MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011147	CGCC	2	8	451099	451106	0 %	0 %	25 %	75 %	197361568
8002	NC_011147	CAG	2	6	451124	451129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361568
8003	NC_011147	TGCA	2	8	451145	451152	25 %	25 %	25 %	25 %	197361568
8004	NC_011147	GGC	2	6	451153	451158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361568
8005	NC_011147	AGC	2	6	451265	451270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361568
8006	NC_011147	GCA	2	6	451327	451332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361568
8007	NC_011147	GGCGA	2	10	451382	451391	20 %	0 %	60 %	20 %	197361568
8008	NC_011147	GGC	2	6	451399	451404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361568
8009	NC_011147	ATG	2	6	451425	451430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361568
8010	NC_011147	CCGC	2	8	451468	451475	0 %	0 %	25 %	75 %	197361568
8011	NC_011147	GAA	2	6	451553	451558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361568
8012	NC_011147	CTG	2	6	451613	451618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361568
8013	NC_011147	GGC	2	6	451636	451641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361568
8014	NC_011147	CGG	2	6	451699	451704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361568
8015	NC_011147	TCTT	2	8	451766	451773	0 %	75 %	0 %	25 %	197361569
8016	NC_011147	TCT	2	6	451781	451786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361569
8017	NC_011147	CAG	2	6	451888	451893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361569
8018	NC_011147	CCA	2	6	451924	451929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361569
8019	NC_011147	GCCA	2	8	451937	451944	25 %	0 %	25 %	50 %	197361569
8020	NC_011147	TCA	2	6	451975	451980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361570
8021	NC_011147	CGA	2	6	451983	451988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8022	NC_011147	ATAC	2	8	452008	452015	50 %	25 %	0 %	25 %	197361570
8023	NC_011147	CGG	2	6	452034	452039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361570
8024	NC_011147	CA	3	6	452044	452049	50 %	0 %	0 %	50 %	197361570
8025	NC_011147	TGG	2	6	452067	452072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361570
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8027	NC_011147	CGTC	2	8	452123	452130	0 %	25 %	25 %	50 %	197361570
8028	NC_011147	CGT	2	6	452143	452148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8029	NC_011147	ACC	2	6	452192	452197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361570
8030	NC_011147	CCA	2	6	452202	452207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361570
8031	NC_011147	CCA	2	6	452245	452250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361570
8032	NC_011147	AGC	2	6	452282	452287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8033	NC_011147	ATT	2	6	452374	452379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361570
8034	NC_011147	TGCC	2	8	452388	452395	0 %	25 %	25 %	50 %	197361570
8035	NC_011147	TGG	2	6	452418	452423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361570
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8040	NC_011147	TGA	2	6	452744	452749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361570
8041	NC_011147	TGC	2	6	452753	452758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8042	NC_011147	CAA	2	6	452760	452765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361570
8043	NC_011147	CAG	2	6	452772	452777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8044	NC_011147	CCA	3	9	452778	452786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361570
8045	NC_011147	GCC	2	6	452789	452794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361570
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8047	NC_011147	CGC	2	6	452817	452822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361570
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8050	NC_011147	ACG	2	6	452897	452902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8051	NC_011147	CCACGC	2	12	452933	452944	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	197361570
8052	NC_011147	AGGG	2	8	453053	453060	25 %	0 %	75 %	0 %	197361570
8053	NC_011147	CGA	2	6	453062	453067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361570
8054	NC_011147	TCA	2	6	453116	453121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361571
8055	NC_011147	A	6	6	453121	453126	100 %	0 %	0 %	0 %	197361571
8056	NC_011147	CTG	2	6	453127	453132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361571
8057	NC_011147	AGC	2	6	453155	453160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361571
8058	NC_011147	GC	3	6	453174	453179	0 %	0 %	50 %	50 %	197361571
8059	NC_011147	TGA	2	6	453195	453200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361571
8060	NC_011147	AGC	2	6	453223	453228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361571
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8062	NC_011147	CG	3	6	453291	453296	0 %	0 %	50 %	50 %	197361571
8063	NC_011147	AAG	2	6	453340	453345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361571
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8089	NC_011147	AACA	2	8	455269	455276	75 %	0 %	0 %	25 %	197361572
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8091	NC_011147	ACCG	2	8	455314	455321	25 %	0 %	25 %	50 %	197361572
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8118	NC_011147	A	7	7	457138	457144	100 %	0 %	0 %	0 %	197361572
8119	NC_011147	TAT	2	6	459236	459241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361573
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8487	NC_011147	CTG	2	6	477102	477107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361589
8488	NC_011147	GTG	2	6	477126	477131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361589
8489	NC_011147	GGC	3	9	477138	477146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361589
8490	NC_011147	CCG	2	6	477190	477195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361589
8491	NC_011147	GCA	2	6	477280	477285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361589
8492	NC_011147	TCG	2	6	477340	477345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361589
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8495	NC_011147	CCG	2	6	477610	477615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361590
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