MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 chromosome

Total Repeats: 86402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011094	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
2	NC_011094	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	194737774
3	NC_011094	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194737774
4	NC_011094	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	194737774
5	NC_011094	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
6	NC_011094	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	194737774
7	NC_011094	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
8	NC_011094	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
9	NC_011094	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	194737774
10	NC_011094	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	194737774
11	NC_011094	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
12	NC_011094	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
13	NC_011094	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194737774
14	NC_011094	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
15	NC_011094	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
16	NC_011094	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
17	NC_011094	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
18	NC_011094	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	194737774
19	NC_011094	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194737774
20	NC_011094	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194737774
21	NC_011094	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194737774
22	NC_011094	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
23	NC_011094	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
24	NC_011094	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194737774
25	NC_011094	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194737774
26	NC_011094	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	194737774
27	NC_011094	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	194737774
28	NC_011094	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
29	NC_011094	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194737774
30	NC_011094	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194737774
31	NC_011094	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194737774
32	NC_011094	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194737774
33	NC_011094	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194737774
34	NC_011094	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194737774
35	NC_011094	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194737774
36	NC_011094	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
37	NC_011094	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
38	NC_011094	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194737774
39	NC_011094	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
40	NC_011094	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194737774
41	NC_011094	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194737774
42	NC_011094	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
43	NC_011094	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194737774
44	NC_011094	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
45	NC_011094	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
46	NC_011094	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194737774
47	NC_011094	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	194737774
48	NC_011094	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	194737774
49	NC_011094	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	194737774
50	NC_011094	CGA	2	6	2349	2354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194737774
51	NC_011094	ACC	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194737774
52	NC_011094	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194737774
53	NC_011094	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194737774
54	NC_011094	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	194737774
55	NC_011094	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194737774
56	NC_011094	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194737774
57	NC_011094	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194737774
58	NC_011094	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737774
59	NC_011094	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194734054
60	NC_011094	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194734054
61	NC_011094	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	194734054
62	NC_011094	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194734054
63	NC_011094	TGC	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194734054
64	NC_011094	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	194734054
65	NC_011094	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194734054
66	NC_011094	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194734054
67	NC_011094	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194734054
68	NC_011094	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194734054
69	NC_011094	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194734054
70	NC_011094	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194734054
71	NC_011094	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	194734054
72	NC_011094	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194734054
73	NC_011094	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194734054
74	NC_011094	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	194734054
75	NC_011094	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	194734054
76	NC_011094	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194734054
77	NC_011094	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194734054
78	NC_011094	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736906
79	NC_011094	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	194736906
80	NC_011094	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194736906
81	NC_011094	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736906
82	NC_011094	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	194736906
83	NC_011094	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194736906
84	NC_011094	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194736906
85	NC_011094	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	194736906
86	NC_011094	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	194736906
87	NC_011094	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194736906
88	NC_011094	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194736906
89	NC_011094	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194736906
90	NC_011094	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194736906
91	NC_011094	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194736906
92	NC_011094	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194736906
93	NC_011094	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194736906
94	NC_011094	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	194736906
95	NC_011094	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	194736906
96	NC_011094	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194736906
97	NC_011094	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194736906
98	NC_011094	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	194736906
99	NC_011094	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194736906
100	NC_011094	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736906
101	NC_011094	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194736906
102	NC_011094	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	194736906
103	NC_011094	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194736906
104	NC_011094	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194736906
105	NC_011094	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	194736906
106	NC_011094	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194736906
107	NC_011094	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194736906
108	NC_011094	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194738139
109	NC_011094	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194738139
110	NC_011094	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194738139
111	NC_011094	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	194738139
112	NC_011094	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	194738139
113	NC_011094	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194738139
114	NC_011094	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194738139
115	NC_011094	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194738139
116	NC_011094	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194738139
117	NC_011094	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	194738139
118	NC_011094	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	194738139
119	NC_011094	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194738139
120	NC_011094	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194738139
121	NC_011094	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194738139
122	NC_011094	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194738139
123	NC_011094	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194738139
124	NC_011094	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194738139
125	NC_011094	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	194735924
126	NC_011094	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194735924
127	NC_011094	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194735924
128	NC_011094	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	194735924
129	NC_011094	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194735924
130	NC_011094	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194735924
131	NC_011094	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194735924
132	NC_011094	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194735924
133	NC_011094	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194735924
134	NC_011094	TGAG	2	8	6624	6631	25 %	25 %	50 %	0 %	194735924
135	NC_011094	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	194735924
136	NC_011094	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	194735924
137	NC_011094	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194735924
138	NC_011094	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	194735924
139	NC_011094	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194735924
140	NC_011094	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	194735924
141	NC_011094	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194735924
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143	NC_011094	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194735924
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145	NC_011094	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	194735924
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149	NC_011094	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194735924
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152	NC_011094	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736669
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154	NC_011094	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	194736669
155	NC_011094	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736669
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158	NC_011094	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194736669
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160	NC_011094	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194736669
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162	NC_011094	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	194736669
163	NC_011094	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194736669
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166	NC_011094	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194736669
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385	NC_011094	CCTGA	2	10	19915	19924	20 %	20 %	20 %	40 %	194737593
386	NC_011094	CGG	2	6	19935	19940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194737593
387	NC_011094	GACCAT	2	12	20057	20068	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194738313
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