MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_011080	TTC	2	6	789916	789921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445175
15003	NC_011080	TGG	2	6	789967	789972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445175
15004	NC_011080	GTAG	2	8	789989	789996	25 %	25 %	50 %	0 %	194445175
15005	NC_011080	AT	4	8	790000	790007	50 %	50 %	0 %	0 %	194445175
15006	NC_011080	ATG	4	12	790041	790052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445175
15007	NC_011080	TTA	2	6	790088	790093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445175
15008	NC_011080	TCA	2	6	790170	790175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445175
15009	NC_011080	TATT	2	8	790201	790208	25 %	75 %	0 %	0 %	194445175
15010	NC_011080	AG	3	6	790222	790227	50 %	0 %	50 %	0 %	194445175
15011	NC_011080	ATT	2	6	790286	790291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445175
15012	NC_011080	ATG	2	6	790329	790334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445175
15013	NC_011080	TAT	2	6	790346	790351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445175
15014	NC_011080	GAT	2	6	790352	790357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445175
15015	NC_011080	T	6	6	790357	790362	0 %	100 %	0 %	0 %	194445175
15016	NC_011080	AAATT	2	10	790413	790422	60 %	40 %	0 %	0 %	194445175
15017	NC_011080	TAT	2	6	790475	790480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445175
15018	NC_011080	TGC	2	6	790497	790502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445175
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15026	NC_011080	T	8	8	790887	790894	0 %	100 %	0 %	0 %	194446387
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15031	NC_011080	TGCG	2	8	791076	791083	0 %	25 %	50 %	25 %	194446387
15032	NC_011080	AT	3	6	791104	791109	50 %	50 %	0 %	0 %	194446387
15033	NC_011080	TAA	2	6	791116	791121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446387
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15039	NC_011080	A	7	7	791349	791355	100 %	0 %	0 %	0 %	194446387
15040	NC_011080	TCAT	2	8	791424	791431	25 %	50 %	0 %	25 %	194446387
15041	NC_011080	CTGG	2	8	791458	791465	0 %	25 %	50 %	25 %	194446387
15042	NC_011080	TTA	2	6	791552	791557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446387
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15053	NC_011080	TA	4	8	792254	792261	50 %	50 %	0 %	0 %	194445723
15054	NC_011080	T	8	8	792326	792333	0 %	100 %	0 %	0 %	194445723
15055	NC_011080	TAA	2	6	792383	792388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445723
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15057	NC_011080	T	6	6	792428	792433	0 %	100 %	0 %	0 %	194445723
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15060	NC_011080	CAT	2	6	792501	792506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445723
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15094	NC_011080	AT	3	6	793878	793883	50 %	50 %	0 %	0 %	194444123
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15111	NC_011080	CTTT	2	8	794522	794529	0 %	75 %	0 %	25 %	194444123
15112	NC_011080	GTG	2	6	794534	794539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444123
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15245	NC_011080	CG	3	6	800275	800280	0 %	0 %	50 %	50 %	194445700
15246	NC_011080	TAC	2	6	800293	800298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445700
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15249	NC_011080	AGC	2	6	800385	800390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445700
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15263	NC_011080	CGC	2	6	801327	801332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445649
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15316	NC_011080	TGC	2	6	804615	804620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443628
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15365	NC_011080	CGA	2	6	807744	807749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444060
15366	NC_011080	CGC	2	6	807800	807805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444060
15367	NC_011080	GTG	2	6	807910	807915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444060
15368	NC_011080	GGC	2	6	808107	808112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444060
15369	NC_011080	GCG	2	6	808136	808141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444060
15370	NC_011080	CTT	2	6	808221	808226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444060
15371	NC_011080	GCA	2	6	808281	808286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444060
15372	NC_011080	GAA	2	6	808336	808341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444060
15373	NC_011080	CGG	2	6	808373	808378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444060
15374	NC_011080	GC	3	6	808430	808435	0 %	0 %	50 %	50 %	194444060
15375	NC_011080	TCC	2	6	808459	808464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444060
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15379	NC_011080	TGC	2	6	808634	808639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444060
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15382	NC_011080	GCT	2	6	808695	808700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444060
15383	NC_011080	TGA	2	6	808728	808733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444060
15384	NC_011080	TTCC	2	8	808746	808753	0 %	50 %	0 %	50 %	194444060
15385	NC_011080	TTA	2	6	808827	808832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444060
15386	NC_011080	CTG	2	6	808837	808842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444060
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15392	NC_011080	ATAA	2	8	809165	809172	75 %	25 %	0 %	0 %	194444650
15393	NC_011080	CCTG	2	8	809201	809208	0 %	25 %	25 %	50 %	194444650
15394	NC_011080	A	6	6	809244	809249	100 %	0 %	0 %	0 %	194444650
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15447	NC_011080	TAAT	2	8	811698	811705	50 %	50 %	0 %	0 %	194446366
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15456	NC_011080	CGG	2	6	812317	812322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446366
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15466	NC_011080	TTGT	2	8	812641	812648	0 %	75 %	25 %	0 %	194442265
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15469	NC_011080	A	7	7	812891	812897	100 %	0 %	0 %	0 %	194442741
15470	NC_011080	GCA	2	6	812904	812909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442741
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15474	NC_011080	T	6	6	813626	813631	0 %	100 %	0 %	0 %	194443486
15475	NC_011080	A	6	6	813649	813654	100 %	0 %	0 %	0 %	194443486
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15477	NC_011080	CTG	2	6	814233	814238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
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15479	NC_011080	TAC	2	6	814386	814391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444913
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15481	NC_011080	TTC	3	9	814479	814487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444913
15482	NC_011080	CTGG	2	8	814529	814536	0 %	25 %	50 %	25 %	194444913
15483	NC_011080	TAC	2	6	814752	814757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444913
15484	NC_011080	TGC	2	6	814805	814810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15485	NC_011080	CCT	2	6	814939	814944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444913
15486	NC_011080	CTG	2	6	815118	815123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15487	NC_011080	AGC	2	6	815125	815130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15488	NC_011080	GC	3	6	815132	815137	0 %	0 %	50 %	50 %	194444913
15489	NC_011080	GAA	2	6	815180	815185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444913
15490	NC_011080	CTG	3	9	815202	815210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15491	NC_011080	TGAC	2	8	815230	815237	25 %	25 %	25 %	25 %	194444913
15492	NC_011080	CGA	2	6	815263	815268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15493	NC_011080	ATTCC	2	10	815272	815281	20 %	40 %	0 %	40 %	194444913
15494	NC_011080	TGG	2	6	815317	815322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444913
15495	NC_011080	CTG	3	9	815334	815342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15496	NC_011080	ATC	2	6	815346	815351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444913
15497	NC_011080	A	6	6	815394	815399	100 %	0 %	0 %	0 %	194444913
15498	NC_011080	GCT	2	6	815402	815407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444913
15499	NC_011080	GC	3	6	815408	815413	0 %	0 %	50 %	50 %	194444913
15500	NC_011080	GGTT	2	8	815457	815464	0 %	50 %	50 %	0 %	194444913

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