MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011080	GTC	2	6	815479	815484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15502	NC_011080	CTG	2	6	815550	815555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15503	NC_011080	TGG	2	6	815596	815601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444913
15504	NC_011080	AGC	2	6	815643	815648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15505	NC_011080	TAC	2	6	815740	815745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443845
15506	NC_011080	TGG	2	6	815754	815759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443845
15507	NC_011080	CTG	2	6	815760	815765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443845
15508	NC_011080	GTT	2	6	815933	815938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443845
15509	NC_011080	TGC	2	6	815939	815944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443845
15510	NC_011080	CGC	2	6	815960	815965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443845
15511	NC_011080	GAT	2	6	815990	815995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443845
15512	NC_011080	TTC	2	6	816015	816020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443845
15513	NC_011080	CGGT	2	8	816025	816032	0 %	25 %	50 %	25 %	194443845
15514	NC_011080	GCC	2	6	816110	816115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443845
15515	NC_011080	TAC	2	6	816189	816194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443845
15516	NC_011080	CTT	2	6	816203	816208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443845
15517	NC_011080	CTG	2	6	816231	816236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443845
15518	NC_011080	GAT	2	6	816257	816262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443845
15519	NC_011080	GC	6	12	816317	816328	0 %	0 %	50 %	50 %	194443845
15520	NC_011080	GCG	2	6	816342	816347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443845
15521	NC_011080	GGCG	2	8	816374	816381	0 %	0 %	75 %	25 %	194443845
15522	NC_011080	CAT	2	6	816432	816437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443845
15523	NC_011080	GCC	2	6	816438	816443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443845
15524	NC_011080	AAG	2	6	816460	816465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443845
15525	NC_011080	CTGG	2	8	816485	816492	0 %	25 %	50 %	25 %	194443845
15526	NC_011080	TAA	2	6	816500	816505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443845
15527	NC_011080	TGGT	2	8	816519	816526	0 %	50 %	50 %	0 %	194443845
15528	NC_011080	GCT	2	6	816551	816556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443845
15529	NC_011080	ATT	2	6	816627	816632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443845
15530	NC_011080	CGG	2	6	816637	816642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443845
15531	NC_011080	GAT	2	6	816680	816685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443845
15532	NC_011080	CCAG	2	8	816718	816725	25 %	0 %	25 %	50 %	194443845
15533	NC_011080	TGA	2	6	816739	816744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443845
15534	NC_011080	GCG	2	6	816753	816758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443845
15535	NC_011080	CT	3	6	816851	816856	0 %	50 %	0 %	50 %	194443845
15536	NC_011080	TAAG	2	8	816861	816868	50 %	25 %	25 %	0 %	194443845
15537	NC_011080	CTT	2	6	816908	816913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444135
15538	NC_011080	AAG	2	6	816978	816983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444135
15539	NC_011080	ATGT	2	8	817080	817087	25 %	50 %	25 %	0 %	194442242
15540	NC_011080	GCC	2	6	817108	817113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442242
15541	NC_011080	ATT	2	6	817143	817148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442242
15542	NC_011080	T	6	6	817223	817228	0 %	100 %	0 %	0 %	194442242
15543	NC_011080	TCG	2	6	817256	817261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442242
15544	NC_011080	TCT	3	9	817271	817279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442242
15545	NC_011080	TTA	2	6	817548	817553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446009
15546	NC_011080	CGG	2	6	817569	817574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446009
15547	NC_011080	GC	3	6	817615	817620	0 %	0 %	50 %	50 %	194446009
15548	NC_011080	TGC	2	6	817628	817633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446009
15549	NC_011080	TGC	2	6	817658	817663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446009
15550	NC_011080	CGA	2	6	817728	817733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446009
15551	NC_011080	ACGCA	2	10	817789	817798	40 %	0 %	20 %	40 %	194446009
15552	NC_011080	GCT	2	6	817818	817823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446009
15553	NC_011080	TGAC	2	8	817915	817922	25 %	25 %	25 %	25 %	194446009
15554	NC_011080	TTGATT	2	12	817977	817988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	194446660
15555	NC_011080	CAT	2	6	818012	818017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446660
15556	NC_011080	CGC	2	6	818042	818047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446660
15557	NC_011080	ATGC	2	8	818361	818368	25 %	25 %	25 %	25 %	194446660
15558	NC_011080	ATTG	2	8	818435	818442	25 %	50 %	25 %	0 %	194446660
15559	NC_011080	CAA	2	6	818594	818599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446660
15560	NC_011080	GTC	2	6	818632	818637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444970
15561	NC_011080	TGC	3	9	818689	818697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444970
15562	NC_011080	AGT	2	6	818778	818783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444970
15563	NC_011080	ACG	2	6	818785	818790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444970
15564	NC_011080	ATT	2	6	818802	818807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444970
15565	NC_011080	CGG	2	6	818936	818941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444970
15566	NC_011080	AAT	2	6	818966	818971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444970
15567	NC_011080	ATT	2	6	819148	819153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445627
15568	NC_011080	TGC	2	6	819161	819166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15569	NC_011080	ATC	2	6	819169	819174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445627
15570	NC_011080	TGA	2	6	819204	819209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445627
15571	NC_011080	CGG	5	15	819228	819242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15572	NC_011080	GCA	2	6	819285	819290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15573	NC_011080	CAG	2	6	819301	819306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15574	NC_011080	CG	3	6	819328	819333	0 %	0 %	50 %	50 %	194445627
15575	NC_011080	GAA	2	6	819334	819339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15576	NC_011080	CAG	2	6	819358	819363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15577	NC_011080	GCA	2	6	819378	819383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15578	NC_011080	AAC	2	6	819413	819418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194445627
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15581	NC_011080	GCA	2	6	819469	819474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
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15583	NC_011080	GAA	2	6	819505	819510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15584	NC_011080	GCG	2	6	819511	819516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15585	NC_011080	GCG	3	9	819520	819528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15586	NC_011080	GAA	2	6	819534	819539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15587	NC_011080	A	6	6	819538	819543	100 %	0 %	0 %	0 %	194445627
15588	NC_011080	GGC	2	6	819555	819560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15589	NC_011080	GCG	3	9	819565	819573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15590	NC_011080	GAA	3	9	819579	819587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15591	NC_011080	GAA	3	9	819624	819632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15592	NC_011080	GCG	2	6	819646	819651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
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15598	NC_011080	GCG	2	6	819736	819741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
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15601	NC_011080	GGC	2	6	819780	819785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15602	NC_011080	GCG	3	9	819790	819798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15603	NC_011080	GAA	3	9	819804	819812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15604	NC_011080	CGG	2	6	819824	819829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15605	NC_011080	AGC	2	6	819834	819839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445627
15606	NC_011080	AAG	2	6	819850	819855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445627
15607	NC_011080	GCC	2	6	819877	819882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445627
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15609	NC_011080	CGG	3	9	819942	819950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445627
15610	NC_011080	GCCA	2	8	819965	819972	25 %	0 %	25 %	50 %	194445627
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15618	NC_011080	GGC	2	6	820578	820583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443806
15619	NC_011080	GCA	2	6	820635	820640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443806
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15978	NC_011080	GGC	2	6	837890	837895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445207
15979	NC_011080	GCT	2	6	837950	837955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445207
15980	NC_011080	GCA	2	6	837963	837968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445207
15981	NC_011080	GTC	2	6	837970	837975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445207
15982	NC_011080	CAGT	2	8	838025	838032	25 %	25 %	25 %	25 %	194445207
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