MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_011134	CTG	2	6	1627170	1627175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978679
28004	NC_011134	GCT	2	6	1627191	1627196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978679
28005	NC_011134	ATC	2	6	1627249	1627254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978679
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28008	NC_011134	ACG	2	6	1627510	1627515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978679
28009	NC_011134	CTT	2	6	1627531	1627536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978679
28010	NC_011134	CTG	2	6	1627569	1627574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978679
28011	NC_011134	GAAA	2	8	1627611	1627618	75 %	0 %	25 %	0 %	195978679
28012	NC_011134	CTC	2	6	1627663	1627668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978679
28013	NC_011134	TCT	2	6	1627742	1627747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978679
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28015	NC_011134	CAC	2	6	1627767	1627772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978679
28016	NC_011134	ACC	2	6	1627915	1627920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978679
28017	NC_011134	AAT	2	6	1627936	1627941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978679
28018	NC_011134	TAC	2	6	1627956	1627961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978679
28019	NC_011134	TGC	2	6	1627963	1627968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978679
28020	NC_011134	AGC	2	6	1627975	1627980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978679
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28023	NC_011134	ATT	2	6	1628084	1628089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978680
28024	NC_011134	ATC	2	6	1628161	1628166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978680
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28027	NC_011134	CTA	2	6	1628303	1628308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978680
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28030	NC_011134	ATC	2	6	1628588	1628593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978681
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28033	NC_011134	TAA	2	6	1628677	1628682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978681
28034	NC_011134	AGAT	2	8	1628743	1628750	50 %	25 %	25 %	0 %	195978681
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28037	NC_011134	CCTT	2	8	1628855	1628862	0 %	50 %	0 %	50 %	195978681
28038	NC_011134	GCG	2	6	1628881	1628886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195978681
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28041	NC_011134	ACCA	2	8	1629064	1629071	50 %	0 %	0 %	50 %	195978681
28042	NC_011134	GTC	2	6	1629109	1629114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978681
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28050	NC_011134	GCA	2	6	1629808	1629813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978682
28051	NC_011134	ATA	2	6	1629853	1629858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978682
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28053	NC_011134	ATTA	2	8	1630315	1630322	50 %	50 %	0 %	0 %	195978684
28054	NC_011134	TCC	2	6	1630340	1630345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978684
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28062	NC_011134	GCT	2	6	1630591	1630596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978684
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28073	NC_011134	CATAC	2	10	1631141	1631150	40 %	20 %	0 %	40 %	195978684
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28091	NC_011134	CGT	2	6	1633136	1633141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978686
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28098	NC_011134	CT	3	6	1633325	1633330	0 %	50 %	0 %	50 %	195978686
28099	NC_011134	TCA	2	6	1633627	1633632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978686
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28101	NC_011134	TGACT	2	10	1633671	1633680	20 %	40 %	20 %	20 %	195978686
28102	NC_011134	GCT	2	6	1633751	1633756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978686
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28107	NC_011134	GCA	2	6	1633916	1633921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978686
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28114	NC_011134	AGTA	2	8	1634358	1634365	50 %	25 %	25 %	0 %	195978687
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28231	NC_011134	TCA	2	6	1640877	1640882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978693
28232	NC_011134	CAT	2	6	1640893	1640898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978693
28233	NC_011134	GTC	2	6	1641015	1641020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978693
28234	NC_011134	TCA	2	6	1641052	1641057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978693
28235	NC_011134	CTG	2	6	1641086	1641091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978693
28236	NC_011134	AGCA	2	8	1641248	1641255	50 %	0 %	25 %	25 %	195978693
28237	NC_011134	TCA	2	6	1641313	1641318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978693
28238	NC_011134	AAG	2	6	1641947	1641952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978694
28239	NC_011134	TCG	2	6	1641997	1642002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978694
28240	NC_011134	TCA	2	6	1642020	1642025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978694
28241	NC_011134	TA	3	6	1642062	1642067	50 %	50 %	0 %	0 %	195978694
28242	NC_011134	AGC	2	6	1642108	1642113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978694
28243	NC_011134	A	6	6	1642117	1642122	100 %	0 %	0 %	0 %	195978694
28244	NC_011134	ATCA	2	8	1642158	1642165	50 %	25 %	0 %	25 %	195978694
28245	NC_011134	GAG	2	6	1642212	1642217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978694
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28249	NC_011134	TA	3	6	1642516	1642521	50 %	50 %	0 %	0 %	195978694
28250	NC_011134	CTAT	2	8	1642524	1642531	25 %	50 %	0 %	25 %	195978694
28251	NC_011134	GCT	2	6	1642565	1642570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978694
28252	NC_011134	ACTT	2	8	1642590	1642597	25 %	50 %	0 %	25 %	195978694
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28254	NC_011134	GA	3	6	1642671	1642676	50 %	0 %	50 %	0 %	195978694
28255	NC_011134	T	6	6	1642727	1642732	0 %	100 %	0 %	0 %	195978694
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28258	NC_011134	AACA	2	8	1643004	1643011	75 %	0 %	0 %	25 %	195978694
28259	NC_011134	AGTG	2	8	1643012	1643019	25 %	25 %	50 %	0 %	195978694
28260	NC_011134	ATG	2	6	1643020	1643025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978694
28261	NC_011134	AT	3	6	1643032	1643037	50 %	50 %	0 %	0 %	195978694
28262	NC_011134	AGC	2	6	1643284	1643289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978695
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28264	NC_011134	CTTGAT	2	12	1643366	1643377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	195978695
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28268	NC_011134	AAG	2	6	1643663	1643668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978696
28269	NC_011134	GCT	2	6	1643671	1643676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978696
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28271	NC_011134	CCA	2	6	1643718	1643723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978696
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28273	NC_011134	ACC	2	6	1643940	1643945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978696
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28303	NC_011134	GCT	2	6	1645340	1645345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978697
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28312	NC_011134	ATA	2	6	1645781	1645786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978698
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28331	NC_011134	TCT	2	6	1648623	1648628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978700
28332	NC_011134	GTCT	2	8	1648694	1648701	0 %	50 %	25 %	25 %	195978700
28333	NC_011134	AGC	2	6	1648721	1648726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28334	NC_011134	GTTT	2	8	1648727	1648734	0 %	75 %	25 %	0 %	195978700
28335	NC_011134	CTAG	2	8	1648785	1648792	25 %	25 %	25 %	25 %	195978700
28336	NC_011134	GCT	2	6	1648870	1648875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
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28338	NC_011134	CCA	2	6	1648950	1648955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978700
28339	NC_011134	CATT	2	8	1648969	1648976	25 %	50 %	0 %	25 %	195978700
28340	NC_011134	GCT	2	6	1648977	1648982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28341	NC_011134	GTCT	2	8	1649045	1649052	0 %	50 %	25 %	25 %	195978700
28342	NC_011134	CTG	2	6	1649141	1649146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28343	NC_011134	CTG	2	6	1649167	1649172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
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28347	NC_011134	TGC	2	6	1649255	1649260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28348	NC_011134	CAC	2	6	1649305	1649310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978700
28349	NC_011134	AAT	2	6	1649486	1649491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978700
28350	NC_011134	TGC	2	6	1649574	1649579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28351	NC_011134	TCT	2	6	1649610	1649615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978700
28352	NC_011134	CCT	2	6	1649713	1649718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978700
28353	NC_011134	GCT	2	6	1649805	1649810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
28354	NC_011134	GCCATA	2	12	1649823	1649834	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	195978700
28355	NC_011134	CAT	2	6	1649965	1649970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978700
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28358	NC_011134	GCC	2	6	1650111	1650116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195978700
28359	NC_011134	TGC	2	6	1650146	1650151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978700
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28365	NC_011134	TG	3	6	1650709	1650714	0 %	50 %	50 %	0 %	195978702
28366	NC_011134	GCTG	2	8	1650758	1650765	0 %	25 %	50 %	25 %	195978702
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28370	NC_011134	GTC	2	6	1650987	1650992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978702
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28383	NC_011134	GTT	2	6	1652060	1652065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978703
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28400	NC_011134	CTGT	2	8	1652646	1652653	0 %	50 %	25 %	25 %	195978703
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28403	NC_011134	CAGC	2	8	1652795	1652802	25 %	0 %	25 %	50 %	195978703
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28409	NC_011134	CAA	2	6	1653154	1653159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978704
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28434	NC_011134	ACC	2	6	1655759	1655764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978707
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28438	NC_011134	TGGGGC	2	12	1655918	1655929	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	195978707
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28445	NC_011134	TCA	2	6	1656384	1656389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978708
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28450	NC_011134	CCT	2	6	1656677	1656682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978709
28451	NC_011134	T	6	6	1656810	1656815	0 %	100 %	0 %	0 %	195978709
28452	NC_011134	GCA	2	6	1656852	1656857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978709
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28456	NC_011134	GCGG	2	8	1656971	1656978	0 %	0 %	75 %	25 %	195978709
28457	NC_011134	GAG	2	6	1657074	1657079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978709
28458	NC_011134	ATCA	2	8	1657182	1657189	50 %	25 %	0 %	25 %	195978709
28459	NC_011134	AT	3	6	1657470	1657475	50 %	50 %	0 %	0 %	195978710
28460	NC_011134	CTC	2	6	1657613	1657618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978710
28461	NC_011134	TCT	2	6	1657623	1657628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978710
28462	NC_011134	A	6	6	1657741	1657746	100 %	0 %	0 %	0 %	195978710
28463	NC_011134	GCT	2	6	1657753	1657758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978710
28464	NC_011134	GCT	2	6	1657767	1657772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978710
28465	NC_011134	T	7	7	1657812	1657818	0 %	100 %	0 %	0 %	195978710
28466	NC_011134	AG	3	6	1657829	1657834	50 %	0 %	50 %	0 %	195978710
28467	NC_011134	TCA	2	6	1657902	1657907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978710
28468	NC_011134	TA	3	6	1657949	1657954	50 %	50 %	0 %	0 %	195978710
28469	NC_011134	TCA	2	6	1658053	1658058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978710
28470	NC_011134	TGA	2	6	1658080	1658085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978710
28471	NC_011134	TGA	2	6	1658157	1658162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978710
28472	NC_011134	T	6	6	1658179	1658184	0 %	100 %	0 %	0 %	195978710
28473	NC_011134	A	6	6	1658191	1658196	100 %	0 %	0 %	0 %	195978710
28474	NC_011134	A	7	7	1658208	1658214	100 %	0 %	0 %	0 %	195978710
28475	NC_011134	T	8	8	1658270	1658277	0 %	100 %	0 %	0 %	195978710
28476	NC_011134	TG	4	8	1658357	1658364	0 %	50 %	50 %	0 %	195978711
28477	NC_011134	TCAAGA	2	12	1658497	1658508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	195978711
28478	NC_011134	TC	3	6	1658516	1658521	0 %	50 %	0 %	50 %	195978711
28479	NC_011134	GCTT	2	8	1658632	1658639	0 %	50 %	25 %	25 %	195978711
28480	NC_011134	AACTG	2	10	1658670	1658679	40 %	20 %	20 %	20 %	195978711
28481	NC_011134	CCA	2	6	1658693	1658698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978711
28482	NC_011134	TGC	2	6	1658746	1658751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978711
28483	NC_011134	CTT	2	6	1658752	1658757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978711
28484	NC_011134	AGC	3	9	1658770	1658778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978711
28485	NC_011134	TGAC	2	8	1658803	1658810	25 %	25 %	25 %	25 %	195978711
28486	NC_011134	TCT	2	6	1658831	1658836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978711
28487	NC_011134	CT	3	6	1658859	1658864	0 %	50 %	0 %	50 %	195978711
28488	NC_011134	GTT	2	6	1658866	1658871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978711
28489	NC_011134	GTT	2	6	1658926	1658931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978711
28490	NC_011134	TTA	2	6	1658960	1658965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978711
28491	NC_011134	CAA	2	6	1659350	1659355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978712
28492	NC_011134	CAAT	2	8	1659361	1659368	50 %	25 %	0 %	25 %	195978712
28493	NC_011134	TCA	2	6	1659370	1659375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978712
28494	NC_011134	TTC	2	6	1659432	1659437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978712
28495	NC_011134	GTA	2	6	1659489	1659494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978712
28496	NC_011134	TCA	2	6	1659509	1659514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978712
28497	NC_011134	CTG	2	6	1659564	1659569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978712
28498	NC_011134	CTTTT	2	10	1659591	1659600	0 %	80 %	0 %	20 %	195978713
28499	NC_011134	TCG	2	6	1659707	1659712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978713
28500	NC_011134	CCT	2	6	1659719	1659724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978713

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