MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 87671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
2	NC_011149	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	197250740
3	NC_011149	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
4	NC_011149	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
5	NC_011149	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	197250740
6	NC_011149	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
7	NC_011149	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	197250740
8	NC_011149	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
9	NC_011149	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
10	NC_011149	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
11	NC_011149	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	197250740
12	NC_011149	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	197250740
13	NC_011149	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
14	NC_011149	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
15	NC_011149	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
16	NC_011149	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
17	NC_011149	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
18	NC_011149	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
19	NC_011149	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
20	NC_011149	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
21	NC_011149	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
22	NC_011149	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
23	NC_011149	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
24	NC_011149	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
25	NC_011149	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
26	NC_011149	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
27	NC_011149	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197250740
28	NC_011149	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	197250740
29	NC_011149	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
30	NC_011149	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
31	NC_011149	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
32	NC_011149	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250740
33	NC_011149	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
34	NC_011149	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197250740
35	NC_011149	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197250740
36	NC_011149	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250740
37	NC_011149	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
38	NC_011149	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197250740
39	NC_011149	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
40	NC_011149	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
41	NC_011149	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197250740
42	NC_011149	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
43	NC_011149	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250740
44	NC_011149	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197250740
45	NC_011149	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
46	NC_011149	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197250740
47	NC_011149	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
48	NC_011149	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
49	NC_011149	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
50	NC_011149	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
51	NC_011149	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	197250740
52	NC_011149	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
53	NC_011149	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	197250740
54	NC_011149	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197250740
55	NC_011149	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197250740
56	NC_011149	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
57	NC_011149	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	197250740
58	NC_011149	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197250740
59	NC_011149	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197250740
60	NC_011149	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197250740
61	NC_011149	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197250740
62	NC_011149	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
63	NC_011149	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249934
64	NC_011149	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	197249934
65	NC_011149	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249934
66	NC_011149	CGCTG	2	10	3112	3121	0 %	20 %	40 %	40 %	197249934
67	NC_011149	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	197249934
68	NC_011149	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
69	NC_011149	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
70	NC_011149	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249934
71	NC_011149	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197249934
72	NC_011149	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249934
73	NC_011149	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
74	NC_011149	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	197249934
75	NC_011149	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249934
76	NC_011149	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
77	NC_011149	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
78	NC_011149	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	197249934
79	NC_011149	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249934
80	NC_011149	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249934
81	NC_011149	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249168
82	NC_011149	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	197249168
83	NC_011149	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
84	NC_011149	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197249168
85	NC_011149	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
86	NC_011149	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
87	NC_011149	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
88	NC_011149	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	197249168
89	NC_011149	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
90	NC_011149	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
91	NC_011149	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
92	NC_011149	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
93	NC_011149	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197249168
94	NC_011149	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
95	NC_011149	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249168
96	NC_011149	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
97	NC_011149	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
98	NC_011149	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	197249168
99	NC_011149	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	197249168
100	NC_011149	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	197249168
101	NC_011149	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197249168
102	NC_011149	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
103	NC_011149	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	197249168
104	NC_011149	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
105	NC_011149	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197249168
106	NC_011149	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249168
107	NC_011149	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	197249168
108	NC_011149	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249168
109	NC_011149	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249168
110	NC_011149	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	197249168
111	NC_011149	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197249168
112	NC_011149	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197249168
113	NC_011149	TG	3	6	5147	5152	0 %	50 %	50 %	0 %	197249510
114	NC_011149	TCA	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
115	NC_011149	AAT	2	6	5227	5232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197249510
116	NC_011149	TCA	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
117	NC_011149	CG	3	6	5250	5255	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
118	NC_011149	T	6	6	5257	5262	0 %	100 %	0 %	0 %	197249510
119	NC_011149	ACC	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249510
120	NC_011149	TCA	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197249510
121	NC_011149	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197249510
122	NC_011149	CAC	3	9	5383	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197249510
123	NC_011149	CG	3	6	5469	5474	0 %	0 %	50 %	50 %	197249510
124	NC_011149	AG	3	6	5551	5556	50 %	0 %	50 %	0 %	197249510
125	NC_011149	TGT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197249510
126	NC_011149	CAAAAT	2	12	5577	5588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197249510
127	NC_011149	CGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249510
128	NC_011149	GCG	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197249510
129	NC_011149	GCT	2	6	5787	5792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197249510
130	NC_011149	AATCAG	2	12	5872	5883	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197249510
131	NC_011149	CG	3	6	5970	5975	0 %	0 %	50 %	50 %	197248129
132	NC_011149	ACC	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197248129
133	NC_011149	CAA	2	6	6109	6114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197248129
134	NC_011149	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	197248129
135	NC_011149	CGA	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248129
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152	NC_011149	GCC	2	6	7225	7230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197248129
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162	NC_011149	CAG	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197248384
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165	NC_011149	ATG	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197248384
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388	NC_011149	AGAGC	2	10	19373	19382	40 %	0 %	40 %	20 %	197248226
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493	NC_011149	TGG	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197250118
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499	NC_011149	ATT	2	6	25143	25148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449785010
500	NC_011149	CTG	2	6	25153	25158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449785010

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