MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011147	CGACTT	2	12	162369	162380	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197361344
3002	NC_011147	GAG	2	6	162427	162432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361344
3003	NC_011147	AGA	2	6	162483	162488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361344
3004	NC_011147	GGT	2	6	162489	162494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361344
3005	NC_011147	ATG	2	6	162505	162510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361344
3006	NC_011147	TGC	2	6	162533	162538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361344
3007	NC_011147	GGC	2	6	162570	162575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361344
3008	NC_011147	CGC	2	6	162666	162671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344
3009	NC_011147	GCA	2	6	162795	162800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361344
3010	NC_011147	GCC	2	6	162823	162828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344
3011	NC_011147	GCC	2	6	162844	162849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361344
3012	NC_011147	A	6	6	163094	163099	100 %	0 %	0 %	0 %	197361345
3013	NC_011147	ACG	2	6	163134	163139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361345
3014	NC_011147	TTA	2	6	163146	163151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361345
3015	NC_011147	CGC	2	6	163159	163164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361345
3016	NC_011147	CGG	2	6	163198	163203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361345
3017	NC_011147	ATT	2	6	163288	163293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361345
3018	NC_011147	AAG	2	6	163380	163385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361345
3019	NC_011147	CCG	2	6	163436	163441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361345
3020	NC_011147	ATT	2	6	163454	163459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361345
3021	NC_011147	TTA	2	6	163517	163522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361346
3022	NC_011147	GCCG	2	8	163562	163569	0 %	0 %	50 %	50 %	197361346
3023	NC_011147	CAG	2	6	163706	163711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3024	NC_011147	GCA	2	6	163842	163847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3025	NC_011147	TCT	2	6	163851	163856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361346
3026	NC_011147	CGA	2	6	163906	163911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3027	NC_011147	TCT	2	6	164106	164111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361346
3028	NC_011147	TCG	2	6	164269	164274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3029	NC_011147	CGA	2	6	164292	164297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3030	NC_011147	CATA	2	8	164341	164348	50 %	25 %	0 %	25 %	197361346
3031	NC_011147	GTC	2	6	164414	164419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361346
3032	NC_011147	GGCT	2	8	164600	164607	0 %	25 %	50 %	25 %	197361347
3033	NC_011147	TAA	2	6	164608	164613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361347
3034	NC_011147	ATG	2	6	164620	164625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361347
3035	NC_011147	GCG	2	6	164685	164690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361347
3036	NC_011147	GGA	2	6	164738	164743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361347
3037	NC_011147	TTG	2	6	164760	164765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361347
3038	NC_011147	ACC	2	6	164772	164777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361347
3039	NC_011147	TGA	2	6	164846	164851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361347
3040	NC_011147	CGG	2	6	164920	164925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361347
3041	NC_011147	AACG	2	8	165024	165031	50 %	0 %	25 %	25 %	197361347
3042	NC_011147	CGC	2	6	165151	165156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361347
3043	NC_011147	TCA	2	6	165172	165177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361347
3044	NC_011147	TC	3	6	165305	165310	0 %	50 %	0 %	50 %	197361347
3045	NC_011147	CGC	2	6	165311	165316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361347
3046	NC_011147	GAG	2	6	165399	165404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361347
3047	NC_011147	CTGC	2	8	165408	165415	0 %	25 %	25 %	50 %	197361347
3048	NC_011147	TAT	2	6	165435	165440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361347
3049	NC_011147	CG	3	6	165447	165452	0 %	0 %	50 %	50 %	197361347
3050	NC_011147	TATT	2	8	165475	165482	25 %	75 %	0 %	0 %	197361347
3051	NC_011147	ATT	2	6	165484	165489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361347
3052	NC_011147	GTC	2	6	165551	165556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3053	NC_011147	CGC	2	6	165571	165576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361348
3054	NC_011147	CGG	2	6	165598	165603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361348
3055	NC_011147	C	6	6	165667	165672	0 %	0 %	0 %	100 %	197361348
3056	NC_011147	GAC	2	6	165674	165679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3057	NC_011147	ACG	2	6	165705	165710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361348
3058	NC_011147	GCA	2	6	165874	165879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3059	NC_011147	CGT	2	6	165886	165891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3060	NC_011147	GATCA	2	10	165953	165962	40 %	20 %	20 %	20 %	197361349
3061	NC_011147	TGT	2	6	166038	166043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361349
3062	NC_011147	GCC	2	6	166088	166093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361349
3063	NC_011147	GCT	2	6	166144	166149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3064	NC_011147	CCG	2	6	166183	166188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361349
3065	NC_011147	CTG	2	6	166196	166201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3066	NC_011147	GCT	2	6	166264	166269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3067	NC_011147	CAG	2	6	166286	166291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361349
3068	NC_011147	A	6	6	166347	166352	100 %	0 %	0 %	0 %	197361349
3069	NC_011147	TCT	2	6	166435	166440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361349
3070	NC_011147	TTA	2	6	166571	166576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361350
3071	NC_011147	GC	3	6	166603	166608	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3072	NC_011147	CG	3	6	166650	166655	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3073	NC_011147	CAT	2	6	166659	166664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361350
3074	NC_011147	ACC	2	6	166709	166714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361350
3075	NC_011147	CAG	2	6	166753	166758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361350
3076	NC_011147	TGT	2	6	166802	166807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361350
3077	NC_011147	CTG	2	6	166816	166821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361350
3078	NC_011147	TTC	2	6	166858	166863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361350
3079	NC_011147	A	6	6	166872	166877	100 %	0 %	0 %	0 %	197361350
3080	NC_011147	CGG	2	6	166914	166919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361350
3081	NC_011147	GGGC	2	8	166959	166966	0 %	0 %	75 %	25 %	197361350
3082	NC_011147	GC	3	6	166987	166992	0 %	0 %	50 %	50 %	197361350
3083	NC_011147	ATA	2	6	166994	166999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361350
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3085	NC_011147	GAA	2	6	167332	167337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3086	NC_011147	CTG	2	6	167540	167545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3087	NC_011147	GAA	2	6	167566	167571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3088	NC_011147	A	6	6	167654	167659	100 %	0 %	0 %	0 %	197361351
3089	NC_011147	TCG	2	6	167744	167749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3090	NC_011147	ACG	2	6	167881	167886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361351
3091	NC_011147	CGG	2	6	167921	167926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3092	NC_011147	GGC	2	6	167959	167964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3093	NC_011147	GGC	2	6	167980	167985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3094	NC_011147	CGG	3	9	168018	168026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3095	NC_011147	AG	3	6	168069	168074	50 %	0 %	50 %	0 %	197361351
3096	NC_011147	CGG	2	6	168075	168080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3097	NC_011147	AGA	2	6	168090	168095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361351
3098	NC_011147	CGG	2	6	168159	168164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361351
3099	NC_011147	CG	3	6	168178	168183	0 %	0 %	50 %	50 %	197361351
3100	NC_011147	CCGC	2	8	168233	168240	0 %	0 %	25 %	75 %	197361351
3101	NC_011147	CAC	2	6	168312	168317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361351
3102	NC_011147	ATCCC	2	10	168399	168408	20 %	20 %	0 %	60 %	197361352
3103	NC_011147	CCA	3	9	168450	168458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361352
3104	NC_011147	TGA	2	6	168480	168485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361352
3105	NC_011147	GCCAGC	2	12	168524	168535	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197361352
3106	NC_011147	GCA	2	6	168567	168572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3107	NC_011147	T	6	6	168644	168649	0 %	100 %	0 %	0 %	197361352
3108	NC_011147	GAA	2	6	168756	168761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3109	NC_011147	CTT	2	6	168821	168826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361352
3110	NC_011147	AGA	2	6	168857	168862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3111	NC_011147	CGCTGC	2	12	168863	168874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197361352
3112	NC_011147	CTG	2	6	168902	168907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3113	NC_011147	ATA	2	6	168980	168985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361352
3114	NC_011147	CG	3	6	168987	168992	0 %	0 %	50 %	50 %	197361352
3115	NC_011147	AGA	2	6	168995	169000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361352
3116	NC_011147	GGC	2	6	169030	169035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3117	NC_011147	GCA	2	6	169056	169061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3118	NC_011147	GGC	2	6	169078	169083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361352
3119	NC_011147	AAT	2	6	169093	169098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361352
3120	NC_011147	TAGCG	2	10	169106	169115	20 %	20 %	40 %	20 %	197361352
3121	NC_011147	AGC	2	6	169173	169178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361352
3122	NC_011147	ATC	2	6	169214	169219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361352
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3124	NC_011147	ATGA	2	8	169384	169391	50 %	25 %	25 %	0 %	197361352
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3363	NC_011147	CTT	2	6	182046	182051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361362
3364	NC_011147	AAT	2	6	182184	182189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361363
3365	NC_011147	CGT	2	6	182343	182348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
3366	NC_011147	CCG	2	6	182414	182419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361363
3367	NC_011147	AGA	2	6	182451	182456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361363
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3369	NC_011147	GCA	3	9	182476	182484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
3370	NC_011147	CTG	2	6	182486	182491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3373	NC_011147	GCA	3	9	182740	182748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3375	NC_011147	CAG	3	9	182786	182794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3377	NC_011147	CGA	2	6	182835	182840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
3378	NC_011147	GAAA	2	8	182961	182968	75 %	0 %	25 %	0 %	197361363
3379	NC_011147	GCG	3	9	183067	183075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361363
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3381	NC_011147	CTG	2	6	183104	183109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
3382	NC_011147	ACG	2	6	183152	183157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3384	NC_011147	CG	3	6	183295	183300	0 %	0 %	50 %	50 %	197361363
3385	NC_011147	GCT	2	6	183313	183318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
3386	NC_011147	GCGG	2	8	183319	183326	0 %	0 %	75 %	25 %	197361363
3387	NC_011147	TGC	2	6	183341	183346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3390	NC_011147	CAG	2	6	183511	183516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3392	NC_011147	GCT	2	6	183589	183594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361363
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3438	NC_011147	GCA	2	6	186191	186196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361365
3439	NC_011147	TGA	2	6	186204	186209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361365
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3452	NC_011147	GCC	2	6	186782	186787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361366
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3467	NC_011147	TC	3	6	187341	187346	0 %	50 %	0 %	50 %	197361367
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3471	NC_011147	GTG	2	6	187407	187412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361367
3472	NC_011147	CTG	2	6	187427	187432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
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3483	NC_011147	TAT	2	6	187696	187701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361367
3484	NC_011147	TGC	2	6	187737	187742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361367
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