MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_011080	CGTG	2	8	1025796	1025803	0 %	25 %	50 %	25 %	194446322
19502	NC_011080	CTT	2	6	1025809	1025814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446322
19503	NC_011080	CGC	2	6	1025815	1025820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446322
19504	NC_011080	CCT	2	6	1025918	1025923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446322
19505	NC_011080	GGA	2	6	1025925	1025930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446322
19506	NC_011080	CGA	2	6	1026015	1026020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446322
19507	NC_011080	CTG	3	9	1026056	1026064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446322
19508	NC_011080	GC	3	6	1026130	1026135	0 %	0 %	50 %	50 %	194446322
19509	NC_011080	GAA	2	6	1026297	1026302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444412
19510	NC_011080	CCCG	2	8	1026322	1026329	0 %	0 %	25 %	75 %	194444412
19511	NC_011080	TCGT	2	8	1026337	1026344	0 %	50 %	25 %	25 %	194444412
19512	NC_011080	GTT	3	9	1026348	1026356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444412
19513	NC_011080	GTA	2	6	1026372	1026377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444412
19514	NC_011080	AGA	2	6	1026494	1026499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444412
19515	NC_011080	CT	3	6	1026519	1026524	0 %	50 %	0 %	50 %	194444412
19516	NC_011080	CG	3	6	1026651	1026656	0 %	0 %	50 %	50 %	194444412
19517	NC_011080	AAC	2	6	1026759	1026764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444412
19518	NC_011080	TCG	2	6	1026776	1026781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19519	NC_011080	GCT	2	6	1026821	1026826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19520	NC_011080	GCG	2	6	1026904	1026909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444412
19521	NC_011080	CTG	2	6	1026918	1026923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19522	NC_011080	CGA	2	6	1026983	1026988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19523	NC_011080	GCT	2	6	1027141	1027146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19524	NC_011080	GAA	2	6	1027158	1027163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444412
19525	NC_011080	TGGAC	2	10	1027195	1027204	20 %	20 %	40 %	20 %	194444412
19526	NC_011080	CAA	2	6	1027205	1027210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444412
19527	NC_011080	CGA	2	6	1027274	1027279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19528	NC_011080	CGT	3	9	1027284	1027292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19529	NC_011080	GCA	2	6	1027331	1027336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19530	NC_011080	CAA	2	6	1027352	1027357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444412
19531	NC_011080	CGG	2	6	1027421	1027426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444412
19532	NC_011080	GAA	2	6	1027476	1027481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444412
19533	NC_011080	A	6	6	1027497	1027502	100 %	0 %	0 %	0 %	194444412
19534	NC_011080	CGA	2	6	1027505	1027510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19535	NC_011080	GTT	2	6	1027521	1027526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444412
19536	NC_011080	GAACGT	2	12	1027542	1027553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194444412
19537	NC_011080	AGA	2	6	1027580	1027585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444412
19538	NC_011080	CAA	2	6	1027592	1027597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444412
19539	NC_011080	CGA	2	6	1027763	1027768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19540	NC_011080	CTGT	2	8	1027818	1027825	0 %	50 %	25 %	25 %	194444412
19541	NC_011080	AACA	2	8	1027872	1027879	75 %	0 %	0 %	25 %	194444412
19542	NC_011080	AAC	2	6	1027899	1027904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444412
19543	NC_011080	AGC	2	6	1027925	1027930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444412
19544	NC_011080	ATTG	2	8	1028113	1028120	25 %	50 %	25 %	0 %	194442716
19545	NC_011080	CG	3	6	1028264	1028269	0 %	0 %	50 %	50 %	194442716
19546	NC_011080	GGAA	2	8	1028314	1028321	50 %	0 %	50 %	0 %	194442716
19547	NC_011080	TTTGC	2	10	1028723	1028732	0 %	60 %	20 %	20 %	194445241
19548	NC_011080	GC	3	6	1028751	1028756	0 %	0 %	50 %	50 %	194445241
19549	NC_011080	GCC	2	6	1028799	1028804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445241
19550	NC_011080	AGGC	2	8	1028805	1028812	25 %	0 %	50 %	25 %	194445241
19551	NC_011080	CGC	2	6	1028837	1028842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445241
19552	NC_011080	AGG	2	6	1028848	1028853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445241
19553	NC_011080	GTC	2	6	1028859	1028864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19554	NC_011080	CTG	2	6	1028935	1028940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19555	NC_011080	GT	3	6	1028979	1028984	0 %	50 %	50 %	0 %	194445241
19556	NC_011080	CAG	2	6	1028991	1028996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19557	NC_011080	GCA	2	6	1029077	1029082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19558	NC_011080	GCTTC	2	10	1029156	1029165	0 %	40 %	20 %	40 %	194445241
19559	NC_011080	GCA	2	6	1029191	1029196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19560	NC_011080	AGG	2	6	1029241	1029246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445241
19561	NC_011080	TGC	2	6	1029314	1029319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19562	NC_011080	GGC	2	6	1029399	1029404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19563	NC_011080	CTGCG	2	10	1029451	1029460	0 %	20 %	40 %	40 %	194445241
19564	NC_011080	GGC	2	6	1029467	1029472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19565	NC_011080	GGA	2	6	1029486	1029491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445241
19566	NC_011080	GAC	2	6	1029505	1029510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19567	NC_011080	TGC	2	6	1029534	1029539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19568	NC_011080	ATT	2	6	1029552	1029557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445241
19569	NC_011080	GTTG	2	8	1029679	1029686	0 %	50 %	50 %	0 %	194445241
19570	NC_011080	CAGG	2	8	1029705	1029712	25 %	0 %	50 %	25 %	194445241
19571	NC_011080	T	6	6	1029864	1029869	0 %	100 %	0 %	0 %	194445241
19572	NC_011080	CG	3	6	1029900	1029905	0 %	0 %	50 %	50 %	194445241
19573	NC_011080	CGG	2	6	1030039	1030044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19574	NC_011080	TTG	2	6	1030062	1030067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445241
19575	NC_011080	GGC	2	6	1030084	1030089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19576	NC_011080	TTA	2	6	1030225	1030230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445241
19577	NC_011080	ATC	2	6	1030294	1030299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445241
19578	NC_011080	GGGC	2	8	1030301	1030308	0 %	0 %	75 %	25 %	194445241
19579	NC_011080	CAG	2	6	1030320	1030325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19580	NC_011080	TG	3	6	1030473	1030478	0 %	50 %	50 %	0 %	194445241
19581	NC_011080	A	6	6	1030543	1030548	100 %	0 %	0 %	0 %	194445241
19582	NC_011080	GCG	2	6	1030575	1030580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19583	NC_011080	CAT	2	6	1030599	1030604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445241
19584	NC_011080	GTA	2	6	1030606	1030611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445241
19585	NC_011080	CGT	3	9	1030615	1030623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19586	NC_011080	GCG	2	6	1030656	1030661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19587	NC_011080	GGC	2	6	1030690	1030695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445241
19588	NC_011080	CAG	2	6	1030728	1030733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19589	NC_011080	CCA	2	6	1030757	1030762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445241
19590	NC_011080	TGC	2	6	1030774	1030779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445241
19591	NC_011080	ATC	2	6	1030840	1030845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445241
19592	NC_011080	TC	3	6	1030931	1030936	0 %	50 %	0 %	50 %	194443714
19593	NC_011080	CCG	2	6	1030952	1030957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443714
19594	NC_011080	CAGC	2	8	1031026	1031033	25 %	0 %	25 %	50 %	194443714
19595	NC_011080	CTC	2	6	1031052	1031057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443714
19596	NC_011080	GAT	2	6	1031070	1031075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443714
19597	NC_011080	TGG	2	6	1031119	1031124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443714
19598	NC_011080	TGA	2	6	1031134	1031139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443714
19599	NC_011080	GGT	2	6	1031198	1031203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443714
19600	NC_011080	ATG	2	6	1031235	1031240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443714
19601	NC_011080	CTT	2	6	1031255	1031260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443714
19602	NC_011080	GCT	2	6	1031282	1031287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443714
19603	NC_011080	CTT	2	6	1031323	1031328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443714
19604	NC_011080	GC	3	6	1031335	1031340	0 %	0 %	50 %	50 %	194443714
19605	NC_011080	GTG	2	6	1031349	1031354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443714
19606	NC_011080	ATC	2	6	1031370	1031375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443714
19607	NC_011080	ATG	2	6	1031388	1031393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443714
19608	NC_011080	ATC	2	6	1031418	1031423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443714
19609	NC_011080	GTT	2	6	1031427	1031432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443714
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19611	NC_011080	CGCTGG	2	12	1031692	1031703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194443714
19612	NC_011080	TGC	2	6	1031717	1031722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443714
19613	NC_011080	GTG	2	6	1031769	1031774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443714
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19615	NC_011080	GGC	2	6	1031849	1031854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443714
19616	NC_011080	GTT	2	6	1031864	1031869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443714
19617	NC_011080	CG	3	6	1031922	1031927	0 %	0 %	50 %	50 %	194443714
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19620	NC_011080	TGA	2	6	1032098	1032103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443714
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