MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011205	CCG	3	9	810955	810963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198246067
14502	NC_011205	CCT	2	6	810986	810991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198246067
14503	NC_011205	GTT	2	6	811019	811024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198246067
14504	NC_011205	GTG	2	6	811039	811044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198246067
14505	NC_011205	TTG	2	6	811080	811085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198246067
14506	NC_011205	A	6	6	811089	811094	100 %	0 %	0 %	0 %	198246067
14507	NC_011205	ATA	2	6	811121	811126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198246067
14508	NC_011205	ACC	2	6	811213	811218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198246067
14509	NC_011205	CGC	2	6	811230	811235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198246067
14510	NC_011205	CGC	2	6	811295	811300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198246067
14511	NC_011205	CGG	2	6	811337	811342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198246067
14512	NC_011205	CAG	2	6	811413	811418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198246067
14513	NC_011205	CAG	2	6	811440	811445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198246067
14514	NC_011205	GCCA	2	8	811533	811540	25 %	0 %	25 %	50 %	198246067
14515	NC_011205	AACGG	2	10	811549	811558	40 %	0 %	40 %	20 %	198246067
14516	NC_011205	A	6	6	811618	811623	100 %	0 %	0 %	0 %	198246067
14517	NC_011205	T	6	6	811787	811792	0 %	100 %	0 %	0 %	198244345
14518	NC_011205	A	7	7	811831	811837	100 %	0 %	0 %	0 %	198244345
14519	NC_011205	CGT	2	6	812123	812128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245007
14520	NC_011205	CG	4	8	812186	812193	0 %	0 %	50 %	50 %	198245007
14521	NC_011205	ATGG	2	8	812245	812252	25 %	25 %	50 %	0 %	198245007
14522	NC_011205	TTA	2	6	812281	812286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245007
14523	NC_011205	CCCA	2	8	812402	812409	25 %	0 %	0 %	75 %	198244498
14524	NC_011205	GCC	3	9	812459	812467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14525	NC_011205	CG	3	6	812482	812487	0 %	0 %	50 %	50 %	198244498
14526	NC_011205	GGC	2	6	812551	812556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14527	NC_011205	TCA	2	6	812559	812564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244498
14528	NC_011205	GC	3	6	812565	812570	0 %	0 %	50 %	50 %	198244498
14529	NC_011205	GGC	2	6	812587	812592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14530	NC_011205	GCT	2	6	812614	812619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244498
14531	NC_011205	GCG	2	6	812741	812746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14532	NC_011205	A	6	6	812751	812756	100 %	0 %	0 %	0 %	198244498
14533	NC_011205	TGA	2	6	812817	812822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244498
14534	NC_011205	CCG	2	6	812897	812902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14535	NC_011205	GCG	2	6	812931	812936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14536	NC_011205	CGC	2	6	812992	812997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14537	NC_011205	GAA	2	6	813011	813016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244498
14538	NC_011205	GC	3	6	813048	813053	0 %	0 %	50 %	50 %	198244498
14539	NC_011205	GGC	2	6	813134	813139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14540	NC_011205	CGC	2	6	813144	813149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14541	NC_011205	CGG	2	6	813196	813201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14542	NC_011205	TGAA	2	8	813219	813226	50 %	25 %	25 %	0 %	198244498
14543	NC_011205	CGCGT	2	10	813311	813320	0 %	20 %	40 %	40 %	198244498
14544	NC_011205	GCG	2	6	813386	813391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14545	NC_011205	TTGA	2	8	813470	813477	25 %	50 %	25 %	0 %	198244498
14546	NC_011205	GCC	2	6	813530	813535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
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14549	NC_011205	GCC	2	6	813557	813562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14550	NC_011205	CGC	2	6	813577	813582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244498
14551	NC_011205	GA	3	6	813618	813623	50 %	0 %	50 %	0 %	198244498
14552	NC_011205	GGC	2	6	813799	813804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244498
14553	NC_011205	GC	3	6	813876	813881	0 %	0 %	50 %	50 %	198245004
14554	NC_011205	TTTGAA	2	12	813886	813897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	198245004
14555	NC_011205	CAG	2	6	813916	813921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
14556	NC_011205	GC	3	6	813942	813947	0 %	0 %	50 %	50 %	198245004
14557	NC_011205	CGC	2	6	814002	814007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245004
14558	NC_011205	CAG	2	6	814078	814083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
14559	NC_011205	GCG	2	6	814229	814234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245004
14560	NC_011205	TCA	2	6	814275	814280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245004
14561	NC_011205	CT	3	6	814337	814342	0 %	50 %	0 %	50 %	198245004
14562	NC_011205	CCAG	2	8	814347	814354	25 %	0 %	25 %	50 %	198245004
14563	NC_011205	GAC	2	6	814360	814365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
14564	NC_011205	CA	3	6	814368	814373	50 %	0 %	0 %	50 %	198245004
14565	NC_011205	GCC	2	6	814477	814482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245004
14566	NC_011205	CTG	2	6	814483	814488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245004
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14568	NC_011205	AGAC	2	8	814629	814636	50 %	0 %	25 %	25 %	198245004
14569	NC_011205	CAGAA	2	10	814646	814655	60 %	0 %	20 %	20 %	198245004
14570	NC_011205	CAG	2	6	814681	814686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
14571	NC_011205	CAGC	2	8	814693	814700	25 %	0 %	25 %	50 %	198245004
14572	NC_011205	GCA	2	6	814710	814715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
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14580	NC_011205	CGCGG	2	10	814932	814941	0 %	0 %	60 %	40 %	198245004
14581	NC_011205	CAG	2	6	814966	814971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245004
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14585	NC_011205	GTA	2	6	815302	815307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245004
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14601	NC_011205	GTT	2	6	816441	816446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244656
14602	NC_011205	CGG	2	6	816462	816467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244656
14603	NC_011205	CCG	2	6	816485	816490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244656
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14605	NC_011205	TGG	2	6	816647	816652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244656
14606	NC_011205	AG	3	6	816655	816660	50 %	0 %	50 %	0 %	198244656
14607	NC_011205	GGC	2	6	816710	816715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244656
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14609	NC_011205	GGCAC	2	10	816742	816751	20 %	0 %	40 %	40 %	198244656
14610	NC_011205	GTC	2	6	816803	816808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244656
14611	NC_011205	CG	3	6	816878	816883	0 %	0 %	50 %	50 %	198244656
14612	NC_011205	CCGG	2	8	816902	816909	0 %	0 %	50 %	50 %	198244656
14613	NC_011205	CGG	2	6	816922	816927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244656
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14618	NC_011205	GCG	2	6	817163	817168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243417
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14621	NC_011205	GTA	2	6	817460	817465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243417
14622	NC_011205	GCT	2	6	817503	817508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243417
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14624	NC_011205	CTG	2	6	817747	817752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243417
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14653	NC_011205	GGTC	2	8	819230	819237	0 %	25 %	50 %	25 %	198244062
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14655	NC_011205	CGC	2	6	819292	819297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244062
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14743	NC_011205	CGG	2	6	824258	824263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242418
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14978	NC_011205	CGA	2	6	838050	838055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243267
14979	NC_011205	ACGCA	2	10	838111	838120	40 %	0 %	20 %	40 %	198243267
14980	NC_011205	GCT	2	6	838140	838145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243267
14981	NC_011205	TGAC	2	8	838237	838244	25 %	25 %	25 %	25 %	198243267
14982	NC_011205	TTGATT	2	12	838299	838310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	198242904
14983	NC_011205	CAT	2	6	838334	838339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242904
14984	NC_011205	CGC	2	6	838364	838369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242904
14985	NC_011205	ATGC	2	8	838683	838690	25 %	25 %	25 %	25 %	198242904
14986	NC_011205	ATTG	2	8	838757	838764	25 %	50 %	25 %	0 %	198242904
14987	NC_011205	GCC	2	6	838785	838790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242904
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14989	NC_011205	GTC	2	6	838954	838959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243683
14990	NC_011205	TGC	2	6	839014	839019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243683
14991	NC_011205	AGT	2	6	839100	839105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198243683
14992	NC_011205	ACG	2	6	839107	839112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243683
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14997	NC_011205	TGC	2	6	839483	839488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244347
14998	NC_011205	ATC	2	6	839491	839496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244347
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15000	NC_011205	CGG	4	12	839550	839561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244347

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