MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011080	AAT	2	6	736181	736186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443019
14002	NC_011080	ACG	2	6	736187	736192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443019
14003	NC_011080	TCAATG	2	12	736227	736238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194443019
14004	NC_011080	CGC	2	6	736243	736248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443019
14005	NC_011080	CCG	2	6	736284	736289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443019
14006	NC_011080	GC	3	6	736357	736362	0 %	0 %	50 %	50 %	194443019
14007	NC_011080	GGC	2	6	736378	736383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443019
14008	NC_011080	TCT	2	6	736407	736412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443019
14009	NC_011080	CGC	2	6	736483	736488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443019
14010	NC_011080	GCA	2	6	736636	736641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443019
14011	NC_011080	GAT	2	6	736718	736723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443019
14012	NC_011080	ATC	2	6	736767	736772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443019
14013	NC_011080	ATA	2	6	736788	736793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443019
14014	NC_011080	CG	3	6	736840	736845	0 %	0 %	50 %	50 %	194443019
14015	NC_011080	GCTG	2	8	736930	736937	0 %	25 %	50 %	25 %	194443019
14016	NC_011080	A	7	7	736948	736954	100 %	0 %	0 %	0 %	194443019
14017	NC_011080	ACT	2	6	736979	736984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443019
14018	NC_011080	GTC	2	6	736994	736999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443019
14019	NC_011080	CTA	2	6	737160	737165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443004
14020	NC_011080	TCT	2	6	737174	737179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443004
14021	NC_011080	AGCA	2	8	737208	737215	50 %	0 %	25 %	25 %	194443004
14022	NC_011080	GA	3	6	737229	737234	50 %	0 %	50 %	0 %	194443004
14023	NC_011080	TCG	2	6	737257	737262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443004
14024	NC_011080	AAT	2	6	737373	737378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443004
14025	NC_011080	G	6	6	737409	737414	0 %	0 %	100 %	0 %	194443004
14026	NC_011080	GA	3	6	737431	737436	50 %	0 %	50 %	0 %	194443004
14027	NC_011080	CCA	2	6	737498	737503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443004
14028	NC_011080	CCAG	2	8	737552	737559	25 %	0 %	25 %	50 %	194443004
14029	NC_011080	GCC	2	6	737673	737678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442235
14030	NC_011080	CAC	2	6	737756	737761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442235
14031	NC_011080	GAA	2	6	737774	737779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442235
14032	NC_011080	GTG	2	6	737937	737942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442235
14033	NC_011080	CGT	2	6	737971	737976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442235
14034	NC_011080	GCG	2	6	738004	738009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442235
14035	NC_011080	CCG	2	6	738157	738162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442235
14036	NC_011080	GCG	2	6	738216	738221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442235
14037	NC_011080	CCG	2	6	738247	738252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442235
14038	NC_011080	CGC	2	6	738331	738336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442235
14039	NC_011080	CTT	2	6	738406	738411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442235
14040	NC_011080	CGC	2	6	738503	738508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442235
14041	NC_011080	GAC	2	6	738523	738528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442235
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14043	NC_011080	GAC	2	6	738574	738579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442235
14044	NC_011080	TCA	2	6	738600	738605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442235
14045	NC_011080	TACGGG	2	12	738922	738933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446753
14046	NC_011080	CAC	2	6	738989	738994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446753
14047	NC_011080	ATC	2	6	739053	739058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446753
14048	NC_011080	CAC	2	6	739079	739084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446753
14049	NC_011080	ACGTG	2	10	739127	739136	20 %	20 %	40 %	20 %	194446753
14050	NC_011080	CCA	2	6	739141	739146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446753
14051	NC_011080	CGG	2	6	739173	739178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446753
14052	NC_011080	CTG	2	6	739193	739198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14053	NC_011080	GCT	2	6	739228	739233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14054	NC_011080	TCT	2	6	739234	739239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446753
14055	NC_011080	CTT	2	6	739240	739245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446753
14056	NC_011080	TCA	2	6	739254	739259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446753
14057	NC_011080	AGA	2	6	739294	739299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446753
14058	NC_011080	T	6	6	739348	739353	0 %	100 %	0 %	0 %	194446753
14059	NC_011080	ATC	2	6	739358	739363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446753
14060	NC_011080	CGA	2	6	739384	739389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14061	NC_011080	GCCGC	2	10	739417	739426	0 %	0 %	40 %	60 %	194446753
14062	NC_011080	GC	3	6	739425	739430	0 %	0 %	50 %	50 %	194446753
14063	NC_011080	GAT	2	6	739439	739444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446753
14064	NC_011080	ATA	2	6	739563	739568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446753
14065	NC_011080	TCG	2	6	739569	739574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14066	NC_011080	TGG	2	6	739594	739599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446753
14067	NC_011080	GGC	2	6	739628	739633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446753
14068	NC_011080	GCA	2	6	739642	739647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14069	NC_011080	GGT	2	6	739664	739669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446753
14070	NC_011080	CGT	2	6	739672	739677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446753
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14073	NC_011080	CTT	2	6	739789	739794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446753
14074	NC_011080	AGTA	2	8	739819	739826	50 %	25 %	25 %	0 %	194446753
14075	NC_011080	AAAC	2	8	739855	739862	75 %	0 %	0 %	25 %	194446753
14076	NC_011080	GC	3	6	739878	739883	0 %	0 %	50 %	50 %	194446753
14077	NC_011080	ACC	2	6	739932	739937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446753
14078	NC_011080	CACG	2	8	739951	739958	25 %	0 %	25 %	50 %	194446753
14079	NC_011080	ATC	2	6	739965	739970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446753
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14084	NC_011080	CAG	2	6	740231	740236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446753
14085	NC_011080	T	6	6	740297	740302	0 %	100 %	0 %	0 %	194446753
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14087	NC_011080	CGG	2	6	740484	740489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446092
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14090	NC_011080	GCA	2	6	740526	740531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446092
14091	NC_011080	CAGC	2	8	740586	740593	25 %	0 %	25 %	50 %	194446092
14092	NC_011080	GCT	2	6	740634	740639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446092
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14098	NC_011080	CG	3	6	741086	741091	0 %	0 %	50 %	50 %	194446092
14099	NC_011080	CGA	2	6	741108	741113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446092
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14101	NC_011080	CGT	2	6	741265	741270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446092
14102	NC_011080	TTGA	2	8	741382	741389	25 %	50 %	25 %	0 %	194446092
14103	NC_011080	GCCA	2	8	741427	741434	25 %	0 %	25 %	50 %	194446092
14104	NC_011080	ATG	2	6	741481	741486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446092
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14106	NC_011080	GGC	2	6	741567	741572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446092
14107	NC_011080	GC	3	6	741576	741581	0 %	0 %	50 %	50 %	194446092
14108	NC_011080	TTACT	2	10	741694	741703	20 %	60 %	0 %	20 %	194445479
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14115	NC_011080	GGC	2	6	742165	742170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445479
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14117	NC_011080	A	6	6	742219	742224	100 %	0 %	0 %	0 %	194445479
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14119	NC_011080	CG	3	6	743366	743371	0 %	0 %	50 %	50 %	194444808
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14239	NC_011080	CGG	2	6	750434	750439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
14240	NC_011080	TGC	2	6	750442	750447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
14241	NC_011080	TGTC	2	8	750448	750455	0 %	50 %	25 %	25 %	194444609
14242	NC_011080	GCT	2	6	750521	750526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
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14244	NC_011080	TCG	2	6	750565	750570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
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14246	NC_011080	CTG	2	6	750711	750716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
14247	NC_011080	TGA	2	6	750773	750778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444609
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14249	NC_011080	GAA	2	6	750810	750815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444609
14250	NC_011080	TGC	2	6	750845	750850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444609
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14255	NC_011080	GTG	2	6	751047	751052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444609
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14259	NC_011080	CGG	3	9	751279	751287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
14260	NC_011080	TCTG	2	8	751324	751331	0 %	50 %	25 %	25 %	194444609
14261	NC_011080	CGG	2	6	751435	751440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444609
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14263	NC_011080	GTT	2	6	751506	751511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444609
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14268	NC_011080	GCCC	2	8	751833	751840	0 %	0 %	25 %	75 %	194446155
14269	NC_011080	ATT	2	6	751860	751865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446155
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14271	NC_011080	ATCT	2	8	751955	751962	25 %	50 %	0 %	25 %	194446155
14272	NC_011080	AGA	2	6	752036	752041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446155
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14275	NC_011080	TCA	2	6	752158	752163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446155
14276	NC_011080	GGCCT	2	10	752169	752178	0 %	20 %	40 %	40 %	194446155
14277	NC_011080	TGA	2	6	752183	752188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446155
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14279	NC_011080	CGG	2	6	752306	752311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446155
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14354	NC_011080	A	6	6	757193	757198	100 %	0 %	0 %	0 %	194444148
14355	NC_011080	GC	3	6	757256	757261	0 %	0 %	50 %	50 %	194444148
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14480	NC_011080	ATT	2	6	763571	763576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443137
14481	NC_011080	TGA	3	9	763820	763828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445958
14482	NC_011080	GCCA	2	8	763845	763852	25 %	0 %	25 %	50 %	194445958
14483	NC_011080	GCG	2	6	763953	763958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445958
14484	NC_011080	CG	3	6	764007	764012	0 %	0 %	50 %	50 %	194445958
14485	NC_011080	GCT	2	6	764021	764026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445958
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14488	NC_011080	CG	3	6	764149	764154	0 %	0 %	50 %	50 %	194445958
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14490	NC_011080	GCT	2	6	764180	764185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445958
14491	NC_011080	CACCAA	2	12	764243	764254	50 %	0 %	0 %	50 %	194445958
14492	NC_011080	GCA	2	6	764269	764274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445958
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14499	NC_011080	GTC	2	6	764524	764529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445942
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