	622229	622234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10511	NC_011274	TTG	2	6	622297	622302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351864
10512	NC_011274	CGG	2	6	622490	622495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10513	NC_011274	GCG	3	9	622543	622551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10514	NC_011274	T	6	6	622552	622557	0 %	100 %	0 %	0 %	205351864
10515	NC_011274	GCT	2	6	622671	622676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351864
10516	NC_011274	CGG	2	6	622689	622694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10517	NC_011274	TTC	2	6	622735	622740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351864
10518	NC_011274	GCG	2	6	622822	622827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10519	NC_011274	GC	3	6	622831	622836	0 %	0 %	50 %	50 %	205351864
10520	NC_011274	A	6	6	622844	622849	100 %	0 %	0 %	0 %	205351864
10521	NC_011274	GGT	2	6	622872	622877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351864
10522	NC_011274	TGG	2	6	622910	622915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351864
10523	NC_011274	AGC	2	6	622957	622962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351864
10524	NC_011274	TGA	2	6	622970	622975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351864
10525	NC_011274	TGG	2	6	623000	623005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351864
10526	NC_011274	GTCGC	2	10	623032	623041	0 %	20 %	40 %	40 %	205351864
10527	NC_011274	TA	3	6	623048	623053	50 %	50 %	0 %	0 %	205351864
10528	NC_011274	GCG	2	6	623057	623062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351864
10529	NC_011274	TGG	2	6	623189	623194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351864
10530	NC_011274	CG	3	6	623305	623310	0 %	0 %	50 %	50 %	205351864
10531	NC_011274	CGT	2	6	623317	623322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351864
10532	NC_011274	CCG	2	6	623360	623365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351864
10533	NC_011274	TGC	2	6	623447	623452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351864
10534	NC_011274	TGA	2	6	623605	623610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351865
10535	NC_011274	CCA	2	6	623630	623635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351865
10536	NC_011274	ACG	2	6	623689	623694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10537	NC_011274	TGG	2	6	623788	623793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351865
10538	NC_011274	CGG	2	6	623842	623847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351865
10539	NC_011274	GTT	2	6	623876	623881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351865
10540	NC_011274	TGA	2	6	623902	623907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351865
10541	NC_011274	TCA	3	9	623959	623967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351865
10542	NC_011274	TGC	2	6	624002	624007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10543	NC_011274	CCG	2	6	624022	624027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351865
10544	NC_011274	TGG	2	6	624086	624091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351865
10545	NC_011274	TAT	2	6	624098	624103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351865
10546	NC_011274	CCAG	2	8	624176	624183	25 %	0 %	25 %	50 %	205351865
10547	NC_011274	CAG	2	6	624321	624326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10548	NC_011274	ATC	2	6	624331	624336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351865
10549	NC_011274	CGA	2	6	624344	624349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10550	NC_011274	GGC	2	6	624405	624410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351865
10551	NC_011274	CAG	2	6	624444	624449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10552	NC_011274	CAG	2	6	624462	624467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10553	NC_011274	GC	3	6	624491	624496	0 %	0 %	50 %	50 %	205351865
10554	NC_011274	GTC	2	6	624499	624504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10555	NC_011274	ATG	2	6	624562	624567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351865
10556	NC_011274	AAT	2	6	624595	624600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351865
10557	NC_011274	TAA	2	6	624611	624616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351865
10558	NC_011274	CTGGCG	2	12	624637	624648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	205351865
10559	NC_011274	GC	3	6	624661	624666	0 %	0 %	50 %	50 %	205351865
10560	NC_011274	ATA	2	6	624685	624690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351865
10561	NC_011274	CTG	2	6	624701	624706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351865
10562	NC_011274	ATA	2	6	624715	624720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351865
10563	NC_011274	CAC	2	6	624729	624734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351865
10564	NC_011274	GTG	2	6	624742	624747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351865
10565	NC_011274	TCT	2	6	624772	624777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351865
10566	NC_011274	CGCTGG	2	12	625151	625162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	205351866
10567	NC_011274	CT	3	6	625191	625196	0 %	50 %	0 %	50 %	205351866
10568	NC_011274	ACG	2	6	625274	625279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351866
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10572	NC_011274	G	6	6	625425	625430	0 %	0 %	100 %	0 %	205351866
10573	NC_011274	CGG	2	6	625467	625472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
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10576	NC_011274	GCG	3	9	625543	625551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10577	NC_011274	GTG	2	6	625591	625596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351866
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10579	NC_011274	GCG	2	6	625687	625692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10580	NC_011274	GGAG	2	8	625707	625714	25 %	0 %	75 %	0 %	205351866
10581	NC_011274	GGC	3	9	625764	625772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10582	NC_011274	AGC	2	6	625783	625788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351866
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10584	NC_011274	GCG	2	6	625840	625845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10585	NC_011274	GCAGG	2	10	625846	625855	20 %	0 %	60 %	20 %	205351866
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10587	NC_011274	CGG	2	6	625911	625916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10588	NC_011274	CCG	2	6	626011	626016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351866
10589	NC_011274	CTC	2	6	626037	626042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351866
10590	NC_011274	ATT	2	6	626119	626124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351866
10591	NC_011274	AT	3	6	626130	626135	50 %	50 %	0 %	0 %	205351866
10592	NC_011274	CAG	2	6	626233	626238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351866
10593	NC_011274	CGG	2	6	626280	626285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
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10595	NC_011274	ATA	2	6	626342	626347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351866
10596	NC_011274	CTG	2	6	626389	626394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351866
10597	NC_011274	GC	3	6	626490	626495	0 %	0 %	50 %	50 %	205351866
10598	NC_011274	ATG	2	6	626653	626658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351866
10599	NC_011274	GACCG	2	10	626670	626679	20 %	0 %	40 %	40 %	205351866
10600	NC_011274	TGC	2	6	626681	626686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351866
10601	NC_011274	GCTG	2	8	626791	626798	0 %	25 %	50 %	25 %	205351866
10602	NC_011274	CAT	2	6	626820	626825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351866
10603	NC_011274	ATTA	2	8	626842	626849	50 %	50 %	0 %	0 %	205351866
10604	NC_011274	GAT	2	6	626866	626871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351866
10605	NC_011274	GGC	2	6	626887	626892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351866
10606	NC_011274	TGA	2	6	627079	627084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351866
10607	NC_011274	ATG	2	6	627420	627425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351867
10608	NC_011274	CAC	2	6	627435	627440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351867
10609	NC_011274	TTTC	2	8	627461	627468	0 %	75 %	0 %	25 %	205351867
10610	NC_011274	CAG	2	6	627546	627551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351867
10611	NC_011274	TGG	2	6	627592	627597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351867
10612	NC_011274	GCG	2	6	627636	627641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351867
10613	NC_011274	CGA	2	6	627704	627709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351867
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10615	NC_011274	CCA	2	6	627755	627760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351867
10616	NC_011274	CGTT	2	8	627784	627791	0 %	50 %	25 %	25 %	205351867
10617	NC_011274	CG	3	6	627824	627829	0 %	0 %	50 %	50 %	205351867
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10978	NC_011274	CTG	2	6	644258	644263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351882
10979	NC_011274	GC	3	6	644264	644269	0 %	0 %	50 %	50 %	205351882
10980	NC_011274	AT	3	6	644339	644344	50 %	50 %	0 %	0 %	205351882
10981	NC_011274	GGC	2	6	644398	644403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351882
10982	NC_011274	G	6	6	644497	644502	0 %	0 %	100 %	0 %	205351882
10983	NC_011274	TTGC	2	8	644507	644514	0 %	50 %	25 %	25 %	205351882
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10990	NC_011274	CGG	2	6	644680	644685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351882
10991	NC_011274	GCT	2	6	644692	644697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351882
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