MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011274	CAC	3	9	94	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351347
2	NC_011274	ACC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351347
3	NC_011274	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
4	NC_011274	ACCA	2	8	356	363	50 %	0 %	0 %	50 %	205351348
5	NC_011274	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
6	NC_011274	GAT	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
7	NC_011274	A	6	6	381	386	100 %	0 %	0 %	0 %	205351348
8	NC_011274	CGG	2	6	391	396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
9	NC_011274	T	6	6	435	440	0 %	100 %	0 %	0 %	205351348
10	NC_011274	GC	3	6	465	470	0 %	0 %	50 %	50 %	205351348
11	NC_011274	CTG	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
12	NC_011274	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
13	NC_011274	A	6	6	606	611	100 %	0 %	0 %	0 %	205351348
14	NC_011274	GATC	2	8	667	674	25 %	25 %	25 %	25 %	205351348
15	NC_011274	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
16	NC_011274	CCG	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
17	NC_011274	TGG	2	6	822	827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
18	NC_011274	CCG	3	9	855	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
19	NC_011274	GCC	2	6	869	874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
20	NC_011274	CTG	2	6	889	894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
21	NC_011274	GCT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
22	NC_011274	CT	3	6	995	1000	0 %	50 %	0 %	50 %	205351348
23	NC_011274	TTC	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
24	NC_011274	CGA	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
25	NC_011274	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351348
26	NC_011274	GAT	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
27	NC_011274	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
28	NC_011274	CGC	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
29	NC_011274	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
30	NC_011274	TCC	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351348
31	NC_011274	TG	3	6	1307	1312	0 %	50 %	50 %	0 %	205351348
32	NC_011274	GC	3	6	1326	1331	0 %	0 %	50 %	50 %	205351348
33	NC_011274	CCG	2	6	1336	1341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
34	NC_011274	GCT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
35	NC_011274	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351348
36	NC_011274	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
37	NC_011274	AATATC	2	12	1496	1507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	205351348
38	NC_011274	TCT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351348
39	NC_011274	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351348
40	NC_011274	ACG	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
41	NC_011274	CCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351348
42	NC_011274	CGG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
43	NC_011274	CGG	2	6	1654	1659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
44	NC_011274	GAA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351348
45	NC_011274	GCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
46	NC_011274	ATC	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351348
47	NC_011274	TTG	2	6	1878	1883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351348
48	NC_011274	TCG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
49	NC_011274	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351348
50	NC_011274	CGC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
51	NC_011274	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
52	NC_011274	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
53	NC_011274	CT	3	6	2144	2149	0 %	50 %	0 %	50 %	205351348
54	NC_011274	TC	3	6	2182	2187	0 %	50 %	0 %	50 %	205351348
55	NC_011274	GC	3	6	2204	2209	0 %	0 %	50 %	50 %	205351348
56	NC_011274	CG	3	6	2235	2240	0 %	0 %	50 %	50 %	205351348
57	NC_011274	GAC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351348
58	NC_011274	GCC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351348
59	NC_011274	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
60	NC_011274	AGGTA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	40 %	0 %	205351348
61	NC_011274	TAT	2	6	2576	2581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351348
62	NC_011274	TGC	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351348
63	NC_011274	ATG	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351348
64	NC_011274	CGG	3	9	2631	2639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351348
65	NC_011274	AGC	2	6	2807	2812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
66	NC_011274	GCC	2	6	2858	2863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
67	NC_011274	A	7	7	2950	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	205351349
68	NC_011274	CGT	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351349
69	NC_011274	CGC	2	6	3002	3007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
70	NC_011274	ATGA	2	8	3018	3025	50 %	25 %	25 %	0 %	205351349
71	NC_011274	GCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
72	NC_011274	TGA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
73	NC_011274	GAA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351349
74	NC_011274	ATT	2	6	3168	3173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351349
75	NC_011274	CAG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351349
76	NC_011274	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
77	NC_011274	ATTGC	2	10	3286	3295	20 %	40 %	20 %	20 %	205351349
78	NC_011274	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351349
79	NC_011274	TGA	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
80	NC_011274	CG	4	8	3393	3400	0 %	0 %	50 %	50 %	205351349
81	NC_011274	GC	3	6	3448	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	205351349
82	NC_011274	CGG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351349
83	NC_011274	AGT	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351349
84	NC_011274	CAG	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351350
85	NC_011274	T	8	8	3709	3716	0 %	100 %	0 %	0 %	205351350
86	NC_011274	TGA	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
87	NC_011274	GCA	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351350
88	NC_011274	CG	3	6	3852	3857	0 %	0 %	50 %	50 %	205351350
89	NC_011274	CGG	2	6	3950	3955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
90	NC_011274	GCG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
91	NC_011274	CGGCG	2	10	4034	4043	0 %	0 %	60 %	40 %	205351350
92	NC_011274	GTC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
93	NC_011274	CG	3	6	4096	4101	0 %	0 %	50 %	50 %	205351350
94	NC_011274	GGC	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
95	NC_011274	TGA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
96	NC_011274	GAA	2	6	4221	4226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351350
97	NC_011274	GCC	2	6	4273	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
98	NC_011274	CTA	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351350
99	NC_011274	CTG	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
100	NC_011274	CGC	2	6	4433	4438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
101	NC_011274	GATG	2	8	4523	4530	25 %	25 %	50 %	0 %	205351350
102	NC_011274	CAGC	2	8	4532	4539	25 %	0 %	25 %	50 %	205351350
103	NC_011274	GGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351350
104	NC_011274	CCG	2	6	4571	4576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
105	NC_011274	CTGA	2	8	4590	4597	25 %	25 %	25 %	25 %	205351350
106	NC_011274	GCG	2	6	4608	4613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
107	NC_011274	ACA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351350
108	NC_011274	GCG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351350
109	NC_011274	AAAG	2	8	4770	4777	75 %	0 %	25 %	0 %	205351350
110	NC_011274	GCT	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351350
111	NC_011274	CAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351350
112	NC_011274	CTGC	2	8	4860	4867	0 %	25 %	25 %	50 %	205351350
113	NC_011274	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351350
114	NC_011274	TGA	3	9	4891	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351350
115	NC_011274	TG	3	6	5038	5043	0 %	50 %	50 %	0 %	205351351
116	NC_011274	TCA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
117	NC_011274	AAT	2	6	5118	5123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351351
118	NC_011274	TCA	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
119	NC_011274	CG	3	6	5141	5146	0 %	0 %	50 %	50 %	205351351
120	NC_011274	T	6	6	5148	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	205351351
121	NC_011274	ACC	2	6	5167	5172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351351
122	NC_011274	TCA	2	6	5191	5196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351351
123	NC_011274	TTC	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351351
124	NC_011274	CAC	3	9	5274	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351351
125	NC_011274	CG	3	6	5360	5365	0 %	0 %	50 %	50 %	205351351
126	NC_011274	AG	3	6	5442	5447	50 %	0 %	50 %	0 %	205351351
127	NC_011274	TGT	2	6	5458	5463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351351
128	NC_011274	CAAAAT	2	12	5468	5479	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	205351351
129	NC_011274	CGT	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351351
130	NC_011274	GCG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351351
131	NC_011274	GCT	2	6	5678	5683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351351
132	NC_011274	AATCAG	2	12	5763	5774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	205351351
133	NC_011274	CG	3	6	5861	5866	0 %	0 %	50 %	50 %	205351352
134	NC_011274	ACC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351352
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138	NC_011274	CGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351352
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264	NC_011274	CAG	2	6	14032	14037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351358
265	NC_011274	CGG	2	6	14144	14149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351358
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268	NC_011274	GGC	2	6	14313	14318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351358
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270	NC_011274	GTG	2	6	14467	14472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351358
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272	NC_011274	GGC	2	6	14539	14544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351358
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285	NC_011274	TTA	2	6	15209	15214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351359
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295	NC_011274	TGA	2	6	15627	15632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351359
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373	NC_011274	AAAT	2	8	25363	25370	75 %	25 %	0 %	0 %	205351365
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388	NC_011274	GGC	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
389	NC_011274	ACT	2	6	26359	26364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351366
390	NC_011274	GCG	2	6	26383	26388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351366
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392	NC_011274	GCA	2	6	26411	26416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351366
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