MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011080	CCCG	2	8	999263	999270	0 %	0 %	25 %	75 %	194445292
19002	NC_011080	TCC	2	6	999271	999276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445292
19003	NC_011080	AAC	2	6	999324	999329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445292
19004	NC_011080	GGC	2	6	999331	999336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445292
19005	NC_011080	GCC	3	9	999431	999439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19006	NC_011080	GCA	2	6	999476	999481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19007	NC_011080	CGG	2	6	999520	999525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445292
19008	NC_011080	CGC	2	6	999528	999533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19009	NC_011080	CCGAC	2	10	999593	999602	20 %	0 %	20 %	60 %	194445292
19010	NC_011080	AGA	2	6	999649	999654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445292
19011	NC_011080	GAA	2	6	999710	999715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445292
19012	NC_011080	ATGCA	2	10	999720	999729	40 %	20 %	20 %	20 %	194445292
19013	NC_011080	GCA	3	9	999763	999771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19014	NC_011080	AGA	2	6	999811	999816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445292
19015	NC_011080	CAG	2	6	999869	999874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19016	NC_011080	GC	3	6	999900	999905	0 %	0 %	50 %	50 %	194445292
19017	NC_011080	TGA	2	6	999955	999960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445292
19018	NC_011080	CAG	2	6	1000052	1000057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19019	NC_011080	GCA	2	6	1000060	1000065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19020	NC_011080	GCCGCA	2	12	1000075	1000086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445292
19021	NC_011080	CAG	2	6	1000091	1000096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19022	NC_011080	GCA	2	6	1000099	1000104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19023	NC_011080	GCCGCA	2	12	1000114	1000125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445292
19024	NC_011080	CAG	2	6	1000130	1000135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19025	NC_011080	CAG	2	6	1000169	1000174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19026	NC_011080	GCCGCA	2	12	1000192	1000203	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445292
19027	NC_011080	CAG	2	6	1000208	1000213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19028	NC_011080	GCCGCA	2	12	1000231	1000242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194445292
19029	NC_011080	CAG	2	6	1000247	1000252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19030	NC_011080	CAG	2	6	1000286	1000291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19031	NC_011080	GCA	2	6	1000294	1000299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19032	NC_011080	CAG	2	6	1000325	1000330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19033	NC_011080	GTC	2	6	1000395	1000400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19034	NC_011080	CGA	2	6	1000413	1000418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19035	NC_011080	CGC	2	6	1000419	1000424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19036	NC_011080	TCT	2	6	1000438	1000443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445292
19037	NC_011080	CGC	3	9	1000446	1000454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19038	NC_011080	GCG	2	6	1000613	1000618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445292
19039	NC_011080	GC	3	6	1000646	1000651	0 %	0 %	50 %	50 %	194445292
19040	NC_011080	CGC	2	6	1000791	1000796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19041	NC_011080	GTG	2	6	1000802	1000807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445292
19042	NC_011080	CTG	2	6	1000865	1000870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19043	NC_011080	GTCG	2	8	1000897	1000904	0 %	25 %	50 %	25 %	194445292
19044	NC_011080	CTG	2	6	1001018	1001023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19045	NC_011080	GTT	2	6	1001030	1001035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445292
19046	NC_011080	GCGT	2	8	1001118	1001125	0 %	25 %	50 %	25 %	194445292
19047	NC_011080	CTGG	2	8	1001129	1001136	0 %	25 %	50 %	25 %	194445292
19048	NC_011080	TGA	2	6	1001266	1001271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445292
19049	NC_011080	TGA	3	9	1001283	1001291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445292
19050	NC_011080	A	6	6	1001300	1001305	100 %	0 %	0 %	0 %	194445292
19051	NC_011080	CG	3	6	1001320	1001325	0 %	0 %	50 %	50 %	194445292
19052	NC_011080	GC	4	8	1001339	1001346	0 %	0 %	50 %	50 %	194445292
19053	NC_011080	CGTC	2	8	1001378	1001385	0 %	25 %	25 %	50 %	194445292
19054	NC_011080	TTAA	2	8	1001405	1001412	50 %	50 %	0 %	0 %	194445292
19055	NC_011080	CCA	2	6	1001538	1001543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445292
19056	NC_011080	GGT	2	6	1001593	1001598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445292
19057	NC_011080	GC	3	6	1001612	1001617	0 %	0 %	50 %	50 %	194445292
19058	NC_011080	GTC	2	6	1001619	1001624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445292
19059	NC_011080	AGCGAA	2	12	1001654	1001665	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194445292
19060	NC_011080	GGTGGC	2	12	1001666	1001677	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194445292
19061	NC_011080	CGG	2	6	1001686	1001691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445292
19062	NC_011080	GAA	2	6	1001693	1001698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445292
19063	NC_011080	GCG	2	6	1001798	1001803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445292
19064	NC_011080	TAT	2	6	1001806	1001811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445292
19065	NC_011080	CCG	2	6	1001879	1001884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445292
19066	NC_011080	A	7	7	1002042	1002048	100 %	0 %	0 %	0 %	194445389
19067	NC_011080	CAG	2	6	1002086	1002091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445389
19068	NC_011080	CGC	2	6	1002104	1002109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445389
19069	NC_011080	CT	3	6	1002113	1002118	0 %	50 %	0 %	50 %	194445389
19070	NC_011080	AGC	2	6	1002141	1002146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445389
19071	NC_011080	AGG	2	6	1002199	1002204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445389
19072	NC_011080	GCA	2	6	1002404	1002409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445389
19073	NC_011080	ATA	2	6	1002412	1002417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445389
19074	NC_011080	CCA	2	6	1002512	1002517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445389
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19076	NC_011080	GAC	2	6	1002633	1002638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445389
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19079	NC_011080	CAG	2	6	1002750	1002755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446297
19080	NC_011080	GCC	2	6	1002830	1002835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446297
19081	NC_011080	CGCT	2	8	1002853	1002860	0 %	25 %	25 %	50 %	194446297
19082	NC_011080	CCG	2	6	1002904	1002909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446297
19083	NC_011080	GC	3	6	1002947	1002952	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19084	NC_011080	TGT	2	6	1003117	1003122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446297
19085	NC_011080	CTG	2	6	1003140	1003145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446297
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19087	NC_011080	CG	3	6	1003280	1003285	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19088	NC_011080	GC	3	6	1003286	1003291	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19089	NC_011080	ATG	2	6	1003308	1003313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446297
19090	NC_011080	GGCGGA	2	12	1003322	1003333	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	194446297
19091	NC_011080	TTG	2	6	1003365	1003370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446297
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19093	NC_011080	ATA	2	6	1003405	1003410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446297
19094	NC_011080	GC	3	6	1003465	1003470	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19095	NC_011080	GCC	2	6	1003476	1003481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446297
19096	NC_011080	CG	4	8	1003582	1003589	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19097	NC_011080	GC	3	6	1003684	1003689	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19098	NC_011080	CG	4	8	1003736	1003743	0 %	0 %	50 %	50 %	194446297
19099	NC_011080	CCAA	2	8	1003785	1003792	50 %	0 %	0 %	50 %	194446297
19100	NC_011080	TGA	2	6	1003795	1003800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446297
19101	NC_011080	TGC	2	6	1003856	1003861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446297
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19103	NC_011080	TAT	2	6	1003902	1003907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446297
19104	NC_011080	CTGG	2	8	1003955	1003962	0 %	25 %	50 %	25 %	194446297
19105	NC_011080	CTG	2	6	1004277	1004282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445741
19106	NC_011080	GC	3	6	1004351	1004356	0 %	0 %	50 %	50 %	194445741
19107	NC_011080	CGT	2	6	1004367	1004372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445741
19108	NC_011080	TCGA	2	8	1004420	1004427	25 %	25 %	25 %	25 %	194445741
19109	NC_011080	GC	3	6	1004448	1004453	0 %	0 %	50 %	50 %	194445741
19110	NC_011080	GCG	2	6	1004511	1004516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445741
19111	NC_011080	CCTG	2	8	1004576	1004583	0 %	25 %	25 %	50 %	194445741
19112	NC_011080	GGTA	2	8	1004597	1004604	25 %	25 %	50 %	0 %	194445741
19113	NC_011080	GCC	2	6	1004715	1004720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445741
19114	NC_011080	TGA	2	6	1004752	1004757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445741
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19116	NC_011080	CAG	2	6	1004945	1004950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445741
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19233	NC_011080	GGC	2	6	1010933	1010938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444300
19234	NC_011080	GCG	2	6	1010967	1010972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444300
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19335	NC_011080	GAA	2	6	1016559	1016564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443827
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19347	NC_011080	TCA	2	6	1017275	1017280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443827
19348	NC_011080	GAT	2	6	1017321	1017326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443827
19349	NC_011080	ACGGCC	2	12	1017327	1017338	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194443827
19350	NC_011080	T	7	7	1017449	1017455	0 %	100 %	0 %	0 %	194443827
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19354	NC_011080	CGT	2	6	1017599	1017604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443827
19355	NC_011080	TGG	2	6	1017614	1017619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443827
19356	NC_011080	TGG	2	6	1017701	1017706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443827
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19463	NC_011080	ATT	2	6	1023674	1023679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446151
19464	NC_011080	ACC	2	6	1023762	1023767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446151
19465	NC_011080	CAA	2	6	1023773	1023778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446151
19466	NC_011080	CGC	2	6	1023862	1023867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446151
19467	NC_011080	GGC	2	6	1023881	1023886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446151
19468	NC_011080	GAT	2	6	1023983	1023988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446151
19469	NC_011080	CG	3	6	1024002	1024007	0 %	0 %	50 %	50 %	194446151
19470	NC_011080	GATATG	2	12	1024025	1024036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446151
19471	NC_011080	GCG	2	6	1024052	1024057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446151
19472	NC_011080	CCA	2	6	1024068	1024073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446151
19473	NC_011080	ACG	2	6	1024097	1024102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446151
19474	NC_011080	GAAA	2	8	1024129	1024136	75 %	0 %	25 %	0 %	194446151
19475	NC_011080	GAA	2	6	1024190	1024195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446151
19476	NC_011080	CGC	2	6	1024218	1024223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446151
19477	NC_011080	ACC	2	6	1024263	1024268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446151
19478	NC_011080	ATT	2	6	1024356	1024361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446151
19479	NC_011080	AAC	2	6	1024365	1024370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446151
19480	NC_011080	GCCT	2	8	1024387	1024394	0 %	25 %	25 %	50 %	194446151
19481	NC_011080	TAC	2	6	1024555	1024560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445715
19482	NC_011080	GCC	2	6	1024653	1024658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445715
19483	NC_011080	TAA	2	6	1024691	1024696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445715
19484	NC_011080	AAC	2	6	1024788	1024793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445715
19485	NC_011080	TGA	2	6	1024897	1024902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445715
19486	NC_011080	GGC	2	6	1024997	1025002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445715
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19488	NC_011080	GCG	2	6	1025026	1025031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445715
19489	NC_011080	CGCAG	2	10	1025033	1025042	20 %	0 %	40 %	40 %	194445715
19490	NC_011080	TCA	2	6	1025080	1025085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445715
19491	NC_011080	CGGATG	2	12	1025113	1025124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194445715
19492	NC_011080	CTG	2	6	1025139	1025144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445715
19493	NC_011080	A	6	6	1025145	1025150	100 %	0 %	0 %	0 %	194445715
19494	NC_011080	CG	3	6	1025256	1025261	0 %	0 %	50 %	50 %	194445715
19495	NC_011080	TAA	2	6	1025492	1025497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446322
19496	NC_011080	CTG	2	6	1025569	1025574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446322
19497	NC_011080	CTGGCG	2	12	1025599	1025610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194446322
19498	NC_011080	ACGG	2	8	1025692	1025699	25 %	0 %	50 %	25 %	194446322
19499	NC_011080	GCG	2	6	1025735	1025740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446322
19500	NC_011080	GCA	2	6	1025782	1025787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446322

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