MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_011205	TGG	2	6	580228	580233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245657
10503	NC_011205	TGC	2	6	580325	580330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245657
10504	NC_011205	GC	3	6	580421	580426	0 %	0 %	50 %	50 %	198245657
10505	NC_011205	GTC	2	6	580436	580441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245657
10506	NC_011205	GCT	2	6	580473	580478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245657
10507	NC_011205	GAA	2	6	580492	580497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245657
10508	NC_011205	TGG	2	6	580502	580507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245657
10509	NC_011205	TCG	2	6	580511	580516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245657
10510	NC_011205	GCG	2	6	580530	580535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245657
10511	NC_011205	TGG	2	6	580553	580558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245657
10512	NC_011205	GAA	2	6	580621	580626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245657
10513	NC_011205	TGT	2	6	580629	580634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245657
10514	NC_011205	CTAT	2	8	580658	580665	25 %	50 %	0 %	25 %	198245657
10515	NC_011205	CGC	2	6	580686	580691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245657
10516	NC_011205	ATGT	2	8	580930	580937	25 %	50 %	25 %	0 %	198245781
10517	NC_011205	AAG	2	6	580946	580951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198245781
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10520	NC_011205	GCG	2	6	581089	581094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245781
10521	NC_011205	CCGGC	2	10	581126	581135	0 %	0 %	40 %	60 %	198245781
10522	NC_011205	GGC	2	6	581304	581309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245781
10523	NC_011205	CG	3	6	581318	581323	0 %	0 %	50 %	50 %	198245781
10524	NC_011205	CAG	2	6	581329	581334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245781
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10526	NC_011205	TA	3	6	581447	581452	50 %	50 %	0 %	0 %	198245781
10527	NC_011205	AGCC	2	8	581453	581460	25 %	0 %	25 %	50 %	198245781
10528	NC_011205	GCG	2	6	581531	581536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245781
10529	NC_011205	TTA	2	6	581540	581545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198245781
10530	NC_011205	ACGCCG	2	12	581546	581557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198245781
10531	NC_011205	CTG	2	6	581563	581568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10532	NC_011205	CAG	2	6	581569	581574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10533	NC_011205	GGGCTG	2	12	581616	581627	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	198245781
10534	NC_011205	CTG	2	6	581701	581706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10535	NC_011205	ATC	2	6	581791	581796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245781
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10538	NC_011205	CAG	2	6	581956	581961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10539	NC_011205	TGC	2	6	581975	581980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10540	NC_011205	TG	3	6	582057	582062	0 %	50 %	50 %	0 %	198245781
10541	NC_011205	CAC	2	6	582069	582074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245781
10542	NC_011205	TGC	2	6	582107	582112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10543	NC_011205	AGAC	2	8	582123	582130	50 %	0 %	25 %	25 %	198245781
10544	NC_011205	CGG	2	6	582176	582181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245781
10545	NC_011205	TGC	2	6	582195	582200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198245781
10546	NC_011205	CGCAA	2	10	582206	582215	40 %	0 %	20 %	40 %	198245781
10547	NC_011205	TGG	2	6	582218	582223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198245781
10548	NC_011205	GC	3	6	582275	582280	0 %	0 %	50 %	50 %	198245781
10549	NC_011205	AAC	2	6	582313	582318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245781
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10553	NC_011205	ATA	2	6	582845	582850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244905
10554	NC_011205	CTG	2	6	582878	582883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244905
10555	NC_011205	GGC	2	6	582891	582896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244905
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10557	NC_011205	AAAT	2	8	582995	583002	75 %	25 %	0 %	0 %	198244905
10558	NC_011205	TGG	2	6	583007	583012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244905
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10562	NC_011205	ATA	2	6	583205	583210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198244905
10563	NC_011205	ATTA	2	8	583348	583355	50 %	50 %	0 %	0 %	198244905
10564	NC_011205	ATG	2	6	583391	583396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244905
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10588	NC_011205	A	6	6	585003	585008	100 %	0 %	0 %	0 %	198243148
10589	NC_011205	CAAACC	2	12	585130	585141	50 %	0 %	0 %	50 %	198243148
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10599	NC_011205	GCAAC	2	10	585736	585745	40 %	0 %	20 %	40 %	198243148
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10602	NC_011205	TTA	2	6	585906	585911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198243659
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10605	NC_011205	T	7	7	586010	586016	0 %	100 %	0 %	0 %	198243659
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10610	NC_011205	GGCA	2	8	586103	586110	25 %	0 %	50 %	25 %	198243659
10611	NC_011205	GC	3	6	586165	586170	0 %	0 %	50 %	50 %	198243659
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10862	NC_011205	CTG	2	6	598455	598460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242647
10863	NC_011205	GCT	2	6	598490	598495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242647
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10981	NC_011205	TGGC	2	8	604562	604569	0 %	25 %	50 %	25 %	198243695
10982	NC_011205	GAC	2	6	604640	604645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198243695
10983	NC_011205	CGGAT	2	10	604646	604655	20 %	20 %	40 %	20 %	198243695
10984	NC_011205	TGT	2	6	604668	604673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198243695
10985	NC_011205	CGT	2	6	604842	604847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244616
10986	NC_011205	T	6	6	604882	604887	0 %	100 %	0 %	0 %	198244616
10987	NC_011205	T	6	6	604914	604919	0 %	100 %	0 %	0 %	198244616
10988	NC_011205	CTT	2	6	604953	604958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244616
10989	NC_011205	GAC	2	6	604960	604965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244616
10990	NC_011205	T	6	6	605028	605033	0 %	100 %	0 %	0 %	198244616
10991	NC_011205	ACA	2	6	605048	605053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198244616
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10994	NC_011205	TTC	2	6	605173	605178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244616
10995	NC_011205	CGG	2	6	605217	605222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244616
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10997	NC_011205	CAGC	2	8	605432	605439	25 %	0 %	25 %	50 %	198244546
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10999	NC_011205	CAGC	2	8	605507	605514	25 %	0 %	25 %	50 %	198244546
11000	NC_011205	TCG	2	6	605540	605545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244546

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