MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011147	GC	3	6	616496	616501	0 %	0 %	50 %	50 %	197361715
11002	NC_011147	GTG	2	6	616554	616559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361715
11003	NC_011147	GTCACC	2	12	616675	616686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	197361715
11004	NC_011147	TTC	2	6	616764	616769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361715
11005	NC_011147	GTT	2	6	616817	616822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361715
11006	NC_011147	TGGC	2	8	616829	616836	0 %	25 %	50 %	25 %	197361715
11007	NC_011147	TTC	2	6	616884	616889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361715
11008	NC_011147	ATG	3	9	616890	616898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361715
11009	NC_011147	CGT	2	6	616915	616920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361715
11010	NC_011147	CCGCGT	2	12	616923	616934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	197361715
11011	NC_011147	TGCC	2	8	616968	616975	0 %	25 %	25 %	50 %	197361715
11012	NC_011147	TCA	2	6	616984	616989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361715
11013	NC_011147	CGG	2	6	617002	617007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361715
11014	NC_011147	ATT	2	6	617062	617067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361716
11015	NC_011147	GAT	2	6	617101	617106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361716
11016	NC_011147	CG	3	6	617199	617204	0 %	0 %	50 %	50 %	197361716
11017	NC_011147	TG	3	6	617241	617246	0 %	50 %	50 %	0 %	197361716
11018	NC_011147	TC	3	6	617271	617276	0 %	50 %	0 %	50 %	197361716
11019	NC_011147	TCT	2	6	617346	617351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361716
11020	NC_011147	GAA	2	6	617363	617368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361716
11021	NC_011147	CTG	2	6	617456	617461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361716
11022	NC_011147	TCCGG	2	10	617465	617474	0 %	20 %	40 %	40 %	197361716
11023	NC_011147	AAGCC	2	10	617553	617562	40 %	0 %	20 %	40 %	197361716
11024	NC_011147	TGT	2	6	617686	617691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361717
11025	NC_011147	CAT	2	6	617786	617791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361717
11026	NC_011147	GTG	2	6	617808	617813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361717
11027	NC_011147	ATG	2	6	617814	617819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361717
11028	NC_011147	CGG	2	6	617828	617833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361717
11029	NC_011147	CGG	2	6	617887	617892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361717
11030	NC_011147	TGC	3	9	618037	618045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361717
11031	NC_011147	TGG	3	9	618055	618063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361717
11032	NC_011147	GTCG	2	8	618072	618079	0 %	25 %	50 %	25 %	197361717
11033	NC_011147	CG	3	6	618123	618128	0 %	0 %	50 %	50 %	197361717
11034	NC_011147	GGA	2	6	618140	618145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361717
11035	NC_011147	GC	3	6	618146	618151	0 %	0 %	50 %	50 %	197361717
11036	NC_011147	AC	3	6	618164	618169	50 %	0 %	0 %	50 %	197361718
11037	NC_011147	CCG	2	6	618223	618228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361718
11038	NC_011147	CTG	2	6	618233	618238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361718
11039	NC_011147	TGC	2	6	618390	618395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361718
11040	NC_011147	ATT	2	6	618472	618477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361719
11041	NC_011147	ATTG	2	8	618483	618490	25 %	50 %	25 %	0 %	197361719
11042	NC_011147	CTG	2	6	618499	618504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
11043	NC_011147	TC	3	6	618509	618514	0 %	50 %	0 %	50 %	197361719
11044	NC_011147	TC	3	6	618534	618539	0 %	50 %	0 %	50 %	197361719
11045	NC_011147	GGC	2	6	618570	618575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361719
11046	NC_011147	GGAT	2	8	618596	618603	25 %	25 %	50 %	0 %	197361719
11047	NC_011147	TTC	2	6	618604	618609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361719
11048	NC_011147	CAGC	2	8	618630	618637	25 %	0 %	25 %	50 %	197361719
11049	NC_011147	GTCG	2	8	618654	618661	0 %	25 %	50 %	25 %	197361719
11050	NC_011147	CT	3	6	618715	618720	0 %	50 %	0 %	50 %	197361719
11051	NC_011147	CTT	2	6	618795	618800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361719
11052	NC_011147	TGG	2	6	618830	618835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361719
11053	NC_011147	CTG	2	6	618856	618861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
11054	NC_011147	GAA	2	6	618933	618938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361719
11055	NC_011147	GCG	2	6	618943	618948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361719
11056	NC_011147	CAA	2	6	619083	619088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361719
11057	NC_011147	TGC	2	6	619112	619117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
11058	NC_011147	GCG	2	6	619121	619126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361719
11059	NC_011147	CGGT	2	8	619127	619134	0 %	25 %	50 %	25 %	197361719
11060	NC_011147	CGC	2	6	619212	619217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361719
11061	NC_011147	CCG	2	6	619229	619234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361719
11062	NC_011147	GCAC	2	8	619249	619256	25 %	0 %	25 %	50 %	197361719
11063	NC_011147	TGA	2	6	619271	619276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361719
11064	NC_011147	TGG	2	6	619295	619300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361719
11065	NC_011147	TAT	2	6	619302	619307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361719
11066	NC_011147	CGC	2	6	619338	619343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361719
11067	NC_011147	CCA	2	6	619382	619387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361719
11068	NC_011147	GCG	2	6	619438	619443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361719
11069	NC_011147	TGA	2	6	619454	619459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361719
11070	NC_011147	CTT	2	6	619467	619472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361719
11071	NC_011147	GCT	2	6	619479	619484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
11072	NC_011147	GAACA	2	10	619525	619534	60 %	0 %	20 %	20 %	197361719
11073	NC_011147	TGG	2	6	619589	619594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361719
11074	NC_011147	G	6	6	619593	619598	0 %	0 %	100 %	0 %	197361719
11075	NC_011147	CTT	2	6	619635	619640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361719
11076	NC_011147	CTGG	2	8	619657	619664	0 %	25 %	50 %	25 %	197361719
11077	NC_011147	TGG	2	6	619694	619699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361719
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11079	NC_011147	TCATGC	2	12	619779	619790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197361719
11080	NC_011147	CCA	2	6	619806	619811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361719
11081	NC_011147	TGA	2	6	619829	619834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361719
11082	NC_011147	GC	3	6	619853	619858	0 %	0 %	50 %	50 %	197361719
11083	NC_011147	GCC	2	6	619866	619871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361719
11084	NC_011147	TGC	2	6	619883	619888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
11085	NC_011147	AACTG	2	10	619896	619905	40 %	20 %	20 %	20 %	197361719
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11087	NC_011147	TGGCTG	2	12	619978	619989	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197361719
11088	NC_011147	ACGC	2	8	619995	620002	25 %	0 %	25 %	50 %	197361719
11089	NC_011147	GC	3	6	620024	620029	0 %	0 %	50 %	50 %	197361719
11090	NC_011147	CTG	2	6	620038	620043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
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11092	NC_011147	GCT	2	6	620124	620129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361719
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11107	NC_011147	GCT	2	6	621170	621175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361720
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11119	NC_011147	ATG	2	6	621660	621665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361720
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11479	NC_011147	CCA	2	6	639870	639875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361738
11480	NC_011147	CGG	2	6	639892	639897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361738
11481	NC_011147	CGC	2	6	639933	639938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361738
11482	NC_011147	TGC	2	6	639964	639969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361738
11483	NC_011147	GAT	2	6	640003	640008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361738
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11485	NC_011147	CCG	2	6	640047	640052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361738
11486	NC_011147	GCT	2	6	640060	640065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361738
11487	NC_011147	CAT	2	6	640068	640073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361738
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11491	NC_011147	T	7	7	640186	640192	0 %	100 %	0 %	0 %	197361738
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11494	NC_011147	CGCT	2	8	640303	640310	0 %	25 %	25 %	50 %	197361739
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11499	NC_011147	CTGCG	2	10	640557	640566	0 %	20 %	40 %	40 %	197361739
11500	NC_011147	GGC	2	6	640569	640574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361739

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