MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011147	GCT	2	6	1002557	1002562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362073
18002	NC_011147	CG	3	6	1002576	1002581	0 %	0 %	50 %	50 %	197362073
18003	NC_011147	GAA	2	6	1002619	1002624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197362073
18004	NC_011147	TCT	2	6	1002694	1002699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197362073
18005	NC_011147	CGA	2	6	1002709	1002714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362073
18006	NC_011147	TTG	2	6	1002765	1002770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362073
18007	NC_011147	GAG	2	6	1002781	1002786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197362073
18008	NC_011147	TAA	3	9	1003083	1003091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197362074
18009	NC_011147	AAACG	2	10	1003202	1003211	60 %	0 %	20 %	20 %	197362074
18010	NC_011147	CTG	2	6	1003229	1003234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362074
18011	NC_011147	A	6	6	1003286	1003291	100 %	0 %	0 %	0 %	197362074
18012	NC_011147	GGCT	2	8	1003333	1003340	0 %	25 %	50 %	25 %	197362074
18013	NC_011147	ACG	2	6	1003767	1003772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362075
18014	NC_011147	CTT	2	6	1003831	1003836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197362075
18015	NC_011147	CTG	3	9	1003865	1003873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362075
18016	NC_011147	CAT	2	6	1003912	1003917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362075
18017	NC_011147	TCC	2	6	1003974	1003979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197362075
18018	NC_011147	TTC	2	6	1003997	1004002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197362075
18019	NC_011147	AG	3	6	1004004	1004009	50 %	0 %	50 %	0 %	197362075
18020	NC_011147	CAT	2	6	1004087	1004092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362075
18021	NC_011147	GAA	2	6	1004122	1004127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197362075
18022	NC_011147	GAA	2	6	1004837	1004842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197362076
18023	NC_011147	GGT	2	6	1004923	1004928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197362076
18024	NC_011147	CAG	2	6	1004978	1004983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362076
18025	NC_011147	GGC	2	6	1005037	1005042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362076
18026	NC_011147	CGG	2	6	1005048	1005053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362076
18027	NC_011147	ATG	2	6	1005075	1005080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362076
18028	NC_011147	GGCA	2	8	1005082	1005089	25 %	0 %	50 %	25 %	197362076
18029	NC_011147	AATT	2	8	1005090	1005097	50 %	50 %	0 %	0 %	197362076
18030	NC_011147	CGG	2	6	1005114	1005119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362076
18031	NC_011147	CGT	2	6	1005155	1005160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362076
18032	NC_011147	TAATT	2	10	1005235	1005244	40 %	60 %	0 %	0 %	197362076
18033	NC_011147	CTG	2	6	1005299	1005304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362076
18034	NC_011147	TAT	2	6	1005344	1005349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197362076
18035	NC_011147	TGCG	2	8	1005505	1005512	0 %	25 %	50 %	25 %	197362077
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18037	NC_011147	GGC	2	6	1005536	1005541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362077
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18039	NC_011147	T	7	7	1005925	1005931	0 %	100 %	0 %	0 %	197362078
18040	NC_011147	GTT	2	6	1006003	1006008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362078
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18042	NC_011147	CGCT	2	8	1006104	1006111	0 %	25 %	25 %	50 %	197362078
18043	NC_011147	CGT	2	6	1006130	1006135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362078
18044	NC_011147	TTA	2	6	1006199	1006204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197362078
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18046	NC_011147	GCA	2	6	1006327	1006332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362078
18047	NC_011147	TGT	2	6	1006366	1006371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362078
18048	NC_011147	GCC	2	6	1006412	1006417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197362078
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18050	NC_011147	CGA	2	6	1006465	1006470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362078
18051	NC_011147	GGCT	2	8	1006483	1006490	0 %	25 %	50 %	25 %	197362078
18052	NC_011147	GTG	2	6	1006496	1006501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197362078
18053	NC_011147	GGC	2	6	1006549	1006554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362078
18054	NC_011147	GGC	2	6	1006557	1006562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362078
18055	NC_011147	GCTG	2	8	1006587	1006594	0 %	25 %	50 %	25 %	197362078
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18058	NC_011147	GA	3	6	1006642	1006647	50 %	0 %	50 %	0 %	197362078
18059	NC_011147	GTA	2	6	1006668	1006673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362078
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18099	NC_011147	CA	3	6	1008228	1008233	50 %	0 %	0 %	50 %	197362080
18100	NC_011147	CG	3	6	1008344	1008349	0 %	0 %	50 %	50 %	197362080
18101	NC_011147	TCC	2	6	1008354	1008359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197362080
18102	NC_011147	GGGC	2	8	1008435	1008442	0 %	0 %	75 %	25 %	197362080
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18107	NC_011147	AGTT	2	8	1009500	1009507	25 %	50 %	25 %	0 %	197362082
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18112	NC_011147	CA	3	6	1009586	1009591	50 %	0 %	0 %	50 %	197362082
18113	NC_011147	A	6	6	1009667	1009672	100 %	0 %	0 %	0 %	197362083
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18117	NC_011147	GTT	2	6	1009998	1010003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362083
18118	NC_011147	TTG	2	6	1010036	1010041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362083
18119	NC_011147	CTG	2	6	1010073	1010078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362083
18120	NC_011147	TTA	2	6	1010090	1010095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197362083
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18122	NC_011147	TGC	2	6	1010184	1010189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362083
18123	NC_011147	ATT	2	6	1010194	1010199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197362083
18124	NC_011147	CTG	2	6	1010206	1010211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362083
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18126	NC_011147	CTG	2	6	1010455	1010460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362084
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18141	NC_011147	GGTA	2	8	1010981	1010988	25 %	25 %	50 %	0 %	197362084
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18231	NC_011147	GCGT	2	8	1017072	1017079	0 %	25 %	50 %	25 %	197362088
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18233	NC_011147	T	6	6	1017162	1017167	0 %	100 %	0 %	0 %	197362088
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18465	NC_011147	CAG	2	6	1028018	1028023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18466	NC_011147	CAT	2	6	1028084	1028089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362098
18467	NC_011147	CGGAA	2	10	1028111	1028120	40 %	0 %	40 %	20 %	197362098
18468	NC_011147	GGTGCT	2	12	1028167	1028178	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197362098
18469	NC_011147	GTA	2	6	1028192	1028197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362098
18470	NC_011147	TCTT	2	8	1028277	1028284	0 %	75 %	0 %	25 %	197362098
18471	NC_011147	AAT	2	6	1028288	1028293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197362098
18472	NC_011147	CCTT	2	8	1028310	1028317	0 %	50 %	0 %	50 %	197362098
18473	NC_011147	TCA	2	6	1028328	1028333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362098
18474	NC_011147	ACC	2	6	1028340	1028345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197362098
18475	NC_011147	CGA	2	6	1028392	1028397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18476	NC_011147	GCA	2	6	1028404	1028409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18477	NC_011147	GAC	2	6	1028555	1028560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18478	NC_011147	CG	4	8	1028568	1028575	0 %	0 %	50 %	50 %	197362098
18479	NC_011147	T	6	6	1028606	1028611	0 %	100 %	0 %	0 %	197362098
18480	NC_011147	CTG	3	9	1028666	1028674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18481	NC_011147	CCAG	2	8	1028680	1028687	25 %	0 %	25 %	50 %	197362098
18482	NC_011147	ATG	2	6	1028744	1028749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362098
18483	NC_011147	AGT	2	6	1028842	1028847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362098
18484	NC_011147	CGA	2	6	1028848	1028853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18485	NC_011147	G	6	6	1029034	1029039	0 %	0 %	100 %	0 %	197362098
18486	NC_011147	T	6	6	1029050	1029055	0 %	100 %	0 %	0 %	197362098
18487	NC_011147	CAT	2	6	1029065	1029070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362098
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18489	NC_011147	CTGA	2	8	1029106	1029113	25 %	25 %	25 %	25 %	197362098
18490	NC_011147	GC	3	6	1029139	1029144	0 %	0 %	50 %	50 %	197362098
18491	NC_011147	GCA	2	6	1029147	1029152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362098
18492	NC_011147	GA	3	6	1029177	1029182	50 %	0 %	50 %	0 %	197362098
18493	NC_011147	TGA	2	6	1029456	1029461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197362099
18494	NC_011147	ACG	2	6	1029586	1029591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197362099
18495	NC_011147	GCG	2	6	1029623	1029628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197362099
18496	NC_011147	ATC	2	6	1029646	1029651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197362099
18497	NC_011147	TG	3	6	1029694	1029699	0 %	50 %	50 %	0 %	197362099
18498	NC_011147	TGC	2	6	1029785	1029790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197362099
18499	NC_011147	GTT	2	6	1029828	1029833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197362099
18500	NC_011147	GCTG	2	8	1029918	1029925	0 %	25 %	50 %	25 %	197362099

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