MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_011274	TTCAG	2	10	3820382	3820391	20 %	40 %	20 %	20 %	205354610
65003	NC_011274	GCA	2	6	3820422	3820427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65004	NC_011274	GC	3	6	3820472	3820477	0 %	0 %	50 %	50 %	205354610
65005	NC_011274	GCC	2	6	3820552	3820557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354610
65006	NC_011274	CAG	2	6	3820582	3820587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65007	NC_011274	GCG	2	6	3820653	3820658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354610
65008	NC_011274	CAG	2	6	3820711	3820716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65009	NC_011274	ACG	2	6	3820766	3820771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65010	NC_011274	AAC	2	6	3820784	3820789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205354610
65011	NC_011274	CCA	2	6	3820809	3820814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205354610
65012	NC_011274	CAG	2	6	3820830	3820835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65013	NC_011274	AG	3	6	3820834	3820839	50 %	0 %	50 %	0 %	205354610
65014	NC_011274	CCG	2	6	3820875	3820880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354610
65015	NC_011274	CAT	2	6	3820894	3820899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354610
65016	NC_011274	CGG	2	6	3820929	3820934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354610
65017	NC_011274	CAT	2	6	3821002	3821007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354610
65018	NC_011274	CAG	2	6	3821098	3821103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354610
65019	NC_011274	GGC	2	6	3821460	3821465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354611
65020	NC_011274	ATCA	2	8	3821506	3821513	50 %	25 %	0 %	25 %	205354611
65021	NC_011274	TCG	2	6	3821608	3821613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354611
65022	NC_011274	GCTG	2	8	3821705	3821712	0 %	25 %	50 %	25 %	205354611
65023	NC_011274	CTAT	2	8	3821816	3821823	25 %	50 %	0 %	25 %	205354611
65024	NC_011274	T	6	6	3821859	3821864	0 %	100 %	0 %	0 %	205354611
65025	NC_011274	CGT	2	6	3821908	3821913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354611
65026	NC_011274	GACA	2	8	3821965	3821972	50 %	0 %	25 %	25 %	205354611
65027	NC_011274	GCA	2	6	3822018	3822023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354611
65028	NC_011274	TGGCG	2	10	3822105	3822114	0 %	20 %	60 %	20 %	205354611
65029	NC_011274	GCG	2	6	3822152	3822157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354611
65030	NC_011274	TCA	2	6	3822195	3822200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354611
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65032	NC_011274	CAC	2	6	3822213	3822218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205354611
65033	NC_011274	GGCA	2	8	3822226	3822233	25 %	0 %	50 %	25 %	205354611
65034	NC_011274	CGT	2	6	3822366	3822371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354612
65035	NC_011274	CT	3	6	3822390	3822395	0 %	50 %	0 %	50 %	205354612
65036	NC_011274	GTC	2	6	3822412	3822417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354612
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65038	NC_011274	GCA	2	6	3822456	3822461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354612
65039	NC_011274	GATG	2	8	3822474	3822481	25 %	25 %	50 %	0 %	205354612
65040	NC_011274	GAACG	2	10	3822494	3822503	40 %	0 %	40 %	20 %	205354612
65041	NC_011274	GC	3	6	3822584	3822589	0 %	0 %	50 %	50 %	205354612
65042	NC_011274	GC	3	6	3822598	3822603	0 %	0 %	50 %	50 %	205354612
65043	NC_011274	ATT	2	6	3822658	3822663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205354612
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65049	NC_011274	GC	3	6	3822909	3822914	0 %	0 %	50 %	50 %	205354612
65050	NC_011274	GGA	2	6	3822921	3822926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205354612
65051	NC_011274	TCT	2	6	3822986	3822991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205354612
65052	NC_011274	GCG	2	6	3823010	3823015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354612
65053	NC_011274	CGG	3	9	3823040	3823048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354612
65054	NC_011274	GCG	2	6	3823054	3823059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354612
65055	NC_011274	GCA	2	6	3823092	3823097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354612
65056	NC_011274	TGGG	2	8	3823117	3823124	0 %	25 %	75 %	0 %	205354612
65057	NC_011274	GTTTGC	2	12	3823173	3823184	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	205354612
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65061	NC_011274	CAGC	2	8	3823400	3823407	25 %	0 %	25 %	50 %	205354612
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65065	NC_011274	CGC	2	6	3823573	3823578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354613
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65088	NC_011274	CG	3	6	3824176	3824181	0 %	0 %	50 %	50 %	205354613
65089	NC_011274	GGC	2	6	3824237	3824242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354613
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65101	NC_011274	T	6	6	3824961	3824966	0 %	100 %	0 %	0 %	205354614
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65118	NC_011274	CTA	2	6	3826448	3826453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354615
65119	NC_011274	GTC	2	6	3826478	3826483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354615
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65121	NC_011274	GTC	2	6	3826499	3826504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354615
65122	NC_011274	CGG	2	6	3826730	3826735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354616
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65227	NC_011274	GCG	2	6	3832099	3832104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354621
65228	NC_011274	GAT	2	6	3832166	3832171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205354621
65229	NC_011274	GTG	2	6	3832245	3832250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205354621
65230	NC_011274	TTGCT	2	10	3832262	3832271	0 %	60 %	20 %	20 %	205354621
65231	NC_011274	GCT	2	6	3832347	3832352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354621
65232	NC_011274	GAC	2	6	3832356	3832361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205354621
65233	NC_011274	CTGG	2	8	3832364	3832371	0 %	25 %	50 %	25 %	205354621
65234	NC_011274	TCA	2	6	3832430	3832435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354621
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65237	NC_011274	TGGC	2	8	3832653	3832660	0 %	25 %	50 %	25 %	205354621
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65332	NC_011274	TGC	3	9	3836544	3836552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354624
65333	NC_011274	CG	3	6	3836574	3836579	0 %	0 %	50 %	50 %	205354624
65334	NC_011274	CTT	2	6	3836747	3836752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205354625
65335	NC_011274	GCG	2	6	3836795	3836800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354625
65336	NC_011274	TGG	2	6	3836836	3836841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205354625
65337	NC_011274	CTAC	2	8	3836911	3836918	25 %	25 %	0 %	50 %	205354625
65338	NC_011274	GAT	2	6	3836942	3836947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205354625
65339	NC_011274	CTA	2	6	3836996	3837001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354625
65340	NC_011274	TCCTC	2	10	3837046	3837055	0 %	40 %	0 %	60 %	205354625
65341	NC_011274	TGA	2	6	3837112	3837117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205354625
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65343	NC_011274	CGG	2	6	3837155	3837160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354625
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65465	NC_011274	TGG	2	6	3844438	3844443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205354632
65466	NC_011274	CG	3	6	3844481	3844486	0 %	0 %	50 %	50 %	205354632
65467	NC_011274	AG	3	6	3844535	3844540	50 %	0 %	50 %	0 %	205354632
65468	NC_011274	CG	3	6	3844564	3844569	0 %	0 %	50 %	50 %	205354632
65469	NC_011274	C	6	6	3844598	3844603	0 %	0 %	0 %	100 %	205354632
65470	NC_011274	CCG	2	6	3844686	3844691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354632
65471	NC_011274	GCT	2	6	3844724	3844729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354632
65472	NC_011274	GCT	2	6	3844901	3844906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354632
65473	NC_011274	CTG	2	6	3844926	3844931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354632
65474	NC_011274	GCC	2	6	3844987	3844992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354632
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65480	NC_011274	AGAT	2	8	3845263	3845270	50 %	25 %	25 %	0 %	205354632
65481	NC_011274	CTG	2	6	3845304	3845309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354632
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65485	NC_011274	A	6	6	3845467	3845472	100 %	0 %	0 %	0 %	205354632
65486	NC_011274	GGA	2	6	3845486	3845491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205354632
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65488	NC_011274	AGCG	2	8	3845589	3845596	25 %	0 %	50 %	25 %	205354632
65489	NC_011274	AGCGC	2	10	3845746	3845755	20 %	0 %	40 %	40 %	205354632
65490	NC_011274	GC	3	6	3845770	3845775	0 %	0 %	50 %	50 %	205354632
65491	NC_011274	ATC	2	6	3845790	3845795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354632
65492	NC_011274	GCC	2	6	3845887	3845892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205354632
65493	NC_011274	CTG	3	9	3845918	3845926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354632
65494	NC_011274	CG	5	10	3845996	3846005	0 %	0 %	50 %	50 %	205354632
65495	NC_011274	TCA	2	6	3846013	3846018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205354632
65496	NC_011274	CA	3	6	3846334	3846339	50 %	0 %	0 %	50 %	205354633
65497	NC_011274	CTG	3	9	3846356	3846364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205354633
65498	NC_011274	GGC	2	6	3846371	3846376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354633
65499	NC_011274	GTG	2	6	3846494	3846499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205354633
65500	NC_011274	CGG	2	6	3846541	3846546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205354633

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