MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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20116	NC_011205	TTG	2	6	1110696	1110701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245317
20117	NC_011205	CGG	2	6	1110715	1110720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245317
20118	NC_011205	CGG	2	6	1110846	1110851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245887
20119	NC_011205	GGGCG	2	10	1110906	1110915	0 %	0 %	80 %	20 %	198245887
20120	NC_011205	TGG	2	6	1110977	1110982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245887
20121	NC_011205	GCT	2	6	1111035	1111040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245887
20122	NC_011205	TGA	2	6	1111067	1111072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245887
20123	NC_011205	GC	3	6	1111124	1111129	0 %	0 %	50 %	50 %	198245887
20124	NC_011205	GCAG	2	8	1111131	1111138	25 %	0 %	50 %	25 %	198245887
20125	NC_011205	TAC	2	6	1111139	1111144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245887
20126	NC_011205	TCG	2	6	1111175	1111180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245887
20127	NC_011205	CAT	2	6	1111191	1111196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245887
20128	NC_011205	CTG	2	6	1111249	1111254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245887
20129	NC_011205	AAT	2	6	1111324	1111329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242527
20130	NC_011205	GGC	2	6	1111348	1111353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242527
20131	NC_011205	CGG	3	9	1111382	1111390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242527
20132	NC_011205	AT	3	6	1111551	1111556	50 %	50 %	0 %	0 %	198245985
20133	NC_011205	T	6	6	1111773	1111778	0 %	100 %	0 %	0 %	198243005
20134	NC_011205	CGC	2	6	1111914	1111919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243005
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20136	NC_011205	GCA	2	6	1111966	1111971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243005
20137	NC_011205	CAGA	2	8	1111975	1111982	50 %	0 %	25 %	25 %	198243005
20138	NC_011205	TGG	2	6	1112251	1112256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243005
20139	NC_011205	AAT	2	6	1112294	1112299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243005
20140	NC_011205	GTAT	2	8	1112310	1112317	25 %	50 %	25 %	0 %	198243005
20141	NC_011205	ATT	2	6	1112369	1112374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243005
20142	NC_011205	GTG	2	6	1112408	1112413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198243005
20143	NC_011205	A	6	6	1112465	1112470	100 %	0 %	0 %	0 %	198243005
20144	NC_011205	GGA	2	6	1112473	1112478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198243005
20145	NC_011205	ACC	2	6	1112499	1112504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243005
20146	NC_011205	ATA	2	6	1112556	1112561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243005
20147	NC_011205	TGA	2	6	1112671	1112676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243005
20148	NC_011205	TCT	2	6	1112716	1112721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198243005
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20150	NC_011205	GGC	2	6	1112827	1112832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242478
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20152	NC_011205	GCC	2	6	1112863	1112868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242478
20153	NC_011205	GTC	2	6	1112905	1112910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242478
20154	NC_011205	AGTC	2	8	1112911	1112918	25 %	25 %	25 %	25 %	198242478
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20156	NC_011205	CGG	2	6	1113050	1113055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242478
20157	NC_011205	TACC	2	8	1113057	1113064	25 %	25 %	0 %	50 %	198242478
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20162	NC_011205	CT	3	6	1113746	1113751	0 %	50 %	0 %	50 %	198244531
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20173	NC_011205	ACCTG	2	10	1114350	1114359	20 %	20 %	20 %	40 %	198243497
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20186	NC_011205	AAC	2	6	1115175	1115180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245055
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20192	NC_011205	T	8	8	1115554	1115561	0 %	100 %	0 %	0 %	198245055
20193	NC_011205	TTTA	2	8	1115640	1115647	25 %	75 %	0 %	0 %	198245055
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20199	NC_011205	GAC	2	6	1115737	1115742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244544
20200	NC_011205	CAG	2	6	1115886	1115891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244544
20201	NC_011205	TAA	2	6	1115893	1115898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244544
20202	NC_011205	ACA	2	6	1115933	1115938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244544
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20204	NC_011205	TGG	2	6	1116106	1116111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244544
20205	NC_011205	GGA	2	6	1116194	1116199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244544
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20209	NC_011205	TGA	2	6	1116439	1116444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244544
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20211	NC_011205	GC	3	6	1116567	1116572	0 %	0 %	50 %	50 %	198244544
20212	NC_011205	ACTG	2	8	1116580	1116587	25 %	25 %	25 %	25 %	198244544
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20218	NC_011205	CAA	2	6	1117033	1117038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244544
20219	NC_011205	CGG	2	6	1117153	1117158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244544
20220	NC_011205	AGG	2	6	1117207	1117212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244544
20221	NC_011205	GGA	2	6	1117262	1117267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244544
20222	NC_011205	TA	3	6	1117283	1117288	50 %	50 %	0 %	0 %	198244544
20223	NC_011205	CGT	2	6	1117303	1117308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244544
20224	NC_011205	CCG	2	6	1117480	1117485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241967
20225	NC_011205	CA	3	6	1117486	1117491	50 %	0 %	0 %	50 %	198241967
20226	NC_011205	CCT	2	6	1117522	1117527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241967
20227	NC_011205	ACA	2	6	1117618	1117623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241967
20228	NC_011205	GGT	2	6	1117690	1117695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241967
20229	NC_011205	AGC	2	6	1117755	1117760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241967
20230	NC_011205	GAA	2	6	1117777	1117782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241967
20231	NC_011205	A	6	6	1117814	1117819	100 %	0 %	0 %	0 %	198241967
20232	NC_011205	GAT	2	6	1117861	1117866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241967
20233	NC_011205	CGA	2	6	1117881	1117886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241967
20234	NC_011205	A	6	6	1117891	1117896	100 %	0 %	0 %	0 %	198241967
20235	NC_011205	GGAT	2	8	1117916	1117923	25 %	25 %	50 %	0 %	198241967
20236	NC_011205	GCC	2	6	1117927	1117932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241967
20237	NC_011205	CCAG	3	12	1117951	1117962	25 %	0 %	25 %	50 %	198241967
20238	NC_011205	GAT	2	6	1118215	1118220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245534
20239	NC_011205	A	6	6	1118246	1118251	100 %	0 %	0 %	0 %	198245534
20240	NC_011205	TCA	2	6	1118291	1118296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245534
20241	NC_011205	TCT	2	6	1118308	1118313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245534
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20243	NC_011205	CAT	2	6	1118478	1118483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245372
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20245	NC_011205	C	7	7	1118522	1118528	0 %	0 %	0 %	100 %	198245372
20246	NC_011205	A	6	6	1118546	1118551	100 %	0 %	0 %	0 %	198245372
20247	NC_011205	T	7	7	1118560	1118566	0 %	100 %	0 %	0 %	198245372
20248	NC_011205	GCCG	2	8	1118619	1118626	0 %	0 %	50 %	50 %	198245372
20249	NC_011205	ACG	2	6	1118629	1118634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245372
20250	NC_011205	GGA	2	6	1118637	1118642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245372
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20252	NC_011205	GGA	2	6	1118691	1118696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245372
20253	NC_011205	CATT	2	8	1118700	1118707	25 %	50 %	0 %	25 %	198245372
20254	NC_011205	ACT	2	6	1118726	1118731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245372
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20256	NC_011205	TGC	2	6	1118901	1118906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245372
20257	NC_011205	GGA	2	6	1118916	1118921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245372
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20260	NC_011205	ATGA	2	8	1119007	1119014	50 %	25 %	25 %	0 %	198245372
20261	NC_011205	ATA	2	6	1119026	1119031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245372
20262	NC_011205	AAC	2	6	1119078	1119083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245372
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20333	NC_011205	TCA	2	6	1124365	1124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243924
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20336	NC_011205	ATC	2	6	1124607	1124612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243924
20337	NC_011205	AAT	2	6	1124741	1124746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243924
20338	NC_011205	GGC	2	6	1124761	1124766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243924
20339	NC_011205	CTG	2	6	1124772	1124777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243924
20340	NC_011205	GGC	2	6	1124782	1124787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243924
20341	NC_011205	TGCCG	2	10	1124793	1124802	0 %	20 %	40 %	40 %	198243924
20342	NC_011205	CGG	2	6	1124889	1124894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243924
20343	NC_011205	GCA	2	6	1124991	1124996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243924
20344	NC_011205	CGG	2	6	1125000	1125005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243924
20345	NC_011205	TGCG	2	8	1125150	1125157	0 %	25 %	50 %	25 %	198243924
20346	NC_011205	TTCG	2	8	1125452	1125459	0 %	50 %	25 %	25 %	198243233
20347	NC_011205	GC	3	6	1125487	1125492	0 %	0 %	50 %	50 %	198243233
20348	NC_011205	CAA	2	6	1125509	1125514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198243233
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20350	NC_011205	CGC	2	6	1125534	1125539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243233
20351	NC_011205	GCTG	2	8	1125616	1125623	0 %	25 %	50 %	25 %	198243233
20352	NC_011205	CGC	2	6	1125702	1125707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243233
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20451	NC_011205	CTGG	2	8	1131062	1131069	0 %	25 %	50 %	25 %	198242644
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20456	NC_011205	CTG	2	6	1131207	1131212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242644
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20460	NC_011205	GC	3	6	1131309	1131314	0 %	0 %	50 %	50 %	198242644
20461	NC_011205	CGT	2	6	1131357	1131362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242644
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20464	NC_011205	A	6	6	1131673	1131678	100 %	0 %	0 %	0 %	198242644
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20466	NC_011205	CG	3	6	1131798	1131803	0 %	0 %	50 %	50 %	198242644
20467	NC_011205	CGG	2	6	1131809	1131814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242644
20468	NC_011205	CTG	3	9	1131828	1131836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242644
20469	NC_011205	AACG	2	8	1131884	1131891	50 %	0 %	25 %	25 %	198242644
20470	NC_011205	AGA	2	6	1131920	1131925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242644
20471	NC_011205	TAC	2	6	1131952	1131957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242644
20472	NC_011205	ATA	2	6	1131985	1131990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242644
20473	NC_011205	GCG	2	6	1132018	1132023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242644
20474	NC_011205	CGG	2	6	1132043	1132048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242644
20475	NC_011205	ATG	2	6	1132054	1132059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242644
20476	NC_011205	GCA	2	6	1132067	1132072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242644
20477	NC_011205	AGC	2	6	1132075	1132080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242644
20478	NC_011205	CGA	2	6	1132087	1132092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242644
20479	NC_011205	A	8	8	1132107	1132114	100 %	0 %	0 %	0 %	198242644
20480	NC_011205	GAAGC	2	10	1132224	1132233	40 %	0 %	40 %	20 %	198242644
20481	NC_011205	T	6	6	1132269	1132274	0 %	100 %	0 %	0 %	198242644
20482	NC_011205	TG	3	6	1132407	1132412	0 %	50 %	50 %	0 %	198242144
20483	NC_011205	TGC	2	6	1132423	1132428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20484	NC_011205	TGG	2	6	1132461	1132466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198242144
20485	NC_011205	AGC	2	6	1132495	1132500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20486	NC_011205	GCG	2	6	1132512	1132517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242144
20487	NC_011205	TGC	2	6	1132590	1132595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20488	NC_011205	TAT	2	6	1132716	1132721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242144
20489	NC_011205	CTATT	2	10	1132755	1132764	20 %	60 %	0 %	20 %	198242144
20490	NC_011205	A	8	8	1132798	1132805	100 %	0 %	0 %	0 %	198242144
20491	NC_011205	TCC	2	6	1132824	1132829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198242144
20492	NC_011205	ATCGGC	2	12	1132907	1132918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20493	NC_011205	AGC	2	6	1132919	1132924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20494	NC_011205	GT	3	6	1132972	1132977	0 %	50 %	50 %	0 %	198242144
20495	NC_011205	CGC	2	6	1132982	1132987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242144
20496	NC_011205	GAT	2	6	1132997	1133002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242144
20497	NC_011205	CTG	2	6	1133080	1133085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242144
20498	NC_011205	CCTG	2	8	1133095	1133102	0 %	25 %	25 %	50 %	198242144
20499	NC_011205	TTA	2	6	1133180	1133185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242144
20500	NC_011205	CTGG	2	8	1133273	1133280	0 %	25 %	50 %	25 %	198242144

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