MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011147	GCG	2	6	640575	640580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361739
11502	NC_011147	GCG	2	6	640624	640629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361739
11503	NC_011147	GC	3	6	640682	640687	0 %	0 %	50 %	50 %	197361739
11504	NC_011147	TCC	2	6	640689	640694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361739
11505	NC_011147	GAC	2	6	640776	640781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361739
11506	NC_011147	CGG	2	6	640949	640954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361739
11507	NC_011147	ATCGAC	2	12	641046	641057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197361739
11508	NC_011147	TCG	2	6	641131	641136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361739
11509	NC_011147	ACGGCA	2	12	641194	641205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361739
11510	NC_011147	ATTG	2	8	641207	641214	25 %	50 %	25 %	0 %	197361739
11511	NC_011147	CGC	2	6	641232	641237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361739
11512	NC_011147	GTT	2	6	641263	641268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361739
11513	NC_011147	GCA	2	6	641299	641304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361739
11514	NC_011147	CAT	2	6	641352	641357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361739
11515	NC_011147	TTA	2	6	641675	641680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361740
11516	NC_011147	AAAC	2	8	641682	641689	75 %	0 %	0 %	25 %	197361740
11517	NC_011147	TTA	2	6	641720	641725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361740
11518	NC_011147	GGC	2	6	641793	641798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361740
11519	NC_011147	AGC	2	6	641807	641812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361740
11520	NC_011147	ATA	2	6	641861	641866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361740
11521	NC_011147	CCTG	2	8	641867	641874	0 %	25 %	25 %	50 %	197361740
11522	NC_011147	A	7	7	642037	642043	100 %	0 %	0 %	0 %	197361740
11523	NC_011147	TCAA	2	8	642073	642080	50 %	25 %	0 %	25 %	197361740
11524	NC_011147	A	6	6	642153	642158	100 %	0 %	0 %	0 %	197361740
11525	NC_011147	GCG	2	6	642164	642169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361740
11526	NC_011147	ATGC	2	8	642205	642212	25 %	25 %	25 %	25 %	197361740
11527	NC_011147	TAA	2	6	642306	642311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361741
11528	NC_011147	TG	3	6	642327	642332	0 %	50 %	50 %	0 %	197361741
11529	NC_011147	TTC	2	6	642366	642371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361741
11530	NC_011147	TCG	2	6	642400	642405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361741
11531	NC_011147	AT	3	6	642413	642418	50 %	50 %	0 %	0 %	197361741
11532	NC_011147	TCT	2	6	642466	642471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361741
11533	NC_011147	GTC	2	6	642504	642509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361741
11534	NC_011147	TCC	2	6	642559	642564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361741
11535	NC_011147	CGC	2	6	642614	642619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361741
11536	NC_011147	CGC	2	6	642647	642652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361741
11537	NC_011147	CAG	2	6	642672	642677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361741
11538	NC_011147	CAT	2	6	642686	642691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361741
11539	NC_011147	TGCT	2	8	642986	642993	0 %	50 %	25 %	25 %	197361742
11540	NC_011147	A	7	7	643010	643016	100 %	0 %	0 %	0 %	197361742
11541	NC_011147	ATT	2	6	643021	643026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361742
11542	NC_011147	GGCG	2	8	643087	643094	0 %	0 %	75 %	25 %	197361742
11543	NC_011147	GAT	3	9	643172	643180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361742
11544	NC_011147	GCT	2	6	643228	643233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361742
11545	NC_011147	CGG	2	6	643243	643248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361742
11546	NC_011147	GCG	2	6	643292	643297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361742
11547	NC_011147	CGG	2	6	643303	643308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361742
11548	NC_011147	TAT	3	9	643355	643363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361742
11549	NC_011147	GAA	2	6	643400	643405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361742
11550	NC_011147	GC	3	6	643416	643421	0 %	0 %	50 %	50 %	197361742
11551	NC_011147	GCC	2	6	643730	643735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361743
11552	NC_011147	TGGC	2	8	643736	643743	0 %	25 %	50 %	25 %	197361743
11553	NC_011147	T	6	6	643747	643752	0 %	100 %	0 %	0 %	197361743
11554	NC_011147	TCA	2	6	643756	643761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361743
11555	NC_011147	GAT	2	6	643886	643891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361743
11556	NC_011147	GC	3	6	643896	643901	0 %	0 %	50 %	50 %	197361743
11557	NC_011147	CGC	2	6	643903	643908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361743
11558	NC_011147	CAG	2	6	643976	643981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361743
11559	NC_011147	CTGC	2	8	644024	644031	0 %	25 %	25 %	50 %	197361743
11560	NC_011147	TAA	2	6	644047	644052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361743
11561	NC_011147	TCGG	2	8	644054	644061	0 %	25 %	50 %	25 %	197361743
11562	NC_011147	TGG	2	6	644142	644147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361743
11563	NC_011147	CG	4	8	644171	644178	0 %	0 %	50 %	50 %	197361743
11564	NC_011147	GCC	2	6	644194	644199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361743
11565	NC_011147	GCC	2	6	644272	644277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361743
11566	NC_011147	TCA	2	6	644300	644305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361743
11567	NC_011147	CCGGC	2	10	644331	644340	0 %	0 %	40 %	60 %	197361743
11568	NC_011147	CGC	2	6	644444	644449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361743
11569	NC_011147	GAGC	2	8	644479	644486	25 %	0 %	50 %	25 %	197361743
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11572	NC_011147	AGG	2	6	644751	644756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361743
11573	NC_011147	GAT	2	6	644764	644769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361743
11574	NC_011147	TGC	2	6	644781	644786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361743
11575	NC_011147	CAT	2	6	644853	644858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361743
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11579	NC_011147	TGAA	2	8	645246	645253	50 %	25 %	25 %	0 %	197361744
11580	NC_011147	TTA	2	6	645270	645275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361744
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11584	NC_011147	GCT	2	6	645403	645408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361744
11585	NC_011147	ATC	2	6	645422	645427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361744
11586	NC_011147	CT	4	8	645506	645513	0 %	50 %	0 %	50 %	197361744
11587	NC_011147	CTG	2	6	645539	645544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361744
11588	NC_011147	GCCG	2	8	645553	645560	0 %	0 %	50 %	50 %	197361744
11589	NC_011147	ATT	2	6	645575	645580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361744
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11591	NC_011147	GAGC	2	8	645596	645603	25 %	0 %	50 %	25 %	197361744
11592	NC_011147	ACC	2	6	645611	645616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361744
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11598	NC_011147	ACTC	2	8	645876	645883	25 %	25 %	0 %	50 %	197361744
11599	NC_011147	GGC	2	6	645975	645980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361745
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11603	NC_011147	TAC	2	6	646266	646271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361745
11604	NC_011147	CGG	2	6	646280	646285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361745
11605	NC_011147	TGA	2	6	646291	646296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361745
11606	NC_011147	TG	3	6	646308	646313	0 %	50 %	50 %	0 %	197361745
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11608	NC_011147	CGG	2	6	646451	646456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361745
11609	NC_011147	TGG	2	6	646519	646524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361745
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11612	NC_011147	GCA	2	6	646664	646669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361745
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11618	NC_011147	CG	3	6	646855	646860	0 %	0 %	50 %	50 %	197361745
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11620	NC_011147	GTCT	2	8	646886	646893	0 %	50 %	25 %	25 %	197361745
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11983	NC_011147	T	7	7	666343	666349	0 %	100 %	0 %	0 %	197361762
11984	NC_011147	TAT	2	6	666387	666392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361762
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