MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011205	GGA	2	6	605569	605574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244546
11002	NC_011205	CAG	2	6	605696	605701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244546
11003	NC_011205	GAG	2	6	605704	605709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198244546
11004	NC_011205	CGG	2	6	605752	605757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244546
11005	NC_011205	ACG	2	6	605913	605918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198246056
11006	NC_011205	GC	3	6	606034	606039	0 %	0 %	50 %	50 %	198246056
11007	NC_011205	CGC	2	6	606200	606205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245416
11008	NC_011205	CG	4	8	606228	606235	0 %	0 %	50 %	50 %	198245416
11009	NC_011205	ACG	2	6	606253	606258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11010	NC_011205	ATCA	2	8	606300	606307	50 %	25 %	0 %	25 %	198245416
11011	NC_011205	CTT	2	6	606317	606322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245416
11012	NC_011205	CAGC	3	12	606436	606447	25 %	0 %	25 %	50 %	198245416
11013	NC_011205	AGC	3	9	606445	606453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11014	NC_011205	ACC	2	6	606496	606501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245416
11015	NC_011205	AGC	2	6	606538	606543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11016	NC_011205	GAC	2	6	606596	606601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11017	NC_011205	CAG	2	6	606747	606752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11018	NC_011205	TGG	2	6	606764	606769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245416
11019	NC_011205	TCG	2	6	606808	606813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11020	NC_011205	TTGC	2	8	606826	606833	0 %	50 %	25 %	25 %	198245416
11021	NC_011205	TGC	2	6	606857	606862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11022	NC_011205	CTG	2	6	606899	606904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11023	NC_011205	CTG	2	6	606945	606950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11024	NC_011205	AAT	2	6	606969	606974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245416
11025	NC_011205	TGC	2	6	606978	606983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245416
11026	NC_011205	CTA	2	6	607555	607560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198243784
11027	NC_011205	GCT	2	6	607599	607604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198243784
11028	NC_011205	CCG	2	6	607687	607692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198243784
11029	NC_011205	TACCG	2	10	607716	607725	20 %	20 %	20 %	40 %	198243784
11030	NC_011205	GGC	2	6	607802	607807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243784
11031	NC_011205	GCTG	2	8	607859	607866	0 %	25 %	50 %	25 %	198243784
11032	NC_011205	CAC	2	6	607886	607891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198243784
11033	NC_011205	ATA	2	6	607921	607926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243784
11034	NC_011205	ACCGCC	2	12	608025	608036	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198243784
11035	NC_011205	ACG	2	6	608037	608042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243784
11036	NC_011205	CCAGG	2	10	608043	608052	20 %	0 %	40 %	40 %	198243784
11037	NC_011205	AAT	2	6	608086	608091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198243784
11038	NC_011205	TTC	2	6	608772	608777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242962
11039	NC_011205	GGC	2	6	608806	608811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242962
11040	NC_011205	G	7	7	608812	608818	0 %	0 %	100 %	0 %	198242962
11041	NC_011205	CG	3	6	608835	608840	0 %	0 %	50 %	50 %	198242962
11042	NC_011205	TTAT	2	8	608841	608848	25 %	75 %	0 %	0 %	198242962
11043	NC_011205	CGG	2	6	608853	608858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242962
11044	NC_011205	AGAA	2	8	608943	608950	75 %	0 %	25 %	0 %	198242962
11045	NC_011205	A	6	6	608949	608954	100 %	0 %	0 %	0 %	198242962
11046	NC_011205	CGC	2	6	608967	608972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242962
11047	NC_011205	TAT	2	6	609013	609018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242962
11048	NC_011205	GTCG	2	8	609085	609092	0 %	25 %	50 %	25 %	198242962
11049	NC_011205	A	6	6	609112	609117	100 %	0 %	0 %	0 %	198242962
11050	NC_011205	AACC	2	8	609241	609248	50 %	0 %	0 %	50 %	198242962
11051	NC_011205	TTA	2	6	609256	609261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198242962
11052	NC_011205	TGA	2	6	609309	609314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242962
11053	NC_011205	GC	3	6	609354	609359	0 %	0 %	50 %	50 %	198242962
11054	NC_011205	GAA	2	6	609466	609471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245947
11055	NC_011205	GCG	2	6	609519	609524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
11056	NC_011205	GGC	2	6	609541	609546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
11057	NC_011205	CGG	2	6	609600	609605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
11058	NC_011205	ATC	2	6	609648	609653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245947
11059	NC_011205	GCC	2	6	609655	609660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245947
11060	NC_011205	ACG	2	6	609690	609695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245947
11061	NC_011205	GGCG	2	8	609727	609734	0 %	0 %	75 %	25 %	198245947
11062	NC_011205	CGG	2	6	609757	609762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
11063	NC_011205	GC	3	6	609954	609959	0 %	0 %	50 %	50 %	198245947
11064	NC_011205	CCG	2	6	609971	609976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245947
11065	NC_011205	CGC	2	6	610000	610005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245947
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11067	NC_011205	ACAG	2	8	610040	610047	50 %	0 %	25 %	25 %	198245947
11068	NC_011205	T	6	6	610057	610062	0 %	100 %	0 %	0 %	198245947
11069	NC_011205	CTG	2	6	610067	610072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245947
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11074	NC_011205	CAT	2	6	610189	610194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245947
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11082	NC_011205	CGG	2	6	610663	610668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
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11084	NC_011205	CGGGG	2	10	610705	610714	0 %	0 %	80 %	20 %	198245947
11085	NC_011205	GTCG	2	8	610741	610748	0 %	25 %	50 %	25 %	198245947
11086	NC_011205	CA	3	6	610753	610758	50 %	0 %	0 %	50 %	198245947
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11089	NC_011205	GAT	2	6	610898	610903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245947
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11091	NC_011205	A	6	6	611006	611011	100 %	0 %	0 %	0 %	198245947
11092	NC_011205	CAA	2	6	611078	611083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245947
11093	NC_011205	CGG	2	6	611097	611102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245947
11094	NC_011205	TCCGT	2	10	611228	611237	0 %	40 %	20 %	40 %	198245947
11095	NC_011205	GC	3	6	611264	611269	0 %	0 %	50 %	50 %	198245947
11096	NC_011205	CAACCG	2	12	611308	611319	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198245947
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11101	NC_011205	GGTC	2	8	611530	611537	0 %	25 %	50 %	25 %	198245947
11102	NC_011205	CGCGT	2	10	611696	611705	0 %	20 %	40 %	40 %	198245947
11103	NC_011205	CAG	2	6	611752	611757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245947
11104	NC_011205	CG	3	6	611983	611988	0 %	0 %	50 %	50 %	198245947
11105	NC_011205	GGA	2	6	612013	612018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245947
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11109	NC_011205	CGG	2	6	612299	612304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244251
11110	NC_011205	TACC	2	8	612321	612328	25 %	25 %	0 %	50 %	198244251
11111	NC_011205	GCA	2	6	612492	612497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244251
11112	NC_011205	TTAAA	2	10	612533	612542	60 %	40 %	0 %	0 %	198244251
11113	NC_011205	TTA	2	6	612557	612562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244251
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11115	NC_011205	TA	3	6	612641	612646	50 %	50 %	0 %	0 %	198244251
11116	NC_011205	CGT	2	6	612737	612742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244251
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11118	NC_011205	CGC	2	6	612785	612790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244251
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11120	NC_011205	AAT	2	6	612949	612954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244251
11121	NC_011205	TGA	2	6	612981	612986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244251
11122	NC_011205	CGC	3	9	612990	612998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244251
11123	NC_011205	CGG	2	6	613046	613051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244251
11124	NC_011205	GC	3	6	613066	613071	0 %	0 %	50 %	50 %	198244251
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11135	NC_011205	GC	3	6	613755	613760	0 %	0 %	50 %	50 %	198246048
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11139	NC_011205	TTAC	2	8	613988	613995	25 %	50 %	0 %	25 %	198246048
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11142	NC_011205	TAAG	2	8	614100	614107	50 %	25 %	25 %	0 %	198246048
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11239	NC_011205	TCC	2	6	621580	621585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198242602
11240	NC_011205	CGA	2	6	621613	621618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242602
11241	NC_011205	T	6	6	621645	621650	0 %	100 %	0 %	0 %	198242602
11242	NC_011205	CAGTG	2	10	621651	621660	20 %	20 %	40 %	20 %	198242602
11243	NC_011205	AAC	2	6	621702	621707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242602
11244	NC_011205	CCG	2	6	621749	621754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242602
11245	NC_011205	CGC	2	6	621759	621764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242602
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11247	NC_011205	CTT	2	6	621875	621880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242602
11248	NC_011205	TTC	2	6	621885	621890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242087
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11250	NC_011205	TTC	2	6	621959	621964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242087
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11252	NC_011205	ATG	2	6	622050	622055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242087
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11255	NC_011205	TTC	2	6	622185	622190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198245901
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11257	NC_011205	GCG	2	6	622317	622322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245901
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11360	NC_011205	TGTC	2	8	630750	630757	0 %	50 %	25 %	25 %	198245428
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11480	NC_011205	GCT	2	6	640419	640424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245102
11481	NC_011205	CGA	2	6	640561	640566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245102
11482	NC_011205	CAA	2	6	640568	640573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245102
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11484	NC_011205	GGA	2	6	640703	640708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245102
11485	NC_011205	TGA	2	6	640736	640741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245102
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11492	NC_011205	GAA	3	9	641186	641194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245102
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11499	NC_011205	CTG	2	6	641802	641807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245102
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