MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 chromosome

Total Repeats: 34771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_011134	GAA	2	6	1045582	1045587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978131
18004	NC_011134	A	6	6	1045615	1045620	100 %	0 %	0 %	0 %	195978131
18005	NC_011134	TGA	2	6	1045644	1045649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978131
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18008	NC_011134	AT	3	6	1046132	1046137	50 %	50 %	0 %	0 %	195978132
18009	NC_011134	TAA	2	6	1046180	1046185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978132
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18011	NC_011134	AAT	2	6	1046343	1046348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978132
18012	NC_011134	TTA	2	6	1046373	1046378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978132
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18032	NC_011134	GGCCTG	2	12	1047419	1047430	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	195978133
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18062	NC_011134	GTGAT	2	10	1048492	1048501	20 %	40 %	40 %	0 %	195978133
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18231	NC_011134	AT	3	6	1057322	1057327	50 %	50 %	0 %	0 %	195978143
18232	NC_011134	CCT	2	6	1057392	1057397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978143
18233	NC_011134	GCT	2	6	1057408	1057413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978143
18234	NC_011134	T	6	6	1057512	1057517	0 %	100 %	0 %	0 %	195978143
18235	NC_011134	TTA	2	6	1057539	1057544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978143
18236	NC_011134	TAA	3	9	1057607	1057615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978143
18237	NC_011134	TCTT	2	8	1057645	1057652	0 %	75 %	0 %	25 %	195978143
18238	NC_011134	CATT	2	8	1057685	1057692	25 %	50 %	0 %	25 %	195978144
18239	NC_011134	AAGGTA	2	12	1057780	1057791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	195978144
18240	NC_011134	GA	3	6	1057853	1057858	50 %	0 %	50 %	0 %	195978144
18241	NC_011134	AAT	2	6	1057878	1057883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978144
18242	NC_011134	CAC	2	6	1057902	1057907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978144
18243	NC_011134	GCCA	2	8	1057938	1057945	25 %	0 %	25 %	50 %	195978144
18244	NC_011134	T	6	6	1057954	1057959	0 %	100 %	0 %	0 %	195978144
18245	NC_011134	TGA	2	6	1058051	1058056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978144
18246	NC_011134	CTTG	2	8	1058066	1058073	0 %	50 %	25 %	25 %	195978144
18247	NC_011134	ATA	2	6	1058209	1058214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978144
18248	NC_011134	TCCT	2	8	1058256	1058263	0 %	50 %	0 %	50 %	195978144
18249	NC_011134	TGT	2	6	1058343	1058348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978144
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18251	NC_011134	TCT	2	6	1058374	1058379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978144
18252	NC_011134	T	6	6	1058379	1058384	0 %	100 %	0 %	0 %	195978144
18253	NC_011134	CAT	2	6	1058414	1058419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978144
18254	NC_011134	TAG	2	6	1058427	1058432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978144
18255	NC_011134	GCA	2	6	1058455	1058460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978144
18256	NC_011134	TTG	2	6	1058543	1058548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	195978144
18257	NC_011134	CAC	2	6	1058597	1058602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	195978144
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18259	NC_011134	TCT	2	6	1058707	1058712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978144
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18261	NC_011134	GCG	2	6	1058745	1058750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	195978144
18262	NC_011134	TCC	2	6	1058776	1058781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978144
18263	NC_011134	TGA	2	6	1058792	1058797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978144
18264	NC_011134	ATA	2	6	1058983	1058988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978144
18265	NC_011134	TG	3	6	1059062	1059067	0 %	50 %	50 %	0 %	195978144
18266	NC_011134	CCTTGT	2	12	1059080	1059091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	195978144
18267	NC_011134	AAT	2	6	1059144	1059149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978144
18268	NC_011134	TTA	2	6	1059388	1059393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978144
18269	NC_011134	GAC	2	6	1059414	1059419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978144
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18271	NC_011134	TTA	2	6	1059775	1059780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978144
18272	NC_011134	GCA	2	6	1059841	1059846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978144
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18280	NC_011134	TTGG	2	8	1060412	1060419	0 %	50 %	50 %	0 %	195978145
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18314	NC_011134	ATTC	2	8	1062221	1062228	25 %	50 %	0 %	25 %	195978146
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18318	NC_011134	CTG	2	6	1062503	1062508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978146
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18320	NC_011134	AATT	2	8	1062627	1062634	50 %	50 %	0 %	0 %	195978146
18321	NC_011134	CAA	2	6	1062665	1062670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978146
18322	NC_011134	ACA	2	6	1062856	1062861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978146
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18324	NC_011134	ATA	2	6	1063254	1063259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978147
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18329	NC_011134	AGT	2	6	1063335	1063340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978147
18330	NC_011134	GCTAAA	2	12	1063492	1063503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	195978147
18331	NC_011134	GCT	2	6	1063575	1063580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978147
18332	NC_011134	TCC	2	6	1063608	1063613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978147
18333	NC_011134	TA	3	6	1063625	1063630	50 %	50 %	0 %	0 %	195978147
18334	NC_011134	TTGTA	2	10	1063699	1063708	20 %	60 %	20 %	0 %	195978147
18335	NC_011134	A	6	6	1063754	1063759	100 %	0 %	0 %	0 %	195978147
18336	NC_011134	T	6	6	1063828	1063833	0 %	100 %	0 %	0 %	195978148
18337	NC_011134	AAG	2	6	1063911	1063916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	195978148
18338	NC_011134	GACAGC	2	12	1063930	1063941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978148
18339	NC_011134	T	6	6	1063957	1063962	0 %	100 %	0 %	0 %	195978148
18340	NC_011134	AAT	2	6	1064062	1064067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978148
18341	NC_011134	TCT	3	9	1064101	1064109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978148
18342	NC_011134	TTGA	2	8	1064138	1064145	25 %	50 %	25 %	0 %	195978148
18343	NC_011134	T	6	6	1064214	1064219	0 %	100 %	0 %	0 %	195978148
18344	NC_011134	AGC	2	6	1064245	1064250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978148
18345	NC_011134	AGT	2	6	1064306	1064311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978148
18346	NC_011134	TCA	2	6	1064344	1064349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978148
18347	NC_011134	ATT	2	6	1064373	1064378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	195978148
18348	NC_011134	TTC	2	6	1064532	1064537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978148
18349	NC_011134	A	7	7	1064595	1064601	100 %	0 %	0 %	0 %	195978148
18350	NC_011134	A	6	6	1064642	1064647	100 %	0 %	0 %	0 %	195978148
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18464	NC_011134	ATG	2	6	1070051	1070056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	195978157
18465	NC_011134	AGC	2	6	1070097	1070102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978157
18466	NC_011134	AGC	2	6	1070104	1070109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978157
18467	NC_011134	CTA	2	6	1070123	1070128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978157
18468	NC_011134	GAC	2	6	1070159	1070164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978157
18469	NC_011134	TTTG	2	8	1070227	1070234	0 %	75 %	25 %	0 %	195978157
18470	NC_011134	GCTTG	2	10	1070262	1070271	0 %	40 %	40 %	20 %	195978157
18471	NC_011134	AACC	2	8	1070380	1070387	50 %	0 %	0 %	50 %	195978157
18472	NC_011134	ATCAT	2	10	1070391	1070400	40 %	40 %	0 %	20 %	195978157
18473	NC_011134	T	7	7	1070424	1070430	0 %	100 %	0 %	0 %	195978157
18474	NC_011134	GAAA	2	8	1070431	1070438	75 %	0 %	25 %	0 %	195978157
18475	NC_011134	CTG	2	6	1070523	1070528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978157
18476	NC_011134	CAA	2	6	1070569	1070574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978157
18477	NC_011134	CAG	2	6	1070609	1070614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978157
18478	NC_011134	A	6	6	1070622	1070627	100 %	0 %	0 %	0 %	195978157
18479	NC_011134	CAA	2	6	1070656	1070661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	195978157
18480	NC_011134	GA	3	6	1070690	1070695	50 %	0 %	50 %	0 %	195978157
18481	NC_011134	ATC	2	6	1070721	1070726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978157
18482	NC_011134	CTT	2	6	1070729	1070734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978157
18483	NC_011134	CTATC	2	10	1070749	1070758	20 %	40 %	0 %	40 %	195978157
18484	NC_011134	TGCT	2	8	1071396	1071403	0 %	50 %	25 %	25 %	195978158
18485	NC_011134	AAT	2	6	1071405	1071410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	195978158
18486	NC_011134	ATCA	2	8	1071411	1071418	50 %	25 %	0 %	25 %	195978158
18487	NC_011134	TCA	2	6	1071451	1071456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978158
18488	NC_011134	TCT	2	6	1071472	1071477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978158
18489	NC_011134	AGC	2	6	1071484	1071489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978158
18490	NC_011134	CCT	2	6	1071490	1071495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978158
18491	NC_011134	CTG	2	6	1071542	1071547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978158
18492	NC_011134	ATC	2	6	1071595	1071600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978158
18493	NC_011134	CTG	2	6	1071629	1071634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	195978158
18494	NC_011134	TCA	2	6	1071719	1071724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978158
18495	NC_011134	CTC	2	6	1071807	1071812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	195978158
18496	NC_011134	TCA	2	6	1071821	1071826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	195978158
18497	NC_011134	ACG	2	6	1072061	1072066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	195978159
18498	NC_011134	CT	3	6	1072079	1072084	0 %	50 %	0 %	50 %	195978159
18499	NC_011134	TTGG	2	8	1072155	1072162	0 %	50 %	50 %	0 %	195978159
18500	NC_011134	TCT	2	6	1072171	1072176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	195978159

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