MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_011134	TAC	2	6	1811024	1811029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978851
31002	NC_011134	GCA	2	6	1811032	1811037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978851
31003	NC_011134	CAATAT	2	12	1811054	1811065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	195978851
31004	NC_011134	CCA	2	6	1811073	1811078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978851
31005	NC_011134	CAA	2	6	1811119	1811124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978852
31006	NC_011134	CTG	2	6	1811129	1811134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978852
31007	NC_011134	ATC	2	6	1811135	1811140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978852
31008	NC_011134	ATT	2	6	1811180	1811185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978852
31009	NC_011134	ACC	2	6	1811234	1811239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978852
31010	NC_011134	CCA	2	6	1811256	1811261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978852
31011	NC_011134	CTC	2	6	1811264	1811269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978852
31012	NC_011134	CTC	2	6	1811372	1811377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978852
31013	NC_011134	CTG	2	6	1811428	1811433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978852
31014	NC_011134	TAT	2	6	1811437	1811442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978852
31015	NC_011134	TCA	2	6	1811449	1811454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978852
31016	NC_011134	CAG	2	6	1811500	1811505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978852
31017	NC_011134	CAG	2	6	1811563	1811568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978852
31018	NC_011134	CCT	2	6	1811584	1811589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978852
31019	NC_011134	AGAGC	2	10	1811601	1811610	40 %	0 %	40 %	20 %	195978852
31020	NC_011134	CTC	2	6	1811645	1811650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978852
31021	NC_011134	GTC	2	6	1811666	1811671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978852
31022	NC_011134	T	6	6	1811727	1811732	0 %	100 %	0 %	0 %	195978852
31023	NC_011134	A	6	6	1811784	1811789	100 %	0 %	0 %	0 %	195978852
31024	NC_011134	CTT	2	6	1811855	1811860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978853
31025	NC_011134	T	7	7	1811859	1811865	0 %	100 %	0 %	0 %	195978853
31026	NC_011134	GGCG	2	8	1811887	1811894	0 %	0 %	75 %	25 %	195978853
31027	NC_011134	ATC	2	6	1811934	1811939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978853
31028	NC_011134	TAA	2	6	1811945	1811950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978853
31029	NC_011134	TCCT	2	8	1812198	1812205	0 %	50 %	0 %	50 %	195978853
31030	NC_011134	GTCAAT	2	12	1812207	1812218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195978853
31031	NC_011134	AAT	2	6	1812237	1812242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978853
31032	NC_011134	ACC	2	6	1812274	1812279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978853
31033	NC_011134	TCAA	2	8	1812364	1812371	50 %	25 %	0 %	25 %	195978853
31034	NC_011134	CTT	2	6	1812413	1812418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978853
31035	NC_011134	CAC	2	6	1812614	1812619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978853
31036	NC_011134	AAGC	2	8	1812629	1812636	50 %	0 %	25 %	25 %	195978853
31037	NC_011134	GAA	2	6	1812664	1812669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978853
31038	NC_011134	GC	3	6	1812748	1812753	0 %	0 %	50 %	50 %	195978853
31039	NC_011134	ACG	2	6	1812780	1812785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31040	NC_011134	CTG	2	6	1812788	1812793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31041	NC_011134	GTG	2	6	1812840	1812845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195978853
31042	NC_011134	AAG	2	6	1812847	1812852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978853
31043	NC_011134	T	6	6	1812855	1812860	0 %	100 %	0 %	0 %	195978853
31044	NC_011134	AAT	2	6	1812882	1812887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978853
31045	NC_011134	AGAC	2	8	1812917	1812924	50 %	0 %	25 %	25 %	195978853
31046	NC_011134	CG	3	6	1812941	1812946	0 %	0 %	50 %	50 %	195978853
31047	NC_011134	CAG	2	6	1812989	1812994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31048	NC_011134	TCA	2	6	1813009	1813014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978853
31049	NC_011134	ACG	2	6	1813017	1813022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31050	NC_011134	TGA	2	6	1813049	1813054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978853
31051	NC_011134	CGA	2	6	1813057	1813062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31052	NC_011134	CTG	2	6	1813130	1813135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31053	NC_011134	CTC	2	6	1813143	1813148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978853
31054	NC_011134	T	6	6	1813200	1813205	0 %	100 %	0 %	0 %	195978853
31055	NC_011134	CTC	2	6	1813206	1813211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978853
31056	NC_011134	CTG	2	6	1813224	1813229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31057	NC_011134	CAG	2	6	1813271	1813276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31058	NC_011134	CAA	2	6	1813322	1813327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978853
31059	NC_011134	TCT	2	6	1813330	1813335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978853
31060	NC_011134	CCAA	2	8	1813369	1813376	50 %	0 %	0 %	50 %	195978853
31061	NC_011134	ATA	2	6	1813390	1813395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978853
31062	NC_011134	TAA	2	6	1813467	1813472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978853
31063	NC_011134	CCT	2	6	1813478	1813483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978853
31064	NC_011134	TGA	2	6	1813502	1813507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978853
31065	NC_011134	AGC	2	6	1813602	1813607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31066	NC_011134	TCA	2	6	1813627	1813632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978853
31067	NC_011134	GACAG	2	10	1813636	1813645	40 %	0 %	40 %	20 %	195978853
31068	NC_011134	TCAA	2	8	1813705	1813712	50 %	25 %	0 %	25 %	195978853
31069	NC_011134	CCA	2	6	1813765	1813770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978853
31070	NC_011134	CTG	2	6	1813781	1813786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31071	NC_011134	TTC	2	6	1813797	1813802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978853
31072	NC_011134	TCT	2	6	1813841	1813846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978853
31073	NC_011134	CAG	3	9	1813856	1813864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978853
31074	NC_011134	AACG	2	8	1813886	1813893	50 %	0 %	25 %	25 %	195978853
31075	NC_011134	TGCT	2	8	1813908	1813915	0 %	50 %	25 %	25 %	195978853
31076	NC_011134	GACC	2	8	1813925	1813932	25 %	0 %	25 %	50 %	195978853
31077	NC_011134	CAA	3	9	1813934	1813942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978853
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31080	NC_011134	TTCT	2	8	1813985	1813992	0 %	75 %	0 %	25 %	195978853
31081	NC_011134	ACG	2	6	1814357	1814362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978854
31082	NC_011134	ACG	2	6	1814408	1814413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978854
31083	NC_011134	ACG	2	6	1814432	1814437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978854
31084	NC_011134	T	7	7	1814446	1814452	0 %	100 %	0 %	0 %	195978854
31085	NC_011134	T	6	6	1814480	1814485	0 %	100 %	0 %	0 %	195978854
31086	NC_011134	GTT	2	6	1814501	1814506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978854
31087	NC_011134	T	8	8	1814598	1814605	0 %	100 %	0 %	0 %	195978854
31088	NC_011134	ATA	2	6	1814622	1814627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978854
31089	NC_011134	TAGCA	2	10	1814928	1814937	40 %	20 %	20 %	20 %	195978855
31090	NC_011134	TCCTAC	2	12	1814943	1814954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	195978855
31091	NC_011134	TGC	2	6	1815028	1815033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978855
31092	NC_011134	CTG	2	6	1815036	1815041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978855
31093	NC_011134	TCA	2	6	1815100	1815105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978855
31094	NC_011134	GT	3	6	1815149	1815154	0 %	50 %	50 %	0 %	195978855
31095	NC_011134	CCT	2	6	1815155	1815160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978855
31096	NC_011134	TTG	2	6	1815175	1815180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978855
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31098	NC_011134	GCT	2	6	1815260	1815265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978855
31099	NC_011134	GTA	2	6	1815283	1815288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978855
31100	NC_011134	ATA	2	6	1815361	1815366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978855
31101	NC_011134	GCT	2	6	1815377	1815382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978855
31102	NC_011134	AGT	2	6	1815444	1815449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978855
31103	NC_011134	ACC	2	6	1815468	1815473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978855
31104	NC_011134	AAT	2	6	1815474	1815479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978855
31105	NC_011134	T	6	6	1815489	1815494	0 %	100 %	0 %	0 %	195978855
31106	NC_011134	ACC	2	6	1815528	1815533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978855
31107	NC_011134	TTC	2	6	1815534	1815539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978855
31108	NC_011134	CCA	3	9	1815580	1815588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978855
31109	NC_011134	AAT	2	6	1815621	1815626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978855
31110	NC_011134	CTTC	2	8	1815727	1815734	0 %	50 %	0 %	50 %	195978855
31111	NC_011134	CTAT	2	8	1815784	1815791	25 %	50 %	0 %	25 %	195978855
31112	NC_011134	TTC	2	6	1815807	1815812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978855
31113	NC_011134	T	6	6	1815888	1815893	0 %	100 %	0 %	0 %	195978855
31114	NC_011134	TAAA	2	8	1815938	1815945	75 %	25 %	0 %	0 %	195978855
31115	NC_011134	T	6	6	1815975	1815980	0 %	100 %	0 %	0 %	195978855
31116	NC_011134	CTCAGT	2	12	1815981	1815992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	195978855
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31233	NC_011134	GTT	2	6	1822145	1822150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978859
31234	NC_011134	AGG	3	9	1822246	1822254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978859
31235	NC_011134	ATA	2	6	1822278	1822283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978859
31236	NC_011134	GGC	2	6	1822285	1822290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195978859
31237	NC_011134	GTC	2	6	1822299	1822304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978859
31238	NC_011134	TCT	2	6	1822350	1822355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978859
31239	NC_011134	GCTT	2	8	1822397	1822404	0 %	50 %	25 %	25 %	195978859
31240	NC_011134	CT	3	6	1822421	1822426	0 %	50 %	0 %	50 %	195978859
31241	NC_011134	GCTTGG	2	12	1822436	1822447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	195978859
31242	NC_011134	TGG	2	6	1822463	1822468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195978859
31243	NC_011134	TGCTG	2	10	1822488	1822497	0 %	40 %	40 %	20 %	195978859
31244	NC_011134	CCA	2	6	1822522	1822527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978859
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31248	NC_011134	ACCTG	2	10	1822717	1822726	20 %	20 %	20 %	40 %	195978859
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31250	NC_011134	TAG	2	6	1822791	1822796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978859
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31253	NC_011134	CTG	2	6	1822861	1822866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978859
31254	NC_011134	CTAT	2	8	1822908	1822915	25 %	50 %	0 %	25 %	195978859
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31259	NC_011134	GACA	2	8	1823519	1823526	50 %	0 %	25 %	25 %	195978860
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31265	NC_011134	CTG	2	6	1823858	1823863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978860
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31320	NC_011134	TGA	2	6	1826718	1826723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978862
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31332	NC_011134	TCA	2	6	1827186	1827191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978862
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31335	NC_011134	ATA	3	9	1827378	1827386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978862
31336	NC_011134	ATT	2	6	1827393	1827398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978862
31337	NC_011134	ATC	2	6	1827478	1827483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978863
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31339	NC_011134	A	6	6	1827599	1827604	100 %	0 %	0 %	0 %	195978863
31340	NC_011134	ATG	2	6	1827633	1827638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978863
31341	NC_011134	CCA	2	6	1827703	1827708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978863
31342	NC_011134	TTGTT	2	10	1827722	1827731	0 %	80 %	20 %	0 %	195978863
31343	NC_011134	GCCAAC	2	12	1827873	1827884	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	195978863
31344	NC_011134	AGCT	2	8	1827890	1827897	25 %	25 %	25 %	25 %	195978863
31345	NC_011134	GCT	2	6	1827936	1827941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978863
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31347	NC_011134	AGC	2	6	1828108	1828113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978863
31348	NC_011134	ACAA	2	8	1828144	1828151	75 %	0 %	0 %	25 %	195978863
31349	NC_011134	CAG	2	6	1828193	1828198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978863
31350	NC_011134	ACC	2	6	1828206	1828211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978863
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31352	NC_011134	CGATGA	2	12	1828261	1828272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195978864
31353	NC_011134	TTA	2	6	1828292	1828297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978864
31354	NC_011134	GTAAA	2	10	1828333	1828342	60 %	20 %	20 %	0 %	195978864
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31358	NC_011134	GCT	2	6	1828615	1828620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978864
31359	NC_011134	TAGG	2	8	1828643	1828650	25 %	25 %	50 %	0 %	195978864
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31410	NC_011134	ATG	2	6	1831439	1831444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978867
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31462	NC_011134	GAG	2	6	1835528	1835533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978871
31463	NC_011134	GCT	2	6	1835543	1835548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978871
31464	NC_011134	A	6	6	1835549	1835554	100 %	0 %	0 %	0 %	195978871
31465	NC_011134	AAC	2	6	1835563	1835568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978871
31466	NC_011134	TCA	2	6	1835595	1835600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978871
31467	NC_011134	ACA	2	6	1835612	1835617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978871
31468	NC_011134	CAA	2	6	1835749	1835754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978871
31469	NC_011134	TGT	2	6	1835785	1835790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978871
31470	NC_011134	TATTT	2	10	1835798	1835807	20 %	80 %	0 %	0 %	195978871
31471	NC_011134	GACA	2	8	1835867	1835874	50 %	0 %	25 %	25 %	195978871
31472	NC_011134	GCA	2	6	1835875	1835880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978871
31473	NC_011134	AC	3	6	1835906	1835911	50 %	0 %	0 %	50 %	195978871
31474	NC_011134	CAT	2	6	1835951	1835956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978871
31475	NC_011134	GAC	2	6	1835992	1835997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978871
31476	NC_011134	CAT	2	6	1836236	1836241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978872
31477	NC_011134	CTC	2	6	1836297	1836302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978872
31478	NC_011134	GAT	2	6	1836305	1836310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978872
31479	NC_011134	TGT	2	6	1836320	1836325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978872
31480	NC_011134	AGC	2	6	1836351	1836356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978872
31481	NC_011134	AGGC	2	8	1836365	1836372	25 %	0 %	50 %	25 %	195978872
31482	NC_011134	AGACA	2	10	1836417	1836426	60 %	0 %	20 %	20 %	195978872
31483	NC_011134	CAA	2	6	1836548	1836553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978872
31484	NC_011134	GCA	3	9	1836554	1836562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978872
31485	NC_011134	CAA	2	6	1836709	1836714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978873
31486	NC_011134	GCA	2	6	1836835	1836840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978873
31487	NC_011134	CAT	2	6	1836841	1836846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978873
31488	NC_011134	TAAG	2	8	1836847	1836854	50 %	25 %	25 %	0 %	195978873
31489	NC_011134	TCAA	2	8	1836930	1836937	50 %	25 %	0 %	25 %	195978873
31490	NC_011134	GCA	2	6	1837049	1837054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978873
31491	NC_011134	GAG	2	6	1837070	1837075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978873
31492	NC_011134	CAC	2	6	1837150	1837155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978873
31493	NC_011134	CTC	2	6	1837166	1837171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978873
31494	NC_011134	GGCCTT	2	12	1837178	1837189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978873
31495	NC_011134	TCC	2	6	1837197	1837202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978873
31496	NC_011134	CCTTT	2	10	1837208	1837217	0 %	60 %	0 %	40 %	195978873
31497	NC_011134	TTA	2	6	1837227	1837232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978873
31498	NC_011134	ACTG	2	8	1837238	1837245	25 %	25 %	25 %	25 %	195978873
31499	NC_011134	AG	3	6	1837276	1837281	50 %	0 %	50 %	0 %	195978873
31500	NC_011134	CTC	2	6	1837283	1837288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978873

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