MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 85529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
2	NC_011205	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	198244353
3	NC_011205	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
4	NC_011205	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
5	NC_011205	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	198244353
6	NC_011205	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
7	NC_011205	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	198244353
8	NC_011205	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	198244353
9	NC_011205	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
10	NC_011205	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
11	NC_011205	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	198244353
12	NC_011205	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	198244353
13	NC_011205	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
14	NC_011205	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
15	NC_011205	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
16	NC_011205	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
17	NC_011205	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
18	NC_011205	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
19	NC_011205	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
20	NC_011205	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	198244353
21	NC_011205	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
22	NC_011205	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
23	NC_011205	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
24	NC_011205	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
25	NC_011205	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
26	NC_011205	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
27	NC_011205	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198244353
28	NC_011205	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	198244353
29	NC_011205	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	198244353
30	NC_011205	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
31	NC_011205	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
32	NC_011205	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244353
33	NC_011205	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
34	NC_011205	CAATAT	2	12	1605	1616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	198244353
35	NC_011205	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
36	NC_011205	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
37	NC_011205	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
38	NC_011205	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244353
39	NC_011205	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
40	NC_011205	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
41	NC_011205	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244353
42	NC_011205	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
43	NC_011205	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244353
44	NC_011205	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244353
45	NC_011205	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
46	NC_011205	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244353
47	NC_011205	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
48	NC_011205	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
49	NC_011205	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
50	NC_011205	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	198244353
51	NC_011205	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	198244353
52	NC_011205	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	198244353
53	NC_011205	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	198244353
54	NC_011205	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
55	NC_011205	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
56	NC_011205	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
57	NC_011205	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	198244353
58	NC_011205	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244353
59	NC_011205	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
60	NC_011205	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
61	NC_011205	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
62	NC_011205	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
63	NC_011205	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
64	NC_011205	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	198244850
65	NC_011205	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244850
66	NC_011205	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
67	NC_011205	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	198244850
68	NC_011205	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
69	NC_011205	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
70	NC_011205	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244850
71	NC_011205	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244850
72	NC_011205	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
73	NC_011205	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
74	NC_011205	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	198244850
75	NC_011205	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
76	NC_011205	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
77	NC_011205	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	198244850
78	NC_011205	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	198244850
79	NC_011205	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244850
80	NC_011205	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
81	NC_011205	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242395
82	NC_011205	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	198242395
83	NC_011205	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
84	NC_011205	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242395
85	NC_011205	GGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242395
86	NC_011205	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	198242395
87	NC_011205	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
88	NC_011205	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
89	NC_011205	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	198242395
90	NC_011205	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
91	NC_011205	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	198242395
92	NC_011205	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
93	NC_011205	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
94	NC_011205	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
95	NC_011205	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242395
96	NC_011205	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
97	NC_011205	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
98	NC_011205	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	198242395
99	NC_011205	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	198242395
100	NC_011205	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	198242395
101	NC_011205	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242395
102	NC_011205	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
103	NC_011205	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	198242395
104	NC_011205	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
105	NC_011205	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
106	NC_011205	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242395
107	NC_011205	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
108	NC_011205	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	198242395
109	NC_011205	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
110	NC_011205	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242395
111	NC_011205	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	198242395
112	NC_011205	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
113	NC_011205	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
114	NC_011205	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	198242886
115	NC_011205	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
116	NC_011205	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242886
117	NC_011205	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
118	NC_011205	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	198242886
119	NC_011205	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	198242886
120	NC_011205	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242886
121	NC_011205	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
122	NC_011205	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242886
123	NC_011205	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242886
124	NC_011205	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	198242886
125	NC_011205	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	198242886
126	NC_011205	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242886
127	NC_011205	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	198242886
128	NC_011205	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242886
129	NC_011205	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242886
130	NC_011205	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242886
131	NC_011205	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	198242886
132	NC_011205	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	198245613
133	NC_011205	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245613
134	NC_011205	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245613
135	NC_011205	TGA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245613
136	NC_011205	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	198245613
137	NC_011205	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
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143	NC_011205	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	198245613
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153	NC_011205	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	198245613
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264	NC_011205	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198242776
265	NC_011205	TGA	2	6	13270	13275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242776
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280	NC_011205	GGC	2	6	13911	13916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198243023
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381	NC_011205	AGAGC	2	10	19374	19383	40 %	0 %	40 %	20 %	198242422
382	NC_011205	CGA	2	6	19389	19394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242422
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