MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

< Previous12...2930313233343536373839...177178Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_011080	CTG	2	6	865964	865969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16502	NC_011080	GCC	2	6	865973	865978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
16503	NC_011080	CGC	2	6	866000	866005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
16504	NC_011080	GCA	2	6	866023	866028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16505	NC_011080	TGG	2	6	866070	866075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446519
16506	NC_011080	GC	3	6	866109	866114	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
16507	NC_011080	CAT	2	6	866147	866152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446519
16508	NC_011080	GTTG	2	8	866161	866168	0 %	50 %	50 %	0 %	194446519
16509	NC_011080	ATG	2	6	866169	866174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446519
16510	NC_011080	GAGGG	2	10	866201	866210	20 %	0 %	80 %	0 %	194446519
16511	NC_011080	CTG	2	6	866215	866220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16512	NC_011080	G	6	6	866226	866231	0 %	0 %	100 %	0 %	194446519
16513	NC_011080	TGG	2	6	866247	866252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446519
16514	NC_011080	GCG	2	6	866280	866285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
16515	NC_011080	TGCTC	2	10	866292	866301	0 %	40 %	20 %	40 %	194446519
16516	NC_011080	CTG	2	6	866321	866326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16517	NC_011080	GCC	2	6	866362	866367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
16518	NC_011080	CAGGCG	2	12	866372	866383	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194446519
16519	NC_011080	CGC	2	6	866443	866448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
16520	NC_011080	CAA	2	6	866576	866581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446519
16521	NC_011080	CGCC	2	8	866603	866610	0 %	0 %	25 %	75 %	194446519
16522	NC_011080	GC	3	6	866630	866635	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
16523	NC_011080	TTAACG	2	12	866642	866653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194446519
16524	NC_011080	CTG	2	6	866684	866689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16525	NC_011080	TGC	2	6	866694	866699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16526	NC_011080	GCG	3	9	866727	866735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443253
16527	NC_011080	GGCCG	2	10	866739	866748	0 %	0 %	60 %	40 %	194443253
16528	NC_011080	GCT	2	6	866798	866803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443253
16529	NC_011080	GCC	2	6	866818	866823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443253
16530	NC_011080	GT	3	6	866833	866838	0 %	50 %	50 %	0 %	194443253
16531	NC_011080	TGC	2	6	866926	866931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443253
16532	NC_011080	GGC	2	6	866951	866956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443253
16533	NC_011080	CCTGG	2	10	867014	867023	0 %	20 %	40 %	40 %	194443253
16534	NC_011080	GTG	2	6	867041	867046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443253
16535	NC_011080	CGG	2	6	867095	867100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443253
16536	NC_011080	GTG	2	6	867102	867107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443253
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16538	NC_011080	GGCG	2	8	867232	867239	0 %	0 %	75 %	25 %	194443253
16539	NC_011080	ACC	2	6	867421	867426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443253
16540	NC_011080	TACTGA	2	12	867474	867485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194443425
16541	NC_011080	CAG	2	6	867633	867638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443425
16542	NC_011080	CGA	2	6	867711	867716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443425
16543	NC_011080	CGG	2	6	867734	867739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443425
16544	NC_011080	GCAG	2	8	867771	867778	25 %	0 %	50 %	25 %	194443425
16545	NC_011080	GCGG	2	8	867799	867806	0 %	0 %	75 %	25 %	194443425
16546	NC_011080	CT	3	6	867820	867825	0 %	50 %	0 %	50 %	194443425
16547	NC_011080	AGC	2	6	867860	867865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443425
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16549	NC_011080	GGAT	2	8	867961	867968	25 %	25 %	50 %	0 %	194443425
16550	NC_011080	GCC	2	6	867984	867989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443425
16551	NC_011080	GC	3	6	867992	867997	0 %	0 %	50 %	50 %	194443425
16552	NC_011080	CGC	2	6	868024	868029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443425
16553	NC_011080	GGC	2	6	868086	868091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443425
16554	NC_011080	GACAG	2	10	868092	868101	40 %	0 %	40 %	20 %	194443425
16555	NC_011080	CGT	2	6	868848	868853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445085
16556	NC_011080	GGA	2	6	868868	868873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445085
16557	NC_011080	GGC	2	6	868991	868996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445085
16558	NC_011080	CTA	2	6	869057	869062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445085
16559	NC_011080	ACT	2	6	869065	869070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445085
16560	NC_011080	GTG	3	9	869193	869201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445085
16561	NC_011080	ATG	2	6	869253	869258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445085
16562	NC_011080	GC	3	6	869291	869296	0 %	0 %	50 %	50 %	194445085
16563	NC_011080	GCG	2	6	869371	869376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445085
16564	NC_011080	GAC	2	6	869406	869411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445085
16565	NC_011080	TGA	2	6	869435	869440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445085
16566	NC_011080	CTAT	2	8	869509	869516	25 %	50 %	0 %	25 %	194445085
16567	NC_011080	CGC	2	6	869536	869541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445085
16568	NC_011080	ATA	2	6	869614	869619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445085
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16571	NC_011080	GAT	2	6	869669	869674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445085
16572	NC_011080	CGGGC	2	10	869732	869741	0 %	0 %	60 %	40 %	194445085
16573	NC_011080	CCG	2	6	869745	869750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445085
16574	NC_011080	CCG	2	6	869773	869778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445085
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16578	NC_011080	GC	3	6	869850	869855	0 %	0 %	50 %	50 %	194445085
16579	NC_011080	GAG	2	6	869922	869927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445085
16580	NC_011080	CTAT	2	8	869950	869957	25 %	50 %	0 %	25 %	194445085
16581	NC_011080	TGA	2	6	869999	870004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445085
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16584	NC_011080	GCT	2	6	870035	870040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445085
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16587	NC_011080	GCGT	2	8	870199	870206	0 %	25 %	50 %	25 %	194445085
16588	NC_011080	ATC	2	6	870246	870251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445085
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16591	NC_011080	TGG	2	6	870334	870339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445085
16592	NC_011080	GC	3	6	870404	870409	0 %	0 %	50 %	50 %	194445085
16593	NC_011080	AGC	2	6	870505	870510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445085
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16601	NC_011080	AGA	2	6	871481	871486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445572
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16603	NC_011080	TAG	2	6	871553	871558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445572
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16606	NC_011080	AGTC	2	8	871657	871664	25 %	25 %	25 %	25 %	194445572
16607	NC_011080	GCA	2	6	871779	871784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445572
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16609	NC_011080	ATA	2	6	871828	871833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445572
16610	NC_011080	ACT	2	6	871899	871904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445572
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16619	NC_011080	AAT	2	6	872552	872557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445572
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16979	NC_011080	GCA	2	6	890641	890646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
16980	NC_011080	TAA	2	6	890701	890706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442237
16981	NC_011080	GCG	2	6	890723	890728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
16982	NC_011080	TAA	2	6	890737	890742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442237
16983	NC_011080	CG	3	6	890762	890767	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
16984	NC_011080	GCG	2	6	890819	890824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
16985	NC_011080	CG	3	6	890918	890923	0 %	0 %	50 %	50 %	194442237
16986	NC_011080	A	6	6	890999	891004	100 %	0 %	0 %	0 %	194442237
16987	NC_011080	ACG	2	6	891020	891025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
16988	NC_011080	GTC	2	6	891075	891080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442237
16989	NC_011080	AGC	2	6	891081	891086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
16990	NC_011080	GCG	4	12	891087	891098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442237
16991	NC_011080	G	6	6	891121	891126	0 %	0 %	100 %	0 %	194442237
16992	NC_011080	CAG	2	6	891140	891145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442237
16993	NC_011080	CCG	2	6	891230	891235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442237
16994	NC_011080	CGCTG	2	10	891487	891496	0 %	20 %	40 %	40 %	194445323
16995	NC_011080	CGC	2	6	891508	891513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445323
16996	NC_011080	GAT	2	6	891574	891579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445323
16997	NC_011080	GAA	2	6	891608	891613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445323
16998	NC_011080	A	6	6	891702	891707	100 %	0 %	0 %	0 %	194445323
16999	NC_011080	TGG	2	6	891711	891716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445323
17000	NC_011080	GCT	2	6	891769	891774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445323

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