MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011080	ATC	2	6	891782	891787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445323
17002	NC_011080	CCG	2	6	891804	891809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445323
17003	NC_011080	GT	3	6	891830	891835	0 %	50 %	50 %	0 %	194445323
17004	NC_011080	GGC	2	6	891847	891852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17005	NC_011080	GCA	2	6	891874	891879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17006	NC_011080	TGA	2	6	891898	891903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445323
17007	NC_011080	AAC	2	6	891917	891922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445323
17008	NC_011080	GAC	2	6	892013	892018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17009	NC_011080	GGC	2	6	892026	892031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17010	NC_011080	GTG	2	6	892133	892138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445323
17011	NC_011080	GGC	2	6	892159	892164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17012	NC_011080	CTG	2	6	892202	892207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17013	NC_011080	TCA	2	6	892225	892230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445323
17014	NC_011080	TCGC	2	8	892242	892249	0 %	25 %	25 %	50 %	194445323
17015	NC_011080	CCT	2	6	892281	892286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445323
17016	NC_011080	TGG	2	6	892320	892325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445323
17017	NC_011080	CGC	2	6	892359	892364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445323
17018	NC_011080	GAG	2	6	892400	892405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445323
17019	NC_011080	CGCAG	2	10	892456	892465	20 %	0 %	40 %	40 %	194445323
17020	NC_011080	TGA	2	6	892501	892506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445323
17021	NC_011080	A	6	6	892590	892595	100 %	0 %	0 %	0 %	194445323
17022	NC_011080	GGC	2	6	892683	892688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17023	NC_011080	GC	3	6	892713	892718	0 %	0 %	50 %	50 %	194445323
17024	NC_011080	ATT	2	6	892838	892843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445323
17025	NC_011080	GCTC	2	8	892863	892870	0 %	25 %	25 %	50 %	194445323
17026	NC_011080	AGC	2	6	893019	893024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17027	NC_011080	GGC	2	6	893038	893043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17028	NC_011080	A	6	6	893069	893074	100 %	0 %	0 %	0 %	194445323
17029	NC_011080	CAT	2	6	893075	893080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445323
17030	NC_011080	GCGG	2	8	893103	893110	0 %	0 %	75 %	25 %	194445323
17031	NC_011080	CTC	2	6	893153	893158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445323
17032	NC_011080	TGG	2	6	893190	893195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445323
17033	NC_011080	GCG	2	6	893220	893225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445323
17034	NC_011080	GCT	2	6	893284	893289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17035	NC_011080	TCCATA	2	12	893298	893309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445323
17036	NC_011080	CCG	2	6	893321	893326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445323
17037	NC_011080	TAATT	2	10	893419	893428	40 %	60 %	0 %	0 %	194445323
17038	NC_011080	CAG	2	6	893429	893434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17039	NC_011080	TTG	2	6	893495	893500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445323
17040	NC_011080	AGC	2	6	893553	893558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445323
17041	NC_011080	CGC	2	6	893603	893608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445323
17042	NC_011080	ATC	2	6	893665	893670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445812
17043	NC_011080	GATCTG	2	12	893704	893715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194445812
17044	NC_011080	CG	4	8	893721	893728	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17045	NC_011080	AGGCGA	2	12	893805	893816	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	194445812
17046	NC_011080	CCGC	2	8	893872	893879	0 %	0 %	25 %	75 %	194445812
17047	NC_011080	GC	3	6	893918	893923	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17048	NC_011080	CGC	2	6	893942	893947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445812
17049	NC_011080	CTG	2	6	893959	893964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445812
17050	NC_011080	GTA	2	6	893986	893991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445812
17051	NC_011080	GC	3	6	894125	894130	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17052	NC_011080	CGC	2	6	894137	894142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445812
17053	NC_011080	AAC	2	6	894149	894154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445812
17054	NC_011080	GCGT	2	8	894176	894183	0 %	25 %	50 %	25 %	194445812
17055	NC_011080	GC	3	6	894188	894193	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17056	NC_011080	T	6	6	894289	894294	0 %	100 %	0 %	0 %	194445812
17057	NC_011080	GGCG	2	8	894304	894311	0 %	0 %	75 %	25 %	194445812
17058	NC_011080	TGAT	2	8	894380	894387	25 %	50 %	25 %	0 %	194445812
17059	NC_011080	ACG	2	6	894431	894436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445812
17060	NC_011080	CTGC	2	8	894448	894455	0 %	25 %	25 %	50 %	194445812
17061	NC_011080	CG	3	6	894477	894482	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17062	NC_011080	TGT	2	6	894547	894552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445812
17063	NC_011080	GGC	2	6	894570	894575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445812
17064	NC_011080	AGA	2	6	894582	894587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445812
17065	NC_011080	GC	3	6	894595	894600	0 %	0 %	50 %	50 %	194445812
17066	NC_011080	A	7	7	894623	894629	100 %	0 %	0 %	0 %	194445812
17067	NC_011080	ATT	2	6	894779	894784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444503
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17069	NC_011080	CAG	2	6	894854	894859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444503
17070	NC_011080	CGG	2	6	894860	894865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444503
17071	NC_011080	GTG	2	6	894901	894906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444503
17072	NC_011080	AAAG	2	8	894988	894995	75 %	0 %	25 %	0 %	194444503
17073	NC_011080	CTG	2	6	895397	895402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443834
17074	NC_011080	CGC	2	6	895440	895445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443834
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17078	NC_011080	TTCA	2	8	895553	895560	25 %	50 %	0 %	25 %	194443834
17079	NC_011080	TCA	2	6	895566	895571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443834
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17081	NC_011080	CGCC	2	8	895905	895912	0 %	0 %	25 %	75 %	194442902
17082	NC_011080	CA	3	6	895993	895998	50 %	0 %	0 %	50 %	194442902
17083	NC_011080	CCG	2	6	896027	896032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442902
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17086	NC_011080	TGGC	2	8	896173	896180	0 %	25 %	50 %	25 %	194442902
17087	NC_011080	GC	3	6	896220	896225	0 %	0 %	50 %	50 %	194442902
17088	NC_011080	CGG	2	6	896289	896294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442902
17089	NC_011080	TCAT	2	8	896310	896317	25 %	50 %	0 %	25 %	194442902
17090	NC_011080	CCG	3	9	896367	896375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442902
17091	NC_011080	CG	3	6	896381	896386	0 %	0 %	50 %	50 %	194442902
17092	NC_011080	AGCG	2	8	896390	896397	25 %	0 %	50 %	25 %	194442902
17093	NC_011080	GAT	2	6	896426	896431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442902
17094	NC_011080	CAG	2	6	896453	896458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442902
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17096	NC_011080	A	7	7	896495	896501	100 %	0 %	0 %	0 %	194442902
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17099	NC_011080	CG	3	6	896559	896564	0 %	0 %	50 %	50 %	194442902
17100	NC_011080	CCG	2	6	896576	896581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442902
17101	NC_011080	GTG	2	6	896618	896623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442902
17102	NC_011080	A	6	6	896624	896629	100 %	0 %	0 %	0 %	194442902
17103	NC_011080	AAAGC	2	10	896647	896656	60 %	0 %	20 %	20 %	194442902
17104	NC_011080	GAC	2	6	896684	896689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442902
17105	NC_011080	TCG	2	6	896724	896729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443832
17106	NC_011080	CG	3	6	896733	896738	0 %	0 %	50 %	50 %	194443832
17107	NC_011080	GGC	2	6	896753	896758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443832
17108	NC_011080	GCC	2	6	896761	896766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443832
17109	NC_011080	GGCGGG	2	12	896767	896778	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	194443832
17110	NC_011080	GC	4	8	896802	896809	0 %	0 %	50 %	50 %	194443832
17111	NC_011080	GTG	2	6	896885	896890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443832
17112	NC_011080	GTAAA	2	10	896901	896910	60 %	20 %	20 %	0 %	194443832
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17116	NC_011080	ATA	2	6	897122	897127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443832
17117	NC_011080	TAA	2	6	897258	897263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443832
17118	NC_011080	CGCGCC	2	12	897310	897321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443832
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17120	NC_011080	CAG	2	6	897418	897423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443832
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17479	NC_011080	TG	3	6	918721	918726	0 %	50 %	50 %	0 %	194445661
17480	NC_011080	GCA	2	6	918729	918734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445661
17481	NC_011080	GATG	2	8	918776	918783	25 %	25 %	50 %	0 %	194445661
17482	NC_011080	GC	4	8	918797	918804	0 %	0 %	50 %	50 %	194445661
17483	NC_011080	GC	3	6	918827	918832	0 %	0 %	50 %	50 %	194445661
17484	NC_011080	CG	3	6	918859	918864	0 %	0 %	50 %	50 %	194445661
17485	NC_011080	GCGCGG	2	12	918883	918894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445661
17486	NC_011080	TAC	2	6	918945	918950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445661
17487	NC_011080	CATCG	2	10	919345	919354	20 %	20 %	20 %	40 %	194446486
17488	NC_011080	CAG	2	6	919396	919401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446486
17489	NC_011080	TACG	2	8	919626	919633	25 %	25 %	25 %	25 %	194446486
17490	NC_011080	CGT	3	9	919692	919700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446486
17491	NC_011080	CG	3	6	919706	919711	0 %	0 %	50 %	50 %	194446486
17492	NC_011080	GGAAAC	2	12	919825	919836	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194446486
17493	NC_011080	AAT	2	6	919981	919986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446486
17494	NC_011080	GCA	2	6	920001	920006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446486
17495	NC_011080	GGT	2	6	920169	920174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445569
17496	NC_011080	TTC	2	6	920245	920250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445569
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17498	NC_011080	GCG	2	6	920279	920284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445569
17499	NC_011080	GCC	2	6	920304	920309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445569
17500	NC_011080	CTC	2	6	920466	920471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445569

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