MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011134	TGC	2	6	1128081	1128086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978211
19502	NC_011134	CTG	2	6	1128114	1128119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978211
19503	NC_011134	ACA	2	6	1128166	1128171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978211
19504	NC_011134	TCAA	2	8	1128187	1128194	50 %	25 %	0 %	25 %	195978211
19505	NC_011134	CAG	2	6	1128296	1128301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978211
19506	NC_011134	CT	3	6	1128310	1128315	0 %	50 %	0 %	50 %	195978211
19507	NC_011134	ATC	2	6	1128384	1128389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978211
19508	NC_011134	GCC	2	6	1128523	1128528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	195978211
19509	NC_011134	ACC	2	6	1128588	1128593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978211
19510	NC_011134	TAAGC	2	10	1128595	1128604	40 %	20 %	20 %	20 %	195978211
19511	NC_011134	AC	3	6	1128617	1128622	50 %	0 %	0 %	50 %	195978211
19512	NC_011134	CAAA	2	8	1128656	1128663	75 %	0 %	0 %	25 %	195978211
19513	NC_011134	TCC	3	9	1128816	1128824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978211
19514	NC_011134	CCCT	2	8	1128915	1128922	0 %	25 %	0 %	75 %	195978211
19515	NC_011134	TGA	2	6	1128939	1128944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978211
19516	NC_011134	ATC	2	6	1128987	1128992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978211
19517	NC_011134	CCT	2	6	1129106	1129111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978211
19518	NC_011134	GAA	2	6	1129121	1129126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978211
19519	NC_011134	AGT	2	6	1129349	1129354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978212
19520	NC_011134	ATA	2	6	1129379	1129384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978212
19521	NC_011134	AGC	2	6	1129394	1129399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19522	NC_011134	TAG	2	6	1129592	1129597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978212
19523	NC_011134	CAG	2	6	1129631	1129636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19524	NC_011134	TCA	2	6	1129675	1129680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19525	NC_011134	AATGA	2	10	1129709	1129718	60 %	20 %	20 %	0 %	195978212
19526	NC_011134	AGC	2	6	1129736	1129741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19527	NC_011134	TCA	2	6	1129755	1129760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19528	NC_011134	TGC	2	6	1129798	1129803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19529	NC_011134	GCA	2	6	1129825	1129830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19530	NC_011134	CAT	2	6	1129912	1129917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19531	NC_011134	TAA	2	6	1129936	1129941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978212
19532	NC_011134	CTG	2	6	1130032	1130037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19533	NC_011134	TCA	2	6	1130115	1130120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19534	NC_011134	TCA	2	6	1130124	1130129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19535	NC_011134	GAC	2	6	1130154	1130159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19536	NC_011134	CTGA	2	8	1130207	1130214	25 %	25 %	25 %	25 %	195978212
19537	NC_011134	GGC	2	6	1130260	1130265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195978212
19538	NC_011134	CAT	2	6	1130339	1130344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978212
19539	NC_011134	CTT	2	6	1130377	1130382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978212
19540	NC_011134	TGA	2	6	1130400	1130405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978212
19541	NC_011134	CTT	2	6	1130410	1130415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978212
19542	NC_011134	TTC	2	6	1130423	1130428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978212
19543	NC_011134	CATT	2	8	1130482	1130489	25 %	50 %	0 %	25 %	195978212
19544	NC_011134	T	7	7	1130531	1130537	0 %	100 %	0 %	0 %	195978212
19545	NC_011134	AT	3	6	1130558	1130563	50 %	50 %	0 %	0 %	195978212
19546	NC_011134	A	6	6	1130642	1130647	100 %	0 %	0 %	0 %	195978212
19547	NC_011134	CTG	2	6	1130672	1130677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19548	NC_011134	T	6	6	1130773	1130778	0 %	100 %	0 %	0 %	195978212
19549	NC_011134	CGA	2	6	1130790	1130795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978212
19550	NC_011134	AAAG	2	8	1130893	1130900	75 %	0 %	25 %	0 %	195978212
19551	NC_011134	TTA	2	6	1130913	1130918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978212
19552	NC_011134	CCAAG	2	10	1130980	1130989	40 %	0 %	20 %	40 %	195978212
19553	NC_011134	CACT	2	8	1131019	1131026	25 %	25 %	0 %	50 %	195978212
19554	NC_011134	AGGT	2	8	1131072	1131079	25 %	25 %	50 %	0 %	195978212
19555	NC_011134	TTC	2	6	1131085	1131090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978212
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19557	NC_011134	TCT	2	6	1131137	1131142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978213
19558	NC_011134	TTGC	2	8	1131182	1131189	0 %	50 %	25 %	25 %	195978213
19559	NC_011134	TG	3	6	1131203	1131208	0 %	50 %	50 %	0 %	195978213
19560	NC_011134	GCT	2	6	1131426	1131431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978213
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19562	NC_011134	TAA	2	6	1131498	1131503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978213
19563	NC_011134	TGGC	2	8	1131548	1131555	0 %	25 %	50 %	25 %	195978213
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19566	NC_011134	GAAATC	2	12	1131908	1131919	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	195978213
19567	NC_011134	GCTT	2	8	1131945	1131952	0 %	50 %	25 %	25 %	195978213
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19570	NC_011134	CCA	2	6	1132038	1132043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978213
19571	NC_011134	ATC	2	6	1132106	1132111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978213
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19574	NC_011134	CTG	2	6	1132303	1132308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978213
19575	NC_011134	GTCTT	2	10	1132323	1132332	0 %	60 %	20 %	20 %	195978213
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19577	NC_011134	ATG	2	6	1132395	1132400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978213
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19582	NC_011134	T	6	6	1132539	1132544	0 %	100 %	0 %	0 %	195978213
19583	NC_011134	AAT	2	6	1132560	1132565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978213
19584	NC_011134	AGC	2	6	1132572	1132577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978213
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19587	NC_011134	CAT	2	6	1132681	1132686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978213
19588	NC_011134	CTG	2	6	1132717	1132722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978213
19589	NC_011134	ATCA	2	8	1132735	1132742	50 %	25 %	0 %	25 %	195978213
19590	NC_011134	TTG	2	6	1132755	1132760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978213
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19592	NC_011134	CAAA	2	8	1132807	1132814	75 %	0 %	0 %	25 %	195978213
19593	NC_011134	CATT	2	8	1132855	1132862	25 %	50 %	0 %	25 %	195978213
19594	NC_011134	TAAT	2	8	1132955	1132962	50 %	50 %	0 %	0 %	195978214
19595	NC_011134	TTC	2	6	1132965	1132970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978214
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19598	NC_011134	TAG	2	6	1133096	1133101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978214
19599	NC_011134	TTG	2	6	1133106	1133111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978214
19600	NC_011134	TTC	2	6	1133130	1133135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978214
19601	NC_011134	T	7	7	1133174	1133180	0 %	100 %	0 %	0 %	195978214
19602	NC_011134	CAG	2	6	1133222	1133227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978214
19603	NC_011134	TTG	2	6	1133324	1133329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978214
19604	NC_011134	A	6	6	1133392	1133397	100 %	0 %	0 %	0 %	195978214
19605	NC_011134	AGC	2	6	1133449	1133454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978214
19606	NC_011134	TCAA	2	8	1133470	1133477	50 %	25 %	0 %	25 %	195978214
19607	NC_011134	T	7	7	1133498	1133504	0 %	100 %	0 %	0 %	195978214
19608	NC_011134	GTG	2	6	1133587	1133592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195978214
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19612	NC_011134	TCA	2	6	1133744	1133749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978214
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19614	NC_011134	CAA	2	6	1133786	1133791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978214
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19850	NC_011134	CAA	2	6	1148624	1148629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978229
19851	NC_011134	TCA	3	9	1148702	1148710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978229
19852	NC_011134	AAG	2	6	1148737	1148742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978229
19853	NC_011134	CAT	3	9	1148748	1148756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978229
19854	NC_011134	GGCAAT	2	12	1148772	1148783	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195978229
19855	NC_011134	CA	3	6	1148818	1148823	50 %	0 %	0 %	50 %	195978229
19856	NC_011134	GGCAAT	2	12	1148940	1148951	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	195978229
19857	NC_011134	GTC	2	6	1149013	1149018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978229
19858	NC_011134	AGC	2	6	1149037	1149042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978229
19859	NC_011134	AAT	3	9	1149072	1149080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978229
19860	NC_011134	TAA	2	6	1149084	1149089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978229
19861	NC_011134	AAT	2	6	1149090	1149095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978229
19862	NC_011134	ATC	2	6	1149157	1149162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978229
19863	NC_011134	CAGC	2	8	1149275	1149282	25 %	0 %	25 %	50 %	195978229
19864	NC_011134	TGC	2	6	1149283	1149288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978229
19865	NC_011134	CTG	2	6	1149306	1149311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978229
19866	NC_011134	A	6	6	1149319	1149324	100 %	0 %	0 %	0 %	195978229
19867	NC_011134	GCT	2	6	1149379	1149384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978229
19868	NC_011134	TGT	3	9	1149510	1149518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978229
19869	NC_011134	AATC	2	8	1149655	1149662	50 %	25 %	0 %	25 %	195978230
19870	NC_011134	TGAA	2	8	1149671	1149678	50 %	25 %	25 %	0 %	195978230
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19872	NC_011134	AATCA	2	10	1149758	1149767	60 %	20 %	0 %	20 %	195978230
19873	NC_011134	GCT	2	6	1149783	1149788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978230
19874	NC_011134	GA	3	6	1149835	1149840	50 %	0 %	50 %	0 %	195978230
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19876	NC_011134	TTA	2	6	1149888	1149893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978230
19877	NC_011134	TTG	2	6	1149978	1149983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978230
19878	NC_011134	AGT	2	6	1150031	1150036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978230
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19883	NC_011134	AAT	2	6	1150315	1150320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978230
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19888	NC_011134	GCT	2	6	1150423	1150428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978230
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19919	NC_011134	CTA	2	6	1151536	1151541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978232
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19927	NC_011134	GCTTT	2	10	1152311	1152320	0 %	60 %	20 %	20 %	195978233
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19935	NC_011134	GATA	2	8	1152685	1152692	50 %	25 %	25 %	0 %	195978233
19936	NC_011134	AGGTA	2	10	1152705	1152714	40 %	20 %	40 %	0 %	195978233
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19941	NC_011134	CGA	2	6	1152928	1152933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978233
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19946	NC_011134	TAA	2	6	1153027	1153032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978233
19947	NC_011134	GAT	2	6	1153101	1153106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978234
19948	NC_011134	TC	3	6	1153149	1153154	0 %	50 %	0 %	50 %	195978234
19949	NC_011134	T	6	6	1153158	1153163	0 %	100 %	0 %	0 %	195978234
19950	NC_011134	TCT	2	6	1153237	1153242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978234
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19952	NC_011134	CTT	2	6	1153275	1153280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978234
19953	NC_011134	ATCA	2	8	1153388	1153395	50 %	25 %	0 %	25 %	195978234
19954	NC_011134	TAT	2	6	1153406	1153411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978234
19955	NC_011134	AAT	2	6	1153432	1153437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978234
19956	NC_011134	AGA	2	6	1154162	1154167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978235
19957	NC_011134	GGT	2	6	1154269	1154274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	195978235
19958	NC_011134	ACT	2	6	1154322	1154327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978235
19959	NC_011134	TTC	2	6	1154338	1154343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978235
19960	NC_011134	TCA	2	6	1154395	1154400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978235
19961	NC_011134	TCT	2	6	1154524	1154529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978235
19962	NC_011134	T	6	6	1154576	1154581	0 %	100 %	0 %	0 %	195978235
19963	NC_011134	CTG	2	6	1154582	1154587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978235
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19966	NC_011134	TAA	2	6	1154658	1154663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978235
19967	NC_011134	ATA	2	6	1154679	1154684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978235
19968	NC_011134	CAC	2	6	1154685	1154690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978235
19969	NC_011134	GAG	2	6	1154996	1155001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	195978235
19970	NC_011134	CCA	2	6	1155013	1155018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978235
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19972	NC_011134	GT	3	6	1155182	1155187	0 %	50 %	50 %	0 %	195978235
19973	NC_011134	TTA	2	6	1155259	1155264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978235
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19975	NC_011134	T	6	6	1155330	1155335	0 %	100 %	0 %	0 %	195978235
19976	NC_011134	CTT	2	6	1155350	1155355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978235
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19978	NC_011134	TAA	2	6	1155440	1155445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978235
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19981	NC_011134	TCT	2	6	1155715	1155720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978235
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19985	NC_011134	ATA	2	6	1155921	1155926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978235
19986	NC_011134	TTG	2	6	1155974	1155979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978235
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19990	NC_011134	T	6	6	1156035	1156040	0 %	100 %	0 %	0 %	195978235
19991	NC_011134	TTC	2	6	1156047	1156052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978235
19992	NC_011134	GTT	2	6	1156175	1156180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978235
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19994	NC_011134	TTA	2	6	1156255	1156260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978235
19995	NC_011134	CTTT	2	8	1156317	1156324	0 %	75 %	0 %	25 %	195978235
19996	NC_011134	TCCT	2	8	1156350	1156357	0 %	50 %	0 %	50 %	195978235
19997	NC_011134	CCA	2	6	1156396	1156401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978235
19998	NC_011134	TTTCC	2	10	1156481	1156490	0 %	60 %	0 %	40 %	195978235
19999	NC_011134	ACC	2	6	1156520	1156525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978235
20000	NC_011134	T	7	7	1156612	1156618	0 %	100 %	0 %	0 %	195978235

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