MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011080	GCGCT	2	10	839144	839153	0 %	20 %	40 %	40 %	194443543
16002	NC_011080	GCC	2	6	839191	839196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443543
16003	NC_011080	CGC	2	6	839277	839282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443543
16004	NC_011080	GTG	2	6	839290	839295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443543
16005	NC_011080	TGA	2	6	839358	839363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443543
16006	NC_011080	CG	3	6	839410	839415	0 %	0 %	50 %	50 %	194443543
16007	NC_011080	GTG	2	6	839443	839448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443543
16008	NC_011080	T	6	6	839462	839467	0 %	100 %	0 %	0 %	194443543
16009	NC_011080	AG	3	6	839514	839519	50 %	0 %	50 %	0 %	194443543
16010	NC_011080	CCG	2	6	839544	839549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443543
16011	NC_011080	CTG	2	6	839557	839562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443543
16012	NC_011080	TTG	2	6	839566	839571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443543
16013	NC_011080	TCG	2	6	839606	839611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443543
16014	NC_011080	GCG	2	6	839737	839742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443543
16015	NC_011080	CG	3	6	839929	839934	0 %	0 %	50 %	50 %	194446520
16016	NC_011080	TAC	2	6	839983	839988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446520
16017	NC_011080	GCT	2	6	840026	840031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446520
16018	NC_011080	GGC	2	6	840162	840167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446520
16019	NC_011080	CGG	2	6	840260	840265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446520
16020	NC_011080	TCG	2	6	840302	840307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446520
16021	NC_011080	GC	3	6	840340	840345	0 %	0 %	50 %	50 %	194446520
16022	NC_011080	GCG	2	6	840499	840504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446520
16023	NC_011080	GAT	2	6	840515	840520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446520
16024	NC_011080	GGT	2	6	840593	840598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446520
16025	NC_011080	TCG	2	6	840808	840813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445433
16026	NC_011080	GCG	2	6	840919	840924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445433
16027	NC_011080	TCA	2	6	841075	841080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445433
16028	NC_011080	CGG	2	6	841095	841100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445433
16029	NC_011080	CTT	3	9	841322	841330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445433
16030	NC_011080	GCT	2	6	841345	841350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445433
16031	NC_011080	CAT	2	6	841385	841390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445433
16032	NC_011080	CTC	2	6	841729	841734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446021
16033	NC_011080	GAT	2	6	841773	841778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446021
16034	NC_011080	GCA	2	6	841791	841796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446021
16035	NC_011080	GGT	2	6	841900	841905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446021
16036	NC_011080	CAT	2	6	841912	841917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446021
16037	NC_011080	TGGT	2	8	842207	842214	0 %	50 %	50 %	0 %	194446021
16038	NC_011080	TCA	2	6	842333	842338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446021
16039	NC_011080	AAT	2	6	842351	842356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446021
16040	NC_011080	GCG	2	6	842389	842394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446021
16041	NC_011080	CCG	2	6	842414	842419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446021
16042	NC_011080	ACG	2	6	842529	842534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446021
16043	NC_011080	AGA	2	6	842618	842623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446021
16044	NC_011080	ACC	2	6	842648	842653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446021
16045	NC_011080	CATA	2	8	842755	842762	50 %	25 %	0 %	25 %	194446739
16046	NC_011080	ACA	2	6	842851	842856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446739
16047	NC_011080	GCC	2	6	842859	842864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446739
16048	NC_011080	GCC	3	9	842868	842876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446739
16049	NC_011080	CGC	2	6	842888	842893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446739
16050	NC_011080	ATC	2	6	842961	842966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446739
16051	NC_011080	GC	3	6	843029	843034	0 %	0 %	50 %	50 %	194446739
16052	NC_011080	GC	3	6	843051	843056	0 %	0 %	50 %	50 %	194446739
16053	NC_011080	GCT	2	6	843155	843160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446739
16054	NC_011080	GAA	2	6	843162	843167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446739
16055	NC_011080	ACG	2	6	843192	843197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446739
16056	NC_011080	TAT	2	6	843200	843205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446739
16057	NC_011080	TGA	2	6	843242	843247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446739
16058	NC_011080	CAC	2	6	843249	843254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446739
16059	NC_011080	CAAT	2	8	843301	843308	50 %	25 %	0 %	25 %	194446739
16060	NC_011080	T	6	6	843324	843329	0 %	100 %	0 %	0 %	194446739
16061	NC_011080	GC	3	6	843416	843421	0 %	0 %	50 %	50 %	194446739
16062	NC_011080	GCT	2	6	843443	843448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446739
16063	NC_011080	GGA	2	6	843483	843488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446739
16064	NC_011080	TGA	2	6	843521	843526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446739
16065	NC_011080	CGC	2	6	843536	843541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446739
16066	NC_011080	GTT	2	6	843549	843554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446739
16067	NC_011080	CGC	2	6	843578	843583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446739
16068	NC_011080	CTG	2	6	843600	843605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446739
16069	NC_011080	CGG	2	6	843665	843670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446739
16070	NC_011080	GTACG	2	10	843680	843689	20 %	20 %	40 %	20 %	194446739
16071	NC_011080	TCG	2	6	843691	843696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446739
16072	NC_011080	CG	3	6	843695	843700	0 %	0 %	50 %	50 %	194446739
16073	NC_011080	CAT	2	6	843752	843757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446739
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16075	NC_011080	CG	3	6	843911	843916	0 %	0 %	50 %	50 %	194442321
16076	NC_011080	ACGG	2	8	843992	843999	25 %	0 %	50 %	25 %	194442321
16077	NC_011080	GCA	2	6	844009	844014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442321
16078	NC_011080	GCG	2	6	844015	844020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442321
16079	NC_011080	GTGC	2	8	844030	844037	0 %	25 %	50 %	25 %	194442321
16080	NC_011080	TTC	2	6	844055	844060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442321
16081	NC_011080	GC	3	6	844072	844077	0 %	0 %	50 %	50 %	194442321
16082	NC_011080	GGAA	2	8	844099	844106	50 %	0 %	50 %	0 %	194442321
16083	NC_011080	CGCCAG	2	12	844148	844159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194442321
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16085	NC_011080	GCT	2	6	844168	844173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442321
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16088	NC_011080	GCCA	2	8	844260	844267	25 %	0 %	25 %	50 %	194442321
16089	NC_011080	CCA	2	6	844324	844329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442321
16090	NC_011080	ATGCGG	2	12	844424	844435	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194442321
16091	NC_011080	CGC	2	6	844451	844456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442321
16092	NC_011080	CGG	2	6	844504	844509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442321
16093	NC_011080	CG	4	8	844612	844619	0 %	0 %	50 %	50 %	194442321
16094	NC_011080	CA	3	6	844756	844761	50 %	0 %	0 %	50 %	194442321
16095	NC_011080	GCA	2	6	844786	844791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442321
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16099	NC_011080	TAAT	2	8	845092	845099	50 %	50 %	0 %	0 %	194445130
16100	NC_011080	ACG	2	6	845215	845220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445130
16101	NC_011080	TCGG	2	8	845275	845282	0 %	25 %	50 %	25 %	194445130
16102	NC_011080	GCGA	2	8	845302	845309	25 %	0 %	50 %	25 %	194445130
16103	NC_011080	CGA	2	6	845314	845319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445130
16104	NC_011080	TCT	2	6	845374	845379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445130
16105	NC_011080	GC	3	6	845399	845404	0 %	0 %	50 %	50 %	194445130
16106	NC_011080	GCA	2	6	845423	845428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445130
16107	NC_011080	ACTCC	2	10	845436	845445	20 %	20 %	0 %	60 %	194445130
16108	NC_011080	GCG	2	6	845513	845518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445130
16109	NC_011080	CGCA	2	8	845610	845617	25 %	0 %	25 %	50 %	194445130
16110	NC_011080	GTT	2	6	845649	845654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445130
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16115	NC_011080	CGA	2	6	846218	846223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444759
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16117	NC_011080	GCG	2	6	846316	846321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444759
16118	NC_011080	AGCGT	2	10	846363	846372	20 %	20 %	40 %	20 %	194444759
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16120	NC_011080	TTCA	2	8	846513	846520	25 %	50 %	0 %	25 %	194444759
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16227	NC_011080	GCCA	2	8	851553	851560	25 %	0 %	25 %	50 %	194445080
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16240	NC_011080	GGC	2	6	852439	852444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445080
16241	NC_011080	GCCTG	2	10	852498	852507	0 %	20 %	40 %	40 %	194445080
16242	NC_011080	GGTG	2	8	852558	852565	0 %	25 %	75 %	0 %	194446604
16243	NC_011080	TAAA	2	8	852566	852573	75 %	25 %	0 %	0 %	194446604
16244	NC_011080	ACG	2	6	852608	852613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446604
16245	NC_011080	GC	4	8	852617	852624	0 %	0 %	50 %	50 %	194446604
16246	NC_011080	TGCC	2	8	852663	852670	0 %	25 %	25 %	50 %	194446604
16247	NC_011080	CCCT	2	8	852730	852737	0 %	25 %	0 %	75 %	194446604
16248	NC_011080	GC	3	6	852784	852789	0 %	0 %	50 %	50 %	194446604
16249	NC_011080	CG	3	6	852918	852923	0 %	0 %	50 %	50 %	194446604
16250	NC_011080	ACG	2	6	853004	853009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446604
16251	NC_011080	TCA	2	6	853040	853045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446604
16252	NC_011080	ACAT	2	8	853046	853053	50 %	25 %	0 %	25 %	194446604
16253	NC_011080	ATCA	2	8	853084	853091	50 %	25 %	0 %	25 %	194446604
16254	NC_011080	GCA	2	6	853171	853176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446604
16255	NC_011080	CCAGCG	2	12	853191	853202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194446604
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16259	NC_011080	TAA	2	6	853389	853394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446604
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16261	NC_011080	GACGCT	2	12	853603	853614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194446085
16262	NC_011080	TGG	2	6	853653	853658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446085
16263	NC_011080	CGTAT	2	10	853716	853725	20 %	40 %	20 %	20 %	194446085
16264	NC_011080	GAT	2	6	853733	853738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446085
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16266	NC_011080	GCC	2	6	853754	853759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446085
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16270	NC_011080	TGG	2	6	853896	853901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446085
16271	NC_011080	TGG	2	6	854016	854021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446085
16272	NC_011080	CGG	2	6	854031	854036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446085
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16280	NC_011080	CAT	2	6	854420	854425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446085
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16284	NC_011080	CTG	2	6	855028	855033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442976
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16292	NC_011080	TCG	2	6	855378	855383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442976
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16302	NC_011080	AG	3	6	856178	856183	50 %	0 %	50 %	0 %	194445732
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16347	NC_011080	CG	3	6	858304	858309	0 %	0 %	50 %	50 %	194444635
16348	NC_011080	GGC	2	6	858311	858316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444635
16349	NC_011080	TGGC	2	8	858323	858330	0 %	25 %	50 %	25 %	194444635
16350	NC_011080	TGG	2	6	858342	858347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444635
16351	NC_011080	CTGCGC	2	12	858420	858431	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194445134
16352	NC_011080	A	7	7	858464	858470	100 %	0 %	0 %	0 %	194445134
16353	NC_011080	GCCGA	2	10	858626	858635	20 %	0 %	40 %	40 %	194445134
16354	NC_011080	GAG	2	6	858674	858679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445134
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16357	NC_011080	TCCAT	2	10	858789	858798	20 %	40 %	0 %	40 %	194445134
16358	NC_011080	CGC	2	6	858900	858905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445134
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16360	NC_011080	GC	3	6	858964	858969	0 %	0 %	50 %	50 %	194445134
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16481	NC_011080	TGT	2	6	865135	865140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445747
16482	NC_011080	CCG	2	6	865164	865169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445747
16483	NC_011080	CGC	2	6	865210	865215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445747
16484	NC_011080	GC	3	6	865269	865274	0 %	0 %	50 %	50 %	194445747
16485	NC_011080	ATG	2	6	865278	865283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
16486	NC_011080	GCA	2	6	865457	865462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
16487	NC_011080	GGCG	2	8	865475	865482	0 %	0 %	75 %	25 %	194445747
16488	NC_011080	AGC	3	9	865489	865497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445747
16489	NC_011080	TGA	2	6	865516	865521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
16490	NC_011080	GAT	2	6	865533	865538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445747
16491	NC_011080	CAA	2	6	865568	865573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446519
16492	NC_011080	CGA	2	6	865579	865584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16493	NC_011080	GCC	2	6	865620	865625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446519
16494	NC_011080	GCTG	2	8	865653	865660	0 %	25 %	50 %	25 %	194446519
16495	NC_011080	ATT	2	6	865730	865735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446519
16496	NC_011080	GCG	2	6	865776	865781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
16497	NC_011080	CG	3	6	865859	865864	0 %	0 %	50 %	50 %	194446519
16498	NC_011080	CTG	2	6	865865	865870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446519
16499	NC_011080	GCG	2	6	865886	865891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446519
16500	NC_011080	A	8	8	865919	865926	100 %	0 %	0 %	0 %	194446519

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