MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011274	AATGC	2	10	423980	423989	40 %	20 %	20 %	20 %	205351686
7002	NC_011274	GAC	2	6	423991	423996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7003	NC_011274	TGT	2	6	424030	424035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351686
7004	NC_011274	CTT	2	6	424060	424065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351686
7005	NC_011274	AAT	2	6	424154	424159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351686
7006	NC_011274	GCA	2	6	424178	424183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7007	NC_011274	GACA	2	8	424198	424205	50 %	0 %	25 %	25 %	205351686
7008	NC_011274	GCAACT	2	12	424325	424336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	205351686
7009	NC_011274	ACT	2	6	424493	424498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351686
7010	NC_011274	TGAT	2	8	424509	424516	25 %	50 %	25 %	0 %	205351686
7011	NC_011274	TGT	2	6	424540	424545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351686
7012	NC_011274	TGG	2	6	424591	424596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351686
7013	NC_011274	TGA	2	6	424675	424680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351686
7014	NC_011274	CTG	2	6	424686	424691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7015	NC_011274	ATG	2	6	424704	424709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351686
7016	NC_011274	AAT	2	6	424742	424747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351686
7017	NC_011274	CTGAC	2	10	424884	424893	20 %	20 %	20 %	40 %	205351686
7018	NC_011274	ACGAC	2	10	424908	424917	40 %	0 %	20 %	40 %	205351686
7019	NC_011274	TAACGG	2	12	424975	424986	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	205351686
7020	NC_011274	GCA	2	6	425177	425182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7021	NC_011274	CGG	2	6	425377	425382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351686
7022	NC_011274	CGG	2	6	425401	425406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351686
7023	NC_011274	CAT	2	6	425458	425463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351686
7024	NC_011274	AAC	2	6	425492	425497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351686
7025	NC_011274	GCA	2	6	425519	425524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7026	NC_011274	ACA	2	6	425616	425621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351686
7027	NC_011274	TTG	2	6	425625	425630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351686
7028	NC_011274	CAA	2	6	425656	425661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351686
7029	NC_011274	CGA	2	6	425818	425823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7030	NC_011274	ACG	2	6	425964	425969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351686
7031	NC_011274	CAA	2	6	425974	425979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351686
7032	NC_011274	GAA	2	6	426067	426072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351686
7033	NC_011274	CGG	3	9	426103	426111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351686
7034	NC_011274	AAGC	2	8	426260	426267	50 %	0 %	25 %	25 %	205351687
7035	NC_011274	TGA	2	6	426359	426364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351687
7036	NC_011274	GTT	2	6	426399	426404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351687
7037	NC_011274	A	6	6	426483	426488	100 %	0 %	0 %	0 %	205351687
7038	NC_011274	AATT	2	8	426502	426509	50 %	50 %	0 %	0 %	205351687
7039	NC_011274	TCA	3	9	426540	426548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351687
7040	NC_011274	CAT	2	6	426560	426565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351687
7041	NC_011274	AAAC	2	8	426572	426579	75 %	0 %	0 %	25 %	205351687
7042	NC_011274	AGC	2	6	426640	426645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351687
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7044	NC_011274	GAA	2	6	426708	426713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351687
7045	NC_011274	TCA	2	6	426746	426751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351687
7046	NC_011274	CG	3	6	426757	426762	0 %	0 %	50 %	50 %	205351687
7047	NC_011274	GGT	2	6	426773	426778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351687
7048	NC_011274	ATATT	2	10	427038	427047	40 %	60 %	0 %	0 %	205351688
7049	NC_011274	ATC	2	6	427053	427058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351688
7050	NC_011274	TAA	2	6	427069	427074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351688
7051	NC_011274	CCG	2	6	427077	427082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351688
7052	NC_011274	CCT	3	9	427083	427091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351688
7053	NC_011274	CGTC	2	8	427113	427120	0 %	25 %	25 %	50 %	205351688
7054	NC_011274	ACCCA	2	10	427137	427146	40 %	0 %	0 %	60 %	205351688
7055	NC_011274	GAT	2	6	427184	427189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351688
7056	NC_011274	TG	3	6	427200	427205	0 %	50 %	50 %	0 %	205351688
7057	NC_011274	GAC	2	6	427263	427268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351688
7058	NC_011274	CAT	2	6	427289	427294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351688
7059	NC_011274	CAGC	2	8	427333	427340	25 %	0 %	25 %	50 %	205351688
7060	NC_011274	TAT	2	6	427342	427347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351688
7061	NC_011274	GTG	2	6	427413	427418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351688
7062	NC_011274	GCGG	2	8	427432	427439	0 %	0 %	75 %	25 %	205351688
7063	NC_011274	TTC	2	6	427448	427453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351688
7064	NC_011274	GCC	2	6	427530	427535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351688
7065	NC_011274	GTT	2	6	427585	427590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351688
7066	NC_011274	GCGCC	2	10	427621	427630	0 %	0 %	40 %	60 %	205351688
7067	NC_011274	GC	3	6	427651	427656	0 %	0 %	50 %	50 %	205351688
7068	NC_011274	GC	3	6	427714	427719	0 %	0 %	50 %	50 %	205351688
7069	NC_011274	GA	3	6	427811	427816	50 %	0 %	50 %	0 %	205351688
7070	NC_011274	ATT	2	6	427853	427858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351688
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7075	NC_011274	T	6	6	428596	428601	0 %	100 %	0 %	0 %	205351689
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7080	NC_011274	TGATT	2	10	428768	428777	20 %	60 %	20 %	0 %	205351689
7081	NC_011274	CGC	2	6	428794	428799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351689
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7085	NC_011274	CAT	2	6	429056	429061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351689
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7088	NC_011274	GTC	2	6	429198	429203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351689
7089	NC_011274	CGC	2	6	429301	429306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351689
7090	NC_011274	CCGT	2	8	429310	429317	0 %	25 %	25 %	50 %	205351689
7091	NC_011274	ACT	2	6	429343	429348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351689
7092	NC_011274	CG	3	6	429383	429388	0 %	0 %	50 %	50 %	205351689
7093	NC_011274	CTG	2	6	429429	429434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351689
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7099	NC_011274	CGG	2	6	429660	429665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351690
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7101	NC_011274	GTA	2	6	429717	429722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351690
7102	NC_011274	GTA	2	6	429776	429781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351690
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7104	NC_011274	AG	3	6	429812	429817	50 %	0 %	50 %	0 %	205351690
7105	NC_011274	GCTG	2	8	429892	429899	0 %	25 %	50 %	25 %	205351690
7106	NC_011274	CAG	2	6	429905	429910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351690
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7114	NC_011274	GGCAG	2	10	430501	430510	20 %	0 %	60 %	20 %	205351690
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7116	NC_011274	A	6	6	430572	430577	100 %	0 %	0 %	0 %	205351690
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7486	NC_011274	GA	3	6	450070	450075	50 %	0 %	50 %	0 %	205351710
7487	NC_011274	CGTAT	2	10	450103	450112	20 %	40 %	20 %	20 %	205351710
7488	NC_011274	AAC	2	6	450127	450132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351710
7489	NC_011274	GGC	2	6	450155	450160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351710
7490	NC_011274	TTA	2	6	450171	450176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351710
7491	NC_011274	GAT	2	6	450197	450202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351710
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7493	NC_011274	CGA	2	6	450269	450274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351710
7494	NC_011274	AGC	2	6	450301	450306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351710
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7499	NC_011274	TGC	2	6	450613	450618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351710
7500	NC_011274	CG	3	6	451078	451083	0 %	0 %	50 %	50 %	205351711

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