MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011080	ACG	2	6	1109656	1109661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444212
21002	NC_011080	TCC	2	6	1109704	1109709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444212
21003	NC_011080	AATA	2	8	1109812	1109819	75 %	25 %	0 %	0 %	194444212
21004	NC_011080	TCGG	2	8	1109986	1109993	0 %	25 %	50 %	25 %	194444212
21005	NC_011080	GC	3	6	1110029	1110034	0 %	0 %	50 %	50 %	194444212
21006	NC_011080	CGT	2	6	1110065	1110070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444212
21007	NC_011080	GGCG	2	8	1110110	1110117	0 %	0 %	75 %	25 %	194444212
21008	NC_011080	TAA	2	6	1110119	1110124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444212
21009	NC_011080	AACTG	2	10	1110406	1110415	40 %	20 %	20 %	20 %	194444574
21010	NC_011080	GTT	2	6	1110443	1110448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444574
21011	NC_011080	GCC	2	6	1110507	1110512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444574
21012	NC_011080	TAT	2	6	1110523	1110528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444574
21013	NC_011080	CGATCT	2	12	1110559	1110570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194444574
21014	NC_011080	GTG	2	6	1110819	1110824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444574
21015	NC_011080	GGC	2	6	1110886	1110891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444574
21016	NC_011080	GCT	2	6	1110931	1110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21017	NC_011080	TG	3	6	1110945	1110950	0 %	50 %	50 %	0 %	194444574
21018	NC_011080	TTGA	2	8	1110965	1110972	25 %	50 %	25 %	0 %	194444574
21019	NC_011080	CG	3	6	1110995	1111000	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21020	NC_011080	GCA	2	6	1111042	1111047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21021	NC_011080	GC	3	6	1111166	1111171	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21022	NC_011080	CTG	2	6	1111337	1111342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21023	NC_011080	GGC	2	6	1111367	1111372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444574
21024	NC_011080	CTG	2	6	1111406	1111411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21025	NC_011080	CGG	2	6	1111503	1111508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444574
21026	NC_011080	GC	3	6	1111583	1111588	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21027	NC_011080	ATG	2	6	1111617	1111622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444574
21028	NC_011080	GCC	2	6	1111690	1111695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444574
21029	NC_011080	ATT	2	6	1111739	1111744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444574
21030	NC_011080	CCG	2	6	1111772	1111777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444574
21031	NC_011080	A	6	6	1111816	1111821	100 %	0 %	0 %	0 %	194444574
21032	NC_011080	GC	3	6	1111877	1111882	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21033	NC_011080	GCAAAG	2	12	1111965	1111976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194444574
21034	NC_011080	GCG	2	6	1112031	1112036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444574
21035	NC_011080	CG	3	6	1112035	1112040	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21036	NC_011080	CAC	2	6	1112044	1112049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444574
21037	NC_011080	CG	3	6	1112120	1112125	0 %	0 %	50 %	50 %	194444574
21038	NC_011080	GCTG	2	8	1112154	1112161	0 %	25 %	50 %	25 %	194444574
21039	NC_011080	CCG	2	6	1112201	1112206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444574
21040	NC_011080	CTG	2	6	1112288	1112293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21041	NC_011080	GGC	2	6	1112300	1112305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444574
21042	NC_011080	CAT	2	6	1112308	1112313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444574
21043	NC_011080	ATA	2	6	1112322	1112327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444574
21044	NC_011080	GCTG	2	8	1112356	1112363	0 %	25 %	50 %	25 %	194444574
21045	NC_011080	A	6	6	1112394	1112399	100 %	0 %	0 %	0 %	194444574
21046	NC_011080	CTG	2	6	1112440	1112445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444574
21047	NC_011080	CGC	2	6	1112455	1112460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444574
21048	NC_011080	CGC	2	6	1112523	1112528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445231
21049	NC_011080	AACG	2	8	1112561	1112568	50 %	0 %	25 %	25 %	194445231
21050	NC_011080	GTCT	2	8	1112570	1112577	0 %	50 %	25 %	25 %	194445231
21051	NC_011080	TGA	2	6	1112610	1112615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445231
21052	NC_011080	TAT	2	6	1112653	1112658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445231
21053	NC_011080	TCG	2	6	1112676	1112681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21054	NC_011080	CG	3	6	1112680	1112685	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21055	NC_011080	GAA	2	6	1112750	1112755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445231
21056	NC_011080	TGA	2	6	1112799	1112804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445231
21057	NC_011080	GC	3	6	1112837	1112842	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21058	NC_011080	ATC	2	6	1112859	1112864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445231
21059	NC_011080	CGC	2	6	1112929	1112934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445231
21060	NC_011080	GTC	2	6	1112938	1112943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21061	NC_011080	CGG	2	6	1112950	1112955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445231
21062	NC_011080	CG	3	6	1113000	1113005	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21063	NC_011080	CTGG	2	8	1113055	1113062	0 %	25 %	50 %	25 %	194445231
21064	NC_011080	ATT	2	6	1113092	1113097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445231
21065	NC_011080	TC	3	6	1113102	1113107	0 %	50 %	0 %	50 %	194445231
21066	NC_011080	TCGT	2	8	1113112	1113119	0 %	50 %	25 %	25 %	194445231
21067	NC_011080	TCGATC	2	12	1113147	1113158	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	194445231
21068	NC_011080	CTG	2	6	1113200	1113205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21069	NC_011080	AGA	2	6	1113211	1113216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445231
21070	NC_011080	AGA	2	6	1113229	1113234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445231
21071	NC_011080	GAA	2	6	1113272	1113277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445231
21072	NC_011080	GC	3	6	1113302	1113307	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21073	NC_011080	CGT	2	6	1113350	1113355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21074	NC_011080	AGCG	2	8	1113362	1113369	25 %	0 %	50 %	25 %	194445231
21075	NC_011080	A	6	6	1113666	1113671	100 %	0 %	0 %	0 %	194445231
21076	NC_011080	GCAA	2	8	1113696	1113703	50 %	0 %	25 %	25 %	194445231
21077	NC_011080	CG	3	6	1113791	1113796	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21078	NC_011080	CGG	2	6	1113802	1113807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445231
21079	NC_011080	CTG	3	9	1113821	1113829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21080	NC_011080	AACG	2	8	1113877	1113884	50 %	0 %	25 %	25 %	194445231
21081	NC_011080	AGA	2	6	1113913	1113918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445231
21082	NC_011080	TAC	2	6	1113945	1113950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445231
21083	NC_011080	ATA	2	6	1113978	1113983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445231
21084	NC_011080	GCG	2	6	1114011	1114016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445231
21085	NC_011080	CGG	2	6	1114036	1114041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445231
21086	NC_011080	ATG	2	6	1114047	1114052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445231
21087	NC_011080	CG	4	8	1114053	1114060	0 %	0 %	50 %	50 %	194445231
21088	NC_011080	AGC	2	6	1114068	1114073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21089	NC_011080	CGA	2	6	1114080	1114085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445231
21090	NC_011080	A	8	8	1114100	1114107	100 %	0 %	0 %	0 %	194445231
21091	NC_011080	GAAGC	2	10	1114217	1114226	40 %	0 %	40 %	20 %	194445231
21092	NC_011080	T	6	6	1114262	1114267	0 %	100 %	0 %	0 %	194445231
21093	NC_011080	TG	3	6	1114400	1114405	0 %	50 %	50 %	0 %	194446385
21094	NC_011080	TGC	2	6	1114416	1114421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446385
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21096	NC_011080	AGC	2	6	1114488	1114493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446385
21097	NC_011080	GCG	2	6	1114505	1114510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446385
21098	NC_011080	TGC	2	6	1114583	1114588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446385
21099	NC_011080	TAT	2	6	1114709	1114714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446385
21100	NC_011080	A	8	8	1114791	1114798	100 %	0 %	0 %	0 %	194446385
21101	NC_011080	TCC	2	6	1114817	1114822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446385
21102	NC_011080	ATCGGC	2	12	1114900	1114911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194446385
21103	NC_011080	GT	3	6	1114965	1114970	0 %	50 %	50 %	0 %	194446385
21104	NC_011080	CGC	2	6	1114975	1114980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446385
21105	NC_011080	GAT	2	6	1114990	1114995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446385
21106	NC_011080	CTG	2	6	1115073	1115078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446385
21107	NC_011080	CCTG	2	8	1115088	1115095	0 %	25 %	25 %	50 %	194446385
21108	NC_011080	TTA	2	6	1115173	1115178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446385
21109	NC_011080	CTGG	2	8	1115266	1115273	0 %	25 %	50 %	25 %	194446385
21110	NC_011080	GGC	2	6	1115310	1115315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446385
21111	NC_011080	TAT	2	6	1115334	1115339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446385
21112	NC_011080	TTG	2	6	1115376	1115381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446385
21113	NC_011080	AGT	2	6	1115436	1115441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446385
21114	NC_011080	TGAT	2	8	1115465	1115472	25 %	50 %	25 %	0 %	194446385
21115	NC_011080	CT	3	6	1115491	1115496	0 %	50 %	0 %	50 %	194446385
21116	NC_011080	GTC	2	6	1115563	1115568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446385
21117	NC_011080	GAG	2	6	1115641	1115646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446385
21118	NC_011080	A	6	6	1115666	1115671	100 %	0 %	0 %	0 %	194442433
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21124	NC_011080	GCT	2	6	1116019	1116024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442433
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21224	NC_011080	GCCGGT	2	12	1121858	1121869	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194443312
21225	NC_011080	CTA	2	6	1121877	1121882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443312
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21230	NC_011080	TAG	2	6	1122078	1122083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443312
21231	NC_011080	GCC	2	6	1122088	1122093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443312
21232	NC_011080	CCATA	2	10	1122121	1122130	40 %	20 %	0 %	40 %	194443312
21233	NC_011080	TGT	2	6	1122225	1122230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443312
21234	NC_011080	ACC	2	6	1122301	1122306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443312
21235	NC_011080	CAT	2	6	1122345	1122350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443312
21236	NC_011080	CCAG	2	8	1122449	1122456	25 %	0 %	25 %	50 %	194443312
21237	NC_011080	T	6	6	1122489	1122494	0 %	100 %	0 %	0 %	194443312
21238	NC_011080	ATC	2	6	1122505	1122510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443312
21239	NC_011080	TACC	2	8	1122941	1122948	25 %	25 %	0 %	50 %	194445943
21240	NC_011080	GCT	2	6	1122952	1122957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445943
21241	NC_011080	TTC	3	9	1122975	1122983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445943
21242	NC_011080	TTC	2	6	1122990	1122995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445943
21243	NC_011080	CCAA	2	8	1123002	1123009	50 %	0 %	0 %	50 %	194445943
21244	NC_011080	ATC	2	6	1123045	1123050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445943
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21247	NC_011080	CAT	2	6	1123221	1123226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445943
21248	NC_011080	GC	3	6	1123290	1123295	0 %	0 %	50 %	50 %	194445943
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21252	NC_011080	TGG	2	6	1123696	1123701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442968
21253	NC_011080	GAA	2	6	1123731	1123736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442968
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21255	NC_011080	TCC	2	6	1123760	1123765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194442968
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21336	NC_011080	A	6	6	1127767	1127772	100 %	0 %	0 %	0 %	194446484
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21341	NC_011080	CGG	2	6	1128003	1128008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446484
21342	NC_011080	GCAG	2	8	1128012	1128019	25 %	0 %	50 %	25 %	194446484
21343	NC_011080	GC	3	6	1128032	1128037	0 %	0 %	50 %	50 %	194446484
21344	NC_011080	GCT	2	6	1128087	1128092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446484
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21346	NC_011080	GCG	2	6	1128244	1128249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446484
21347	NC_011080	ACG	2	6	1128352	1128357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446484
21348	NC_011080	TCA	2	6	1128363	1128368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446484
21349	NC_011080	GGCGAG	2	12	1128376	1128387	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194446484
21350	NC_011080	CAG	2	6	1128454	1128459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446484
21351	NC_011080	A	6	6	1128475	1128480	100 %	0 %	0 %	0 %	194446484
21352	NC_011080	A	6	6	1128508	1128513	100 %	0 %	0 %	0 %	194446484
21353	NC_011080	GAAG	2	8	1128576	1128583	50 %	0 %	50 %	0 %	194446484
21354	NC_011080	GC	3	6	1128604	1128609	0 %	0 %	50 %	50 %	194446484
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21357	NC_011080	ACG	2	6	1128746	1128751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446484
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21361	NC_011080	CG	5	10	1128857	1128866	0 %	0 %	50 %	50 %	194446484
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21364	NC_011080	GAT	2	6	1129074	1129079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442365
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21367	NC_011080	CTG	2	6	1129236	1129241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442365
21368	NC_011080	CGC	2	6	1129244	1129249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442365
21369	NC_011080	GC	3	6	1129291	1129296	0 %	0 %	50 %	50 %	194442365
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21375	NC_011080	GCG	2	6	1129656	1129661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444628
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21379	NC_011080	GCG	2	6	1129968	1129973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444628
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21463	NC_011080	TCA	2	6	1134218	1134223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446649
21464	NC_011080	AAG	2	6	1134233	1134238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446649
21465	NC_011080	GCTT	2	8	1134367	1134374	0 %	50 %	25 %	25 %	194445878
21466	NC_011080	TTC	2	6	1134423	1134428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445878
21467	NC_011080	AG	3	6	1134534	1134539	50 %	0 %	50 %	0 %	194445878
21468	NC_011080	GGC	2	6	1134555	1134560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445878
21469	NC_011080	CGT	2	6	1134591	1134596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445878
21470	NC_011080	TGT	2	6	1134787	1134792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444830
21471	NC_011080	CCG	2	6	1134840	1134845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444830
21472	NC_011080	ATG	2	6	1134849	1134854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444830
21473	NC_011080	GCAG	2	8	1134924	1134931	25 %	0 %	50 %	25 %	194444830
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21475	NC_011080	ACG	3	9	1134966	1134974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444830
21476	NC_011080	GGT	2	6	1135019	1135024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444830
21477	NC_011080	AGC	2	6	1135039	1135044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444830
21478	NC_011080	ACC	2	6	1135064	1135069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444830
21479	NC_011080	CTG	2	6	1135099	1135104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444830
21480	NC_011080	ACCG	2	8	1135175	1135182	25 %	0 %	25 %	50 %	194444830
21481	NC_011080	CATA	2	8	1135219	1135226	50 %	25 %	0 %	25 %	194444830
21482	NC_011080	GCA	2	6	1135258	1135263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444830
21483	NC_011080	GAT	2	6	1135377	1135382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444830
21484	NC_011080	CGTTTA	2	12	1135490	1135501	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194445547
21485	NC_011080	CGT	2	6	1135530	1135535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445547
21486	NC_011080	GGC	2	6	1135576	1135581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445547
21487	NC_011080	A	6	6	1135605	1135610	100 %	0 %	0 %	0 %	194445547
21488	NC_011080	CTA	2	6	1136099	1136104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444962
21489	NC_011080	GCG	2	6	1136180	1136185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444962
21490	NC_011080	ATT	2	6	1136206	1136211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444962
21491	NC_011080	GTT	2	6	1136242	1136247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444962
21492	NC_011080	TCTG	2	8	1136285	1136292	0 %	50 %	25 %	25 %	194444962
21493	NC_011080	T	7	7	1136341	1136347	0 %	100 %	0 %	0 %	194444962
21494	NC_011080	GGC	2	6	1136425	1136430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444962
21495	NC_011080	GA	4	8	1136530	1136537	50 %	0 %	50 %	0 %	194444962
21496	NC_011080	TGC	2	6	1136610	1136615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444962
21497	NC_011080	ACG	2	6	1136653	1136658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444962
21498	NC_011080	TCT	2	6	1136678	1136683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444962
21499	NC_011080	TTA	2	6	1136688	1136693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444962
21500	NC_011080	GCAA	2	8	1136720	1136727	50 %	0 %	25 %	25 %	194444962

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