MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_011134	AAG	2	6	1979354	1979359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979005
34002	NC_011134	GTC	2	6	1979363	1979368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979005
34003	NC_011134	AAT	3	9	1979401	1979409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979005
34004	NC_011134	TAAAC	2	10	1979423	1979432	60 %	20 %	0 %	20 %	195979005
34005	NC_011134	GAC	2	6	1979537	1979542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34006	NC_011134	CCAA	2	8	1979600	1979607	50 %	0 %	0 %	50 %	195979006
34007	NC_011134	ACTCA	2	10	1979716	1979725	40 %	20 %	0 %	40 %	195979006
34008	NC_011134	GCA	2	6	1979744	1979749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34009	NC_011134	GTA	2	6	1979757	1979762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979006
34010	NC_011134	GCA	2	6	1979763	1979768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34011	NC_011134	ATA	2	6	1979852	1979857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979006
34012	NC_011134	AGC	2	6	1979897	1979902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34013	NC_011134	TTTGC	2	10	1979964	1979973	0 %	60 %	20 %	20 %	195979006
34014	NC_011134	ATCT	2	8	1979982	1979989	25 %	50 %	0 %	25 %	195979006
34015	NC_011134	ATA	2	6	1980023	1980028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979006
34016	NC_011134	AGA	2	6	1980271	1980276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979006
34017	NC_011134	AGCT	2	8	1980295	1980302	25 %	25 %	25 %	25 %	195979006
34018	NC_011134	GCT	2	6	1980321	1980326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34019	NC_011134	TAA	2	6	1980337	1980342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979006
34020	NC_011134	GCT	2	6	1980365	1980370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34021	NC_011134	GTC	2	6	1980419	1980424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34022	NC_011134	GCC	2	6	1980436	1980441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195979006
34023	NC_011134	TGT	2	6	1980475	1980480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979006
34024	NC_011134	TGCCT	2	10	1980523	1980532	0 %	40 %	20 %	40 %	195979006
34025	NC_011134	TAGG	2	8	1980537	1980544	25 %	25 %	50 %	0 %	195979006
34026	NC_011134	TTG	2	6	1980618	1980623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195979006
34027	NC_011134	CTC	2	6	1980637	1980642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195979006
34028	NC_011134	AGCTC	2	10	1980717	1980726	20 %	20 %	20 %	40 %	195979006
34029	NC_011134	CTG	2	6	1980730	1980735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34030	NC_011134	GTAGCT	2	12	1980758	1980769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	195979006
34031	NC_011134	CAG	2	6	1980798	1980803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34032	NC_011134	ATC	2	6	1980805	1980810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979006
34033	NC_011134	CTG	2	6	1980913	1980918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34034	NC_011134	GAT	2	6	1981026	1981031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979006
34035	NC_011134	GA	3	6	1981050	1981055	50 %	0 %	50 %	0 %	195979006
34036	NC_011134	GCT	2	6	1981082	1981087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34037	NC_011134	TAGA	2	8	1981146	1981153	50 %	25 %	25 %	0 %	195979006
34038	NC_011134	ATGC	2	8	1981303	1981310	25 %	25 %	25 %	25 %	195979006
34039	NC_011134	CT	3	6	1981360	1981365	0 %	50 %	0 %	50 %	195979006
34040	NC_011134	GCT	2	6	1981452	1981457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979006
34041	NC_011134	ATA	2	6	1981513	1981518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979006
34042	NC_011134	AGTC	2	8	1981618	1981625	25 %	25 %	25 %	25 %	195979006
34043	NC_011134	AG	3	6	1981731	1981736	50 %	0 %	50 %	0 %	195979006
34044	NC_011134	ACT	2	6	1981766	1981771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979006
34045	NC_011134	ATT	2	6	1981787	1981792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979006
34046	NC_011134	ATT	2	6	1981811	1981816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979006
34047	NC_011134	A	6	6	1981891	1981896	100 %	0 %	0 %	0 %	195979007
34048	NC_011134	T	6	6	1981901	1981906	0 %	100 %	0 %	0 %	195979007
34049	NC_011134	ATG	2	6	1981941	1981946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979007
34050	NC_011134	AGC	2	6	1981957	1981962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979007
34051	NC_011134	AAG	2	6	1981968	1981973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979007
34052	NC_011134	GAT	2	6	1982019	1982024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979007
34053	NC_011134	AAC	2	6	1982027	1982032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979007
34054	NC_011134	GGCA	2	8	1982051	1982058	25 %	0 %	50 %	25 %	195979007
34055	NC_011134	GAT	2	6	1982102	1982107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979007
34056	NC_011134	CAA	2	6	1982118	1982123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979007
34057	NC_011134	T	6	6	1982127	1982132	0 %	100 %	0 %	0 %	195979007
34058	NC_011134	T	6	6	1982183	1982188	0 %	100 %	0 %	0 %	195979007
34059	NC_011134	ACT	2	6	1982219	1982224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979007
34060	NC_011134	TCTGC	2	10	1982226	1982235	0 %	40 %	20 %	40 %	195979007
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34062	NC_011134	A	7	7	1982417	1982423	100 %	0 %	0 %	0 %	195979007
34063	NC_011134	T	6	6	1982919	1982924	0 %	100 %	0 %	0 %	195979008
34064	NC_011134	CTTG	2	8	1982945	1982952	0 %	50 %	25 %	25 %	195979008
34065	NC_011134	CT	3	6	1983071	1983076	0 %	50 %	0 %	50 %	195979008
34066	NC_011134	A	6	6	1983102	1983107	100 %	0 %	0 %	0 %	195979008
34067	NC_011134	GCCT	2	8	1983153	1983160	0 %	25 %	25 %	50 %	195979008
34068	NC_011134	GCT	2	6	1983206	1983211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979008
34069	NC_011134	AAT	2	6	1983228	1983233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979008
34070	NC_011134	TCACT	2	10	1983273	1983282	20 %	40 %	0 %	40 %	195979009
34071	NC_011134	TA	3	6	1983288	1983293	50 %	50 %	0 %	0 %	195979009
34072	NC_011134	ATC	2	6	1983310	1983315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979009
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34074	NC_011134	AAGGC	2	10	1983387	1983396	40 %	0 %	40 %	20 %	195979009
34075	NC_011134	AGCT	2	8	1983432	1983439	25 %	25 %	25 %	25 %	195979009
34076	NC_011134	T	7	7	1983521	1983527	0 %	100 %	0 %	0 %	195979009
34077	NC_011134	TAG	2	6	1983540	1983545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979009
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34080	NC_011134	GTA	2	6	1983708	1983713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979010
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34083	NC_011134	TA	3	6	1984098	1984103	50 %	50 %	0 %	0 %	195979011
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34088	NC_011134	TCG	2	6	1984751	1984756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979012
34089	NC_011134	CAA	2	6	1984938	1984943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979012
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34100	NC_011134	AAC	2	6	1985841	1985846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979013
34101	NC_011134	CTAGA	2	10	1985964	1985973	40 %	20 %	20 %	20 %	195979013
34102	NC_011134	GCC	2	6	1985983	1985988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195979013
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34104	NC_011134	CTC	2	6	1986077	1986082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195979013
34105	NC_011134	AC	3	6	1986202	1986207	50 %	0 %	0 %	50 %	195979013
34106	NC_011134	AAAG	2	8	1986267	1986274	75 %	0 %	25 %	0 %	195979013
34107	NC_011134	TC	3	6	1986339	1986344	0 %	50 %	0 %	50 %	195979013
34108	NC_011134	AAC	2	6	1986413	1986418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979013
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34110	NC_011134	CAT	2	6	1986517	1986522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979013
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34112	NC_011134	CAT	2	6	1986568	1986573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979013
34113	NC_011134	CAT	2	6	1986613	1986618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979013
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34115	NC_011134	TAT	2	6	1986794	1986799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195979013
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34117	NC_011134	ACA	2	6	1986873	1986878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979013
34118	NC_011134	ATC	2	6	1986880	1986885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195979013
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34468	NC_011134	CAA	2	6	2006731	2006736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979034
34469	NC_011134	TAA	2	6	2006789	2006794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979034
34470	NC_011134	TGAT	2	8	2006821	2006828	25 %	50 %	25 %	0 %	195979034
34471	NC_011134	CAA	2	6	2006927	2006932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979035
34472	NC_011134	TAA	2	6	2006951	2006956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195979035
34473	NC_011134	T	7	7	2006970	2006976	0 %	100 %	0 %	0 %	195979035
34474	NC_011134	GAT	2	6	2007018	2007023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979035
34475	NC_011134	GCT	2	6	2007073	2007078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979035
34476	NC_011134	AGC	2	6	2007079	2007084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195979035
34477	NC_011134	CAA	2	6	2007116	2007121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979035
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34479	NC_011134	TGC	2	6	2007330	2007335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979035
34480	NC_011134	TCGTC	2	10	2007338	2007347	0 %	40 %	20 %	40 %	195979035
34481	NC_011134	TGCT	2	8	2007349	2007356	0 %	50 %	25 %	25 %	195979035
34482	NC_011134	CAA	2	6	2007371	2007376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979035
34483	NC_011134	AAG	2	6	2007381	2007386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195979035
34484	NC_011134	CAA	3	9	2007401	2007409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195979035
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34488	NC_011134	CTG	2	6	2007666	2007671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195979035
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34491	NC_011134	CTGA	2	8	2008043	2008050	25 %	25 %	25 %	25 %	195979036
34492	NC_011134	GAG	2	6	2008067	2008072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195979036
34493	NC_011134	TGCT	2	8	2008117	2008124	0 %	50 %	25 %	25 %	195979036
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34497	NC_011134	GTATC	2	10	2008303	2008312	20 %	40 %	20 %	20 %	195979036
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34499	NC_011134	GTCT	2	8	2008477	2008484	0 %	50 %	25 %	25 %	195979036
34500	NC_011134	AGT	2	6	2008520	2008525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195979036

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