MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_011134	GCT	2	6	1249978	1249983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21502	NC_011134	TGC	2	6	1250015	1250020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21503	NC_011134	CAG	2	6	1250036	1250041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21504	NC_011134	AGC	2	6	1250061	1250066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21505	NC_011134	CATT	2	8	1250189	1250196	25 %	50 %	0 %	25 %	195978328
21506	NC_011134	ATT	2	6	1250250	1250255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978328
21507	NC_011134	GTT	2	6	1250274	1250279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978328
21508	NC_011134	CAA	2	6	1250285	1250290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978328
21509	NC_011134	T	6	6	1250342	1250347	0 %	100 %	0 %	0 %	195978328
21510	NC_011134	CCT	2	6	1250363	1250368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978328
21511	NC_011134	CAA	2	6	1250456	1250461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978328
21512	NC_011134	CAC	2	6	1250462	1250467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978328
21513	NC_011134	ATC	2	6	1250514	1250519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978328
21514	NC_011134	AAT	2	6	1250589	1250594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978328
21515	NC_011134	TTG	2	6	1250677	1250682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978328
21516	NC_011134	AAG	2	6	1250688	1250693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978328
21517	NC_011134	ATAGT	2	10	1250761	1250770	40 %	40 %	20 %	0 %	195978328
21518	NC_011134	CTG	2	6	1250798	1250803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21519	NC_011134	AGGT	2	8	1250839	1250846	25 %	25 %	50 %	0 %	195978328
21520	NC_011134	TTG	2	6	1250849	1250854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978328
21521	NC_011134	CCA	2	6	1250881	1250886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978328
21522	NC_011134	CAA	2	6	1250900	1250905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978328
21523	NC_011134	ACC	2	6	1250916	1250921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978328
21524	NC_011134	CAC	2	6	1250930	1250935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978328
21525	NC_011134	AGC	2	6	1250940	1250945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21526	NC_011134	GTA	2	6	1250946	1250951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978328
21527	NC_011134	ACA	2	6	1250971	1250976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978328
21528	NC_011134	ATG	2	6	1250977	1250982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978328
21529	NC_011134	TCA	2	6	1250989	1250994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978328
21530	NC_011134	GCA	2	6	1250995	1251000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21531	NC_011134	GCC	2	6	1251064	1251069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195978328
21532	NC_011134	GCT	2	6	1251109	1251114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978328
21533	NC_011134	CCTG	2	8	1251187	1251194	0 %	25 %	25 %	50 %	195978328
21534	NC_011134	TCT	2	6	1251223	1251228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978328
21535	NC_011134	AAG	2	6	1251267	1251272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978328
21536	NC_011134	GAT	2	6	1251318	1251323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978328
21537	NC_011134	CTT	2	6	1251329	1251334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978328
21538	NC_011134	ATA	2	6	1251358	1251363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978328
21539	NC_011134	TCA	2	6	1251587	1251592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978329
21540	NC_011134	T	6	6	1251623	1251628	0 %	100 %	0 %	0 %	195978329
21541	NC_011134	CCA	2	6	1251664	1251669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978329
21542	NC_011134	CAA	2	6	1251712	1251717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978329
21543	NC_011134	TGAT	2	8	1251783	1251790	25 %	50 %	25 %	0 %	195978329
21544	NC_011134	CCT	2	6	1251876	1251881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978329
21545	NC_011134	GA	3	6	1251924	1251929	50 %	0 %	50 %	0 %	195978329
21546	NC_011134	AAC	2	6	1251950	1251955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978329
21547	NC_011134	CAT	2	6	1251970	1251975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978329
21548	NC_011134	CAT	2	6	1252030	1252035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978329
21549	NC_011134	TCA	2	6	1252072	1252077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978329
21550	NC_011134	AATCA	2	10	1252100	1252109	60 %	20 %	0 %	20 %	195978329
21551	NC_011134	CTT	2	6	1252157	1252162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978329
21552	NC_011134	ATGTCA	2	12	1252185	1252196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	195978329
21553	NC_011134	TCT	2	6	1252273	1252278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978329
21554	NC_011134	TTC	2	6	1252316	1252321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978329
21555	NC_011134	CAG	2	6	1252342	1252347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978329
21556	NC_011134	TCC	2	6	1252377	1252382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978329
21557	NC_011134	CCA	2	6	1252395	1252400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978329
21558	NC_011134	TCT	2	6	1252503	1252508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978329
21559	NC_011134	GCT	2	6	1252572	1252577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978329
21560	NC_011134	GCT	2	6	1252584	1252589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978329
21561	NC_011134	GCT	2	6	1252659	1252664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978329
21562	NC_011134	TGA	2	6	1252691	1252696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978329
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21565	NC_011134	GCA	2	6	1252761	1252766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978329
21566	NC_011134	CCTG	2	8	1252806	1252813	0 %	25 %	25 %	50 %	195978329
21567	NC_011134	TGTCT	2	10	1252865	1252874	0 %	60 %	20 %	20 %	195978329
21568	NC_011134	AAG	2	6	1252886	1252891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978329
21569	NC_011134	CCT	2	6	1252918	1252923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978329
21570	NC_011134	GAT	2	6	1252937	1252942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978329
21571	NC_011134	CTT	2	6	1252948	1252953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978329
21572	NC_011134	ATA	2	6	1252977	1252982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978329
21573	NC_011134	AT	3	6	1252995	1253000	50 %	50 %	0 %	0 %	195978329
21574	NC_011134	AGC	2	6	1253150	1253155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978330
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21577	NC_011134	CAT	2	6	1253323	1253328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978330
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21581	NC_011134	CTT	2	6	1253566	1253571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978330
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21583	NC_011134	ACC	2	6	1253673	1253678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978330
21584	NC_011134	CCA	3	9	1253787	1253795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978330
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21587	NC_011134	ATT	2	6	1253819	1253824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978330
21588	NC_011134	TAA	2	6	1253848	1253853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978330
21589	NC_011134	CAA	2	6	1253872	1253877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978330
21590	NC_011134	AGC	2	6	1253924	1253929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978330
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21592	NC_011134	ATT	2	6	1254117	1254122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978330
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21599	NC_011134	CAG	2	6	1254422	1254427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978331
21600	NC_011134	ACCAA	2	10	1254435	1254444	60 %	0 %	0 %	40 %	195978331
21601	NC_011134	CTCAAC	2	12	1254453	1254464	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	195978331
21602	NC_011134	CAG	2	6	1254467	1254472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978331
21603	NC_011134	AGGTG	2	10	1254592	1254601	20 %	20 %	60 %	0 %	195978331
21604	NC_011134	GTT	2	6	1254642	1254647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978331
21605	NC_011134	TGC	2	6	1254681	1254686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978331
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21607	NC_011134	TTG	2	6	1254754	1254759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978331
21608	NC_011134	GCA	2	6	1254784	1254789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978331
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21610	NC_011134	AC	3	6	1254887	1254892	50 %	0 %	0 %	50 %	195978331
21611	NC_011134	TTACC	2	10	1254896	1254905	20 %	40 %	0 %	40 %	195978331
21612	NC_011134	CAT	2	6	1254918	1254923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978331
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21615	NC_011134	ATC	2	6	1254987	1254992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978331
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21733	NC_011134	CAT	2	6	1261441	1261446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978336
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21738	NC_011134	CTTT	2	8	1261551	1261558	0 %	75 %	0 %	25 %	195978337
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