MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011274	CCG	2	6	592044	592049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
10002	NC_011274	CGC	2	6	592070	592075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351831
10003	NC_011274	CCGT	2	8	592133	592140	0 %	25 %	25 %	50 %	205351831
10004	NC_011274	AG	3	6	592203	592208	50 %	0 %	50 %	0 %	205351831
10005	NC_011274	ATCC	2	8	592224	592231	25 %	25 %	0 %	50 %	205351832
10006	NC_011274	CGG	2	6	592252	592257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
10007	NC_011274	TTA	2	6	592329	592334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351832
10008	NC_011274	GCG	3	9	592384	592392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
10009	NC_011274	CGC	2	6	592528	592533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351832
10010	NC_011274	GAG	2	6	592563	592568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351832
10011	NC_011274	GCA	2	6	592596	592601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10012	NC_011274	TGC	2	6	592664	592669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10013	NC_011274	GACT	2	8	592670	592677	25 %	25 %	25 %	25 %	205351832
10014	NC_011274	GGC	2	6	592678	592683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
10015	NC_011274	GAC	2	6	592722	592727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10016	NC_011274	GGC	2	6	592748	592753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351832
10017	NC_011274	T	7	7	592793	592799	0 %	100 %	0 %	0 %	205351832
10018	NC_011274	CGA	2	6	592825	592830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10019	NC_011274	CTG	2	6	592947	592952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10020	NC_011274	GCT	2	6	592982	592987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351832
10021	NC_011274	ACA	2	6	593003	593008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351832
10022	NC_011274	GGC	2	6	593052	593057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
10023	NC_011274	ATT	2	6	593063	593068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351833
10024	NC_011274	GCC	2	6	593321	593326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351833
10025	NC_011274	CGG	2	6	593359	593364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
10026	NC_011274	AGA	2	6	593417	593422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351833
10027	NC_011274	TGGC	2	8	593447	593454	0 %	25 %	50 %	25 %	205351833
10028	NC_011274	GTC	2	6	593487	593492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351833
10029	NC_011274	GCG	2	6	593572	593577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
10030	NC_011274	GGCGAA	2	12	593598	593609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	205351833
10031	NC_011274	GATA	2	8	593624	593631	50 %	25 %	25 %	0 %	205351833
10032	NC_011274	GGC	3	9	593639	593647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351833
10033	NC_011274	CGGATG	2	12	593692	593703	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	205351833
10034	NC_011274	CGC	2	6	593725	593730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351833
10035	NC_011274	AGC	2	6	593731	593736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351833
10036	NC_011274	GC	3	6	593735	593740	0 %	0 %	50 %	50 %	205351833
10037	NC_011274	TTTA	2	8	593961	593968	25 %	75 %	0 %	0 %	205351834
10038	NC_011274	GA	3	6	594021	594026	50 %	0 %	50 %	0 %	205351834
10039	NC_011274	GACGT	2	10	594048	594057	20 %	20 %	40 %	20 %	205351834
10040	NC_011274	TCAGAT	2	12	594069	594080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	205351834
10041	NC_011274	ATC	2	6	594182	594187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351834
10042	NC_011274	CG	3	6	594235	594240	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
10043	NC_011274	ACTG	2	8	594255	594262	25 %	25 %	25 %	25 %	205351834
10044	NC_011274	CG	3	6	594303	594308	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
10045	NC_011274	CCTGCT	2	12	594414	594425	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	205351834
10046	NC_011274	GC	5	10	594524	594533	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
10047	NC_011274	CAA	2	6	594573	594578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351834
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10049	NC_011274	CGT	2	6	594648	594653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
10050	NC_011274	GCC	2	6	594655	594660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351834
10051	NC_011274	TAA	2	6	594672	594677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351834
10052	NC_011274	TCG	2	6	594716	594721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
10053	NC_011274	CAG	2	6	594730	594735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351834
10054	NC_011274	GAT	2	6	594799	594804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351834
10055	NC_011274	GC	3	6	594838	594843	0 %	0 %	50 %	50 %	205351834
10056	NC_011274	CTG	2	6	594901	594906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351834
10057	NC_011274	CGG	2	6	594915	594920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351834
10058	NC_011274	CGCC	2	8	594969	594976	0 %	0 %	25 %	75 %	205351834
10059	NC_011274	GCA	2	6	594981	594986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351834
10060	NC_011274	CGT	2	6	595112	595117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351835
10061	NC_011274	GCG	2	6	595135	595140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
10062	NC_011274	GCG	2	6	595147	595152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
10063	NC_011274	CG	3	6	595199	595204	0 %	0 %	50 %	50 %	205351835
10064	NC_011274	CGC	2	6	595235	595240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351835
10065	NC_011274	AGCGC	2	10	595243	595252	20 %	0 %	40 %	40 %	205351835
10066	NC_011274	GCGCC	2	10	595313	595322	0 %	0 %	40 %	60 %	205351835
10067	NC_011274	AAT	2	6	595335	595340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351835
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10069	NC_011274	CGG	2	6	595454	595459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351835
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10074	NC_011274	CGA	2	6	595835	595840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351836
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10079	NC_011274	GGC	2	6	595914	595919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351836
10080	NC_011274	CGG	3	9	595924	595932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351836
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10085	NC_011274	CGA	2	6	596318	596323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351836
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10088	NC_011274	TCT	2	6	596412	596417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351837
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10090	NC_011274	TTG	2	6	596652	596657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351837
10091	NC_011274	TGG	2	6	596680	596685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351837
10092	NC_011274	GCC	3	9	596711	596719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351837
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10098	NC_011274	CGA	2	6	597254	597259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351838
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10100	NC_011274	GATGT	2	10	597465	597474	20 %	40 %	40 %	0 %	205351838
10101	NC_011274	ACCG	2	8	597482	597489	25 %	0 %	25 %	50 %	205351838
10102	NC_011274	AGC	2	6	597526	597531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351838
10103	NC_011274	GGCG	2	8	597536	597543	0 %	0 %	75 %	25 %	205351838
10104	NC_011274	CG	4	8	597542	597549	0 %	0 %	50 %	50 %	205351838
10105	NC_011274	CGAGC	2	10	597614	597623	20 %	0 %	40 %	40 %	205351838
10106	NC_011274	CGG	3	9	597716	597724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351838
10107	NC_011274	GC	3	6	597775	597780	0 %	0 %	50 %	50 %	205351838
10108	NC_011274	ACT	2	6	597799	597804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351838
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10114	NC_011274	CGG	2	6	598039	598044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351838
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10116	NC_011274	ATGA	2	8	598080	598087	50 %	25 %	25 %	0 %	205351838
10117	NC_011274	CCG	2	6	598168	598173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351838
10118	NC_011274	CTG	2	6	598221	598226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351838
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10120	NC_011274	GCG	3	9	598341	598349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351838
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10235	NC_011274	CAT	2	6	604626	604631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351847
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10239	NC_011274	AGGGT	2	10	604979	604988	20 %	20 %	60 %	0 %	205351847
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10362	NC_011274	TA	3	6	612918	612923	50 %	50 %	0 %	0 %	205351855
10363	NC_011274	TA	3	6	612937	612942	50 %	50 %	0 %	0 %	205351855
10364	NC_011274	GTT	2	6	612946	612951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351855
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10472	NC_011274	ACT	2	6	619981	619986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351862
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10479	NC_011274	CAC	2	6	620287	620292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351862
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10481	NC_011274	TGA	2	6	620400	620405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351862
10482	NC_011274	CGTT	2	8	620423	620430	0 %	50 %	25 %	25 %	205351862
10483	NC_011274	GCC	2	6	620738	620743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351863
10484	NC_011274	TGCG	2	8	620794	620801	0 %	25 %	50 %	25 %	205351863
10485	NC_011274	CAT	2	6	620856	620861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351863
10486	NC_011274	CG	3	6	620895	620900	0 %	0 %	50 %	50 %	205351863
10487	NC_011274	GCC	2	6	620905	620910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351863
10488	NC_011274	CAT	2	6	620946	620951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351863
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10490	NC_011274	CTG	3	9	621090	621098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351863
10491	NC_011274	GTC	2	6	621156	621161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351863
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10493	NC_011274	CTG	3	9	621225	621233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351863
10494	NC_011274	CG	3	6	621260	621265	0 %	0 %	50 %	50 %	205351863
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10498	NC_011274	GCAG	2	8	621335	621342	25 %	0 %	50 %	25 %	205351863
10499	NC_011274	CTT	2	6	621377	621382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351863
10500	NC_011274	TCA	2	6	621434	621439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351863

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