MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011080	AAT	2	6	764709	764714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445942
14502	NC_011080	A	6	6	764763	764768	100 %	0 %	0 %	0 %	194445942
14503	NC_011080	GGC	2	6	764769	764774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14504	NC_011080	GCTG	2	8	764777	764784	0 %	25 %	50 %	25 %	194445942
14505	NC_011080	CCG	2	6	764814	764819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445942
14506	NC_011080	GGC	2	6	764853	764858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14507	NC_011080	CGG	2	6	764860	764865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14508	NC_011080	AGA	2	6	764888	764893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445942
14509	NC_011080	GCT	2	6	764906	764911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445942
14510	NC_011080	GGCG	2	8	764912	764919	0 %	0 %	75 %	25 %	194445942
14511	NC_011080	TC	3	6	764941	764946	0 %	50 %	0 %	50 %	194445942
14512	NC_011080	GGC	2	6	765032	765037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14513	NC_011080	GGC	2	6	765078	765083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14514	NC_011080	GTTA	2	8	765137	765144	25 %	50 %	25 %	0 %	194445942
14515	NC_011080	CTC	2	6	765212	765217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445942
14516	NC_011080	TGA	2	6	765322	765327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445942
14517	NC_011080	GAT	2	6	765428	765433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445942
14518	NC_011080	GTG	2	6	765441	765446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445942
14519	NC_011080	TTG	2	6	765496	765501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445942
14520	NC_011080	CGG	2	6	765530	765535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14521	NC_011080	AG	3	6	765539	765544	50 %	0 %	50 %	0 %	194445942
14522	NC_011080	ATC	2	6	765603	765608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445942
14523	NC_011080	CTG	2	6	765615	765620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445942
14524	NC_011080	GCG	2	6	765621	765626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14525	NC_011080	CCG	2	6	765634	765639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445942
14526	NC_011080	GC	3	6	765691	765696	0 %	0 %	50 %	50 %	194445942
14527	NC_011080	CG	3	6	765806	765811	0 %	0 %	50 %	50 %	194445942
14528	NC_011080	GGC	2	6	765846	765851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445942
14529	NC_011080	CGC	2	6	765881	765886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445942
14530	NC_011080	GAA	2	6	765942	765947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445942
14531	NC_011080	AAG	2	6	765967	765972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445942
14532	NC_011080	CGG	2	6	766150	766155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446458
14533	NC_011080	CAC	2	6	766182	766187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446458
14534	NC_011080	TCA	2	6	766199	766204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446458
14535	NC_011080	CG	3	6	766280	766285	0 %	0 %	50 %	50 %	194446458
14536	NC_011080	GTA	2	6	766361	766366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446458
14537	NC_011080	GTGC	2	8	766435	766442	0 %	25 %	50 %	25 %	194446458
14538	NC_011080	AAAAT	2	10	766449	766458	80 %	20 %	0 %	0 %	194446458
14539	NC_011080	ACA	2	6	766501	766506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446458
14540	NC_011080	AC	3	6	766539	766544	50 %	0 %	0 %	50 %	194446458
14541	NC_011080	TTCAA	2	10	766691	766700	40 %	40 %	0 %	20 %	194445116
14542	NC_011080	CTT	2	6	766767	766772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445116
14543	NC_011080	GGA	2	6	766777	766782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445116
14544	NC_011080	TGA	2	6	766846	766851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445116
14545	NC_011080	AAT	2	6	766909	766914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445116
14546	NC_011080	CAC	2	6	766921	766926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445116
14547	NC_011080	TCA	2	6	766977	766982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445116
14548	NC_011080	AAT	2	6	766999	767004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445116
14549	NC_011080	AAT	2	6	767008	767013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445116
14550	NC_011080	GA	3	6	767052	767057	50 %	0 %	50 %	0 %	194445116
14551	NC_011080	GGA	2	6	767086	767091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445116
14552	NC_011080	CCAGC	2	10	767119	767128	20 %	0 %	20 %	60 %	194445116
14553	NC_011080	GCA	2	6	767137	767142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445116
14554	NC_011080	TACC	2	8	767172	767179	25 %	25 %	0 %	50 %	194445116
14555	NC_011080	CCG	2	6	767289	767294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445116
14556	NC_011080	GAA	2	6	767411	767416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194445116
14557	NC_011080	ATG	2	6	767495	767500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445116
14558	NC_011080	ATG	2	6	767519	767524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445116
14559	NC_011080	CG	3	6	767564	767569	0 %	0 %	50 %	50 %	194445116
14560	NC_011080	GCG	2	6	767631	767636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445116
14561	NC_011080	GCG	2	6	767642	767647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445116
14562	NC_011080	CAG	2	6	767704	767709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445116
14563	NC_011080	GCC	2	6	767782	767787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445116
14564	NC_011080	CGG	2	6	767847	767852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445116
14565	NC_011080	CCAG	2	8	767856	767863	25 %	0 %	25 %	50 %	194445116
14566	NC_011080	ATG	2	6	767909	767914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445116
14567	NC_011080	CAT	2	6	767926	767931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445116
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14569	NC_011080	CAG	2	6	768009	768014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14570	NC_011080	GC	3	6	768016	768021	0 %	0 %	50 %	50 %	194443613
14571	NC_011080	CGT	2	6	768068	768073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14572	NC_011080	TTC	2	6	768075	768080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443613
14573	NC_011080	GCA	2	6	768116	768121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
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14577	NC_011080	CTTCCG	2	12	768242	768253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194443613
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14582	NC_011080	TGT	2	6	768529	768534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443613
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14584	NC_011080	CAG	2	6	768561	768566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
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14588	NC_011080	GAA	2	6	768780	768785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443613
14589	NC_011080	ATCA	2	8	768837	768844	50 %	25 %	0 %	25 %	194443613
14590	NC_011080	ACGG	2	8	768857	768864	25 %	0 %	50 %	25 %	194443613
14591	NC_011080	TGA	2	6	768868	768873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443613
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14593	NC_011080	GCG	2	6	768979	768984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443613
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14595	NC_011080	GCAT	2	8	769012	769019	25 %	25 %	25 %	25 %	194443613
14596	NC_011080	GTT	2	6	769029	769034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443613
14597	NC_011080	T	6	6	769083	769088	0 %	100 %	0 %	0 %	194443613
14598	NC_011080	TTG	2	6	769119	769124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443613
14599	NC_011080	CAG	3	9	769176	769184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14600	NC_011080	CAT	2	6	769200	769205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443613
14601	NC_011080	CGA	2	6	769277	769282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14602	NC_011080	CGT	2	6	769307	769312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14603	NC_011080	GCG	2	6	769367	769372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443613
14604	NC_011080	TCT	2	6	769402	769407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443613
14605	NC_011080	CCG	2	6	769429	769434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443613
14606	NC_011080	CG	3	6	769453	769458	0 %	0 %	50 %	50 %	194443613
14607	NC_011080	AAT	2	6	769492	769497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443613
14608	NC_011080	GTG	2	6	769503	769508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443613
14609	NC_011080	GTT	2	6	769521	769526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443613
14610	NC_011080	AGG	3	9	769586	769594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443613
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14612	NC_011080	TGC	2	6	769648	769653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14613	NC_011080	GC	3	6	769664	769669	0 %	0 %	50 %	50 %	194443613
14614	NC_011080	CAG	2	6	769680	769685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443613
14615	NC_011080	CGG	2	6	769774	769779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443613
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14618	NC_011080	GC	3	6	769847	769852	0 %	0 %	50 %	50 %	194443613
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14620	NC_011080	TGC	2	6	769890	769895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443613
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